MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015581	ATT	3	9	542956	542964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_015581	T	7	7	542963	542969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_015581	AAAG	2	8	543003	543010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_015581	GT	3	6	543040	543045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_015581	T	6	6	543045	543050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_015581	T	7	7	543062	543068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_015581	CAT	2	6	543100	543105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_015581	TTGA	2	8	543179	543186	25 %	50 %	25 %	0 %	334143496
10509	NC_015581	ACCA	2	8	543211	543218	50 %	0 %	0 %	50 %	334143496
10510	NC_015581	ATT	2	6	543227	543232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143496
10511	NC_015581	ATT	2	6	543368	543373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143496
10512	NC_015581	TGT	2	6	543411	543416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143496
10513	NC_015581	GTG	2	6	543465	543470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143496
10514	NC_015581	CAA	2	6	543488	543493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143496
10515	NC_015581	TCA	3	9	543550	543558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143496
10516	NC_015581	TCA	2	6	543565	543570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143496
10517	NC_015581	ATT	2	6	543623	543628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143496
10518	NC_015581	A	7	7	543655	543661	100 %	0 %	0 %	0 %	334143496
10519	NC_015581	ATAC	2	8	543667	543674	50 %	25 %	0 %	25 %	334143496
10520	NC_015581	ATA	2	6	543685	543690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_015581	GGA	2	6	543702	543707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_015581	TAT	2	6	543708	543713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143497
10523	NC_015581	ACA	2	6	543718	543723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143497
10524	NC_015581	GCG	2	6	543763	543768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143497
10525	NC_015581	ATT	2	6	543771	543776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143497
10526	NC_015581	GCAG	2	8	543798	543805	25 %	0 %	50 %	25 %	334143497
10527	NC_015581	GGT	2	6	543861	543866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143497
10528	NC_015581	AGCG	2	8	543925	543932	25 %	0 %	50 %	25 %	334143497
10529	NC_015581	T	6	6	544083	544088	0 %	100 %	0 %	0 %	334143498
10530	NC_015581	GAA	2	6	544129	544134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143498
10531	NC_015581	TTAG	2	8	544148	544155	25 %	50 %	25 %	0 %	334143498
10532	NC_015581	CGC	2	6	544212	544217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143498
10533	NC_015581	GCT	2	6	544218	544223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143498
10534	NC_015581	ATCGC	2	10	544275	544284	20 %	20 %	20 %	40 %	334143498
10535	NC_015581	CGC	2	6	544323	544328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143498
10536	NC_015581	T	6	6	544375	544380	0 %	100 %	0 %	0 %	334143498
10537	NC_015581	CAA	2	6	544381	544386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143498
10538	NC_015581	TGTT	2	8	544456	544463	0 %	75 %	25 %	0 %	334143498
10539	NC_015581	ATC	2	6	544475	544480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
10540	NC_015581	AAG	2	6	544568	544573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143498
10541	NC_015581	TCT	2	6	544595	544600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143498
10542	NC_015581	TCA	2	6	544646	544651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
10543	NC_015581	TTG	2	6	544750	544755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143498
10544	NC_015581	ATC	2	6	544811	544816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
10545	NC_015581	CTT	2	6	544818	544823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143498
10546	NC_015581	CA	3	6	544874	544879	50 %	0 %	0 %	50 %	334143498
10547	NC_015581	ATC	2	6	544939	544944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
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10549	NC_015581	CAT	2	6	545152	545157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
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10551	NC_015581	CCAGGT	2	12	545263	545274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334143498
10552	NC_015581	TCT	2	6	545309	545314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143498
10553	NC_015581	TAC	2	6	545436	545441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143498
10554	NC_015581	GTG	2	6	545508	545513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143498
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10556	NC_015581	CTC	2	6	545629	545634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_015581	ATT	2	6	545649	545654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_015581	ATT	2	6	545698	545703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_015581	GGTTG	2	10	545711	545720	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_015581	ATT	2	6	545761	545766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143499
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10564	NC_015581	AC	3	6	545833	545838	50 %	0 %	0 %	50 %	334143499
10565	NC_015581	TCC	2	6	545983	545988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10566	NC_015581	TGT	2	6	546049	546054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_015581	T	7	7	546102	546108	0 %	100 %	0 %	0 %	334143500
10568	NC_015581	TTG	2	6	546151	546156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143500
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10573	NC_015581	GTCA	2	8	546358	546365	25 %	25 %	25 %	25 %	334143500
10574	NC_015581	GGT	2	6	546612	546617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143500
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10578	NC_015581	CGC	2	6	546904	546909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143501
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10580	NC_015581	CCGC	2	8	546981	546988	0 %	0 %	25 %	75 %	334143501
10581	NC_015581	CAT	2	6	547011	547016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143501
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10584	NC_015581	CGCC	2	8	547137	547144	0 %	0 %	25 %	75 %	334143501
10585	NC_015581	GTT	2	6	547176	547181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143501
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10588	NC_015581	TG	3	6	547436	547441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_015581	TTA	2	6	547445	547450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_015581	CTC	2	6	547550	547555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143502
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10592	NC_015581	GATT	2	8	547613	547620	25 %	50 %	25 %	0 %	334143502
10593	NC_015581	GAA	2	6	547666	547671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143502
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10595	NC_015581	CCG	2	6	547750	547755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143503
10596	NC_015581	ACAAT	2	10	547786	547795	60 %	20 %	0 %	20 %	334143503
10597	NC_015581	ATT	2	6	547826	547831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143503
10598	NC_015581	GAC	2	6	547897	547902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143503
10599	NC_015581	TGGT	2	8	547908	547915	0 %	50 %	50 %	0 %	334143503
10600	NC_015581	AAAC	2	8	547955	547962	75 %	0 %	0 %	25 %	334143503
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10603	NC_015581	GGT	2	6	548351	548356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143504
10604	NC_015581	GTT	2	6	548360	548365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143504
10605	NC_015581	TCG	2	6	548374	548379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143504
10606	NC_015581	GT	3	6	548507	548512	0 %	50 %	50 %	0 %	334143504
10607	NC_015581	TTG	2	6	548625	548630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143504
10608	NC_015581	GTT	2	6	548642	548647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143504
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10610	NC_015581	TGA	2	6	548714	548719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143504
10611	NC_015581	TCG	2	6	548809	548814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143504
10612	NC_015581	GTT	2	6	548864	548869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143504
10613	NC_015581	GCC	2	6	548874	548879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143504
10614	NC_015581	AGG	2	6	549070	549075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143504
10615	NC_015581	TAA	2	6	549114	549119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143504
10616	NC_015581	GCC	2	6	549205	549210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10617	NC_015581	CG	3	6	549225	549230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10618	NC_015581	TTA	2	6	549244	549249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_015581	T	6	6	549265	549270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_015581	TACT	2	8	549290	549297	25 %	50 %	0 %	25 %	334143505
10621	NC_015581	A	6	6	549329	549334	100 %	0 %	0 %	0 %	334143505
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10623	NC_015581	AGC	2	6	549453	549458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143505
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10989	NC_015581	TGG	2	6	566539	566544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143524
10990	NC_015581	TCG	2	6	566547	566552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143524
10991	NC_015581	TAA	2	6	566594	566599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143524
10992	NC_015581	TTC	2	6	566753	566758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143524
10993	NC_015581	CCTTG	2	10	566818	566827	0 %	40 %	20 %	40 %	334143524
10994	NC_015581	GCCA	2	8	566956	566963	25 %	0 %	25 %	50 %	334143524
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10999	NC_015581	T	6	6	567158	567163	0 %	100 %	0 %	0 %	334143524
11000	NC_015581	CGA	2	6	567271	567276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143524

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