MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015581	GTT	2	6	948079	948084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143894
18003	NC_015581	TTTATG	2	12	948105	948116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	334143894
18004	NC_015581	TTA	2	6	948170	948175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143894
18005	NC_015581	ATT	2	6	948188	948193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143894
18006	NC_015581	CAG	2	6	948194	948199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143894
18007	NC_015581	GAT	2	6	948215	948220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143894
18008	NC_015581	AGG	2	6	948279	948284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143894
18009	NC_015581	CCAG	2	8	948293	948300	25 %	0 %	25 %	50 %	334143894
18010	NC_015581	ATT	2	6	948362	948367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143894
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18012	NC_015581	GTT	2	6	948412	948417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143894
18013	NC_015581	TGA	2	6	948435	948440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143894
18014	NC_015581	ACA	2	6	948511	948516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143894
18015	NC_015581	CAA	2	6	948602	948607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143894
18016	NC_015581	ATG	2	6	948612	948617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143894
18017	NC_015581	TTAT	2	8	948930	948937	25 %	75 %	0 %	0 %	334143894
18018	NC_015581	GTT	2	6	948994	948999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143894
18019	NC_015581	TGAT	2	8	949008	949015	25 %	50 %	25 %	0 %	334143894
18020	NC_015581	CAT	2	6	949082	949087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143894
18021	NC_015581	GTT	2	6	949100	949105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143894
18022	NC_015581	T	6	6	949160	949165	0 %	100 %	0 %	0 %	334143894
18023	NC_015581	GA	3	6	949171	949176	50 %	0 %	50 %	0 %	334143894
18024	NC_015581	TTA	2	6	949295	949300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143894
18025	NC_015581	TA	3	6	949307	949312	50 %	50 %	0 %	0 %	334143894
18026	NC_015581	ACC	2	6	949313	949318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143894
18027	NC_015581	TTC	2	6	949321	949326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143894
18028	NC_015581	AT	3	6	949395	949400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_015581	TA	3	6	949458	949463	50 %	50 %	0 %	0 %	334143895
18030	NC_015581	CAT	2	6	949525	949530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143895
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18032	NC_015581	ACA	2	6	949627	949632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143895
18033	NC_015581	GCG	2	6	949690	949695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143896
18034	NC_015581	GCC	2	6	949710	949715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143896
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18037	NC_015581	AAT	2	6	949834	949839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143896
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18039	NC_015581	GGC	2	6	949939	949944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143896
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18043	NC_015581	TGC	2	6	950330	950335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143896
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18045	NC_015581	AAAT	2	8	950490	950497	75 %	25 %	0 %	0 %	334143896
18046	NC_015581	TAA	2	6	950686	950691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143896
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18050	NC_015581	AAGC	2	8	950952	950959	50 %	0 %	25 %	25 %	334143896
18051	NC_015581	GAA	2	6	950988	950993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143896
18052	NC_015581	ACCTC	2	10	950997	951006	20 %	20 %	0 %	60 %	334143896
18053	NC_015581	AAG	2	6	951015	951020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143896
18054	NC_015581	ATT	3	9	951029	951037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143896
18055	NC_015581	T	8	8	951036	951043	0 %	100 %	0 %	0 %	334143897
18056	NC_015581	GTTATT	2	12	951045	951056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	334143897
18057	NC_015581	T	6	6	951055	951060	0 %	100 %	0 %	0 %	334143897
18058	NC_015581	ATTG	2	8	951075	951082	25 %	50 %	25 %	0 %	334143897
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18062	NC_015581	ACC	2	6	951196	951201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143897
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18065	NC_015581	TGA	2	6	951326	951331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143897
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18067	NC_015581	AATT	2	8	951543	951550	50 %	50 %	0 %	0 %	334143898
18068	NC_015581	CAA	2	6	951614	951619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143898
18069	NC_015581	A	6	6	951657	951662	100 %	0 %	0 %	0 %	334143898
18070	NC_015581	CAA	2	6	951668	951673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143898
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18073	NC_015581	CAAC	2	8	951836	951843	50 %	0 %	0 %	50 %	334143898
18074	NC_015581	TAC	2	6	951876	951881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143898
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18078	NC_015581	TCA	2	6	952112	952117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143899
18079	NC_015581	TGC	2	6	952166	952171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143899
18080	NC_015581	TACCC	2	10	952349	952358	20 %	20 %	0 %	60 %	334143899
18081	NC_015581	ATA	2	6	952463	952468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143899
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18083	NC_015581	GCT	2	6	952559	952564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143899
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18086	NC_015581	GTC	2	6	952600	952605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143899
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18089	NC_015581	AAC	2	6	952769	952774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143899
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18104	NC_015581	ATTG	2	8	953628	953635	25 %	50 %	25 %	0 %	334143900
18105	NC_015581	ATC	2	6	953649	953654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143900
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18108	NC_015581	CTAAA	2	10	953804	953813	60 %	20 %	0 %	20 %	334143900
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18244	NC_015581	CGC	2	6	960406	960411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143909
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18272	NC_015581	TAAAA	2	10	962073	962082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18282	NC_015581	TA	4	8	962724	962731	50 %	50 %	0 %	0 %	334143911
18283	NC_015581	ACGGC	2	10	962748	962757	20 %	0 %	40 %	40 %	334143911
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18341	NC_015581	AACA	2	8	966041	966048	75 %	0 %	0 %	25 %	334143914
18342	NC_015581	TGTT	2	8	966089	966096	0 %	75 %	25 %	0 %	334143914
18343	NC_015581	GTG	2	6	966101	966106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143914
18344	NC_015581	TGCCAT	2	12	966107	966118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334143914
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18346	NC_015581	TGC	2	6	966195	966200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143914
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18352	NC_015581	ATTA	2	8	966418	966425	50 %	50 %	0 %	0 %	334143915
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18357	NC_015581	CAT	2	6	966765	966770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143915
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18488	NC_015581	CTT	2	6	974036	974041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143921
18489	NC_015581	GC	3	6	974049	974054	0 %	0 %	50 %	50 %	334143921
18490	NC_015581	GCC	2	6	974098	974103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143921
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