MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015581	GCC	2	6	1290008	1290013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144226
24503	NC_015581	TGC	2	6	1290026	1290031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144226
24504	NC_015581	TCG	2	6	1290102	1290107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144226
24505	NC_015581	CCTG	2	8	1290119	1290126	0 %	25 %	25 %	50 %	334144226
24506	NC_015581	AC	3	6	1290146	1290151	50 %	0 %	0 %	50 %	334144226
24507	NC_015581	GCC	2	6	1290194	1290199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144226
24508	NC_015581	AAC	2	6	1290226	1290231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144226
24509	NC_015581	T	7	7	1290307	1290313	0 %	100 %	0 %	0 %	334144226
24510	NC_015581	TTG	2	6	1290397	1290402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144226
24511	NC_015581	ATA	2	6	1290420	1290425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144226
24512	NC_015581	TAA	2	6	1290481	1290486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144226
24513	NC_015581	CCAA	2	8	1290540	1290547	50 %	0 %	0 %	50 %	334144226
24514	NC_015581	GTC	2	6	1290563	1290568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144226
24515	NC_015581	GTT	2	6	1290572	1290577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144226
24516	NC_015581	CAA	2	6	1290605	1290610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144227
24517	NC_015581	TTG	2	6	1290615	1290620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144227
24518	NC_015581	CTGG	2	8	1290636	1290643	0 %	25 %	50 %	25 %	334144227
24519	NC_015581	TAGG	2	8	1290687	1290694	25 %	25 %	50 %	0 %	334144227
24520	NC_015581	A	6	6	1290711	1290716	100 %	0 %	0 %	0 %	334144227
24521	NC_015581	GGT	2	6	1290721	1290726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144227
24522	NC_015581	CGAT	2	8	1290739	1290746	25 %	25 %	25 %	25 %	334144227
24523	NC_015581	CG	3	6	1290755	1290760	0 %	0 %	50 %	50 %	334144227
24524	NC_015581	CAAAT	2	10	1290792	1290801	60 %	20 %	0 %	20 %	334144227
24525	NC_015581	T	6	6	1290857	1290862	0 %	100 %	0 %	0 %	334144227
24526	NC_015581	CAA	2	6	1290908	1290913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144227
24527	NC_015581	TGA	2	6	1290964	1290969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144227
24528	NC_015581	CAA	2	6	1290996	1291001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144227
24529	NC_015581	CGC	2	6	1291169	1291174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144227
24530	NC_015581	AAC	2	6	1291212	1291217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24531	NC_015581	AATTA	2	10	1291223	1291232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24532	NC_015581	AT	3	6	1291274	1291279	50 %	50 %	0 %	0 %	334144228
24533	NC_015581	CGA	2	6	1291282	1291287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144228
24534	NC_015581	ATG	2	6	1291323	1291328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144228
24535	NC_015581	A	6	6	1291350	1291355	100 %	0 %	0 %	0 %	334144228
24536	NC_015581	AAT	2	6	1291358	1291363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144228
24537	NC_015581	GCC	2	6	1291396	1291401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144228
24538	NC_015581	GCCC	2	8	1291480	1291487	0 %	0 %	25 %	75 %	334144228
24539	NC_015581	GTCT	2	8	1291533	1291540	0 %	50 %	25 %	25 %	334144228
24540	NC_015581	CGA	2	6	1291564	1291569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144228
24541	NC_015581	AC	3	6	1291574	1291579	50 %	0 %	0 %	50 %	334144228
24542	NC_015581	AAT	2	6	1291623	1291628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144228
24543	NC_015581	CGCT	2	8	1291731	1291738	0 %	25 %	25 %	50 %	334144228
24544	NC_015581	TAA	2	6	1291788	1291793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144228
24545	NC_015581	TCA	2	6	1291858	1291863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144228
24546	NC_015581	T	6	6	1291898	1291903	0 %	100 %	0 %	0 %	334144228
24547	NC_015581	CCA	2	6	1292061	1292066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144228
24548	NC_015581	CA	3	6	1292065	1292070	50 %	0 %	0 %	50 %	334144228
24549	NC_015581	CG	3	6	1292113	1292118	0 %	0 %	50 %	50 %	334144228
24550	NC_015581	GTT	2	6	1292162	1292167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144228
24551	NC_015581	ACCC	2	8	1292314	1292321	25 %	0 %	0 %	75 %	334144228
24552	NC_015581	TTG	3	9	1292353	1292361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144228
24553	NC_015581	ATTG	2	8	1292456	1292463	25 %	50 %	25 %	0 %	334144229
24554	NC_015581	TCT	2	6	1292470	1292475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144229
24555	NC_015581	TTGT	2	8	1292502	1292509	0 %	75 %	25 %	0 %	334144229
24556	NC_015581	AC	4	8	1292601	1292608	50 %	0 %	0 %	50 %	334144229
24557	NC_015581	AC	3	6	1292611	1292616	50 %	0 %	0 %	50 %	334144229
24558	NC_015581	CATC	2	8	1292621	1292628	25 %	25 %	0 %	50 %	334144229
24559	NC_015581	GTT	2	6	1292668	1292673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144229
24560	NC_015581	GCA	2	6	1292674	1292679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144229
24561	NC_015581	A	6	6	1292736	1292741	100 %	0 %	0 %	0 %	334144229
24562	NC_015581	ACCAA	2	10	1292756	1292765	60 %	0 %	0 %	40 %	334144229
24563	NC_015581	TGTTGG	2	12	1292791	1292802	0 %	50 %	50 %	0 %	334144229
24564	NC_015581	AC	3	6	1292855	1292860	50 %	0 %	0 %	50 %	334144229
24565	NC_015581	CTG	2	6	1292978	1292983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144229
24566	NC_015581	ATA	2	6	1293004	1293009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144229
24567	NC_015581	CGC	2	6	1293012	1293017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144229
24568	NC_015581	GCT	2	6	1293083	1293088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144229
24569	NC_015581	CATC	2	8	1293125	1293132	25 %	25 %	0 %	50 %	334144229
24570	NC_015581	AAC	2	6	1293245	1293250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144229
24571	NC_015581	CG	3	6	1293267	1293272	0 %	0 %	50 %	50 %	334144229
24572	NC_015581	CGCC	2	8	1293424	1293431	0 %	0 %	25 %	75 %	334144230
24573	NC_015581	AAGCG	2	10	1293435	1293444	40 %	0 %	40 %	20 %	334144230
24574	NC_015581	TTG	2	6	1293452	1293457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144230
24575	NC_015581	CAT	2	6	1293496	1293501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144230
24576	NC_015581	AAT	2	6	1293560	1293565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144230
24577	NC_015581	ACC	2	6	1293602	1293607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144230
24578	NC_015581	ATG	2	6	1293680	1293685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144230
24579	NC_015581	ATA	2	6	1293783	1293788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144230
24580	NC_015581	AATT	2	8	1293815	1293822	50 %	50 %	0 %	0 %	334144230
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24584	NC_015581	CGT	2	6	1293964	1293969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144230
24585	NC_015581	CTG	2	6	1294055	1294060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144230
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24587	NC_015581	TCT	2	6	1294152	1294157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144230
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24590	NC_015581	AACC	2	8	1294416	1294423	50 %	0 %	0 %	50 %	334144230
24591	NC_015581	AAG	2	6	1294445	1294450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144230
24592	NC_015581	GTT	2	6	1294477	1294482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144230
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24600	NC_015581	TGC	2	6	1294914	1294919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144231
24601	NC_015581	GGT	2	6	1294928	1294933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144231
24602	NC_015581	CTG	2	6	1294954	1294959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144231
24603	NC_015581	ATC	2	6	1294977	1294982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144231
24604	NC_015581	CCGG	2	8	1295061	1295068	0 %	0 %	50 %	50 %	334144231
24605	NC_015581	T	6	6	1295124	1295129	0 %	100 %	0 %	0 %	334144231
24606	NC_015581	TGCCAT	2	12	1295132	1295143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334144231
24607	NC_015581	TTC	2	6	1295264	1295269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144231
24608	NC_015581	ACC	2	6	1295274	1295279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144231
24609	NC_015581	GAC	2	6	1295329	1295334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144231
24610	NC_015581	TCA	2	6	1295349	1295354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144231
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24612	NC_015581	ATC	2	6	1295433	1295438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144231
24613	NC_015581	TCAA	2	8	1295457	1295464	50 %	25 %	0 %	25 %	334144231
24614	NC_015581	A	6	6	1295591	1295596	100 %	0 %	0 %	0 %	334144231
24615	NC_015581	AC	3	6	1295602	1295607	50 %	0 %	0 %	50 %	334144231
24616	NC_015581	TGC	2	6	1295637	1295642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144231
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24618	NC_015581	TCT	2	6	1295706	1295711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144231
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24773	NC_015581	T	7	7	1303370	1303376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24774	NC_015581	ATTGG	2	10	1303418	1303427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24775	NC_015581	T	6	6	1303433	1303438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24779	NC_015581	ACTT	2	8	1303712	1303719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24823	NC_015581	GCTG	2	8	1305535	1305542	0 %	25 %	50 %	25 %	334144242
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24836	NC_015581	GA	3	6	1306359	1306364	50 %	0 %	50 %	0 %	334144242
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24844	NC_015581	GGTA	2	8	1307209	1307216	25 %	25 %	50 %	0 %	334144244
24845	NC_015581	GAT	2	6	1307249	1307254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144244
24846	NC_015581	CAA	2	6	1307294	1307299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144244
24847	NC_015581	CCA	2	6	1307380	1307385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144244
24848	NC_015581	ACA	2	6	1307458	1307463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144244
24849	NC_015581	TCAAT	2	10	1307486	1307495	40 %	40 %	0 %	20 %	334144244
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24851	NC_015581	T	6	6	1307523	1307528	0 %	100 %	0 %	0 %	334144245
24852	NC_015581	ACG	2	6	1307574	1307579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144245
24853	NC_015581	AAT	2	6	1307585	1307590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144245
24854	NC_015581	AAC	2	6	1307605	1307610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144245
24855	NC_015581	CACC	2	8	1307612	1307619	25 %	0 %	0 %	75 %	334144245
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24874	NC_015581	TAT	2	6	1308540	1308545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24959	NC_015581	ATC	2	6	1312609	1312614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144249
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24963	NC_015581	TAA	2	6	1313083	1313088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24964	NC_015581	ATG	2	6	1313100	1313105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24965	NC_015581	ATTG	2	8	1313123	1313130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24966	NC_015581	CAT	2	6	1313205	1313210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144250
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