MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_015581	GGT	2	6	1658380	1658385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31503	NC_015581	TGG	2	6	1658415	1658420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31504	NC_015581	CCG	2	6	1658442	1658447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31505	NC_015581	TGG	2	6	1658448	1658453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31506	NC_015581	GCC	2	6	1658482	1658487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31507	NC_015581	GGTGAG	2	12	1658617	1658628	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	334144528
31508	NC_015581	ACC	2	6	1658635	1658640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31509	NC_015581	TGG	2	6	1658748	1658753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31510	NC_015581	CGG	2	6	1658811	1658816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144528
31511	NC_015581	CAG	2	6	1658935	1658940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31512	NC_015581	TGT	2	6	1659153	1659158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31513	NC_015581	AATCA	2	10	1659187	1659196	60 %	20 %	0 %	20 %	334144528
31514	NC_015581	GCC	3	9	1659274	1659282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31515	NC_015581	CTG	2	6	1659286	1659291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31516	NC_015581	CGG	2	6	1659324	1659329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144528
31517	NC_015581	AC	3	6	1659336	1659341	50 %	0 %	0 %	50 %	334144528
31518	NC_015581	TTA	2	6	1659347	1659352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144528
31519	NC_015581	ACCG	2	8	1659367	1659374	25 %	0 %	25 %	50 %	334144528
31520	NC_015581	TGT	2	6	1659375	1659380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31521	NC_015581	CGC	2	6	1659382	1659387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31522	NC_015581	TCAACG	2	12	1659390	1659401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	334144528
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31524	NC_015581	GGT	2	6	1659463	1659468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31525	NC_015581	GCTG	2	8	1659493	1659500	0 %	25 %	50 %	25 %	334144528
31526	NC_015581	GCG	2	6	1659638	1659643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144528
31527	NC_015581	GCC	2	6	1659697	1659702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
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31530	NC_015581	GCT	2	6	1659790	1659795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
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31532	NC_015581	TGC	2	6	1659900	1659905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31533	NC_015581	CAC	2	6	1659948	1659953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31534	NC_015581	GCC	2	6	1659967	1659972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31535	NC_015581	GGT	2	6	1659976	1659981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
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31538	NC_015581	CCA	2	6	1660127	1660132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31539	NC_015581	TACG	2	8	1660278	1660285	25 %	25 %	25 %	25 %	334144528
31540	NC_015581	CCG	2	6	1660296	1660301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31541	NC_015581	CTG	2	6	1660312	1660317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31542	NC_015581	TG	3	6	1660316	1660321	0 %	50 %	50 %	0 %	334144528
31543	NC_015581	GTC	3	9	1660364	1660372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31544	NC_015581	TGCG	2	8	1660391	1660398	0 %	25 %	50 %	25 %	334144528
31545	NC_015581	CTGA	2	8	1660407	1660414	25 %	25 %	25 %	25 %	334144528
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31550	NC_015581	CGG	2	6	1660665	1660670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144528
31551	NC_015581	GTT	2	6	1660780	1660785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31552	NC_015581	CGT	2	6	1660800	1660805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31553	NC_015581	TGG	3	9	1660806	1660814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31554	NC_015581	GTT	2	6	1660837	1660842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
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31557	NC_015581	CGT	2	6	1661028	1661033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31558	NC_015581	CAT	2	6	1661100	1661105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
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31560	NC_015581	ATCA	2	8	1661170	1661177	50 %	25 %	0 %	25 %	334144528
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31565	NC_015581	CACTT	2	10	1661674	1661683	20 %	40 %	0 %	40 %	334144528
31566	NC_015581	GTT	2	6	1661764	1661769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
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31569	NC_015581	ACC	2	6	1661848	1661853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
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31583	NC_015581	AGT	2	6	1662788	1662793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144528
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31585	NC_015581	TGG	2	6	1662843	1662848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31586	NC_015581	GAC	2	6	1662880	1662885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31587	NC_015581	CG	3	6	1662938	1662943	0 %	0 %	50 %	50 %	334144528
31588	NC_015581	TAC	2	6	1662960	1662965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31589	NC_015581	TTC	2	6	1663057	1663062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144528
31590	NC_015581	GTG	2	6	1663100	1663105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31591	NC_015581	CAT	2	6	1663146	1663151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31592	NC_015581	TCC	2	6	1663171	1663176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144528
31593	NC_015581	ACAG	2	8	1663181	1663188	50 %	0 %	25 %	25 %	334144528
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31597	NC_015581	TGC	2	6	1663498	1663503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31598	NC_015581	ATC	2	6	1663516	1663521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31599	NC_015581	GCT	2	6	1663655	1663660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31600	NC_015581	CAT	2	6	1663707	1663712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31601	NC_015581	GCC	2	6	1663750	1663755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
31602	NC_015581	CAC	2	6	1663788	1663793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31603	NC_015581	CG	3	6	1663815	1663820	0 %	0 %	50 %	50 %	334144528
31604	NC_015581	GGT	3	9	1663828	1663836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31605	NC_015581	TTG	2	6	1663856	1663861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31606	NC_015581	GAA	2	6	1663876	1663881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144528
31607	NC_015581	AATA	2	8	1663924	1663931	75 %	25 %	0 %	0 %	334144528
31608	NC_015581	TTA	2	6	1664003	1664008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144528
31609	NC_015581	TGG	2	6	1664175	1664180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31610	NC_015581	TAA	2	6	1664197	1664202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144528
31611	NC_015581	AGG	2	6	1664205	1664210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144528
31612	NC_015581	CCAG	2	8	1664230	1664237	25 %	0 %	25 %	50 %	334144528
31613	NC_015581	TGC	2	6	1664332	1664337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31614	NC_015581	TTG	2	6	1664363	1664368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31615	NC_015581	ATATC	2	10	1664558	1664567	40 %	40 %	0 %	20 %	334144528
31616	NC_015581	GCT	2	6	1664609	1664614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
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