MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015581	ATG	2	6	1503191	1503196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144408
28503	NC_015581	CG	3	6	1503415	1503420	0 %	0 %	50 %	50 %	334144408
28504	NC_015581	GGT	2	6	1503481	1503486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144408
28505	NC_015581	AGGT	2	8	1503554	1503561	25 %	25 %	50 %	0 %	334144408
28506	NC_015581	CAT	2	6	1503568	1503573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144408
28507	NC_015581	AT	4	8	1503584	1503591	50 %	50 %	0 %	0 %	334144408
28508	NC_015581	AACAA	2	10	1503593	1503602	80 %	0 %	0 %	20 %	334144408
28509	NC_015581	ATT	2	6	1503638	1503643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144408
28510	NC_015581	TTC	2	6	1503765	1503770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144409
28511	NC_015581	TGA	2	6	1503775	1503780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144409
28512	NC_015581	A	7	7	1503866	1503872	100 %	0 %	0 %	0 %	334144409
28513	NC_015581	T	6	6	1503907	1503912	0 %	100 %	0 %	0 %	334144409
28514	NC_015581	ACT	2	6	1504015	1504020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144409
28515	NC_015581	CAT	2	6	1504045	1504050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144409
28516	NC_015581	AAG	2	6	1504125	1504130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144409
28517	NC_015581	CCT	2	6	1504155	1504160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144409
28518	NC_015581	TCCA	2	8	1504248	1504255	25 %	25 %	0 %	50 %	334144409
28519	NC_015581	GGT	2	6	1504256	1504261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144409
28520	NC_015581	TTG	2	6	1504323	1504328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144409
28521	NC_015581	ATT	2	6	1504412	1504417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144409
28522	NC_015581	CGC	3	9	1504453	1504461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144409
28523	NC_015581	A	6	6	1504472	1504477	100 %	0 %	0 %	0 %	334144409
28524	NC_015581	AGA	2	6	1504540	1504545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144409
28525	NC_015581	TGA	2	6	1504548	1504553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144409
28526	NC_015581	CTC	2	6	1504574	1504579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144409
28527	NC_015581	GCC	2	6	1504640	1504645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144410
28528	NC_015581	CAG	2	6	1504659	1504664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144410
28529	NC_015581	TTG	2	6	1504726	1504731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144410
28530	NC_015581	GGC	2	6	1504736	1504741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144410
28531	NC_015581	GGC	2	6	1504744	1504749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144410
28532	NC_015581	CTG	2	6	1504802	1504807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144410
28533	NC_015581	TCGG	2	8	1504872	1504879	0 %	25 %	50 %	25 %	334144410
28534	NC_015581	CAA	2	6	1504920	1504925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144410
28535	NC_015581	CAA	2	6	1505045	1505050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144410
28536	NC_015581	CAA	3	9	1505130	1505138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144410
28537	NC_015581	CAG	2	6	1505358	1505363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144410
28538	NC_015581	TTTG	2	8	1505406	1505413	0 %	75 %	25 %	0 %	334144410
28539	NC_015581	GCC	2	6	1505418	1505423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144410
28540	NC_015581	GAA	2	6	1505439	1505444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144410
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28542	NC_015581	TCC	2	6	1505606	1505611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144410
28543	NC_015581	ATCT	2	8	1505622	1505629	25 %	50 %	0 %	25 %	334144410
28544	NC_015581	GCG	2	6	1505676	1505681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144410
28545	NC_015581	GGC	2	6	1505709	1505714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144410
28546	NC_015581	ATA	2	6	1505716	1505721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144410
28547	NC_015581	CGC	2	6	1505732	1505737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144410
28548	NC_015581	TAT	2	6	1505752	1505757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144410
28549	NC_015581	ACCTC	2	10	1505776	1505785	20 %	20 %	0 %	60 %	334144410
28550	NC_015581	CAA	2	6	1505883	1505888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144410
28551	NC_015581	CAA	2	6	1505901	1505906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144410
28552	NC_015581	T	6	6	1505969	1505974	0 %	100 %	0 %	0 %	334144410
28553	NC_015581	AATA	2	8	1505999	1506006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28554	NC_015581	TAT	2	6	1506022	1506027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28555	NC_015581	CAA	2	6	1506139	1506144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144411
28556	NC_015581	ACAA	2	8	1506172	1506179	75 %	0 %	0 %	25 %	334144411
28557	NC_015581	AAC	2	6	1506205	1506210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144411
28558	NC_015581	CAA	2	6	1506225	1506230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144411
28559	NC_015581	CAA	3	9	1506320	1506328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144411
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28561	NC_015581	TATT	2	8	1506589	1506596	25 %	75 %	0 %	0 %	334144411
28562	NC_015581	TGA	2	6	1506605	1506610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144411
28563	NC_015581	GCA	2	6	1506656	1506661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144411
28564	NC_015581	CAGA	2	8	1506664	1506671	50 %	0 %	25 %	25 %	334144411
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28568	NC_015581	GGCG	2	8	1506880	1506887	0 %	0 %	75 %	25 %	334144411
28569	NC_015581	TAT	2	6	1506889	1506894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144411
28570	NC_015581	A	7	7	1506899	1506905	100 %	0 %	0 %	0 %	334144411
28571	NC_015581	G	6	6	1506923	1506928	0 %	0 %	100 %	0 %	334144412
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28574	NC_015581	TACC	2	8	1507094	1507101	25 %	25 %	0 %	50 %	334144412
28575	NC_015581	TAT	2	6	1507232	1507237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144412
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28583	NC_015581	GAAC	2	8	1507669	1507676	50 %	0 %	25 %	25 %	334144412
28584	NC_015581	CAA	2	6	1507712	1507717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144412
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28586	NC_015581	ACTT	2	8	1507779	1507786	25 %	50 %	0 %	25 %	334144412
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28589	NC_015581	TGC	2	6	1507915	1507920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144413
28590	NC_015581	ACC	2	6	1507981	1507986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144413
28591	NC_015581	CAG	2	6	1508004	1508009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144413
28592	NC_015581	TGCCC	2	10	1508017	1508026	0 %	20 %	20 %	60 %	334144413
28593	NC_015581	TCAACT	2	12	1508075	1508086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144413
28594	NC_015581	CAGC	2	8	1508165	1508172	25 %	0 %	25 %	50 %	334144413
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28596	NC_015581	CCAA	2	8	1508262	1508269	50 %	0 %	0 %	50 %	334144413
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28599	NC_015581	TGGC	2	8	1508340	1508347	0 %	25 %	50 %	25 %	334144413
28600	NC_015581	GCT	2	6	1508355	1508360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144413
28601	NC_015581	GC	3	6	1508388	1508393	0 %	0 %	50 %	50 %	334144413
28602	NC_015581	A	6	6	1508434	1508439	100 %	0 %	0 %	0 %	334144413
28603	NC_015581	GCG	2	6	1508484	1508489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144413
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28607	NC_015581	AGC	3	9	1508637	1508645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144414
28608	NC_015581	CAT	2	6	1508763	1508768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144414
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28613	NC_015581	CCA	2	6	1509050	1509055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144414
28614	NC_015581	GGT	2	6	1509319	1509324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144414
28615	NC_015581	CA	3	6	1509376	1509381	50 %	0 %	0 %	50 %	334144414
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28617	NC_015581	CTA	2	6	1509482	1509487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144414
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