MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_015581	CTT	2	6	1632818	1632823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144524
31002	NC_015581	ACA	2	6	1632826	1632831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144524
31003	NC_015581	A	6	6	1633008	1633013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_015581	AATGT	2	10	1633015	1633024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_015581	T	6	6	1633059	1633064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_015581	TAAA	2	8	1633089	1633096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_015581	ATA	2	6	1633139	1633144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144525
31008	NC_015581	TGA	2	6	1633164	1633169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144525
31009	NC_015581	GCC	2	6	1633171	1633176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144525
31010	NC_015581	CCAA	2	8	1633216	1633223	50 %	0 %	0 %	50 %	334144525
31011	NC_015581	CG	3	6	1633265	1633270	0 %	0 %	50 %	50 %	334144525
31012	NC_015581	TTG	2	6	1633271	1633276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144525
31013	NC_015581	CCA	2	6	1633279	1633284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144525
31014	NC_015581	CCCG	2	8	1633285	1633292	0 %	0 %	25 %	75 %	334144525
31015	NC_015581	TGG	2	6	1633300	1633305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144525
31016	NC_015581	CTC	2	6	1633394	1633399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144525
31017	NC_015581	AGAA	2	8	1633421	1633428	75 %	0 %	25 %	0 %	334144525
31018	NC_015581	A	8	8	1633436	1633443	100 %	0 %	0 %	0 %	334144525
31019	NC_015581	A	7	7	1633521	1633527	100 %	0 %	0 %	0 %	334144525
31020	NC_015581	AAC	2	6	1633532	1633537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144525
31021	NC_015581	GTG	2	6	1633555	1633560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144525
31022	NC_015581	AT	3	6	1633689	1633694	50 %	50 %	0 %	0 %	334144525
31023	NC_015581	AGA	2	6	1633905	1633910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144525
31024	NC_015581	ATG	2	6	1633939	1633944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144525
31025	NC_015581	CGG	2	6	1633997	1634002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144525
31026	NC_015581	GAA	2	6	1634020	1634025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144525
31027	NC_015581	GAA	2	6	1634053	1634058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144525
31028	NC_015581	ACA	2	6	1634139	1634144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144525
31029	NC_015581	CG	3	6	1634200	1634205	0 %	0 %	50 %	50 %	334144525
31030	NC_015581	CCA	2	6	1634275	1634280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31031	NC_015581	T	6	6	1634287	1634292	0 %	100 %	0 %	0 %	334144526
31032	NC_015581	CCA	2	6	1634378	1634383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31033	NC_015581	GGCT	2	8	1634487	1634494	0 %	25 %	50 %	25 %	334144526
31034	NC_015581	AAT	2	6	1634508	1634513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144526
31035	NC_015581	TTGG	2	8	1634546	1634553	0 %	50 %	50 %	0 %	334144526
31036	NC_015581	CAA	2	6	1634576	1634581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144526
31037	NC_015581	CGG	2	6	1634594	1634599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144526
31038	NC_015581	AAT	2	6	1634661	1634666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144526
31039	NC_015581	TGG	2	6	1634691	1634696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144526
31040	NC_015581	CG	3	6	1634735	1634740	0 %	0 %	50 %	50 %	334144526
31041	NC_015581	CAC	2	6	1634779	1634784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31042	NC_015581	CAC	2	6	1634825	1634830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31043	NC_015581	ATG	2	6	1634849	1634854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144526
31044	NC_015581	TGG	2	6	1635096	1635101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144526
31045	NC_015581	TGA	2	6	1635123	1635128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144526
31046	NC_015581	AAC	2	6	1635154	1635159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144526
31047	NC_015581	ACG	2	6	1635206	1635211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144526
31048	NC_015581	AACACC	2	12	1635219	1635230	50 %	0 %	0 %	50 %	334144526
31049	NC_015581	CGG	2	6	1635238	1635243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144526
31050	NC_015581	CTT	2	6	1635286	1635291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144526
31051	NC_015581	CAC	2	6	1635301	1635306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31052	NC_015581	GGT	2	6	1635330	1635335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144526
31053	NC_015581	CGCT	2	8	1635347	1635354	0 %	25 %	25 %	50 %	334144526
31054	NC_015581	CAC	2	6	1635431	1635436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31055	NC_015581	GC	4	8	1635454	1635461	0 %	0 %	50 %	50 %	334144526
31056	NC_015581	TAA	2	6	1635483	1635488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144526
31057	NC_015581	TTG	2	6	1635500	1635505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144526
31058	NC_015581	TTC	2	6	1635524	1635529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144526
31059	NC_015581	CCA	2	6	1635667	1635672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31060	NC_015581	GTT	2	6	1635676	1635681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144526
31061	NC_015581	CACCAA	2	12	1635734	1635745	50 %	0 %	0 %	50 %	334144526
31062	NC_015581	A	6	6	1635828	1635833	100 %	0 %	0 %	0 %	334144526
31063	NC_015581	CCG	2	6	1635868	1635873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144526
31064	NC_015581	TTC	2	6	1635881	1635886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144526
31065	NC_015581	T	6	6	1635919	1635924	0 %	100 %	0 %	0 %	334144526
31066	NC_015581	GTT	2	6	1636066	1636071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144526
31067	NC_015581	CAC	2	6	1636136	1636141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31068	NC_015581	GCC	2	6	1636188	1636193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144526
31069	NC_015581	CAC	2	6	1636196	1636201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31070	NC_015581	ATA	2	6	1636220	1636225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144526
31071	NC_015581	GCC	2	6	1636230	1636235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144526
31072	NC_015581	TCA	2	6	1636278	1636283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144526
31073	NC_015581	CAA	2	6	1636292	1636297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144526
31074	NC_015581	ACC	3	9	1636344	1636352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144526
31075	NC_015581	CCAA	2	8	1636391	1636398	50 %	0 %	0 %	50 %	334144526
31076	NC_015581	TCG	2	6	1636449	1636454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144526
31077	NC_015581	ATA	3	9	1636524	1636532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144526
31078	NC_015581	AGA	2	6	1636533	1636538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31079	NC_015581	A	6	6	1636610	1636615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31080	NC_015581	AAACC	2	10	1636624	1636633	60 %	0 %	0 %	40 %	334144527
31081	NC_015581	ACC	2	6	1636850	1636855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144527
31082	NC_015581	CAA	2	6	1636863	1636868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144527
31083	NC_015581	CAC	2	6	1636887	1636892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144527
31084	NC_015581	CGG	2	6	1636929	1636934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144527
31085	NC_015581	CTG	2	6	1636956	1636961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144527
31086	NC_015581	CAC	2	6	1636986	1636991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144527
31087	NC_015581	TGC	2	6	1637045	1637050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144527
31088	NC_015581	TTA	2	6	1637138	1637143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144527
31089	NC_015581	GCC	2	6	1637200	1637205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144527
31090	NC_015581	ATC	2	6	1637290	1637295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144527
31091	NC_015581	ATT	2	6	1637569	1637574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144527
31092	NC_015581	CAAGC	2	10	1637636	1637645	40 %	0 %	20 %	40 %	334144527
31093	NC_015581	GTG	2	6	1637687	1637692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144527
31094	NC_015581	AAT	2	6	1637785	1637790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144527
31095	NC_015581	CGGT	2	8	1637840	1637847	0 %	25 %	50 %	25 %	334144527
31096	NC_015581	TAT	2	6	1637862	1637867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144527
31097	NC_015581	TGC	2	6	1637876	1637881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144527
31098	NC_015581	TTA	2	6	1637919	1637924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144527
31099	NC_015581	ACA	2	6	1637925	1637930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144527
31100	NC_015581	ACCAA	2	10	1638116	1638125	60 %	0 %	0 %	40 %	334144527
31101	NC_015581	ACC	2	6	1638286	1638291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144527
31102	NC_015581	TCA	2	6	1638330	1638335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144527
31103	NC_015581	GTT	2	6	1638381	1638386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144528
31104	NC_015581	ACC	2	6	1638392	1638397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31105	NC_015581	GGC	3	9	1638433	1638441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144528
31106	NC_015581	TAA	2	6	1638448	1638453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144528
31107	NC_015581	ATT	2	6	1638455	1638460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144528
31108	NC_015581	CTA	2	6	1638495	1638500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31109	NC_015581	ACT	2	6	1638589	1638594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31110	NC_015581	GGT	2	6	1638617	1638622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144528
31111	NC_015581	CAA	2	6	1638681	1638686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144528
31112	NC_015581	CAA	2	6	1638717	1638722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144528
31113	NC_015581	CAC	2	6	1638825	1638830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31114	NC_015581	GGCA	2	8	1638847	1638854	25 %	0 %	50 %	25 %	334144528
31115	NC_015581	TCG	2	6	1638917	1638922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31116	NC_015581	ATTT	2	8	1639083	1639090	25 %	75 %	0 %	0 %	334144528
31117	NC_015581	TCA	2	6	1639139	1639144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31118	NC_015581	AAT	2	6	1639393	1639398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144528
31119	NC_015581	TCA	2	6	1639406	1639411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31120	NC_015581	GAG	2	6	1639445	1639450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144528
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31220	NC_015581	GCTG	2	8	1644127	1644134	0 %	25 %	50 %	25 %	334144528
31221	NC_015581	CAC	2	6	1644219	1644224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
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31224	NC_015581	CGT	2	6	1644354	1644359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31225	NC_015581	GCC	2	6	1644415	1644420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144528
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31229	NC_015581	ACC	2	6	1644668	1644673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144528
31230	NC_015581	CCAC	2	8	1644833	1644840	25 %	0 %	0 %	75 %	334144528
31231	NC_015581	AC	3	6	1644957	1644962	50 %	0 %	0 %	50 %	334144528
31232	NC_015581	CAT	2	6	1644990	1644995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144528
31233	NC_015581	TAT	2	6	1645230	1645235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144528
31234	NC_015581	CTACG	2	10	1645326	1645335	20 %	20 %	20 %	40 %	334144528
31235	NC_015581	ATG	3	9	1645349	1645357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144528
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31466	NC_015581	GTC	2	6	1656686	1656691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144528
31467	NC_015581	GCA	2	6	1656704	1656709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144528
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31492	NC_015581	GCTT	2	8	1657958	1657965	0 %	50 %	25 %	25 %	334144528
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