MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_015581	ACA	2	6	1315906	1315911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25002	NC_015581	TCA	2	6	1316023	1316028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144252
25003	NC_015581	GGAT	2	8	1316032	1316039	25 %	25 %	50 %	0 %	334144252
25004	NC_015581	CTA	2	6	1316052	1316057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144252
25005	NC_015581	AAC	2	6	1316067	1316072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25006	NC_015581	ACA	2	6	1316185	1316190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25007	NC_015581	GATCA	2	10	1316247	1316256	40 %	20 %	20 %	20 %	334144252
25008	NC_015581	TCT	2	6	1316260	1316265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144252
25009	NC_015581	CAA	2	6	1316357	1316362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25010	NC_015581	CGA	2	6	1316388	1316393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25011	NC_015581	ATG	2	6	1316433	1316438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144252
25012	NC_015581	GCTT	2	8	1316458	1316465	0 %	50 %	25 %	25 %	334144252
25013	NC_015581	ATA	2	6	1316517	1316522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144252
25014	NC_015581	ATT	2	6	1316533	1316538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144252
25015	NC_015581	CCG	2	6	1316613	1316618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144252
25016	NC_015581	ACTT	2	8	1316622	1316629	25 %	50 %	0 %	25 %	334144252
25017	NC_015581	AC	3	6	1316637	1316642	50 %	0 %	0 %	50 %	334144252
25018	NC_015581	GCA	2	6	1316643	1316648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25019	NC_015581	AATC	2	8	1316668	1316675	50 %	25 %	0 %	25 %	334144252
25020	NC_015581	TGC	2	6	1316808	1316813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25021	NC_015581	TTG	2	6	1316840	1316845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144252
25022	NC_015581	CTA	2	6	1317092	1317097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144252
25023	NC_015581	CTGA	2	8	1317173	1317180	25 %	25 %	25 %	25 %	334144252
25024	NC_015581	A	6	6	1317182	1317187	100 %	0 %	0 %	0 %	334144252
25025	NC_015581	A	6	6	1317207	1317212	100 %	0 %	0 %	0 %	334144252
25026	NC_015581	CAAT	2	8	1317318	1317325	50 %	25 %	0 %	25 %	334144252
25027	NC_015581	TGA	2	6	1317388	1317393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144252
25028	NC_015581	ACA	2	6	1317440	1317445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25029	NC_015581	ACA	2	6	1317499	1317504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25030	NC_015581	AAC	2	6	1317537	1317542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25031	NC_015581	CAG	2	6	1317563	1317568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25032	NC_015581	ATA	2	6	1317606	1317611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144252
25033	NC_015581	CAA	2	6	1317848	1317853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25034	NC_015581	ACG	2	6	1317906	1317911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25035	NC_015581	ACTT	2	8	1317975	1317982	25 %	50 %	0 %	25 %	334144252
25036	NC_015581	CCAT	2	8	1317984	1317991	25 %	25 %	0 %	50 %	334144252
25037	NC_015581	CAG	3	9	1318146	1318154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25038	NC_015581	ACA	2	6	1318268	1318273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25039	NC_015581	CGA	2	6	1318468	1318473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144252
25040	NC_015581	ATT	2	6	1318505	1318510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144252
25041	NC_015581	GAA	2	6	1318511	1318516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144252
25042	NC_015581	ATCG	2	8	1318688	1318695	25 %	25 %	25 %	25 %	334144252
25043	NC_015581	TTTTAA	2	12	1318726	1318737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144252
25044	NC_015581	GTT	2	6	1318781	1318786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144252
25045	NC_015581	TACGC	2	10	1318847	1318856	20 %	20 %	20 %	40 %	334144252
25046	NC_015581	ATTT	2	8	1319027	1319034	25 %	75 %	0 %	0 %	334144252
25047	NC_015581	AAC	2	6	1319057	1319062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144252
25048	NC_015581	T	6	6	1319150	1319155	0 %	100 %	0 %	0 %	334144252
25049	NC_015581	GTG	2	6	1319190	1319195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144252
25050	NC_015581	CT	3	6	1319244	1319249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25051	NC_015581	CTG	2	6	1319351	1319356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144253
25052	NC_015581	C	6	6	1319442	1319447	0 %	0 %	0 %	100 %	334144253
25053	NC_015581	AC	3	6	1319494	1319499	50 %	0 %	0 %	50 %	334144253
25054	NC_015581	CTT	2	6	1319506	1319511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144253
25055	NC_015581	CCCAT	2	10	1319588	1319597	20 %	20 %	0 %	60 %	334144253
25056	NC_015581	TGC	2	6	1319663	1319668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144253
25057	NC_015581	AAG	2	6	1319678	1319683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144253
25058	NC_015581	GTT	2	6	1319688	1319693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144253
25059	NC_015581	A	7	7	1319724	1319730	100 %	0 %	0 %	0 %	334144253
25060	NC_015581	T	6	6	1319735	1319740	0 %	100 %	0 %	0 %	334144253
25061	NC_015581	TGAC	2	8	1319855	1319862	25 %	25 %	25 %	25 %	334144253
25062	NC_015581	GGC	2	6	1319952	1319957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25063	NC_015581	CTC	2	6	1319976	1319981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25064	NC_015581	CAC	2	6	1320000	1320005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25065	NC_015581	AGT	2	6	1320025	1320030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25066	NC_015581	AACA	2	8	1320102	1320109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25067	NC_015581	AAT	2	6	1320145	1320150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25068	NC_015581	TTA	2	6	1320156	1320161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25069	NC_015581	ATTA	2	8	1320165	1320172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25070	NC_015581	TTATTT	2	12	1320183	1320194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25071	NC_015581	AAT	2	6	1320211	1320216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_015581	CA	3	6	1320268	1320273	50 %	0 %	0 %	50 %	334144254
25073	NC_015581	TCA	2	6	1320277	1320282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144254
25074	NC_015581	ATT	2	6	1320350	1320355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144254
25075	NC_015581	ATT	2	6	1320358	1320363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144254
25076	NC_015581	CAT	2	6	1320373	1320378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144254
25077	NC_015581	AAT	2	6	1320434	1320439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144254
25078	NC_015581	GCA	2	6	1320477	1320482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144254
25079	NC_015581	CCT	2	6	1320535	1320540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144254
25080	NC_015581	G	6	6	1320593	1320598	0 %	0 %	100 %	0 %	334144254
25081	NC_015581	CTAT	2	8	1320600	1320607	25 %	50 %	0 %	25 %	334144254
25082	NC_015581	CT	3	6	1320626	1320631	0 %	50 %	0 %	50 %	334144254
25083	NC_015581	TAGC	2	8	1320666	1320673	25 %	25 %	25 %	25 %	334144254
25084	NC_015581	ACC	2	6	1320738	1320743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144254
25085	NC_015581	ATC	2	6	1320852	1320857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144254
25086	NC_015581	GTTT	2	8	1320863	1320870	0 %	75 %	25 %	0 %	334144254
25087	NC_015581	TGT	2	6	1320944	1320949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144255
25088	NC_015581	TGCC	2	8	1320965	1320972	0 %	25 %	25 %	50 %	334144255
25089	NC_015581	AAT	2	6	1320986	1320991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144255
25090	NC_015581	TAA	2	6	1321105	1321110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144255
25091	NC_015581	TGACT	2	10	1321159	1321168	20 %	40 %	20 %	20 %	334144255
25092	NC_015581	GT	3	6	1321240	1321245	0 %	50 %	50 %	0 %	334144255
25093	NC_015581	T	6	6	1321359	1321364	0 %	100 %	0 %	0 %	334144255
25094	NC_015581	CAGGC	2	10	1321417	1321426	20 %	0 %	40 %	40 %	334144255
25095	NC_015581	CTG	2	6	1321427	1321432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144255
25096	NC_015581	ATC	2	6	1321469	1321474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144255
25097	NC_015581	ATC	2	6	1321520	1321525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144255
25098	NC_015581	GCTT	2	8	1321575	1321582	0 %	50 %	25 %	25 %	334144255
25099	NC_015581	GTT	2	6	1321609	1321614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144255
25100	NC_015581	GTT	2	6	1321656	1321661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144255
25101	NC_015581	ACTGCC	2	12	1321710	1321721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334144256
25102	NC_015581	CTG	4	12	1321735	1321746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25103	NC_015581	CGT	2	6	1321915	1321920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25104	NC_015581	TTG	3	9	1322062	1322070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144256
25105	NC_015581	AGC	2	6	1322081	1322086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25106	NC_015581	ACA	2	6	1322099	1322104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144256
25107	NC_015581	TAA	2	6	1322176	1322181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144256
25108	NC_015581	TGA	2	6	1322264	1322269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144256
25109	NC_015581	GT	3	6	1322291	1322296	0 %	50 %	50 %	0 %	334144256
25110	NC_015581	AAC	2	6	1322392	1322397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144256
25111	NC_015581	CAA	2	6	1322472	1322477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144256
25112	NC_015581	CCA	2	6	1322530	1322535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144256
25113	NC_015581	CTG	2	6	1322542	1322547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25114	NC_015581	GCA	2	6	1322609	1322614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25115	NC_015581	AGCC	2	8	1322662	1322669	25 %	0 %	25 %	50 %	334144256
25116	NC_015581	TA	3	6	1322685	1322690	50 %	50 %	0 %	0 %	334144256
25117	NC_015581	TAAA	2	8	1322782	1322789	75 %	25 %	0 %	0 %	334144256
25118	NC_015581	TTG	2	6	1322842	1322847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144256
25119	NC_015581	CGA	2	6	1322870	1322875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25120	NC_015581	AAT	2	6	1322876	1322881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144256
25121	NC_015581	TGC	2	6	1322900	1322905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144256
25122	NC_015581	A	6	6	1322907	1322912	100 %	0 %	0 %	0 %	334144256
25123	NC_015581	TGT	2	6	1322924	1322929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144256
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25125	NC_015581	TTA	2	6	1322955	1322960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144256
25126	NC_015581	ACG	2	6	1322981	1322986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144256
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25129	NC_015581	ATC	2	6	1323108	1323113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144257
25130	NC_015581	AGC	2	6	1323132	1323137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144257
25131	NC_015581	TTG	2	6	1323179	1323184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144257
25132	NC_015581	AAT	2	6	1323202	1323207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144257
25133	NC_015581	GTT	2	6	1323214	1323219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144257
25134	NC_015581	T	6	6	1323244	1323249	0 %	100 %	0 %	0 %	334144257
25135	NC_015581	TTAC	2	8	1323294	1323301	25 %	50 %	0 %	25 %	334144257
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25139	NC_015581	TGA	2	6	1323582	1323587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144257
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25146	NC_015581	CTG	2	6	1323932	1323937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144257
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25148	NC_015581	CTG	2	6	1323980	1323985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144257
25149	NC_015581	GAATC	2	10	1324003	1324012	40 %	20 %	20 %	20 %	334144257
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25152	NC_015581	AAC	2	6	1324116	1324121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144257
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25166	NC_015581	GCTG	2	8	1324873	1324880	0 %	25 %	50 %	25 %	334144258
25167	NC_015581	ATC	2	6	1324914	1324919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144258
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25173	NC_015581	ATC	2	6	1325289	1325294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144258
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25180	NC_015581	TCC	2	6	1325822	1325827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144259
25181	NC_015581	AAT	2	6	1325894	1325899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144259
25182	NC_015581	TGA	2	6	1325915	1325920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144259
25183	NC_015581	GCT	2	6	1325961	1325966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144259
25184	NC_015581	GCC	2	6	1325974	1325979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144259
25185	NC_015581	AAT	2	6	1325980	1325985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144259
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25187	NC_015581	TAA	2	6	1326133	1326138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144259
25188	NC_015581	TGC	2	6	1326146	1326151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144259
25189	NC_015581	ATC	2	6	1326158	1326163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144259
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25196	NC_015581	CAAT	2	8	1326479	1326486	50 %	25 %	0 %	25 %	334144259
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25198	NC_015581	TGA	2	6	1326599	1326604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144259
25199	NC_015581	TG	3	6	1326776	1326781	0 %	50 %	50 %	0 %	334144259
25200	NC_015581	ATC	2	6	1326826	1326831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144259
25201	NC_015581	CAA	2	6	1326900	1326905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144259
25202	NC_015581	GTT	2	6	1326912	1326917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144259
25203	NC_015581	TAA	2	6	1326919	1326924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144259
25204	NC_015581	CAT	2	6	1326978	1326983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144259
25205	NC_015581	GAG	2	6	1327142	1327147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144259
25206	NC_015581	AAT	2	6	1327200	1327205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144259
25207	NC_015581	CAAG	2	8	1327272	1327279	50 %	0 %	25 %	25 %	334144259
25208	NC_015581	TCA	2	6	1327335	1327340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144259
25209	NC_015581	ACA	2	6	1327341	1327346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25210	NC_015581	TAA	2	6	1327365	1327370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25211	NC_015581	ATT	2	6	1327399	1327404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25212	NC_015581	TCT	2	6	1327550	1327555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144260
25213	NC_015581	TCA	2	6	1327595	1327600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144260
25214	NC_015581	ACG	2	6	1327675	1327680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144260
25215	NC_015581	TCG	2	6	1327685	1327690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144260
25216	NC_015581	CAC	2	6	1327707	1327712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144260
25217	NC_015581	CCA	2	6	1327791	1327796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144260
25218	NC_015581	CCA	2	6	1327821	1327826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144260
25219	NC_015581	AG	3	6	1327869	1327874	50 %	0 %	50 %	0 %	334144260
25220	NC_015581	TCG	2	6	1327901	1327906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144260
25221	NC_015581	GGT	2	6	1327966	1327971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144260
25222	NC_015581	TCT	2	6	1328012	1328017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144260
25223	NC_015581	T	7	7	1328025	1328031	0 %	100 %	0 %	0 %	334144260
25224	NC_015581	A	6	6	1328120	1328125	100 %	0 %	0 %	0 %	334144260
25225	NC_015581	AAATC	2	10	1328154	1328163	60 %	20 %	0 %	20 %	334144260
25226	NC_015581	CGC	2	6	1328194	1328199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144260
25227	NC_015581	CAA	2	6	1328311	1328316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144260
25228	NC_015581	CAG	2	6	1328328	1328333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144260
25229	NC_015581	CGC	2	6	1328367	1328372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144260
25230	NC_015581	GTC	2	6	1328374	1328379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144260
25231	NC_015581	CG	3	6	1328400	1328405	0 %	0 %	50 %	50 %	334144260
25232	NC_015581	TAA	2	6	1328439	1328444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144260
25233	NC_015581	CCG	2	6	1328456	1328461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144260
25234	NC_015581	AAC	2	6	1328498	1328503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144260
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25353	NC_015581	T	6	6	1333968	1333973	0 %	100 %	0 %	0 %	334144264
25354	NC_015581	TGG	2	6	1334006	1334011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144264
25355	NC_015581	T	6	6	1334063	1334068	0 %	100 %	0 %	0 %	334144264
25356	NC_015581	TGA	2	6	1334091	1334096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144264
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25469	NC_015581	TAC	2	6	1340626	1340631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144267
25470	NC_015581	CTC	2	6	1340692	1340697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144267
25471	NC_015581	TTGT	2	8	1340780	1340787	0 %	75 %	25 %	0 %	334144267
25472	NC_015581	AAT	2	6	1340857	1340862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144267
25473	NC_015581	TCA	2	6	1340905	1340910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144267
25474	NC_015581	TAA	2	6	1341064	1341069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144267
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25478	NC_015581	A	6	6	1341267	1341272	100 %	0 %	0 %	0 %	334144268
25479	NC_015581	AAT	2	6	1341332	1341337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144268
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25482	NC_015581	A	6	6	1341501	1341506	100 %	0 %	0 %	0 %	334144268
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25491	NC_015581	A	6	6	1342017	1342022	100 %	0 %	0 %	0 %	334144268
25492	NC_015581	AATT	2	8	1342048	1342055	50 %	50 %	0 %	0 %	334144268
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25495	NC_015581	AC	3	6	1342204	1342209	50 %	0 %	0 %	50 %	334144268
25496	NC_015581	CCAAG	2	10	1342211	1342220	40 %	0 %	20 %	40 %	334144268
25497	NC_015581	CCAA	2	8	1342249	1342256	50 %	0 %	0 %	50 %	334144268
25498	NC_015581	CAAT	2	8	1342267	1342274	50 %	25 %	0 %	25 %	334144268
25499	NC_015581	TCA	2	6	1342330	1342335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144268
25500	NC_015581	CGA	2	6	1342340	1342345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144268

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