MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_015581	ATC	2	6	1182578	1182583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144125
22502	NC_015581	TCAGC	2	10	1182661	1182670	20 %	20 %	20 %	40 %	334144125
22503	NC_015581	TAA	2	6	1182710	1182715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144125
22504	NC_015581	AT	3	6	1182724	1182729	50 %	50 %	0 %	0 %	334144125
22505	NC_015581	CTG	2	6	1182833	1182838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144125
22506	NC_015581	TAAACC	2	12	1182857	1182868	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334144125
22507	NC_015581	CGT	2	6	1182924	1182929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144125
22508	NC_015581	CGTAAT	2	12	1182962	1182973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334144125
22509	NC_015581	CAC	2	6	1182997	1183002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144125
22510	NC_015581	TGA	2	6	1183032	1183037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144125
22511	NC_015581	GA	3	6	1183036	1183041	50 %	0 %	50 %	0 %	334144125
22512	NC_015581	CTG	2	6	1183043	1183048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144125
22513	NC_015581	CGC	2	6	1183055	1183060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144125
22514	NC_015581	AGAAT	2	10	1183121	1183130	60 %	20 %	20 %	0 %	334144125
22515	NC_015581	TGC	2	6	1183148	1183153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144125
22516	NC_015581	CGAT	2	8	1183231	1183238	25 %	25 %	25 %	25 %	334144125
22517	NC_015581	CAC	2	6	1183247	1183252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144125
22518	NC_015581	TGA	2	6	1183260	1183265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144125
22519	NC_015581	GGC	2	6	1183272	1183277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144125
22520	NC_015581	CAT	2	6	1183291	1183296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144125
22521	NC_015581	AAT	2	6	1183376	1183381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144126
22522	NC_015581	CAA	2	6	1183425	1183430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144126
22523	NC_015581	TCA	2	6	1183616	1183621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144126
22524	NC_015581	A	6	6	1183702	1183707	100 %	0 %	0 %	0 %	334144126
22525	NC_015581	CAG	2	6	1183800	1183805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144126
22526	NC_015581	TCA	2	6	1183814	1183819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144126
22527	NC_015581	TTA	2	6	1183839	1183844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144126
22528	NC_015581	CAT	2	6	1183927	1183932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144127
22529	NC_015581	CAC	2	6	1183938	1183943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144127
22530	NC_015581	TTA	2	6	1183946	1183951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144127
22531	NC_015581	TGACC	2	10	1184040	1184049	20 %	20 %	20 %	40 %	334144127
22532	NC_015581	GCG	2	6	1184088	1184093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144127
22533	NC_015581	ACC	2	6	1184095	1184100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144127
22534	NC_015581	CAT	2	6	1184130	1184135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144127
22535	NC_015581	GCC	2	6	1184147	1184152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144127
22536	NC_015581	GCC	2	6	1184162	1184167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144127
22537	NC_015581	ACC	2	6	1184221	1184226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144127
22538	NC_015581	CAC	2	6	1184250	1184255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144127
22539	NC_015581	ACT	2	6	1184339	1184344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144127
22540	NC_015581	TTCAT	2	10	1184345	1184354	20 %	60 %	0 %	20 %	334144127
22541	NC_015581	AT	3	6	1184370	1184375	50 %	50 %	0 %	0 %	334144128
22542	NC_015581	AC	3	6	1184446	1184451	50 %	0 %	0 %	50 %	334144128
22543	NC_015581	CTT	2	6	1184578	1184583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144128
22544	NC_015581	TGC	2	6	1184631	1184636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144128
22545	NC_015581	ACCA	2	8	1184653	1184660	50 %	0 %	0 %	50 %	334144128
22546	NC_015581	CTC	2	6	1184663	1184668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144128
22547	NC_015581	CAC	2	6	1184746	1184751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144128
22548	NC_015581	T	6	6	1184857	1184862	0 %	100 %	0 %	0 %	334144128
22549	NC_015581	ATC	2	6	1184939	1184944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144128
22550	NC_015581	TCAT	2	8	1184967	1184974	25 %	50 %	0 %	25 %	334144128
22551	NC_015581	CGA	2	6	1184980	1184985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144128
22552	NC_015581	ACC	2	6	1185062	1185067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144128
22553	NC_015581	CGG	2	6	1185136	1185141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144128
22554	NC_015581	CG	3	6	1185155	1185160	0 %	0 %	50 %	50 %	334144128
22555	NC_015581	CTG	2	6	1185193	1185198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144128
22556	NC_015581	TCA	2	6	1185396	1185401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144128
22557	NC_015581	TAC	2	6	1185454	1185459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144128
22558	NC_015581	CTTTG	2	10	1185478	1185487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22559	NC_015581	GCT	2	6	1185510	1185515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144129
22560	NC_015581	A	6	6	1185520	1185525	100 %	0 %	0 %	0 %	334144129
22561	NC_015581	TGC	2	6	1185556	1185561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144129
22562	NC_015581	ACC	2	6	1185861	1185866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144129
22563	NC_015581	AACC	2	8	1185911	1185918	50 %	0 %	0 %	50 %	334144129
22564	NC_015581	GTT	2	6	1185934	1185939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144129
22565	NC_015581	A	7	7	1185972	1185978	100 %	0 %	0 %	0 %	334144129
22566	NC_015581	AAAC	2	8	1186003	1186010	75 %	0 %	0 %	25 %	334144129
22567	NC_015581	AAT	2	6	1186131	1186136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144129
22568	NC_015581	TA	3	6	1186178	1186183	50 %	50 %	0 %	0 %	334144130
22569	NC_015581	AAC	2	6	1186260	1186265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144130
22570	NC_015581	CAAT	2	8	1186322	1186329	50 %	25 %	0 %	25 %	334144130
22571	NC_015581	ATT	2	6	1186375	1186380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144130
22572	NC_015581	ATC	2	6	1186657	1186662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144130
22573	NC_015581	ATC	2	6	1186684	1186689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144130
22574	NC_015581	TGC	2	6	1186727	1186732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144130
22575	NC_015581	GC	3	6	1186731	1186736	0 %	0 %	50 %	50 %	334144130
22576	NC_015581	GCC	2	6	1186848	1186853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144130
22577	NC_015581	GTT	2	6	1186887	1186892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144130
22578	NC_015581	TGC	2	6	1186945	1186950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144130
22579	NC_015581	GATC	2	8	1186980	1186987	25 %	25 %	25 %	25 %	334144130
22580	NC_015581	ACC	2	6	1186997	1187002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144130
22581	NC_015581	CAA	2	6	1187033	1187038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144130
22582	NC_015581	CAC	2	6	1187091	1187096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144130
22583	NC_015581	CTT	2	6	1187184	1187189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144130
22584	NC_015581	GTA	2	6	1187315	1187320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22585	NC_015581	AGC	2	6	1187331	1187336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144131
22586	NC_015581	TAA	2	6	1187513	1187518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144131
22587	NC_015581	CAT	2	6	1187531	1187536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144131
22588	NC_015581	TAA	2	6	1187633	1187638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144131
22589	NC_015581	CAC	2	6	1187684	1187689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144131
22590	NC_015581	ACGGCG	2	12	1187703	1187714	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334144131
22591	NC_015581	CA	3	6	1187829	1187834	50 %	0 %	0 %	50 %	334144132
22592	NC_015581	AAC	2	6	1187866	1187871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144132
22593	NC_015581	ATCA	2	8	1187905	1187912	50 %	25 %	0 %	25 %	334144132
22594	NC_015581	CTT	2	6	1187949	1187954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144132
22595	NC_015581	AGT	2	6	1187965	1187970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144132
22596	NC_015581	GCC	2	6	1187975	1187980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144132
22597	NC_015581	TTG	2	6	1188041	1188046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144132
22598	NC_015581	GCG	2	6	1188071	1188076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144132
22599	NC_015581	T	6	6	1188131	1188136	0 %	100 %	0 %	0 %	334144132
22600	NC_015581	GCC	2	6	1188139	1188144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144132
22601	NC_015581	ACG	2	6	1188149	1188154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144132
22602	NC_015581	ACC	2	6	1188173	1188178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144132
22603	NC_015581	GCA	2	6	1188266	1188271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144132
22604	NC_015581	TCT	2	6	1188327	1188332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144132
22605	NC_015581	TTAGCT	2	12	1188344	1188355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334144132
22606	NC_015581	CCA	2	6	1188365	1188370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144132
22607	NC_015581	GTT	2	6	1188404	1188409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144132
22608	NC_015581	CGC	2	6	1188445	1188450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144132
22609	NC_015581	CAA	2	6	1188531	1188536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144132
22610	NC_015581	AAT	2	6	1188562	1188567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144132
22611	NC_015581	TAA	2	6	1188748	1188753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144132
22612	NC_015581	TCGC	2	8	1188831	1188838	0 %	25 %	25 %	50 %	334144132
22613	NC_015581	ACC	2	6	1188877	1188882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144132
22614	NC_015581	TAA	2	6	1188884	1188889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144132
22615	NC_015581	TTG	2	6	1188917	1188922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144132
22616	NC_015581	ATA	2	6	1188947	1188952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144132
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22969	NC_015581	AGT	2	6	1207446	1207451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22970	NC_015581	ATC	2	6	1207539	1207544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22971	NC_015581	TAA	2	6	1207549	1207554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22972	NC_015581	T	6	6	1207641	1207646	0 %	100 %	0 %	0 %	334144149
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22974	NC_015581	GTC	2	6	1207767	1207772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144149
22975	NC_015581	T	6	6	1207787	1207792	0 %	100 %	0 %	0 %	334144149
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22984	NC_015581	TTG	2	6	1208155	1208160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144149
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22991	NC_015581	ATC	2	6	1208723	1208728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144150
22992	NC_015581	CAA	2	6	1208781	1208786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144150
22993	NC_015581	CAA	2	6	1208813	1208818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144150
22994	NC_015581	TCAACA	2	12	1208836	1208847	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334144150
22995	NC_015581	GCG	2	6	1209060	1209065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144150
22996	NC_015581	GAA	2	6	1209083	1209088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144150
22997	NC_015581	CCG	2	6	1209123	1209128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144150
22998	NC_015581	GCC	2	6	1209167	1209172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144150
22999	NC_015581	CAA	3	9	1209236	1209244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144150
23000	NC_015581	A	7	7	1209379	1209385	100 %	0 %	0 %	0 %	334144150

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