MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_015581	A	6	6	1450956	1450961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_015581	TCT	2	6	1450998	1451003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27504	NC_015581	GCATC	2	10	1451022	1451031	20 %	20 %	20 %	40 %	334144361
27505	NC_015581	GTT	2	6	1451037	1451042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144361
27506	NC_015581	CAA	2	6	1451074	1451079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144361
27507	NC_015581	ATC	2	6	1451084	1451089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144361
27508	NC_015581	CTT	2	6	1451115	1451120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144361
27509	NC_015581	TCAA	2	8	1451123	1451130	50 %	25 %	0 %	25 %	334144361
27510	NC_015581	CTT	2	6	1451139	1451144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144361
27511	NC_015581	CAAA	2	8	1451262	1451269	75 %	0 %	0 %	25 %	334144361
27512	NC_015581	AGA	2	6	1451296	1451301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144361
27513	NC_015581	TG	3	6	1451320	1451325	0 %	50 %	50 %	0 %	334144361
27514	NC_015581	TG	3	6	1451328	1451333	0 %	50 %	50 %	0 %	334144361
27515	NC_015581	TCA	2	6	1451352	1451357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144361
27516	NC_015581	CCAT	2	8	1451382	1451389	25 %	25 %	0 %	50 %	334144361
27517	NC_015581	ATC	2	6	1451400	1451405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27518	NC_015581	TAA	2	6	1451414	1451419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27519	NC_015581	A	7	7	1451448	1451454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27520	NC_015581	TCA	2	6	1451625	1451630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144362
27521	NC_015581	TCAC	2	8	1451693	1451700	25 %	25 %	0 %	50 %	334144362
27522	NC_015581	TTTCA	2	10	1451797	1451806	20 %	60 %	0 %	20 %	334144362
27523	NC_015581	TTAT	2	8	1451836	1451843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27524	NC_015581	CT	3	6	1451859	1451864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27525	NC_015581	CCG	2	6	1451953	1451958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144363
27526	NC_015581	ATT	2	6	1451978	1451983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144363
27527	NC_015581	TGA	2	6	1451993	1451998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144363
27528	NC_015581	GTG	2	6	1452028	1452033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144363
27529	NC_015581	GCG	2	6	1452040	1452045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144363
27530	NC_015581	AATT	2	8	1452079	1452086	50 %	50 %	0 %	0 %	334144363
27531	NC_015581	CGAACC	2	12	1452101	1452112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334144363
27532	NC_015581	AAC	2	6	1452172	1452177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144363
27533	NC_015581	ATT	2	6	1452235	1452240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27534	NC_015581	CTG	2	6	1452263	1452268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27535	NC_015581	TTA	2	6	1452280	1452285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27536	NC_015581	CAG	2	6	1452385	1452390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27537	NC_015581	CAA	2	6	1452406	1452411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27538	NC_015581	ATT	2	6	1452419	1452424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27539	NC_015581	TCA	2	6	1452428	1452433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27540	NC_015581	GGCCC	2	10	1452448	1452457	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27541	NC_015581	CA	3	6	1452464	1452469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27542	NC_015581	T	7	7	1452475	1452481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27543	NC_015581	GGT	2	6	1452510	1452515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27544	NC_015581	CTG	2	6	1452552	1452557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27545	NC_015581	TTA	2	6	1452572	1452577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27546	NC_015581	ATT	2	6	1452612	1452617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27547	NC_015581	AGT	2	6	1452621	1452626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27548	NC_015581	GCCCTC	2	12	1452639	1452650	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27549	NC_015581	ACC	2	6	1452691	1452696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27550	NC_015581	TGC	2	6	1452778	1452783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27551	NC_015581	ATT	2	6	1452786	1452791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27552	NC_015581	GC	3	6	1452793	1452798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27553	NC_015581	CGA	2	6	1452888	1452893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27554	NC_015581	CTATGC	2	12	1452906	1452917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27555	NC_015581	AC	3	6	1452970	1452975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27556	NC_015581	TGG	2	6	1452992	1452997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27557	NC_015581	TGA	2	6	1453004	1453009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27558	NC_015581	GTT	2	6	1453062	1453067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27559	NC_015581	CAG	2	6	1453069	1453074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27560	NC_015581	TGG	2	6	1453078	1453083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27561	NC_015581	TAT	2	6	1453109	1453114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27562	NC_015581	ACT	2	6	1453149	1453154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27563	NC_015581	ATT	2	6	1453188	1453193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27564	NC_015581	ACA	2	6	1453322	1453327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27565	NC_015581	TGCC	2	8	1453354	1453361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27566	NC_015581	ACC	2	6	1453438	1453443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27567	NC_015581	GTG	2	6	1453489	1453494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27568	NC_015581	TGA	2	6	1453511	1453516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27569	NC_015581	TGA	2	6	1453559	1453564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27570	NC_015581	GCA	2	6	1453620	1453625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27571	NC_015581	T	6	6	1453636	1453641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27572	NC_015581	TGTGA	2	10	1453684	1453693	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27573	NC_015581	CCA	2	6	1453721	1453726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27574	NC_015581	CAG	2	6	1453751	1453756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27575	NC_015581	ATC	2	6	1453854	1453859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27576	NC_015581	ACC	2	6	1453890	1453895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27577	NC_015581	CT	3	6	1453913	1453918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27578	NC_015581	AAT	2	6	1453992	1453997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27579	NC_015581	AAT	2	6	1454040	1454045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27580	NC_015581	CGA	2	6	1454050	1454055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27581	NC_015581	ACG	2	6	1454061	1454066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27582	NC_015581	AAT	2	6	1454161	1454166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27583	NC_015581	AAC	2	6	1454252	1454257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27584	NC_015581	A	8	8	1454296	1454303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27585	NC_015581	ATA	2	6	1454319	1454324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27586	NC_015581	TTG	2	6	1454397	1454402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27587	NC_015581	AAC	2	6	1454519	1454524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144364
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27589	NC_015581	T	6	6	1454560	1454565	0 %	100 %	0 %	0 %	334144364
27590	NC_015581	A	6	6	1454761	1454766	100 %	0 %	0 %	0 %	334144364
27591	NC_015581	CTTT	2	8	1454807	1454814	0 %	75 %	0 %	25 %	334144364
27592	NC_015581	GTC	2	6	1454901	1454906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144364
27593	NC_015581	GGC	2	6	1454932	1454937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144364
27594	NC_015581	GGC	2	6	1454965	1454970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144364
27595	NC_015581	AAG	2	6	1455311	1455316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144364
27596	NC_015581	GGT	2	6	1455331	1455336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144364
27597	NC_015581	GTC	2	6	1455494	1455499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144364
27598	NC_015581	GCA	2	6	1455550	1455555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144364
27599	NC_015581	CAA	2	6	1455585	1455590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144364
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27602	NC_015581	ACC	2	6	1455633	1455638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144364
27603	NC_015581	AGA	3	9	1455639	1455647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144364
27604	NC_015581	AGA	2	6	1455678	1455683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144364
27605	NC_015581	GGT	2	6	1455727	1455732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144364
27606	NC_015581	TGA	2	6	1455741	1455746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144364
27607	NC_015581	CAA	2	6	1455800	1455805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144364
27608	NC_015581	CTT	2	6	1455836	1455841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144364
27609	NC_015581	A	7	7	1455884	1455890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27610	NC_015581	T	6	6	1455907	1455912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27611	NC_015581	TTAGTT	2	12	1455914	1455925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27612	NC_015581	CCA	2	6	1455943	1455948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27613	NC_015581	TAT	2	6	1455951	1455956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27614	NC_015581	TAA	2	6	1456016	1456021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144365
27615	NC_015581	CAT	2	6	1456034	1456039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144365
27616	NC_015581	CT	3	6	1456208	1456213	0 %	50 %	0 %	50 %	334144365
27617	NC_015581	CTT	2	6	1456228	1456233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144365
27618	NC_015581	CAT	2	6	1456273	1456278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144365
27619	NC_015581	A	6	6	1456293	1456298	100 %	0 %	0 %	0 %	334144365
27620	NC_015581	CAT	2	6	1456337	1456342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144365
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27622	NC_015581	TTGAT	2	10	1456439	1456448	20 %	60 %	20 %	0 %	334144365
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