MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_015581	AGC	2	6	1397370	1397375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144309
26503	NC_015581	CA	3	6	1397432	1397437	50 %	0 %	0 %	50 %	334144309
26504	NC_015581	CAA	2	6	1397450	1397455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144309
26505	NC_015581	GC	3	6	1397461	1397466	0 %	0 %	50 %	50 %	334144309
26506	NC_015581	GCCGG	2	10	1397485	1397494	0 %	0 %	60 %	40 %	334144309
26507	NC_015581	TGA	2	6	1397495	1397500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144309
26508	NC_015581	AAT	2	6	1397535	1397540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144309
26509	NC_015581	CCA	2	6	1397624	1397629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144309
26510	NC_015581	TTGA	2	8	1397637	1397644	25 %	50 %	25 %	0 %	334144309
26511	NC_015581	GTT	2	6	1397654	1397659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144309
26512	NC_015581	GTTT	2	8	1397713	1397720	0 %	75 %	25 %	0 %	334144309
26513	NC_015581	CAT	2	6	1397726	1397731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144309
26514	NC_015581	GTG	2	6	1397736	1397741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144309
26515	NC_015581	GTT	2	6	1397745	1397750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144309
26516	NC_015581	CTAAAC	2	12	1397840	1397851	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334144309
26517	NC_015581	CAC	2	6	1397856	1397861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144309
26518	NC_015581	TAA	2	6	1397874	1397879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144309
26519	NC_015581	CG	3	6	1397887	1397892	0 %	0 %	50 %	50 %	334144309
26520	NC_015581	CCG	2	6	1397939	1397944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144309
26521	NC_015581	AATC	2	8	1397973	1397980	50 %	25 %	0 %	25 %	334144309
26522	NC_015581	ATA	2	6	1398096	1398101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144309
26523	NC_015581	AAG	2	6	1398106	1398111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144309
26524	NC_015581	AACC	2	8	1398130	1398137	50 %	0 %	0 %	50 %	334144309
26525	NC_015581	AAT	2	6	1398145	1398150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144309
26526	NC_015581	CCA	2	6	1398185	1398190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144309
26527	NC_015581	GCT	2	6	1398344	1398349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144309
26528	NC_015581	ATT	2	6	1398385	1398390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144309
26529	NC_015581	AATCT	2	10	1398467	1398476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26530	NC_015581	AC	3	6	1398507	1398512	50 %	0 %	0 %	50 %	334144310
26531	NC_015581	TCA	2	6	1398588	1398593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144310
26532	NC_015581	GCC	2	6	1398622	1398627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144310
26533	NC_015581	CGG	2	6	1398687	1398692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144310
26534	NC_015581	GGC	2	6	1398715	1398720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144310
26535	NC_015581	TTC	2	6	1398815	1398820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144310
26536	NC_015581	CGA	2	6	1398879	1398884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144310
26537	NC_015581	TTG	2	6	1398917	1398922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144310
26538	NC_015581	GCC	2	6	1398932	1398937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144310
26539	NC_015581	ATT	2	6	1398975	1398980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144310
26540	NC_015581	A	6	6	1398995	1399000	100 %	0 %	0 %	0 %	334144310
26541	NC_015581	CCAG	2	8	1399176	1399183	25 %	0 %	25 %	50 %	334144310
26542	NC_015581	ATC	2	6	1399198	1399203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144310
26543	NC_015581	TTTG	2	8	1399276	1399283	0 %	75 %	25 %	0 %	334144311
26544	NC_015581	TGA	2	6	1399329	1399334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144311
26545	NC_015581	TGG	2	6	1399446	1399451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144311
26546	NC_015581	AACG	2	8	1399454	1399461	50 %	0 %	25 %	25 %	334144311
26547	NC_015581	GT	3	6	1399500	1399505	0 %	50 %	50 %	0 %	334144311
26548	NC_015581	AACC	2	8	1399634	1399641	50 %	0 %	0 %	50 %	334144311
26549	NC_015581	CGG	2	6	1399665	1399670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144311
26550	NC_015581	GCC	2	6	1399679	1399684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144311
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26552	NC_015581	CAA	2	6	1399802	1399807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144311
26553	NC_015581	ACA	3	9	1399822	1399830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144311
26554	NC_015581	CCAAG	2	10	1399837	1399846	40 %	0 %	20 %	40 %	334144311
26555	NC_015581	GCA	2	6	1399873	1399878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144311
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26557	NC_015581	ACC	2	6	1399998	1400003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144312
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26559	NC_015581	AGCAA	2	10	1400089	1400098	60 %	0 %	20 %	20 %	334144312
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26562	NC_015581	TGA	2	6	1400189	1400194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144312
26563	NC_015581	TGGG	2	8	1400249	1400256	0 %	25 %	75 %	0 %	334144312
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26567	NC_015581	CAA	2	6	1400400	1400405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144312
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26569	NC_015581	CGT	2	6	1400452	1400457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144312
26570	NC_015581	ATT	2	6	1400573	1400578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144312
26571	NC_015581	CAG	2	6	1400643	1400648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144312
26572	NC_015581	TGG	2	6	1400699	1400704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144312
26573	NC_015581	CTA	2	6	1400742	1400747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144312
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26575	NC_015581	TTCA	2	8	1400866	1400873	25 %	50 %	0 %	25 %	334144313
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26581	NC_015581	CTGG	2	8	1401144	1401151	0 %	25 %	50 %	25 %	334144313
26582	NC_015581	ATTAA	2	10	1401152	1401161	60 %	40 %	0 %	0 %	334144313
26583	NC_015581	TCA	2	6	1401164	1401169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144313
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26589	NC_015581	ATC	2	6	1401415	1401420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144313
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26591	NC_015581	TGATT	2	10	1401500	1401509	20 %	60 %	20 %	0 %	334144313
26592	NC_015581	GGT	2	6	1401541	1401546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144313
26593	NC_015581	ACCC	2	8	1401636	1401643	25 %	0 %	0 %	75 %	334144313
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26598	NC_015581	ACCAA	2	10	1401872	1401881	60 %	0 %	0 %	40 %	334144313
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26601	NC_015581	A	6	6	1402050	1402055	100 %	0 %	0 %	0 %	334144314
26602	NC_015581	CGG	2	6	1402099	1402104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144314
26603	NC_015581	GTG	2	6	1402105	1402110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144314
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26605	NC_015581	A	6	6	1402140	1402145	100 %	0 %	0 %	0 %	334144314
26606	NC_015581	TAA	2	6	1402157	1402162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144314
26607	NC_015581	TAA	2	6	1402237	1402242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144314
26608	NC_015581	GGT	2	6	1402254	1402259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144314
26609	NC_015581	CCCG	2	8	1402315	1402322	0 %	0 %	25 %	75 %	334144314
26610	NC_015581	AGCC	2	8	1402460	1402467	25 %	0 %	25 %	50 %	334144314
26611	NC_015581	GCAC	2	8	1402539	1402546	25 %	0 %	25 %	50 %	334144314
26612	NC_015581	CCAACA	2	12	1402573	1402584	50 %	0 %	0 %	50 %	334144314
26613	NC_015581	ACC	2	6	1402671	1402676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144314
26614	NC_015581	CAA	2	6	1402688	1402693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144314
26615	NC_015581	CTGGTG	2	12	1402702	1402713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334144314
26616	NC_015581	CAAC	2	8	1402730	1402737	50 %	0 %	0 %	50 %	334144314
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26972	NC_015581	CTG	2	6	1420926	1420931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144330
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26975	NC_015581	TCA	2	6	1421056	1421061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144330
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26977	NC_015581	TTA	2	6	1421198	1421203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144330
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