MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015581	ACGT	2	8	1002746	1002753	25 %	25 %	25 %	25 %	334143946
19002	NC_015581	AGA	2	6	1002786	1002791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143946
19003	NC_015581	GTT	2	6	1002804	1002809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143946
19004	NC_015581	GCC	2	6	1002861	1002866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143946
19005	NC_015581	AAAG	2	8	1002903	1002910	75 %	0 %	25 %	0 %	334143946
19006	NC_015581	ACC	2	6	1002936	1002941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143946
19007	NC_015581	TGT	3	9	1002969	1002977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143946
19008	NC_015581	TAG	3	9	1002995	1003003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143946
19009	NC_015581	GCT	2	6	1003062	1003067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143946
19010	NC_015581	AGC	2	6	1003085	1003090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143946
19011	NC_015581	TTG	2	6	1003160	1003165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_015581	TGT	2	6	1003246	1003251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143947
19013	NC_015581	GGAT	2	8	1003262	1003269	25 %	25 %	50 %	0 %	334143947
19014	NC_015581	CGA	2	6	1003286	1003291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143947
19015	NC_015581	GAT	2	6	1003335	1003340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143947
19016	NC_015581	ATAA	2	8	1003357	1003364	75 %	25 %	0 %	0 %	334143947
19017	NC_015581	GGT	2	6	1003391	1003396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143947
19018	NC_015581	GC	4	8	1003415	1003422	0 %	0 %	50 %	50 %	334143947
19019	NC_015581	TGG	2	6	1003442	1003447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143947
19020	NC_015581	TCG	2	6	1003450	1003455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143947
19021	NC_015581	TAAT	2	8	1003460	1003467	50 %	50 %	0 %	0 %	334143947
19022	NC_015581	GCC	2	6	1003515	1003520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143947
19023	NC_015581	TTG	2	6	1003569	1003574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143947
19024	NC_015581	T	7	7	1003715	1003721	0 %	100 %	0 %	0 %	334143947
19025	NC_015581	CAC	2	6	1003871	1003876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143947
19026	NC_015581	CTT	2	6	1003941	1003946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143947
19027	NC_015581	AGC	2	6	1004038	1004043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143947
19028	NC_015581	GGGT	2	8	1004056	1004063	0 %	25 %	75 %	0 %	334143947
19029	NC_015581	TAA	2	6	1004072	1004077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143947
19030	NC_015581	ACA	2	6	1004149	1004154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143947
19031	NC_015581	TCA	2	6	1004194	1004199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143947
19032	NC_015581	CAG	2	6	1004211	1004216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143947
19033	NC_015581	TCG	2	6	1004263	1004268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143947
19034	NC_015581	TAA	2	6	1004274	1004279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143947
19035	NC_015581	ATC	2	6	1004308	1004313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143947
19036	NC_015581	GTT	2	6	1004318	1004323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143947
19037	NC_015581	ACC	2	6	1004328	1004333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143947
19038	NC_015581	GTT	2	6	1004363	1004368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143947
19039	NC_015581	AATC	2	8	1004399	1004406	50 %	25 %	0 %	25 %	334143947
19040	NC_015581	GGC	2	6	1004418	1004423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143947
19041	NC_015581	TGAG	2	8	1004492	1004499	25 %	25 %	50 %	0 %	334143947
19042	NC_015581	ATC	2	6	1004518	1004523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143947
19043	NC_015581	GCGCA	2	10	1004613	1004622	20 %	0 %	40 %	40 %	334143947
19044	NC_015581	ATG	2	6	1004648	1004653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143947
19045	NC_015581	CCAA	2	8	1004680	1004687	50 %	0 %	0 %	50 %	334143947
19046	NC_015581	ATCA	2	8	1004727	1004734	50 %	25 %	0 %	25 %	334143947
19047	NC_015581	TAC	2	6	1004754	1004759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143947
19048	NC_015581	TA	3	6	1004805	1004810	50 %	50 %	0 %	0 %	334143948
19049	NC_015581	AGC	2	6	1004906	1004911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143948
19050	NC_015581	GTTT	2	8	1004928	1004935	0 %	75 %	25 %	0 %	334143948
19051	NC_015581	GTT	2	6	1004962	1004967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143948
19052	NC_015581	GTT	2	6	1005055	1005060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143948
19053	NC_015581	CAAA	2	8	1005099	1005106	75 %	0 %	0 %	25 %	334143948
19054	NC_015581	CAAGC	2	10	1005155	1005164	40 %	0 %	20 %	40 %	334143948
19055	NC_015581	ATA	2	6	1005197	1005202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143948
19056	NC_015581	TCA	2	6	1005271	1005276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143948
19057	NC_015581	TCAC	2	8	1005306	1005313	25 %	25 %	0 %	50 %	334143948
19058	NC_015581	T	7	7	1005325	1005331	0 %	100 %	0 %	0 %	334143948
19059	NC_015581	GCC	2	6	1005348	1005353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143948
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19061	NC_015581	ACC	2	6	1005522	1005527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143949
19062	NC_015581	GC	3	6	1005556	1005561	0 %	0 %	50 %	50 %	334143949
19063	NC_015581	CCGACA	2	12	1005605	1005616	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334143949
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19065	NC_015581	GCG	2	6	1005746	1005751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143949
19066	NC_015581	GAC	2	6	1005798	1005803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143949
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19070	NC_015581	CAT	2	6	1005990	1005995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143949
19071	NC_015581	GTG	2	6	1006061	1006066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143949
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19082	NC_015581	GCCA	2	8	1006721	1006728	25 %	0 %	25 %	50 %	334143949
19083	NC_015581	ATA	2	6	1006802	1006807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143949
19084	NC_015581	CAT	2	6	1006828	1006833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143949
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19088	NC_015581	CG	3	6	1007121	1007126	0 %	0 %	50 %	50 %	334143950
19089	NC_015581	TTC	2	6	1007154	1007159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143950
19090	NC_015581	GCCC	2	8	1007187	1007194	0 %	0 %	25 %	75 %	334143950
19091	NC_015581	CCAG	2	8	1007250	1007257	25 %	0 %	25 %	50 %	334143950
19092	NC_015581	TA	3	6	1007319	1007324	50 %	50 %	0 %	0 %	334143950
19093	NC_015581	ATC	2	6	1007347	1007352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143950
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19097	NC_015581	CAAACA	2	12	1007534	1007545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143950
19098	NC_015581	CAA	2	6	1007561	1007566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143950
19099	NC_015581	A	6	6	1007610	1007615	100 %	0 %	0 %	0 %	334143950
19100	NC_015581	CAAT	2	8	1007654	1007661	50 %	25 %	0 %	25 %	334143950
19101	NC_015581	GTTT	2	8	1007671	1007678	0 %	75 %	25 %	0 %	334143950
19102	NC_015581	ATC	2	6	1007703	1007708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143950
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19104	NC_015581	GTT	2	6	1007848	1007853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143951
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19107	NC_015581	ATTCC	2	10	1007942	1007951	20 %	40 %	0 %	40 %	334143951
19108	NC_015581	AACG	2	8	1008057	1008064	50 %	0 %	25 %	25 %	334143951
19109	NC_015581	AAT	2	6	1008122	1008127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143951
19110	NC_015581	CAAA	2	8	1008169	1008176	75 %	0 %	0 %	25 %	334143951
19111	NC_015581	CCCCAA	2	12	1008294	1008305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143951
19112	NC_015581	ATCCA	2	10	1008408	1008417	40 %	20 %	0 %	40 %	334143951
19113	NC_015581	CG	4	8	1008420	1008427	0 %	0 %	50 %	50 %	334143951
19114	NC_015581	ATC	2	6	1008428	1008433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143951
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19117	NC_015581	CTT	2	6	1008595	1008600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143951
19118	NC_015581	GCC	2	6	1008645	1008650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143951
19119	NC_015581	TTCA	2	8	1008659	1008666	25 %	50 %	0 %	25 %	334143951
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19122	NC_015581	CAT	2	6	1008910	1008915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143951
19123	NC_015581	CTTT	2	8	1008951	1008958	0 %	75 %	0 %	25 %	334143951
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19128	NC_015581	ACC	2	6	1009302	1009307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143951
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19210	NC_015581	A	7	7	1013884	1013890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19211	NC_015581	CTTT	2	8	1013927	1013934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19217	NC_015581	CT	3	6	1014386	1014391	0 %	50 %	0 %	50 %	334143954
19218	NC_015581	TCG	2	6	1014408	1014413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143954
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19226	NC_015581	GCAT	2	8	1014776	1014783	25 %	25 %	25 %	25 %	334143954
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19231	NC_015581	CAAT	2	8	1015148	1015155	50 %	25 %	0 %	25 %	334143954
19232	NC_015581	GCA	2	6	1015337	1015342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143954
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19234	NC_015581	GGCT	2	8	1015435	1015442	0 %	25 %	50 %	25 %	334143954
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19471	NC_015581	AAT	2	6	1026802	1026807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143965
19472	NC_015581	CCA	2	6	1026832	1026837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143965
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19497	NC_015581	AC	3	6	1027820	1027825	50 %	0 %	0 %	50 %	334143965
19498	NC_015581	ATC	2	6	1027841	1027846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143965
19499	NC_015581	T	6	6	1027922	1027927	0 %	100 %	0 %	0 %	334143965
19500	NC_015581	AAC	2	6	1027951	1027956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143965

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