MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_015581	CCG	2	6	1235698	1235703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144179
23503	NC_015581	CGC	2	6	1235746	1235751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144179
23504	NC_015581	GCG	2	6	1235821	1235826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144179
23505	NC_015581	ACC	2	6	1235844	1235849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144179
23506	NC_015581	CAC	2	6	1235858	1235863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144179
23507	NC_015581	TTA	2	6	1235880	1235885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144179
23508	NC_015581	TTG	2	6	1235903	1235908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144179
23509	NC_015581	AAT	2	6	1235967	1235972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144179
23510	NC_015581	TCA	2	6	1236013	1236018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144179
23511	NC_015581	GTC	2	6	1236175	1236180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144180
23512	NC_015581	AAT	2	6	1236296	1236301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23513	NC_015581	CAT	2	6	1236307	1236312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144180
23514	NC_015581	CG	3	6	1236327	1236332	0 %	0 %	50 %	50 %	334144180
23515	NC_015581	ATA	2	6	1236401	1236406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23516	NC_015581	CGC	2	6	1236449	1236454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144180
23517	NC_015581	ATC	2	6	1236553	1236558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144180
23518	NC_015581	AGC	2	6	1236572	1236577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144180
23519	NC_015581	ATA	2	6	1236631	1236636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23520	NC_015581	CAC	2	6	1236645	1236650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144180
23521	NC_015581	CCCG	2	8	1236669	1236676	0 %	0 %	25 %	75 %	334144180
23522	NC_015581	CAA	2	6	1236729	1236734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144180
23523	NC_015581	CAC	2	6	1236763	1236768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144180
23524	NC_015581	TTC	2	6	1236772	1236777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144180
23525	NC_015581	CGT	2	6	1236805	1236810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144180
23526	NC_015581	ATC	2	6	1236887	1236892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144180
23527	NC_015581	TCT	2	6	1236932	1236937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144180
23528	NC_015581	AATC	2	8	1237029	1237036	50 %	25 %	0 %	25 %	334144180
23529	NC_015581	TAA	2	6	1237063	1237068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23530	NC_015581	TGA	2	6	1237074	1237079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144180
23531	NC_015581	CAT	2	6	1237240	1237245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144180
23532	NC_015581	AAG	2	6	1237253	1237258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144180
23533	NC_015581	CCA	2	6	1237305	1237310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144180
23534	NC_015581	AAC	2	6	1237337	1237342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144180
23535	NC_015581	GAAA	2	8	1237371	1237378	75 %	0 %	25 %	0 %	334144180
23536	NC_015581	CAA	2	6	1237435	1237440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144180
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23538	NC_015581	TAA	3	9	1237599	1237607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23539	NC_015581	GGA	2	6	1237615	1237620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144180
23540	NC_015581	CGC	2	6	1237648	1237653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144180
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23543	NC_015581	AT	3	6	1237829	1237834	50 %	50 %	0 %	0 %	334144180
23544	NC_015581	ACCGG	2	10	1237847	1237856	20 %	0 %	40 %	40 %	334144180
23545	NC_015581	AC	3	6	1237875	1237880	50 %	0 %	0 %	50 %	334144180
23546	NC_015581	GCTG	2	8	1237900	1237907	0 %	25 %	50 %	25 %	334144180
23547	NC_015581	T	6	6	1237918	1237923	0 %	100 %	0 %	0 %	334144180
23548	NC_015581	ATA	2	6	1237934	1237939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23549	NC_015581	ATA	2	6	1237961	1237966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144180
23550	NC_015581	GTAAA	2	10	1238011	1238020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23551	NC_015581	TAAG	2	8	1238022	1238029	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23552	NC_015581	CAA	2	6	1238142	1238147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144181
23553	NC_015581	TCA	2	6	1238210	1238215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23554	NC_015581	AAC	2	6	1238344	1238349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144181
23555	NC_015581	CATC	2	8	1238393	1238400	25 %	25 %	0 %	50 %	334144181
23556	NC_015581	AAT	2	6	1238452	1238457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144181
23557	NC_015581	ATA	2	6	1238492	1238497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144181
23558	NC_015581	CGC	2	6	1238512	1238517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144181
23559	NC_015581	AGGCCA	2	12	1238555	1238566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144181
23560	NC_015581	CCTT	2	8	1238731	1238738	0 %	50 %	0 %	50 %	334144181
23561	NC_015581	ATC	2	6	1238766	1238771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23562	NC_015581	T	6	6	1238814	1238819	0 %	100 %	0 %	0 %	334144181
23563	NC_015581	CCGC	2	8	1238840	1238847	0 %	0 %	25 %	75 %	334144181
23564	NC_015581	GCC	2	6	1238914	1238919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144181
23565	NC_015581	GC	3	6	1238949	1238954	0 %	0 %	50 %	50 %	334144181
23566	NC_015581	ATC	2	6	1238994	1238999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23567	NC_015581	ATC	2	6	1239097	1239102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23568	NC_015581	CG	3	6	1239155	1239160	0 %	0 %	50 %	50 %	334144181
23569	NC_015581	CAT	2	6	1239209	1239214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23570	NC_015581	T	6	6	1239246	1239251	0 %	100 %	0 %	0 %	334144181
23571	NC_015581	TGA	2	6	1239415	1239420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144181
23572	NC_015581	CGG	2	6	1239527	1239532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144181
23573	NC_015581	ACCA	2	8	1239589	1239596	50 %	0 %	0 %	50 %	334144181
23574	NC_015581	TCATT	2	10	1239758	1239767	20 %	60 %	0 %	20 %	334144181
23575	NC_015581	GTG	2	6	1239802	1239807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144181
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23578	NC_015581	CGT	2	6	1239856	1239861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144181
23579	NC_015581	T	6	6	1239866	1239871	0 %	100 %	0 %	0 %	334144181
23580	NC_015581	CGG	3	9	1239962	1239970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144181
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23583	NC_015581	ATC	2	6	1240081	1240086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144181
23584	NC_015581	TCTG	2	8	1240123	1240130	0 %	50 %	25 %	25 %	334144181
23585	NC_015581	ACC	2	6	1240144	1240149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144181
23586	NC_015581	CTC	2	6	1240151	1240156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144181
23587	NC_015581	ACG	2	6	1240214	1240219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144181
23588	NC_015581	CTT	2	6	1240280	1240285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144181
23589	NC_015581	CCG	2	6	1240322	1240327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144181
23590	NC_015581	AAC	2	6	1240348	1240353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144181
23591	NC_015581	CTT	2	6	1240472	1240477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144181
23592	NC_015581	CAC	2	6	1240506	1240511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144181
23593	NC_015581	GCC	2	6	1240564	1240569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144181
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23596	NC_015581	ACTG	2	8	1240773	1240780	25 %	25 %	25 %	25 %	334144181
23597	NC_015581	ATCA	2	8	1240812	1240819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23598	NC_015581	GAT	2	6	1240861	1240866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144182
23599	NC_015581	CCAT	2	8	1240925	1240932	25 %	25 %	0 %	50 %	334144182
23600	NC_015581	AT	3	6	1240966	1240971	50 %	50 %	0 %	0 %	334144182
23601	NC_015581	GGT	2	6	1241008	1241013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144182
23602	NC_015581	A	6	6	1241059	1241064	100 %	0 %	0 %	0 %	334144182
23603	NC_015581	CAC	2	6	1241071	1241076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144182
23604	NC_015581	CAA	2	6	1241143	1241148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144182
23605	NC_015581	CCA	2	6	1241241	1241246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144182
23606	NC_015581	TGG	2	6	1241262	1241267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144182
23607	NC_015581	CCA	2	6	1241322	1241327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144182
23608	NC_015581	AAG	2	6	1241507	1241512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144182
23609	NC_015581	CAAAA	2	10	1241620	1241629	80 %	0 %	0 %	20 %	334144182
23610	NC_015581	ATC	2	6	1241651	1241656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144182
23611	NC_015581	CAGC	2	8	1241667	1241674	25 %	0 %	25 %	50 %	334144182
23612	NC_015581	CAA	2	6	1241676	1241681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144182
23613	NC_015581	AC	3	6	1241700	1241705	50 %	0 %	0 %	50 %	334144182
23614	NC_015581	ATACCT	2	12	1241729	1241740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144182
23615	NC_015581	CGA	2	6	1241745	1241750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144182
23616	NC_015581	TAGGC	2	10	1241795	1241804	20 %	20 %	40 %	20 %	334144182
23617	NC_015581	AAT	2	6	1241845	1241850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144182
23618	NC_015581	TAA	2	6	1241859	1241864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144182
23619	NC_015581	ACGC	2	8	1241892	1241899	25 %	0 %	25 %	50 %	334144182
23620	NC_015581	GACG	2	8	1241926	1241933	25 %	0 %	50 %	25 %	334144182
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23644	NC_015581	CTG	3	9	1243221	1243229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144185
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23674	NC_015581	AC	3	6	1244585	1244590	50 %	0 %	0 %	50 %	334144185
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23684	NC_015581	ACC	2	6	1245165	1245170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144185
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23719	NC_015581	TGG	2	6	1246996	1247001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144187
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23722	NC_015581	GTT	2	6	1247203	1247208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144187
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23951	NC_015581	TG	3	6	1259289	1259294	0 %	50 %	50 %	0 %	334144191
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23969	NC_015581	ACC	2	6	1260520	1260525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144192
23970	NC_015581	CCA	2	6	1260608	1260613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144192
23971	NC_015581	TTTG	2	8	1260638	1260645	0 %	75 %	25 %	0 %	334144192
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23973	NC_015581	GTT	2	6	1260671	1260676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144192
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23975	NC_015581	ATG	2	6	1260792	1260797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144192
23976	NC_015581	CGT	2	6	1260880	1260885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144192
23977	NC_015581	TTC	2	6	1260921	1260926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144192
23978	NC_015581	TCA	2	6	1260977	1260982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144192
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23992	NC_015581	GTT	2	6	1261697	1261702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144192
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