MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_015581	A	6	6	1369697	1369702	100 %	0 %	0 %	0 %	334144293
26002	NC_015581	AACC	2	8	1369745	1369752	50 %	0 %	0 %	50 %	334144293
26003	NC_015581	CGGC	2	8	1369776	1369783	0 %	0 %	50 %	50 %	334144293
26004	NC_015581	T	6	6	1369816	1369821	0 %	100 %	0 %	0 %	334144293
26005	NC_015581	TAA	2	6	1369834	1369839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144293
26006	NC_015581	TAA	2	6	1369849	1369854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144293
26007	NC_015581	GCA	2	6	1369893	1369898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26008	NC_015581	TTTTA	2	10	1369917	1369926	20 %	80 %	0 %	0 %	334144294
26009	NC_015581	GCAAG	2	10	1369975	1369984	40 %	0 %	40 %	20 %	334144294
26010	NC_015581	AC	3	6	1370003	1370008	50 %	0 %	0 %	50 %	334144294
26011	NC_015581	CTG	2	6	1370045	1370050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144294
26012	NC_015581	GCTT	2	8	1370111	1370118	0 %	50 %	25 %	25 %	334144294
26013	NC_015581	GTG	2	6	1370127	1370132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144294
26014	NC_015581	ACCA	2	8	1370184	1370191	50 %	0 %	0 %	50 %	334144294
26015	NC_015581	ATA	2	6	1370348	1370353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144294
26016	NC_015581	AAC	2	6	1370451	1370456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144294
26017	NC_015581	TTG	3	9	1370486	1370494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144294
26018	NC_015581	CGC	2	6	1370534	1370539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144294
26019	NC_015581	ATC	2	6	1370574	1370579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144294
26020	NC_015581	ACC	2	6	1370604	1370609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144294
26021	NC_015581	ACC	2	6	1370693	1370698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144294
26022	NC_015581	TCA	2	6	1370862	1370867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144294
26023	NC_015581	CTG	2	6	1370885	1370890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144294
26024	NC_015581	CCA	2	6	1370894	1370899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144294
26025	NC_015581	ACC	2	6	1370961	1370966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144294
26026	NC_015581	GCGTCA	2	12	1371040	1371051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334144294
26027	NC_015581	CCG	2	6	1371067	1371072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144294
26028	NC_015581	CCG	2	6	1371259	1371264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144294
26029	NC_015581	TTG	2	6	1371319	1371324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144295
26030	NC_015581	ATC	2	6	1371385	1371390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144295
26031	NC_015581	GTT	2	6	1371429	1371434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144295
26032	NC_015581	GGC	2	6	1371518	1371523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144295
26033	NC_015581	TCGTCA	2	12	1371575	1371586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334144295
26034	NC_015581	ATC	2	6	1371628	1371633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144295
26035	NC_015581	TTG	3	9	1371676	1371684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144295
26036	NC_015581	ATCTTG	2	12	1371691	1371702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334144295
26037	NC_015581	TGA	2	6	1371782	1371787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144295
26038	NC_015581	CTG	2	6	1371829	1371834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26039	NC_015581	TA	3	6	1371858	1371863	50 %	50 %	0 %	0 %	334144295
26040	NC_015581	AAT	2	6	1371899	1371904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144295
26041	NC_015581	TGT	2	6	1371935	1371940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144295
26042	NC_015581	GC	3	6	1371942	1371947	0 %	0 %	50 %	50 %	334144295
26043	NC_015581	TGT	2	6	1371953	1371958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144295
26044	NC_015581	AGC	2	6	1372055	1372060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26045	NC_015581	CAA	2	6	1372108	1372113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144295
26046	NC_015581	CCAG	2	8	1372115	1372122	25 %	0 %	25 %	50 %	334144295
26047	NC_015581	TCA	2	6	1372193	1372198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144295
26048	NC_015581	ATC	2	6	1372267	1372272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144295
26049	NC_015581	ACCA	2	8	1372355	1372362	50 %	0 %	0 %	50 %	334144295
26050	NC_015581	ACCA	2	8	1372414	1372421	50 %	0 %	0 %	50 %	334144295
26051	NC_015581	GCG	2	6	1372451	1372456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144295
26052	NC_015581	TGGC	2	8	1372481	1372488	0 %	25 %	50 %	25 %	334144295
26053	NC_015581	GCT	2	6	1372515	1372520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26054	NC_015581	CAA	2	6	1372627	1372632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144295
26055	NC_015581	ACA	2	6	1372680	1372685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144295
26056	NC_015581	GCC	2	6	1372727	1372732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144295
26057	NC_015581	TCA	2	6	1372979	1372984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144295
26058	NC_015581	CGA	2	6	1373006	1373011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26059	NC_015581	CAG	2	6	1373026	1373031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26060	NC_015581	GCA	3	9	1373046	1373054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144295
26061	NC_015581	CAG	2	6	1373148	1373153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144296
26062	NC_015581	GACC	2	8	1373159	1373166	25 %	0 %	25 %	50 %	334144296
26063	NC_015581	GTC	2	6	1373235	1373240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144296
26064	NC_015581	CCG	2	6	1373311	1373316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144296
26065	NC_015581	CGG	2	6	1373381	1373386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144296
26066	NC_015581	GCCC	2	8	1373399	1373406	0 %	0 %	25 %	75 %	334144296
26067	NC_015581	TGGCAT	2	12	1373435	1373446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334144296
26068	NC_015581	TCAC	2	8	1373494	1373501	25 %	25 %	0 %	50 %	334144296
26069	NC_015581	CAC	3	9	1373499	1373507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144296
26070	NC_015581	CAA	2	6	1373616	1373621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144296
26071	NC_015581	TGA	2	6	1373713	1373718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144296
26072	NC_015581	CTG	2	6	1373748	1373753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144296
26073	NC_015581	TCT	2	6	1373797	1373802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144296
26074	NC_015581	GGCT	2	8	1373875	1373882	0 %	25 %	50 %	25 %	334144296
26075	NC_015581	GCAA	2	8	1373908	1373915	50 %	0 %	25 %	25 %	334144296
26076	NC_015581	CCAAG	2	10	1373964	1373973	40 %	0 %	20 %	40 %	334144296
26077	NC_015581	TTGC	2	8	1373976	1373983	0 %	50 %	25 %	25 %	334144296
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26081	NC_015581	CAGC	2	8	1374105	1374112	25 %	0 %	25 %	50 %	334144296
26082	NC_015581	CAG	2	6	1374135	1374140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144296
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26085	NC_015581	TTG	2	6	1374235	1374240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144297
26086	NC_015581	CTGG	2	8	1374243	1374250	0 %	25 %	50 %	25 %	334144297
26087	NC_015581	ATC	2	6	1374284	1374289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144297
26088	NC_015581	ACG	2	6	1374427	1374432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144297
26089	NC_015581	TTG	2	6	1374457	1374462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144297
26090	NC_015581	CTG	2	6	1374499	1374504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144297
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26100	NC_015581	GCC	2	6	1374856	1374861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144298
26101	NC_015581	CTG	2	6	1374897	1374902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144298
26102	NC_015581	CAA	2	6	1374947	1374952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144298
26103	NC_015581	CTG	2	6	1375068	1375073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144298
26104	NC_015581	GTT	2	6	1375107	1375112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144298
26105	NC_015581	G	6	6	1375123	1375128	0 %	0 %	100 %	0 %	334144298
26106	NC_015581	CGC	2	6	1375173	1375178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144298
26107	NC_015581	TGC	2	6	1375240	1375245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144298
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26109	NC_015581	CA	3	6	1375335	1375340	50 %	0 %	0 %	50 %	334144298
26110	NC_015581	CTG	2	6	1375353	1375358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144298
26111	NC_015581	TTG	2	6	1375365	1375370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144298
26112	NC_015581	CGCC	2	8	1375407	1375414	0 %	0 %	25 %	75 %	334144298
26113	NC_015581	TAA	2	6	1375444	1375449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144298
26114	NC_015581	TGCCC	2	10	1375472	1375481	0 %	20 %	20 %	60 %	334144298
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26116	NC_015581	TCC	2	6	1375588	1375593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144298
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