MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015581	CAT	2	6	1107329	1107334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144053
21002	NC_015581	GCG	2	6	1107369	1107374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144053
21003	NC_015581	CAT	2	6	1107395	1107400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144053
21004	NC_015581	TGCGTT	2	12	1107401	1107412	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	334144053
21005	NC_015581	TTG	3	9	1107540	1107548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144053
21006	NC_015581	AAC	2	6	1107624	1107629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144053
21007	NC_015581	CTGA	2	8	1107647	1107654	25 %	25 %	25 %	25 %	334144053
21008	NC_015581	ACC	2	6	1107967	1107972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144054
21009	NC_015581	TCT	2	6	1108007	1108012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144054
21010	NC_015581	TCGC	2	8	1108050	1108057	0 %	25 %	25 %	50 %	334144054
21011	NC_015581	CCA	2	6	1108064	1108069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144054
21012	NC_015581	TCA	2	6	1108088	1108093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144054
21013	NC_015581	ACC	2	6	1108105	1108110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144054
21014	NC_015581	GAGT	2	8	1108111	1108118	25 %	25 %	50 %	0 %	334144054
21015	NC_015581	GAA	2	6	1108156	1108161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144054
21016	NC_015581	CCA	2	6	1108258	1108263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144054
21017	NC_015581	TCA	2	6	1108268	1108273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144054
21018	NC_015581	GAA	3	9	1108357	1108365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144054
21019	NC_015581	GTC	2	6	1108429	1108434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144054
21020	NC_015581	ATT	2	6	1108441	1108446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144054
21021	NC_015581	CTT	2	6	1108485	1108490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144054
21022	NC_015581	TGCG	2	8	1108548	1108555	0 %	25 %	50 %	25 %	334144054
21023	NC_015581	A	6	6	1108614	1108619	100 %	0 %	0 %	0 %	334144054
21024	NC_015581	T	7	7	1108742	1108748	0 %	100 %	0 %	0 %	334144054
21025	NC_015581	CGG	2	6	1108800	1108805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144054
21026	NC_015581	TTC	2	6	1108825	1108830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144054
21027	NC_015581	TCA	3	9	1108853	1108861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144054
21028	NC_015581	ACG	2	6	1109026	1109031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144054
21029	NC_015581	TGCAAA	2	12	1109119	1109130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	334144054
21030	NC_015581	CAGA	2	8	1109334	1109341	50 %	0 %	25 %	25 %	334144054
21031	NC_015581	CTT	2	6	1109466	1109471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144054
21032	NC_015581	AAC	2	6	1109474	1109479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144054
21033	NC_015581	GTT	2	6	1109512	1109517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144054
21034	NC_015581	CCA	2	6	1109520	1109525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144054
21035	NC_015581	TAA	2	6	1109630	1109635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144054
21036	NC_015581	GAC	2	6	1109652	1109657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144054
21037	NC_015581	TCG	2	6	1109744	1109749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144054
21038	NC_015581	ACT	2	6	1109804	1109809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144054
21039	NC_015581	AAT	2	6	1109812	1109817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144054
21040	NC_015581	A	6	6	1109857	1109862	100 %	0 %	0 %	0 %	334144054
21041	NC_015581	CT	3	6	1109888	1109893	0 %	50 %	0 %	50 %	334144054
21042	NC_015581	CTTGTA	2	12	1109976	1109987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334144054
21043	NC_015581	GCC	2	6	1110168	1110173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144055
21044	NC_015581	ATA	2	6	1110221	1110226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144055
21045	NC_015581	C	6	6	1110236	1110241	0 %	0 %	0 %	100 %	334144055
21046	NC_015581	ACTTAA	2	12	1110281	1110292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	334144055
21047	NC_015581	ATG	2	6	1110513	1110518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144055
21048	NC_015581	CG	3	6	1110553	1110558	0 %	0 %	50 %	50 %	334144055
21049	NC_015581	AAC	2	6	1110569	1110574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144055
21050	NC_015581	ACT	2	6	1110683	1110688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144055
21051	NC_015581	AAT	2	6	1110713	1110718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144055
21052	NC_015581	GC	3	6	1110726	1110731	0 %	0 %	50 %	50 %	334144055
21053	NC_015581	TTG	2	6	1110740	1110745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144055
21054	NC_015581	CCA	2	6	1111019	1111024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144055
21055	NC_015581	AATGG	2	10	1111299	1111308	40 %	20 %	40 %	0 %	334144055
21056	NC_015581	CAATA	2	10	1111451	1111460	60 %	20 %	0 %	20 %	334144055
21057	NC_015581	CAA	2	6	1111465	1111470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144055
21058	NC_015581	CTA	2	6	1111485	1111490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144055
21059	NC_015581	CCCA	2	8	1111502	1111509	25 %	0 %	0 %	75 %	334144056
21060	NC_015581	CCG	2	6	1111556	1111561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144056
21061	NC_015581	AGG	2	6	1111571	1111576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144056
21062	NC_015581	ACT	2	6	1111579	1111584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144056
21063	NC_015581	CTGA	2	8	1111596	1111603	25 %	25 %	25 %	25 %	334144056
21064	NC_015581	AAAT	2	8	1111621	1111628	75 %	25 %	0 %	0 %	334144056
21065	NC_015581	CCA	2	6	1111650	1111655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144056
21066	NC_015581	GCC	2	6	1111717	1111722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144056
21067	NC_015581	CCA	2	6	1111752	1111757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144056
21068	NC_015581	GGC	2	6	1111807	1111812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144056
21069	NC_015581	CAATT	2	10	1111918	1111927	40 %	40 %	0 %	20 %	334144056
21070	NC_015581	GCCAA	2	10	1111931	1111940	40 %	0 %	20 %	40 %	334144056
21071	NC_015581	ATG	2	6	1112079	1112084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144056
21072	NC_015581	ACA	2	6	1112123	1112128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144056
21073	NC_015581	GC	3	6	1112156	1112161	0 %	0 %	50 %	50 %	334144056
21074	NC_015581	ACA	2	6	1112201	1112206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144056
21075	NC_015581	CCA	2	6	1112224	1112229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144056
21076	NC_015581	TCA	2	6	1112234	1112239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144056
21077	NC_015581	CAA	2	6	1112241	1112246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144056
21078	NC_015581	CAA	2	6	1112269	1112274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144056
21079	NC_015581	TAA	2	6	1112286	1112291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144056
21080	NC_015581	ACG	2	6	1112337	1112342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144057
21081	NC_015581	TTC	2	6	1112466	1112471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144057
21082	NC_015581	ACC	2	6	1112472	1112477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144057
21083	NC_015581	GGC	2	6	1112628	1112633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144057
21084	NC_015581	TGAG	2	8	1112662	1112669	25 %	25 %	50 %	0 %	334144057
21085	NC_015581	TTATGC	2	12	1112746	1112757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334144057
21086	NC_015581	CTT	2	6	1112768	1112773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144057
21087	NC_015581	CAC	2	6	1112873	1112878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144057
21088	NC_015581	CGC	2	6	1112886	1112891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144057
21089	NC_015581	T	6	6	1112901	1112906	0 %	100 %	0 %	0 %	334144057
21090	NC_015581	CCG	2	6	1112909	1112914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144057
21091	NC_015581	TGA	2	6	1112926	1112931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144057
21092	NC_015581	CTT	2	6	1112955	1112960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144057
21093	NC_015581	CCAT	2	8	1112977	1112984	25 %	25 %	0 %	50 %	334144057
21094	NC_015581	TTG	2	6	1113030	1113035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144057
21095	NC_015581	ACTTA	2	10	1113066	1113075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21096	NC_015581	TTG	2	6	1113106	1113111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21097	NC_015581	TAG	2	6	1113189	1113194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144058
21098	NC_015581	ATC	3	9	1113237	1113245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144058
21099	NC_015581	GCG	2	6	1113249	1113254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144058
21100	NC_015581	T	6	6	1113292	1113297	0 %	100 %	0 %	0 %	334144058
21101	NC_015581	ACG	2	6	1113384	1113389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144058
21102	NC_015581	TTC	2	6	1113390	1113395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144058
21103	NC_015581	GCATCG	2	12	1113401	1113412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334144058
21104	NC_015581	CAT	2	6	1113420	1113425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144058
21105	NC_015581	CAT	2	6	1113462	1113467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144058
21106	NC_015581	T	6	6	1113482	1113487	0 %	100 %	0 %	0 %	334144058
21107	NC_015581	GTT	2	6	1113497	1113502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144058
21108	NC_015581	GTA	2	6	1113579	1113584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144058
21109	NC_015581	TGGG	2	8	1113612	1113619	0 %	25 %	75 %	0 %	334144058
21110	NC_015581	CCA	2	6	1113650	1113655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144058
21111	NC_015581	T	6	6	1113668	1113673	0 %	100 %	0 %	0 %	334144058
21112	NC_015581	CAT	2	6	1113689	1113694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144058
21113	NC_015581	TCT	2	6	1113749	1113754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144059
21114	NC_015581	AAT	2	6	1113760	1113765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144059
21115	NC_015581	CG	3	6	1113767	1113772	0 %	0 %	50 %	50 %	334144059
21116	NC_015581	TA	3	6	1113938	1113943	50 %	50 %	0 %	0 %	334144059
21117	NC_015581	GGC	3	9	1114000	1114008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144059
21118	NC_015581	GTCG	2	8	1114012	1114019	0 %	25 %	50 %	25 %	334144059
21119	NC_015581	A	6	6	1114021	1114026	100 %	0 %	0 %	0 %	334144059
21120	NC_015581	T	6	6	1114078	1114083	0 %	100 %	0 %	0 %	334144059
21121	NC_015581	TCA	2	6	1114191	1114196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144059
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21126	NC_015581	TGC	2	6	1114530	1114535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21127	NC_015581	GTT	2	6	1114539	1114544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21154	NC_015581	GGGTTA	2	12	1115906	1115917	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	334144061
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21165	NC_015581	GCG	2	6	1116459	1116464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21166	NC_015581	TAATT	2	10	1116518	1116527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21224	NC_015581	ATTGA	2	10	1118971	1118980	40 %	40 %	20 %	0 %	334144063
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21232	NC_015581	CAT	2	6	1119423	1119428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144063
21233	NC_015581	T	6	6	1119492	1119497	0 %	100 %	0 %	0 %	334144063
21234	NC_015581	GTT	2	6	1119541	1119546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144063
21235	NC_015581	GTT	2	6	1119588	1119593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144063
21236	NC_015581	T	6	6	1119597	1119602	0 %	100 %	0 %	0 %	334144063
21237	NC_015581	ATG	3	9	1119680	1119688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144063
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21240	NC_015581	GTAG	2	8	1119835	1119842	25 %	25 %	50 %	0 %	334144063
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21244	NC_015581	GCA	2	6	1119957	1119962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144063
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21246	NC_015581	A	6	6	1120027	1120032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21247	NC_015581	A	7	7	1120038	1120044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21248	NC_015581	CGTG	2	8	1120156	1120163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21249	NC_015581	CTTT	2	8	1120175	1120182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21250	NC_015581	CAT	2	6	1120227	1120232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144064
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21252	NC_015581	TCG	2	6	1120286	1120291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144064
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21259	NC_015581	TGC	2	6	1120658	1120663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144065
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21315	NC_015581	TAA	2	6	1124415	1124420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21331	NC_015581	CT	3	6	1125734	1125739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21332	NC_015581	CAAG	2	8	1125789	1125796	50 %	0 %	25 %	25 %	334144070
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21349	NC_015581	ATG	2	6	1127051	1127056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144071
21350	NC_015581	GGT	2	6	1127064	1127069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144071
21351	NC_015581	CTG	2	6	1127121	1127126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144071
21352	NC_015581	TCA	2	6	1127149	1127154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144071
21353	NC_015581	ATA	2	6	1127159	1127164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144071
21354	NC_015581	CTT	2	6	1127222	1127227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144071
21355	NC_015581	CTG	2	6	1127274	1127279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144071
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21357	NC_015581	TGC	2	6	1127347	1127352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144071
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21428	NC_015581	TTA	2	6	1130956	1130961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21429	NC_015581	ATA	2	6	1130962	1130967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21430	NC_015581	GAC	2	6	1131012	1131017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144074
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21432	NC_015581	CAA	2	6	1131121	1131126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144074
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21443	NC_015581	A	6	6	1131583	1131588	100 %	0 %	0 %	0 %	334144074
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21453	NC_015581	GGC	2	6	1131918	1131923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144074
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21456	NC_015581	CAG	2	6	1131993	1131998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21457	NC_015581	GTT	2	6	1132003	1132008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21458	NC_015581	TTC	2	6	1132150	1132155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144075
21459	NC_015581	CGG	2	6	1132203	1132208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144075
21460	NC_015581	GC	3	6	1132279	1132284	0 %	0 %	50 %	50 %	334144075
21461	NC_015581	ACT	2	6	1132349	1132354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144075
21462	NC_015581	ATT	2	6	1132393	1132398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144075
21463	NC_015581	CTC	2	6	1132429	1132434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144075
21464	NC_015581	TTCATT	2	12	1132466	1132477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	334144075
21465	NC_015581	ACG	2	6	1132495	1132500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144075
21466	NC_015581	AAT	2	6	1132502	1132507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144075
21467	NC_015581	AAT	2	6	1132600	1132605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144075
21468	NC_015581	CTT	2	6	1132620	1132625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144075
21469	NC_015581	TTG	2	6	1132640	1132645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144075
21470	NC_015581	T	6	6	1132705	1132710	0 %	100 %	0 %	0 %	334144075
21471	NC_015581	T	6	6	1132809	1132814	0 %	100 %	0 %	0 %	334144075
21472	NC_015581	GGC	2	6	1132862	1132867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144075
21473	NC_015581	GTT	2	6	1132909	1132914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144075
21474	NC_015581	A	6	6	1132927	1132932	100 %	0 %	0 %	0 %	334144075
21475	NC_015581	TTGC	2	8	1132942	1132949	0 %	50 %	25 %	25 %	334144075
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21477	NC_015581	TAC	2	6	1133028	1133033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144075
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21480	NC_015581	TCGC	2	8	1133088	1133095	0 %	25 %	25 %	50 %	334144075
21481	NC_015581	GAT	2	6	1133139	1133144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144075
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21483	NC_015581	TTG	2	6	1133264	1133269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144075
21484	NC_015581	AC	3	6	1133302	1133307	50 %	0 %	0 %	50 %	334144075
21485	NC_015581	TCA	3	9	1133439	1133447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144075
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21489	NC_015581	GGT	2	6	1133608	1133613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144075
21490	NC_015581	AAT	2	6	1133635	1133640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144075
21491	NC_015581	CGA	2	6	1133651	1133656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144075
21492	NC_015581	GGT	2	6	1133659	1133664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144075
21493	NC_015581	CTA	2	6	1133692	1133697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21494	NC_015581	AAT	2	6	1133702	1133707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21495	NC_015581	AAAAC	2	10	1133714	1133723	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21496	NC_015581	TTG	2	6	1133737	1133742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21497	NC_015581	CTG	2	6	1133746	1133751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21498	NC_015581	ATC	2	6	1133758	1133763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21499	NC_015581	CAG	2	6	1133764	1133769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21500	NC_015581	ATC	2	6	1133841	1133846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144076

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