MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_015581	GAC	2	6	1606495	1606500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144503
30503	NC_015581	ATT	2	6	1606604	1606609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144504
30504	NC_015581	GTT	2	6	1606673	1606678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144504
30505	NC_015581	AAC	2	6	1606701	1606706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30506	NC_015581	CTG	2	6	1606740	1606745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144504
30507	NC_015581	ACA	2	6	1606750	1606755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30508	NC_015581	ACA	2	6	1606776	1606781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30509	NC_015581	AAC	2	6	1606785	1606790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30510	NC_015581	CAA	2	6	1606826	1606831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30511	NC_015581	TGT	2	6	1606840	1606845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144504
30512	NC_015581	TCA	2	6	1606889	1606894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144504
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30515	NC_015581	CTCAA	2	10	1607059	1607068	40 %	20 %	0 %	40 %	334144504
30516	NC_015581	CAA	2	6	1607099	1607104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144504
30517	NC_015581	AAT	2	6	1607166	1607171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144504
30518	NC_015581	GGA	2	6	1607176	1607181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144504
30519	NC_015581	AAT	2	6	1607195	1607200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144504
30520	NC_015581	AAT	2	6	1607232	1607237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144504
30521	NC_015581	TTC	2	6	1607274	1607279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144504
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30524	NC_015581	GAAA	2	8	1607327	1607334	75 %	0 %	25 %	0 %	334144504
30525	NC_015581	AATAT	2	10	1607361	1607370	60 %	40 %	0 %	0 %	334144504
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30528	NC_015581	TAA	2	6	1607441	1607446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144504
30529	NC_015581	AT	3	6	1607474	1607479	50 %	50 %	0 %	0 %	334144504
30530	NC_015581	CAAGG	2	10	1607482	1607491	40 %	0 %	40 %	20 %	334144504
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30532	NC_015581	A	6	6	1607577	1607582	100 %	0 %	0 %	0 %	334144504
30533	NC_015581	AACCA	2	10	1607598	1607607	60 %	0 %	0 %	40 %	334144504
30534	NC_015581	ACC	2	6	1607758	1607763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144504
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30538	NC_015581	A	6	6	1607962	1607967	100 %	0 %	0 %	0 %	334144504
30539	NC_015581	CCA	2	6	1607991	1607996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144504
30540	NC_015581	TC	3	6	1608014	1608019	0 %	50 %	0 %	50 %	334144504
30541	NC_015581	GCA	2	6	1608028	1608033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144504
30542	NC_015581	CAAC	2	8	1608116	1608123	50 %	0 %	0 %	50 %	334144504
30543	NC_015581	AAG	2	6	1608151	1608156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144504
30544	NC_015581	AAC	2	6	1608228	1608233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30545	NC_015581	ATA	2	6	1608343	1608348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30546	NC_015581	AAATA	2	10	1608384	1608393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30547	NC_015581	AT	3	6	1608394	1608399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30548	NC_015581	CTAC	2	8	1608425	1608432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30549	NC_015581	ATT	2	6	1608455	1608460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30550	NC_015581	TCATT	2	10	1608468	1608477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30551	NC_015581	TGAT	2	8	1608504	1608511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_015581	TTA	2	6	1608518	1608523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30553	NC_015581	TAT	2	6	1608536	1608541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_015581	GGC	2	6	1608562	1608567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30555	NC_015581	TTG	2	6	1608570	1608575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30556	NC_015581	GAT	2	6	1608621	1608626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30557	NC_015581	T	6	6	1608764	1608769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30558	NC_015581	TGGCGA	2	12	1608806	1608817	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30559	NC_015581	TGTCGA	2	12	1608818	1608829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30560	NC_015581	CAA	2	6	1608888	1608893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30561	NC_015581	AG	3	6	1608908	1608913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30562	NC_015581	TGAT	2	8	1609004	1609011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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30565	NC_015581	TTA	2	6	1609101	1609106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30568	NC_015581	ATC	2	6	1609341	1609346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30569	NC_015581	AG	4	8	1609348	1609355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30570	NC_015581	TTG	2	6	1609406	1609411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144505
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30572	NC_015581	TGA	2	6	1609440	1609445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144505
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30602	NC_015581	TAA	2	6	1611204	1611209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144507
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30604	NC_015581	CCG	2	6	1611297	1611302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144507
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30608	NC_015581	CGC	2	6	1611454	1611459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144507
30609	NC_015581	A	6	6	1611481	1611486	100 %	0 %	0 %	0 %	334144507
30610	NC_015581	GCC	2	6	1611523	1611528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144507
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30613	NC_015581	T	7	7	1611599	1611605	0 %	100 %	0 %	0 %	334144507
30614	NC_015581	GCAT	2	8	1611683	1611690	25 %	25 %	25 %	25 %	334144507
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30616	NC_015581	CA	3	6	1611820	1611825	50 %	0 %	0 %	50 %	334144507
30617	NC_015581	GTT	2	6	1611915	1611920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144507
30618	NC_015581	TCAC	2	8	1611932	1611939	25 %	25 %	0 %	50 %	334144507
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30975	NC_015581	CGT	2	6	1631454	1631459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144523
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