MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015581	TAA	2	6	567316	567321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143524
11002	NC_015581	TGGT	2	8	567387	567394	0 %	50 %	50 %	0 %	334143524
11003	NC_015581	GCG	2	6	567452	567457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143524
11004	NC_015581	GCC	2	6	567464	567469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143524
11005	NC_015581	TCA	2	6	567486	567491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143524
11006	NC_015581	GCAG	2	8	567495	567502	25 %	0 %	50 %	25 %	334143524
11007	NC_015581	CTG	2	6	567530	567535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143524
11008	NC_015581	TGG	2	6	567615	567620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143524
11009	NC_015581	CCCAGC	2	12	567648	567659	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	334143524
11010	NC_015581	CTG	2	6	567704	567709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143524
11011	NC_015581	TCG	2	6	567753	567758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143524
11012	NC_015581	CAG	2	6	567785	567790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143524
11013	NC_015581	CGA	2	6	567817	567822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143524
11014	NC_015581	GCG	2	6	567876	567881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143524
11015	NC_015581	ATA	2	6	567910	567915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143524
11016	NC_015581	ATGA	2	8	567952	567959	50 %	25 %	25 %	0 %	334143525
11017	NC_015581	ACC	2	6	568009	568014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143525
11018	NC_015581	GC	3	6	568019	568024	0 %	0 %	50 %	50 %	334143525
11019	NC_015581	TAA	3	9	568084	568092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143525
11020	NC_015581	GCG	2	6	568121	568126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143525
11021	NC_015581	TAA	2	6	568150	568155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143525
11022	NC_015581	T	6	6	568255	568260	0 %	100 %	0 %	0 %	334143525
11023	NC_015581	GCA	2	6	568426	568431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143525
11024	NC_015581	TAAA	2	8	568433	568440	75 %	25 %	0 %	0 %	334143525
11025	NC_015581	TTA	2	6	568470	568475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143525
11026	NC_015581	T	6	6	568504	568509	0 %	100 %	0 %	0 %	334143525
11027	NC_015581	GGC	2	6	568553	568558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143526
11028	NC_015581	A	7	7	568579	568585	100 %	0 %	0 %	0 %	334143526
11029	NC_015581	GTC	2	6	568690	568695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143526
11030	NC_015581	TCT	2	6	568760	568765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143526
11031	NC_015581	TTGT	2	8	568879	568886	0 %	75 %	25 %	0 %	334143526
11032	NC_015581	T	8	8	568889	568896	0 %	100 %	0 %	0 %	334143526
11033	NC_015581	AGT	2	6	568995	569000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143526
11034	NC_015581	TGG	2	6	569081	569086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143526
11035	NC_015581	ATCC	2	8	569113	569120	25 %	25 %	0 %	50 %	334143526
11036	NC_015581	CCAT	2	8	569156	569163	25 %	25 %	0 %	50 %	334143526
11037	NC_015581	TTGGT	2	10	569218	569227	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_015581	ATG	2	6	569234	569239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_015581	ATG	2	6	569251	569256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_015581	ATGG	2	8	569295	569302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_015581	GTTT	2	8	569390	569397	0 %	75 %	25 %	0 %	334143527
11042	NC_015581	AGC	2	6	569405	569410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143527
11043	NC_015581	GAGTG	2	10	569524	569533	20 %	20 %	60 %	0 %	334143527
11044	NC_015581	GAA	2	6	569623	569628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143527
11045	NC_015581	CTTG	2	8	569655	569662	0 %	50 %	25 %	25 %	334143527
11046	NC_015581	GCC	2	6	569677	569682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143527
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11049	NC_015581	CAA	2	6	569898	569903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143528
11050	NC_015581	TGA	2	6	570203	570208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143528
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11052	NC_015581	AAC	2	6	570347	570352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143528
11053	NC_015581	GTC	3	9	570391	570399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143528
11054	NC_015581	ATT	2	6	570451	570456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143528
11055	NC_015581	TTG	2	6	570565	570570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143528
11056	NC_015581	GTG	2	6	570580	570585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143528
11057	NC_015581	CCGA	2	8	570624	570631	25 %	0 %	25 %	50 %	334143528
11058	NC_015581	GTG	2	6	570654	570659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143528
11059	NC_015581	A	6	6	570720	570725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_015581	GAAA	2	8	570758	570765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_015581	CAG	3	9	570800	570808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143529
11062	NC_015581	TCT	2	6	570826	570831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143529
11063	NC_015581	CTT	2	6	570890	570895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143529
11064	NC_015581	TTC	2	6	570972	570977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143529
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11067	NC_015581	TGT	2	6	571048	571053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143529
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11069	NC_015581	GCG	2	6	571193	571198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143529
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11071	NC_015581	GCC	2	6	571224	571229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143529
11072	NC_015581	GGT	2	6	571272	571277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143529
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11074	NC_015581	TCA	2	6	571372	571377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143529
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11076	NC_015581	GC	3	6	571586	571591	0 %	0 %	50 %	50 %	334143529
11077	NC_015581	TGG	2	6	571775	571780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143529
11078	NC_015581	AT	3	6	571900	571905	50 %	50 %	0 %	0 %	334143529
11079	NC_015581	TGTT	2	8	571906	571913	0 %	75 %	25 %	0 %	334143529
11080	NC_015581	TCG	2	6	571918	571923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143529
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11083	NC_015581	CCA	2	6	571966	571971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143529
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11085	NC_015581	TG	3	6	572145	572150	0 %	50 %	50 %	0 %	334143530
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11089	NC_015581	ATC	2	6	572407	572412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143530
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11092	NC_015581	TGG	2	6	572717	572722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143531
11093	NC_015581	TAG	2	6	572749	572754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143531
11094	NC_015581	TTC	2	6	572773	572778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143531
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11103	NC_015581	AAATT	2	10	573218	573227	60 %	40 %	0 %	0 %	334143532
11104	NC_015581	TCA	2	6	573370	573375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143532
11105	NC_015581	T	6	6	573413	573418	0 %	100 %	0 %	0 %	334143532
11106	NC_015581	CCA	2	6	573436	573441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143532
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11108	NC_015581	GTT	2	6	573701	573706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143532
11109	NC_015581	GTA	2	6	573752	573757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_015581	AAT	2	6	573758	573763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_015581	AAC	2	6	573769	573774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_015581	A	6	6	573862	573867	100 %	0 %	0 %	0 %	334143533
11113	NC_015581	TG	3	6	573878	573883	0 %	50 %	50 %	0 %	334143533
11114	NC_015581	GTCA	2	8	574029	574036	25 %	25 %	25 %	25 %	334143533
11115	NC_015581	CAGT	2	8	574088	574095	25 %	25 %	25 %	25 %	334143533
11116	NC_015581	TTAA	2	8	574110	574117	50 %	50 %	0 %	0 %	334143533
11117	NC_015581	ACA	2	6	574124	574129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143533
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11119	NC_015581	GCGT	2	8	574145	574152	0 %	25 %	50 %	25 %	334143533
11120	NC_015581	CAA	2	6	574164	574169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143533
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11122	NC_015581	GAG	2	6	574281	574286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143533
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