MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015581	AAT	2	6	649437	649442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143614
12502	NC_015581	TTC	2	6	649456	649461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143614
12503	NC_015581	ACA	2	6	649509	649514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143614
12504	NC_015581	GTT	2	6	649548	649553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143614
12505	NC_015581	TTG	2	6	649567	649572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143614
12506	NC_015581	GT	3	6	649584	649589	0 %	50 %	50 %	0 %	334143614
12507	NC_015581	CAA	2	6	649603	649608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143614
12508	NC_015581	CAC	2	6	649691	649696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143615
12509	NC_015581	CAG	2	6	649702	649707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143615
12510	NC_015581	AAT	2	6	649756	649761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143615
12511	NC_015581	GAC	2	6	649786	649791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143615
12512	NC_015581	CCA	2	6	649860	649865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143615
12513	NC_015581	GCC	2	6	649994	649999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143615
12514	NC_015581	TGG	2	6	650018	650023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143615
12515	NC_015581	TACC	2	8	650041	650048	25 %	25 %	0 %	50 %	334143615
12516	NC_015581	GCA	2	6	650121	650126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143615
12517	NC_015581	TCC	2	6	650157	650162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143615
12518	NC_015581	ATC	2	6	650213	650218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143615
12519	NC_015581	T	6	6	650224	650229	0 %	100 %	0 %	0 %	334143615
12520	NC_015581	GTT	2	6	650413	650418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143615
12521	NC_015581	AAGT	2	8	650433	650440	50 %	25 %	25 %	0 %	334143615
12522	NC_015581	TAA	2	6	650484	650489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143615
12523	NC_015581	ACC	2	6	650506	650511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143615
12524	NC_015581	TAG	2	6	650513	650518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143615
12525	NC_015581	CG	3	6	650674	650679	0 %	0 %	50 %	50 %	334143615
12526	NC_015581	TCACCA	2	12	650734	650745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	334143615
12527	NC_015581	A	7	7	650780	650786	100 %	0 %	0 %	0 %	334143615
12528	NC_015581	GGT	2	6	651002	651007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143615
12529	NC_015581	CGAC	2	8	651010	651017	25 %	0 %	25 %	50 %	334143615
12530	NC_015581	CTG	3	9	651023	651031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143615
12531	NC_015581	A	6	6	651093	651098	100 %	0 %	0 %	0 %	334143615
12532	NC_015581	GTGCG	2	10	651200	651209	0 %	20 %	60 %	20 %	334143615
12533	NC_015581	GGC	2	6	651250	651255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143615
12534	NC_015581	TCGC	2	8	651268	651275	0 %	25 %	25 %	50 %	334143615
12535	NC_015581	TAA	2	6	651280	651285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143615
12536	NC_015581	TGCT	2	8	651288	651295	0 %	50 %	25 %	25 %	334143615
12537	NC_015581	TGT	2	6	651433	651438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143615
12538	NC_015581	TAT	2	6	651475	651480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_015581	TAA	2	6	651563	651568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_015581	ACCC	2	8	651603	651610	25 %	0 %	0 %	75 %	334143616
12541	NC_015581	TGG	2	6	651646	651651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143616
12542	NC_015581	TTA	2	6	651661	651666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143616
12543	NC_015581	AGC	2	6	651706	651711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143616
12544	NC_015581	GGT	2	6	651767	651772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143616
12545	NC_015581	GAG	2	6	651819	651824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143616
12546	NC_015581	ATTT	2	8	651881	651888	25 %	75 %	0 %	0 %	334143616
12547	NC_015581	CAG	2	6	651930	651935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143616
12548	NC_015581	TGT	2	6	652018	652023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143616
12549	NC_015581	CGG	2	6	652063	652068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143616
12550	NC_015581	CGGT	2	8	652084	652091	0 %	25 %	50 %	25 %	334143616
12551	NC_015581	TAT	2	6	652136	652141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143616
12552	NC_015581	ACCG	2	8	652188	652195	25 %	0 %	25 %	50 %	334143616
12553	NC_015581	CGA	2	6	652244	652249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143616
12554	NC_015581	GGT	2	6	652292	652297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143616
12555	NC_015581	ACC	2	6	652619	652624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143616
12556	NC_015581	GAT	2	6	652635	652640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143616
12557	NC_015581	GTTT	2	8	652833	652840	0 %	75 %	25 %	0 %	334143617
12558	NC_015581	T	6	6	652867	652872	0 %	100 %	0 %	0 %	334143617
12559	NC_015581	CAT	2	6	652892	652897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143617
12560	NC_015581	GCG	2	6	652904	652909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143617
12561	NC_015581	GC	3	6	653311	653316	0 %	0 %	50 %	50 %	334143617
12562	NC_015581	AAC	2	6	653343	653348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143617
12563	NC_015581	A	6	6	653559	653564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_015581	GTT	2	6	653594	653599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_015581	GTC	2	6	653619	653624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_015581	ATG	2	6	653683	653688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_015581	TTTCT	2	10	653706	653715	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12568	NC_015581	GC	3	6	653811	653816	0 %	0 %	50 %	50 %	334143618
12569	NC_015581	GCG	2	6	653824	653829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143618
12570	NC_015581	T	6	6	653940	653945	0 %	100 %	0 %	0 %	334143618
12571	NC_015581	CAT	2	6	653952	653957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143618
12572	NC_015581	AGA	2	6	654029	654034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143618
12573	NC_015581	AGC	3	9	654052	654060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143618
12574	NC_015581	ATG	2	6	654085	654090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143618
12575	NC_015581	GGT	2	6	654137	654142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143618
12576	NC_015581	AGT	2	6	654170	654175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143618
12577	NC_015581	TGA	2	6	654224	654229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143618
12578	NC_015581	TTA	2	6	654232	654237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143618
12579	NC_015581	CACC	2	8	654256	654263	25 %	0 %	0 %	75 %	334143618
12580	NC_015581	CGT	2	6	654275	654280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143618
12581	NC_015581	GAC	2	6	654285	654290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143618
12582	NC_015581	TGA	2	6	654323	654328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143618
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12587	NC_015581	CGC	2	6	654599	654604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143618
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12589	NC_015581	CAA	2	6	654645	654650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143618
12590	NC_015581	GATGCC	2	12	654837	654848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334143618
12591	NC_015581	AAG	2	6	654852	654857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143618
12592	NC_015581	TCA	2	6	654941	654946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143618
12593	NC_015581	GGT	2	6	655023	655028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143618
12594	NC_015581	GCA	2	6	655056	655061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143618
12595	NC_015581	CGC	2	6	655115	655120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143618
12596	NC_015581	AAC	2	6	655155	655160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_015581	CGCC	2	8	655260	655267	0 %	0 %	25 %	75 %	334143619
12598	NC_015581	TCAT	2	8	655300	655307	25 %	50 %	0 %	25 %	334143619
12599	NC_015581	T	7	7	655367	655373	0 %	100 %	0 %	0 %	334143619
12600	NC_015581	TGA	2	6	655445	655450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143619
12601	NC_015581	ATG	2	6	655566	655571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143619
12602	NC_015581	CGC	2	6	655639	655644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143619
12603	NC_015581	CGT	2	6	655665	655670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143619
12604	NC_015581	TGA	2	6	655684	655689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143619
12605	NC_015581	CCA	2	6	655800	655805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143619
12606	NC_015581	AAG	2	6	655819	655824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143619
12607	NC_015581	GGC	2	6	655826	655831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143619
12608	NC_015581	GCC	2	6	655898	655903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143619
12609	NC_015581	AGA	2	6	656003	656008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143619
12610	NC_015581	GCA	2	6	656060	656065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143619
12611	NC_015581	GTT	2	6	656114	656119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143619
12612	NC_015581	AAC	2	6	656134	656139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143619
12613	NC_015581	TGG	2	6	656173	656178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143619
12614	NC_015581	TTG	2	6	656220	656225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143619
12615	NC_015581	TTA	2	6	656271	656276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143619
12616	NC_015581	GTT	2	6	656390	656395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143619
12617	NC_015581	TCAA	2	8	656419	656426	50 %	25 %	0 %	25 %	334143619
12618	NC_015581	CG	3	6	656439	656444	0 %	0 %	50 %	50 %	334143619
12619	NC_015581	CAA	2	6	656483	656488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143619
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12621	NC_015581	TAA	2	6	656560	656565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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