MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_015581	CACG	3	12	1422038	1422049	25 %	0 %	25 %	50 %	334144330
27002	NC_015581	GAC	2	6	1422284	1422289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27003	NC_015581	AGGC	2	8	1422363	1422370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27004	NC_015581	ACA	3	9	1422420	1422428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144331
27005	NC_015581	GCC	2	6	1422468	1422473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144331
27006	NC_015581	TTA	2	6	1422474	1422479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144331
27007	NC_015581	CAAATC	2	12	1422507	1422518	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334144331
27008	NC_015581	CAC	2	6	1422545	1422550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144331
27009	NC_015581	ATTA	2	8	1422632	1422639	50 %	50 %	0 %	0 %	334144331
27010	NC_015581	CCG	2	6	1422757	1422762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144331
27011	NC_015581	GGT	2	6	1422801	1422806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144332
27012	NC_015581	CG	3	6	1422814	1422819	0 %	0 %	50 %	50 %	334144332
27013	NC_015581	ACC	2	6	1422820	1422825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144332
27014	NC_015581	GCT	2	6	1422839	1422844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144332
27015	NC_015581	TGC	2	6	1422949	1422954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144332
27016	NC_015581	CAA	2	6	1422955	1422960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144332
27017	NC_015581	TG	3	6	1423007	1423012	0 %	50 %	50 %	0 %	334144332
27018	NC_015581	AAGC	2	8	1423091	1423098	50 %	0 %	25 %	25 %	334144332
27019	NC_015581	CA	4	8	1423173	1423180	50 %	0 %	0 %	50 %	334144332
27020	NC_015581	CTG	2	6	1423182	1423187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144332
27021	NC_015581	ACG	2	6	1423246	1423251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144332
27022	NC_015581	GCC	2	6	1423334	1423339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144332
27023	NC_015581	CGG	2	6	1423415	1423420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144332
27024	NC_015581	ATCTTC	2	12	1423446	1423457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	334144332
27025	NC_015581	TGG	2	6	1423559	1423564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144332
27026	NC_015581	CTG	2	6	1423590	1423595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144332
27027	NC_015581	AACC	2	8	1423648	1423655	50 %	0 %	0 %	50 %	334144333
27028	NC_015581	GCT	2	6	1423662	1423667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144333
27029	NC_015581	GGC	2	6	1423703	1423708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144333
27030	NC_015581	GCT	2	6	1423713	1423718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144333
27031	NC_015581	GAATC	2	10	1423720	1423729	40 %	20 %	20 %	20 %	334144333
27032	NC_015581	AAG	2	6	1423740	1423745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144333
27033	NC_015581	CAT	2	6	1423789	1423794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144333
27034	NC_015581	ACCAAT	2	12	1423832	1423843	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334144333
27035	NC_015581	GCC	2	6	1423860	1423865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144333
27036	NC_015581	TAA	2	6	1423907	1423912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144333
27037	NC_015581	GCCG	2	8	1423919	1423926	0 %	0 %	50 %	50 %	334144333
27038	NC_015581	T	6	6	1423997	1424002	0 %	100 %	0 %	0 %	334144333
27039	NC_015581	ACTG	2	8	1424007	1424014	25 %	25 %	25 %	25 %	334144333
27040	NC_015581	CA	4	8	1424035	1424042	50 %	0 %	0 %	50 %	334144333
27041	NC_015581	AAT	2	6	1424130	1424135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144333
27042	NC_015581	CTG	2	6	1424207	1424212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144333
27043	NC_015581	TCC	2	6	1424250	1424255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144333
27044	NC_015581	GTA	2	6	1424271	1424276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144333
27045	NC_015581	CAC	2	6	1424288	1424293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144333
27046	NC_015581	CACC	2	8	1424308	1424315	25 %	0 %	0 %	75 %	334144333
27047	NC_015581	CAT	2	6	1424362	1424367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144333
27048	NC_015581	GTT	2	6	1424389	1424394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144333
27049	NC_015581	TTC	2	6	1424430	1424435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144333
27050	NC_015581	A	6	6	1424474	1424479	100 %	0 %	0 %	0 %	334144334
27051	NC_015581	TAA	2	6	1424551	1424556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144334
27052	NC_015581	ATA	2	6	1424642	1424647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144334
27053	NC_015581	ATCA	2	8	1424653	1424660	50 %	25 %	0 %	25 %	334144334
27054	NC_015581	TCGC	2	8	1424662	1424669	0 %	25 %	25 %	50 %	334144334
27055	NC_015581	GTT	2	6	1424679	1424684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144334
27056	NC_015581	A	6	6	1424753	1424758	100 %	0 %	0 %	0 %	334144334
27057	NC_015581	TA	3	6	1424920	1424925	50 %	50 %	0 %	0 %	334144334
27058	NC_015581	CGA	2	6	1424993	1424998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144335
27059	NC_015581	ATC	2	6	1425057	1425062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144335
27060	NC_015581	CCA	2	6	1425113	1425118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144335
27061	NC_015581	GCC	2	6	1425150	1425155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144335
27062	NC_015581	GCT	2	6	1425213	1425218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144335
27063	NC_015581	CGG	2	6	1425334	1425339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144335
27064	NC_015581	A	6	6	1425341	1425346	100 %	0 %	0 %	0 %	334144335
27065	NC_015581	CAT	2	6	1425395	1425400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144335
27066	NC_015581	CAAA	2	8	1425421	1425428	75 %	0 %	0 %	25 %	334144335
27067	NC_015581	GCG	2	6	1425461	1425466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144335
27068	NC_015581	TAAA	2	8	1425559	1425566	75 %	25 %	0 %	0 %	334144335
27069	NC_015581	TCA	2	6	1425630	1425635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144335
27070	NC_015581	AGC	2	6	1425663	1425668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144335
27071	NC_015581	GGC	2	6	1425725	1425730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144335
27072	NC_015581	ATC	2	6	1425747	1425752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144335
27073	NC_015581	ATA	2	6	1425866	1425871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144335
27074	NC_015581	GTA	2	6	1425937	1425942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144335
27075	NC_015581	TCA	2	6	1425954	1425959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144335
27076	NC_015581	AAT	2	6	1426013	1426018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144335
27077	NC_015581	AATT	2	8	1426061	1426068	50 %	50 %	0 %	0 %	334144335
27078	NC_015581	CAA	2	6	1426174	1426179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144335
27079	NC_015581	GCCC	2	8	1426193	1426200	0 %	0 %	25 %	75 %	334144335
27080	NC_015581	GAT	2	6	1426246	1426251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144335
27081	NC_015581	AAT	2	6	1426441	1426446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27082	NC_015581	GCCTA	2	10	1426482	1426491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27083	NC_015581	CAA	3	9	1426554	1426562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144336
27084	NC_015581	ATT	2	6	1426582	1426587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144336
27085	NC_015581	CAT	2	6	1426616	1426621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144336
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27087	NC_015581	AGA	2	6	1426652	1426657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144336
27088	NC_015581	GAA	2	6	1426668	1426673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144336
27089	NC_015581	AC	3	6	1426831	1426836	50 %	0 %	0 %	50 %	334144336
27090	NC_015581	ATAAAG	2	12	1426957	1426968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27091	NC_015581	A	6	6	1426987	1426992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27092	NC_015581	CTT	2	6	1427055	1427060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144337
27093	NC_015581	CTTG	2	8	1427128	1427135	0 %	50 %	25 %	25 %	334144337
27094	NC_015581	CAT	2	6	1427188	1427193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144337
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27097	NC_015581	TAAG	2	8	1427236	1427243	50 %	25 %	25 %	0 %	334144337
27098	NC_015581	CGC	2	6	1427244	1427249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144337
27099	NC_015581	ACG	3	9	1427269	1427277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144337
27100	NC_015581	ATA	2	6	1427294	1427299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144337
27101	NC_015581	CAA	2	6	1427340	1427345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144337
27102	NC_015581	AGA	2	6	1427418	1427423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144337
27103	NC_015581	AAC	2	6	1427437	1427442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144337
27104	NC_015581	GAC	2	6	1427661	1427666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144337
27105	NC_015581	CAAC	2	8	1427676	1427683	50 %	0 %	0 %	50 %	334144337
27106	NC_015581	CAA	2	6	1427863	1427868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144337
27107	NC_015581	CGAT	2	8	1427877	1427884	25 %	25 %	25 %	25 %	334144337
27108	NC_015581	TAA	2	6	1427911	1427916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144337
27109	NC_015581	AAAC	2	8	1427917	1427924	75 %	0 %	0 %	25 %	334144337
27110	NC_015581	T	7	7	1427990	1427996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27111	NC_015581	ATG	3	9	1428012	1428020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27112	NC_015581	TCA	2	6	1428022	1428027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27113	NC_015581	A	6	6	1428031	1428036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27114	NC_015581	T	6	6	1428042	1428047	0 %	100 %	0 %	0 %	334144338
27115	NC_015581	CAA	2	6	1428059	1428064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144338
27116	NC_015581	TGCC	2	8	1428086	1428093	0 %	25 %	25 %	50 %	334144338
27117	NC_015581	TCA	2	6	1428106	1428111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144338
27118	NC_015581	CAA	2	6	1428118	1428123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144338
27119	NC_015581	T	6	6	1428136	1428141	0 %	100 %	0 %	0 %	334144338
27120	NC_015581	GCC	2	6	1428146	1428151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144338
27121	NC_015581	TCA	2	6	1428192	1428197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144338
27122	NC_015581	CAC	2	6	1428214	1428219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144338
27123	NC_015581	TAT	2	6	1428325	1428330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144338
27124	NC_015581	CAA	2	6	1428331	1428336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144338
27125	NC_015581	CGG	2	6	1428364	1428369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144338
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27133	NC_015581	TCA	2	6	1428708	1428713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144338
27134	NC_015581	CAC	2	6	1428751	1428756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144338
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27139	NC_015581	AGT	2	6	1429228	1429233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144338
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27149	NC_015581	A	6	6	1429775	1429780	100 %	0 %	0 %	0 %	334144339
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27200	NC_015581	CATT	2	8	1432552	1432559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27201	NC_015581	CTG	2	6	1432583	1432588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27211	NC_015581	GTA	2	6	1433228	1433233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144342
27212	NC_015581	ATA	2	6	1433298	1433303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144342
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27219	NC_015581	GT	3	6	1433525	1433530	0 %	50 %	50 %	0 %	334144343
27220	NC_015581	CTT	2	6	1433542	1433547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144343
27221	NC_015581	GCAT	2	8	1433576	1433583	25 %	25 %	25 %	25 %	334144343
27222	NC_015581	GTT	2	6	1433596	1433601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144343
27223	NC_015581	TGC	2	6	1433615	1433620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144343
27224	NC_015581	CAA	2	6	1433656	1433661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144343
27225	NC_015581	AT	4	8	1433677	1433684	50 %	50 %	0 %	0 %	334144343
27226	NC_015581	ATC	2	6	1433868	1433873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27227	NC_015581	AAC	2	6	1433874	1433879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27228	NC_015581	ATTT	2	8	1433995	1434002	25 %	75 %	0 %	0 %	334144344
27229	NC_015581	TCA	2	6	1434009	1434014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144344
27230	NC_015581	ACCT	2	8	1434022	1434029	25 %	25 %	0 %	50 %	334144344
27231	NC_015581	T	6	6	1434131	1434136	0 %	100 %	0 %	0 %	334144344
27232	NC_015581	CGC	2	6	1434318	1434323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144344
27233	NC_015581	A	6	6	1434365	1434370	100 %	0 %	0 %	0 %	334144344
27234	NC_015581	CAT	2	6	1434477	1434482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144344
27235	NC_015581	AT	3	6	1434515	1434520	50 %	50 %	0 %	0 %	334144344
27236	NC_015581	GC	3	6	1434675	1434680	0 %	0 %	50 %	50 %	334144344
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27277	NC_015581	ATTA	2	8	1436881	1436888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27343	NC_015581	TTA	2	6	1441119	1441124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144351
27344	NC_015581	TGG	2	6	1441192	1441197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144351
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27349	NC_015581	TTTA	2	8	1441421	1441428	25 %	75 %	0 %	0 %	334144351
27350	NC_015581	A	6	6	1441468	1441473	100 %	0 %	0 %	0 %	334144351
27351	NC_015581	ATG	2	6	1441492	1441497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144351
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