MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_015581	AC	3	6	1342474	1342479	50 %	0 %	0 %	50 %	334144268
25503	NC_015581	CAAA	2	8	1342618	1342625	75 %	0 %	0 %	25 %	334144268
25504	NC_015581	CGA	2	6	1342626	1342631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144268
25505	NC_015581	A	6	6	1342631	1342636	100 %	0 %	0 %	0 %	334144268
25506	NC_015581	AAG	2	6	1342659	1342664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144268
25507	NC_015581	A	7	7	1342688	1342694	100 %	0 %	0 %	0 %	334144268
25508	NC_015581	ATG	2	6	1342856	1342861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25509	NC_015581	ACT	2	6	1342880	1342885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25510	NC_015581	TAT	2	6	1342903	1342908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25511	NC_015581	TAC	2	6	1342956	1342961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25512	NC_015581	AATG	2	8	1342962	1342969	50 %	25 %	25 %	0 %	334144269
25513	NC_015581	CAG	2	6	1342970	1342975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144269
25514	NC_015581	AT	3	6	1343013	1343018	50 %	50 %	0 %	0 %	334144269
25515	NC_015581	GAA	2	6	1343035	1343040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144269
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25518	NC_015581	GTA	2	6	1343236	1343241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144269
25519	NC_015581	AAAG	2	8	1343278	1343285	75 %	0 %	25 %	0 %	334144269
25520	NC_015581	CCA	2	6	1343286	1343291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144269
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25524	NC_015581	ATT	2	6	1343560	1343565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144269
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25530	NC_015581	GCA	2	6	1344001	1344006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144269
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25539	NC_015581	CGT	2	6	1344510	1344515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144269
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25544	NC_015581	T	7	7	1344648	1344654	0 %	100 %	0 %	0 %	334144270
25545	NC_015581	GCTTCT	2	12	1344712	1344723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	334144270
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25549	NC_015581	TTG	2	6	1344834	1344839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144270
25550	NC_015581	AACC	2	8	1344847	1344854	50 %	0 %	0 %	50 %	334144270
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25552	NC_015581	CAA	2	6	1344906	1344911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144270
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25554	NC_015581	ACTCAT	2	12	1345019	1345030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144270
25555	NC_015581	ATCCA	2	10	1345032	1345041	40 %	20 %	0 %	40 %	334144270
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25583	NC_015581	CAT	2	6	1346469	1346474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144271
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25588	NC_015581	GGC	2	6	1346710	1346715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144271
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25599	NC_015581	CTT	2	6	1348034	1348039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144271
25600	NC_015581	TAT	2	6	1348154	1348159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144271
25601	NC_015581	GGC	2	6	1348187	1348192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144271
25602	NC_015581	TTG	2	6	1348302	1348307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25603	NC_015581	GA	3	6	1348375	1348380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25604	NC_015581	GCA	2	6	1348480	1348485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144272
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25606	NC_015581	TGA	2	6	1348621	1348626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144272
25607	NC_015581	T	6	6	1348638	1348643	0 %	100 %	0 %	0 %	334144272
25608	NC_015581	CGC	2	6	1348693	1348698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144272
25609	NC_015581	T	6	6	1348705	1348710	0 %	100 %	0 %	0 %	334144272
25610	NC_015581	GC	3	6	1348818	1348823	0 %	0 %	50 %	50 %	334144272
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25614	NC_015581	GC	3	6	1349483	1349488	0 %	0 %	50 %	50 %	334144273
25615	NC_015581	TCA	2	6	1349504	1349509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144273
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25972	NC_015581	GCC	2	6	1368484	1368489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144293
25973	NC_015581	GAT	2	6	1368553	1368558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144293
25974	NC_015581	CG	3	6	1368594	1368599	0 %	0 %	50 %	50 %	334144293
25975	NC_015581	GGT	2	6	1368610	1368615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144293
25976	NC_015581	GTT	2	6	1368639	1368644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144293
25977	NC_015581	ACG	2	6	1368652	1368657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144293
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25979	NC_015581	ACC	2	6	1368705	1368710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144293
25980	NC_015581	CGG	2	6	1368780	1368785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144293
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25982	NC_015581	ATG	2	6	1368913	1368918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144293
25983	NC_015581	CAAGC	2	10	1368977	1368986	40 %	0 %	20 %	40 %	334144293
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25985	NC_015581	TAC	2	6	1369063	1369068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144293
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25990	NC_015581	GCT	2	6	1369321	1369326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144293
25991	NC_015581	GGT	2	6	1369345	1369350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144293
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25993	NC_015581	AAT	2	6	1369370	1369375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144293
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25997	NC_015581	A	6	6	1369498	1369503	100 %	0 %	0 %	0 %	334144293
25998	NC_015581	ACC	2	6	1369532	1369537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144293
25999	NC_015581	CGA	2	6	1369620	1369625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144293
26000	NC_015581	AAT	2	6	1369633	1369638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144293

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