MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_015581	CGA	2	6	1581815	1581820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144482
30002	NC_015581	GC	3	6	1581993	1581998	0 %	0 %	50 %	50 %	334144482
30003	NC_015581	A	6	6	1582039	1582044	100 %	0 %	0 %	0 %	334144482
30004	NC_015581	CGC	2	6	1582048	1582053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144482
30005	NC_015581	GACC	2	8	1582109	1582116	25 %	0 %	25 %	50 %	334144482
30006	NC_015581	TGG	2	6	1582263	1582268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144482
30007	NC_015581	GAC	2	6	1582293	1582298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144482
30008	NC_015581	TGA	2	6	1582322	1582327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144482
30009	NC_015581	CCGT	2	8	1582361	1582368	0 %	25 %	25 %	50 %	334144482
30010	NC_015581	ATT	2	6	1582503	1582508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144482
30011	NC_015581	TTC	2	6	1582509	1582514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144482
30012	NC_015581	GAT	2	6	1582526	1582531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144482
30013	NC_015581	ATG	2	6	1582533	1582538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144482
30014	NC_015581	CGATC	2	10	1582643	1582652	20 %	20 %	20 %	40 %	334144482
30015	NC_015581	ATG	2	6	1582707	1582712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144482
30016	NC_015581	CGA	2	6	1582943	1582948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144482
30017	NC_015581	GTG	2	6	1583019	1583024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144482
30018	NC_015581	GCC	2	6	1583055	1583060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144482
30019	NC_015581	GAAT	2	8	1583084	1583091	50 %	25 %	25 %	0 %	334144482
30020	NC_015581	AGCCA	2	10	1583114	1583123	40 %	0 %	20 %	40 %	334144482
30021	NC_015581	TAAA	2	8	1583128	1583135	75 %	25 %	0 %	0 %	334144482
30022	NC_015581	GCC	2	6	1583148	1583153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144482
30023	NC_015581	GAA	2	6	1583235	1583240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144482
30024	NC_015581	TAT	2	6	1583369	1583374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144482
30025	NC_015581	CGT	2	6	1583382	1583387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144482
30026	NC_015581	TTCG	2	8	1583389	1583396	0 %	50 %	25 %	25 %	334144482
30027	NC_015581	TGA	2	6	1583491	1583496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144482
30028	NC_015581	TGGC	2	8	1583596	1583603	0 %	25 %	50 %	25 %	334144482
30029	NC_015581	TGAT	2	8	1583605	1583612	25 %	50 %	25 %	0 %	334144482
30030	NC_015581	AAG	2	6	1583614	1583619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144482
30031	NC_015581	TCGC	2	8	1583707	1583714	0 %	25 %	25 %	50 %	334144482
30032	NC_015581	GC	3	6	1583713	1583718	0 %	0 %	50 %	50 %	334144482
30033	NC_015581	GTC	2	6	1583727	1583732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144482
30034	NC_015581	CAA	2	6	1583787	1583792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144482
30035	NC_015581	CGC	2	6	1583818	1583823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144483
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30040	NC_015581	C	6	6	1583990	1583995	0 %	0 %	0 %	100 %	334144483
30041	NC_015581	TAA	2	6	1584045	1584050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144483
30042	NC_015581	TCA	2	6	1584072	1584077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144483
30043	NC_015581	TTCAA	2	10	1584081	1584090	40 %	40 %	0 %	20 %	334144483
30044	NC_015581	AAC	2	6	1584182	1584187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144483
30045	NC_015581	CGT	2	6	1584253	1584258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144483
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30049	NC_015581	GT	3	6	1584497	1584502	0 %	50 %	50 %	0 %	334144483
30050	NC_015581	A	6	6	1584534	1584539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30051	NC_015581	TTA	2	6	1584565	1584570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_015581	CAG	2	6	1584629	1584634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144484
30053	NC_015581	CAT	2	6	1584659	1584664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144484
30054	NC_015581	AAT	2	6	1584666	1584671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144484
30055	NC_015581	TCG	2	6	1584674	1584679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144484
30056	NC_015581	CAT	2	6	1584773	1584778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144484
30057	NC_015581	ACACC	2	10	1584804	1584813	40 %	0 %	0 %	60 %	334144484
30058	NC_015581	CAAT	2	8	1584934	1584941	50 %	25 %	0 %	25 %	334144484
30059	NC_015581	ATC	2	6	1584994	1584999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144484
30060	NC_015581	TGCT	2	8	1585035	1585042	0 %	50 %	25 %	25 %	334144484
30061	NC_015581	ATTA	2	8	1585080	1585087	50 %	50 %	0 %	0 %	334144484
30062	NC_015581	CCG	2	6	1585187	1585192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144484
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30065	NC_015581	ATAA	2	8	1585315	1585322	75 %	25 %	0 %	0 %	334144484
30066	NC_015581	CG	3	6	1585342	1585347	0 %	0 %	50 %	50 %	334144485
30067	NC_015581	GAT	2	6	1585348	1585353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144485
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30070	NC_015581	CCGA	2	8	1585583	1585590	25 %	0 %	25 %	50 %	334144485
30071	NC_015581	TCA	2	6	1585608	1585613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144485
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30074	NC_015581	GCCA	2	8	1585665	1585672	25 %	0 %	25 %	50 %	334144485
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30087	NC_015581	CTT	2	6	1586074	1586079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144485
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30089	NC_015581	CTG	2	6	1586162	1586167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144485
30090	NC_015581	A	6	6	1586271	1586276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_015581	A	6	6	1586317	1586322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30092	NC_015581	ACC	2	6	1586361	1586366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30093	NC_015581	CTT	2	6	1586374	1586379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30094	NC_015581	CAA	2	6	1586401	1586406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144486
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30099	NC_015581	ATC	2	6	1586567	1586572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144486
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30101	NC_015581	GCAC	2	8	1586621	1586628	25 %	0 %	25 %	50 %	334144486
30102	NC_015581	AAAGT	2	10	1586684	1586693	60 %	20 %	20 %	0 %	334144486
30103	NC_015581	CAA	2	6	1586701	1586706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144486
30104	NC_015581	CAA	2	6	1586718	1586723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144486
30105	NC_015581	ATC	2	6	1586804	1586809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144486
30106	NC_015581	ATGA	2	8	1586846	1586853	50 %	25 %	25 %	0 %	334144486
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30110	NC_015581	CCGT	2	8	1587255	1587262	0 %	25 %	25 %	50 %	334144486
30111	NC_015581	CAC	2	6	1587280	1587285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144486
30112	NC_015581	GCA	2	6	1587354	1587359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144486
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30118	NC_015581	AATC	2	8	1587765	1587772	50 %	25 %	0 %	25 %	334144486
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30133	NC_015581	GTTG	2	8	1588345	1588352	0 %	50 %	50 %	0 %	334144486
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30181	NC_015581	GC	4	8	1590943	1590950	0 %	0 %	50 %	50 %	334144488
30182	NC_015581	GC	3	6	1591014	1591019	0 %	0 %	50 %	50 %	334144488
30183	NC_015581	CGG	2	6	1591052	1591057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144488
30184	NC_015581	TTC	2	6	1591158	1591163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144488
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30187	NC_015581	CAT	2	6	1591299	1591304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144488
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30202	NC_015581	TGC	2	6	1591765	1591770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144488
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30209	NC_015581	AT	3	6	1592299	1592304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30210	NC_015581	AAT	2	6	1592329	1592334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30211	NC_015581	CAA	2	6	1592352	1592357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144489
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30216	NC_015581	CCG	2	6	1592633	1592638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144489
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30218	NC_015581	CGC	2	6	1592706	1592711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144489
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30220	NC_015581	T	6	6	1592793	1592798	0 %	100 %	0 %	0 %	334144489
30221	NC_015581	TAT	2	6	1592817	1592822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144489
30222	NC_015581	TAC	2	6	1592826	1592831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144489
30223	NC_015581	GGATGC	2	12	1592843	1592854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334144489
30224	NC_015581	AAT	2	6	1592915	1592920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144489
30225	NC_015581	ACT	2	6	1592993	1592998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30226	NC_015581	ACT	2	6	1593009	1593014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30227	NC_015581	TCG	2	6	1593030	1593035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144490
30228	NC_015581	TGA	2	6	1593045	1593050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144490
30229	NC_015581	TGG	2	6	1593152	1593157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144490
30230	NC_015581	TTG	2	6	1593212	1593217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144490
30231	NC_015581	GGTC	2	8	1593228	1593235	0 %	25 %	50 %	25 %	334144490
30232	NC_015581	CAA	2	6	1593265	1593270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144490
30233	NC_015581	CATT	2	8	1593273	1593280	25 %	50 %	0 %	25 %	334144490
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