MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_015581	TTGC	2	8	1529636	1529643	0 %	50 %	25 %	25 %	334144433
29003	NC_015581	TAA	2	6	1529672	1529677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144433
29004	NC_015581	CATG	2	8	1529702	1529709	25 %	25 %	25 %	25 %	334144433
29005	NC_015581	ATG	2	6	1529728	1529733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144433
29006	NC_015581	GTGCCG	2	12	1529762	1529773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334144433
29007	NC_015581	TAA	2	6	1529780	1529785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144433
29008	NC_015581	TGA	2	6	1529833	1529838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144433
29009	NC_015581	ATT	2	6	1529913	1529918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144433
29010	NC_015581	GGT	2	6	1529985	1529990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144433
29011	NC_015581	CTA	2	6	1530014	1530019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144433
29012	NC_015581	GTA	2	6	1530076	1530081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144433
29013	NC_015581	CGCTTG	2	12	1530273	1530284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144433
29014	NC_015581	GTA	2	6	1530296	1530301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144433
29015	NC_015581	AATG	2	8	1530346	1530353	50 %	25 %	25 %	0 %	334144433
29016	NC_015581	CATGGT	2	12	1530372	1530383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334144433
29017	NC_015581	TTG	2	6	1530401	1530406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144434
29018	NC_015581	TGT	2	6	1530443	1530448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144434
29019	NC_015581	AAT	2	6	1530590	1530595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144434
29020	NC_015581	GGC	3	9	1530659	1530667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144434
29021	NC_015581	CAC	3	9	1530700	1530708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144434
29022	NC_015581	ACC	2	6	1530717	1530722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144434
29023	NC_015581	GTT	2	6	1530768	1530773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144434
29024	NC_015581	ATTC	2	8	1530905	1530912	25 %	50 %	0 %	25 %	334144434
29025	NC_015581	TTG	2	6	1531040	1531045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144434
29026	NC_015581	GCC	2	6	1531089	1531094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144434
29027	NC_015581	GCG	2	6	1531128	1531133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144434
29028	NC_015581	CGT	2	6	1531144	1531149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29029	NC_015581	TGC	2	6	1531151	1531156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29030	NC_015581	CAG	2	6	1531215	1531220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29031	NC_015581	A	6	6	1531247	1531252	100 %	0 %	0 %	0 %	334144434
29032	NC_015581	TGA	2	6	1531266	1531271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144434
29033	NC_015581	TTGCT	2	10	1531412	1531421	0 %	60 %	20 %	20 %	334144434
29034	NC_015581	AACGC	2	10	1531515	1531524	40 %	0 %	20 %	40 %	334144434
29035	NC_015581	TCG	2	6	1531564	1531569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29036	NC_015581	AATTA	2	10	1531598	1531607	60 %	40 %	0 %	0 %	334144434
29037	NC_015581	CTG	2	6	1531693	1531698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29038	NC_015581	AC	3	6	1531804	1531809	50 %	0 %	0 %	50 %	334144434
29039	NC_015581	A	6	6	1531901	1531906	100 %	0 %	0 %	0 %	334144434
29040	NC_015581	CGA	2	6	1531949	1531954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144434
29041	NC_015581	TCA	2	6	1532019	1532024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144435
29042	NC_015581	GCC	2	6	1532053	1532058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144435
29043	NC_015581	TCA	2	6	1532081	1532086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144435
29044	NC_015581	GCC	2	6	1532245	1532250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144435
29045	NC_015581	CAT	2	6	1532269	1532274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144435
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29050	NC_015581	CAC	2	6	1532896	1532901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144435
29051	NC_015581	CCA	2	6	1532909	1532914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144435
29052	NC_015581	CAT	2	6	1532937	1532942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144435
29053	NC_015581	GAT	2	6	1533032	1533037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144435
29054	NC_015581	ACC	2	6	1533038	1533043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144435
29055	NC_015581	ATC	2	6	1533133	1533138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144435
29056	NC_015581	ACG	2	6	1533190	1533195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144435
29057	NC_015581	CGA	2	6	1533328	1533333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144435
29058	NC_015581	AAT	2	6	1533361	1533366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144435
29059	NC_015581	AGCA	2	8	1533436	1533443	50 %	0 %	25 %	25 %	334144435
29060	NC_015581	ATT	2	6	1533448	1533453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144435
29061	NC_015581	GTG	2	6	1533474	1533479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144435
29062	NC_015581	CAT	2	6	1533750	1533755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144436
29063	NC_015581	GCA	2	6	1533836	1533841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144436
29064	NC_015581	CCCA	2	8	1533897	1533904	25 %	0 %	0 %	75 %	334144436
29065	NC_015581	ACC	2	6	1533954	1533959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29066	NC_015581	A	6	6	1533987	1533992	100 %	0 %	0 %	0 %	334144437
29067	NC_015581	GCTG	2	8	1534059	1534066	0 %	25 %	50 %	25 %	334144437
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29069	NC_015581	TTTC	2	8	1534177	1534184	0 %	75 %	0 %	25 %	334144437
29070	NC_015581	GC	3	6	1534185	1534190	0 %	0 %	50 %	50 %	334144437
29071	NC_015581	TCT	2	6	1534296	1534301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144437
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29074	NC_015581	CAT	2	6	1534453	1534458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144437
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29076	NC_015581	CAT	2	6	1534532	1534537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144437
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29078	NC_015581	TAAT	2	8	1534723	1534730	50 %	50 %	0 %	0 %	334144437
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29087	NC_015581	A	6	6	1535073	1535078	100 %	0 %	0 %	0 %	334144437
29088	NC_015581	TAC	2	6	1535122	1535127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144437
29089	NC_015581	CCA	2	6	1535130	1535135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144437
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29091	NC_015581	TAA	2	6	1535247	1535252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29092	NC_015581	GAT	2	6	1535260	1535265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144438
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29097	NC_015581	T	7	7	1535610	1535616	0 %	100 %	0 %	0 %	334144438
29098	NC_015581	CAT	2	6	1535678	1535683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144438
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29100	NC_015581	TCCA	2	8	1535914	1535921	25 %	25 %	0 %	50 %	334144438
29101	NC_015581	CCA	2	6	1536038	1536043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144438
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29104	NC_015581	TTA	2	6	1536297	1536302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144439
29105	NC_015581	CAA	2	6	1536311	1536316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144439
29106	NC_015581	AAC	2	6	1536363	1536368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144439
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29108	NC_015581	TTG	2	6	1536532	1536537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144439
29109	NC_015581	CGCA	2	8	1536553	1536560	25 %	0 %	25 %	50 %	334144439
29110	NC_015581	GATT	2	8	1536616	1536623	25 %	50 %	25 %	0 %	334144439
29111	NC_015581	A	6	6	1536638	1536643	100 %	0 %	0 %	0 %	334144439
29112	NC_015581	TTA	2	6	1536750	1536755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29113	NC_015581	GTA	2	6	1536775	1536780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29114	NC_015581	AG	3	6	1536795	1536800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29115	NC_015581	A	7	7	1536853	1536859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29116	NC_015581	ATAA	2	8	1536868	1536875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29117	NC_015581	ACTGGC	2	12	1536901	1536912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29118	NC_015581	AAAG	2	8	1536918	1536925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29119	NC_015581	TCAT	2	8	1537058	1537065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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29234	NC_015581	GGC	2	6	1542591	1542596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144444
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