MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015581	ATT	2	6	516623	516628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143473
10002	NC_015581	A	7	7	516672	516678	100 %	0 %	0 %	0 %	334143473
10003	NC_015581	TGT	2	6	516703	516708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_015581	ATT	2	6	516728	516733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_015581	GAT	2	6	516804	516809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143474
10006	NC_015581	AGCGCA	2	12	516843	516854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10007	NC_015581	AGTG	2	8	517008	517015	25 %	25 %	50 %	0 %	334143474
10008	NC_015581	GGC	2	6	517021	517026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143474
10009	NC_015581	CGAG	2	8	517109	517116	25 %	0 %	50 %	25 %	334143474
10010	NC_015581	TTA	2	6	517162	517167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143474
10011	NC_015581	GAC	2	6	517179	517184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10012	NC_015581	CAA	2	6	517210	517215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143474
10013	NC_015581	GAG	2	6	517220	517225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143474
10014	NC_015581	A	6	6	517273	517278	100 %	0 %	0 %	0 %	334143474
10015	NC_015581	CG	3	6	517298	517303	0 %	0 %	50 %	50 %	334143474
10016	NC_015581	GAC	2	6	517339	517344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10017	NC_015581	CCG	2	6	517350	517355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143474
10018	NC_015581	CGC	2	6	517375	517380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143474
10019	NC_015581	TAT	2	6	517455	517460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143474
10020	NC_015581	GTT	2	6	517521	517526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143474
10021	NC_015581	GAA	2	6	517555	517560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10022	NC_015581	TGA	2	6	517620	517625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143474
10023	NC_015581	GC	3	6	517699	517704	0 %	0 %	50 %	50 %	334143474
10024	NC_015581	TTGCA	2	10	517711	517720	20 %	40 %	20 %	20 %	334143474
10025	NC_015581	TGAA	2	8	517736	517743	50 %	25 %	25 %	0 %	334143474
10026	NC_015581	CGC	2	6	517767	517772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143474
10027	NC_015581	GAA	2	6	517816	517821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10028	NC_015581	GGC	3	9	517902	517910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143474
10029	NC_015581	TTGAT	2	10	517961	517970	20 %	60 %	20 %	0 %	334143474
10030	NC_015581	GCC	2	6	517978	517983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143474
10031	NC_015581	GAA	2	6	518017	518022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10032	NC_015581	A	6	6	518077	518082	100 %	0 %	0 %	0 %	334143474
10033	NC_015581	A	7	7	518101	518107	100 %	0 %	0 %	0 %	334143474
10034	NC_015581	GAA	2	6	518164	518169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10035	NC_015581	A	6	6	518176	518181	100 %	0 %	0 %	0 %	334143474
10036	NC_015581	AAG	2	6	518216	518221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10037	NC_015581	CGGAAG	2	12	518345	518356	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334143474
10038	NC_015581	CGA	2	6	518358	518363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10039	NC_015581	TAA	2	6	518382	518387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143474
10040	NC_015581	ATG	2	6	518449	518454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143474
10041	NC_015581	GAA	2	6	518485	518490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143474
10042	NC_015581	TGGT	2	8	518507	518514	0 %	50 %	50 %	0 %	334143474
10043	NC_015581	TCG	2	6	518550	518555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10044	NC_015581	CG	3	6	518558	518563	0 %	0 %	50 %	50 %	334143474
10045	NC_015581	GTTC	2	8	518594	518601	0 %	50 %	25 %	25 %	334143474
10046	NC_015581	GCC	2	6	518745	518750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143474
10047	NC_015581	GGT	2	6	518773	518778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143474
10048	NC_015581	CTG	2	6	518821	518826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10049	NC_015581	CTG	2	6	518866	518871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10050	NC_015581	GAC	2	6	518881	518886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10051	NC_015581	TGA	2	6	518942	518947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143474
10052	NC_015581	ATT	2	6	518968	518973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143474
10053	NC_015581	GGCG	2	8	518982	518989	0 %	0 %	75 %	25 %	334143474
10054	NC_015581	GAC	2	6	519070	519075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143474
10055	NC_015581	TGG	2	6	519155	519160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143474
10056	NC_015581	GC	3	6	519236	519241	0 %	0 %	50 %	50 %	334143474
10057	NC_015581	T	6	6	519430	519435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015581	ACC	2	6	519450	519455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_015581	TGG	2	6	519461	519466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_015581	CGG	2	6	519480	519485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143475
10061	NC_015581	TGT	2	6	519525	519530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143475
10062	NC_015581	TTC	2	6	519560	519565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143475
10063	NC_015581	TGC	2	6	519582	519587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143475
10064	NC_015581	CTT	2	6	519625	519630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143475
10065	NC_015581	CAG	2	6	519647	519652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143475
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10067	NC_015581	TCG	2	6	519939	519944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143475
10068	NC_015581	TGG	2	6	520087	520092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143475
10069	NC_015581	TGA	2	6	520150	520155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143475
10070	NC_015581	GCAC	2	8	520212	520219	25 %	0 %	25 %	50 %	334143475
10071	NC_015581	CCA	2	6	520309	520314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143475
10072	NC_015581	TCT	2	6	520428	520433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143475
10073	NC_015581	AGGTTC	2	12	520439	520450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334143475
10074	NC_015581	CTG	2	6	520459	520464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143475
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10077	NC_015581	GTT	2	6	520592	520597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143475
10078	NC_015581	TTGA	2	8	520706	520713	25 %	50 %	25 %	0 %	334143475
10079	NC_015581	ATG	2	6	520758	520763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143475
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10084	NC_015581	CCTTG	2	10	521128	521137	0 %	40 %	20 %	40 %	334143475
10085	NC_015581	TGT	2	6	521217	521222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143475
10086	NC_015581	TGGT	2	8	521239	521246	0 %	50 %	50 %	0 %	334143475
10087	NC_015581	TGA	2	6	521264	521269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143475
10088	NC_015581	GA	3	6	521310	521315	50 %	0 %	50 %	0 %	334143475
10089	NC_015581	A	6	6	521426	521431	100 %	0 %	0 %	0 %	334143475
10090	NC_015581	GTTG	2	8	521450	521457	0 %	50 %	50 %	0 %	334143475
10091	NC_015581	GGC	2	6	521516	521521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143475
10092	NC_015581	GAG	2	6	521648	521653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143475
10093	NC_015581	GTA	2	6	521667	521672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143475
10094	NC_015581	TAA	2	6	521744	521749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143475
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10096	NC_015581	TCA	2	6	521802	521807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143475
10097	NC_015581	CGG	2	6	521812	521817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143475
10098	NC_015581	GT	3	6	521904	521909	0 %	50 %	50 %	0 %	334143475
10099	NC_015581	CCAA	2	8	522023	522030	50 %	0 %	0 %	50 %	334143475
10100	NC_015581	TCA	2	6	522037	522042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143475
10101	NC_015581	TG	3	6	522107	522112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_015581	ATT	2	6	522129	522134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143476
10103	NC_015581	T	6	6	522145	522150	0 %	100 %	0 %	0 %	334143476
10104	NC_015581	GGC	2	6	522297	522302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143476
10105	NC_015581	CCA	2	6	522329	522334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143476
10106	NC_015581	ATT	2	6	522337	522342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143476
10107	NC_015581	GTT	2	6	522391	522396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143476
10108	NC_015581	TGGGT	2	10	522496	522505	0 %	40 %	60 %	0 %	334143476
10109	NC_015581	CAAC	2	8	522515	522522	50 %	0 %	0 %	50 %	334143476
10110	NC_015581	TCG	2	6	522538	522543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143476
10111	NC_015581	AG	3	6	522583	522588	50 %	0 %	50 %	0 %	334143476
10112	NC_015581	GGT	2	6	522607	522612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143476
10113	NC_015581	TGT	3	9	522619	522627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143476
10114	NC_015581	CAT	2	6	522731	522736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143476
10115	NC_015581	GGT	2	6	522765	522770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143476
10116	NC_015581	T	6	6	522863	522868	0 %	100 %	0 %	0 %	334143476
10117	NC_015581	AG	3	6	522891	522896	50 %	0 %	50 %	0 %	334143476
10118	NC_015581	TCA	2	6	522908	522913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143476
10119	NC_015581	GGA	2	6	522914	522919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_015581	AATC	2	8	522972	522979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_015581	CTA	2	6	523006	523011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10123	NC_015581	TAGG	2	8	523034	523041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10227	NC_015581	AGTT	2	8	528603	528610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10228	NC_015581	GTTT	2	8	528623	528630	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_015581	TTA	2	6	528897	528902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143484
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10486	NC_015581	ATC	2	6	542207	542212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143495
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