MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015581	ATTA	2	8	404748	404755	50 %	50 %	0 %	0 %	334143416
8002	NC_015581	TAA	2	6	404808	404813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_015581	A	6	6	404812	404817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_015581	ATA	2	6	404839	404844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_015581	AAT	2	6	404860	404865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015581	AGGA	2	8	404879	404886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_015581	AAT	2	6	404910	404915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_015581	T	6	6	404933	404938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015581	ATT	2	6	404957	404962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_015581	GA	3	6	405023	405028	50 %	0 %	50 %	0 %	334143417
8011	NC_015581	CTG	2	6	405072	405077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143417
8012	NC_015581	CTG	2	6	405114	405119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143417
8013	NC_015581	TCT	2	6	405226	405231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143417
8014	NC_015581	ATC	2	6	405331	405336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143417
8015	NC_015581	GGC	3	9	405381	405389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143417
8016	NC_015581	GCCA	2	8	405418	405425	25 %	0 %	25 %	50 %	334143417
8017	NC_015581	GTTGAT	2	12	405470	405481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	334143417
8018	NC_015581	TGA	2	6	405710	405715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143417
8019	NC_015581	ACC	2	6	405809	405814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143418
8020	NC_015581	GCT	2	6	405931	405936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143418
8021	NC_015581	TAA	2	6	405957	405962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143418
8022	NC_015581	GC	3	6	406059	406064	0 %	0 %	50 %	50 %	334143418
8023	NC_015581	AGC	2	6	406094	406099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143418
8024	NC_015581	TTG	2	6	406109	406114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143418
8025	NC_015581	GTC	2	6	406183	406188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143418
8026	NC_015581	CGG	2	6	406201	406206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143418
8027	NC_015581	TGG	2	6	406262	406267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143418
8028	NC_015581	ATC	2	6	406316	406321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143418
8029	NC_015581	CCA	2	6	406377	406382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143418
8030	NC_015581	AAATC	2	10	406383	406392	60 %	20 %	0 %	20 %	334143418
8031	NC_015581	CCG	2	6	406413	406418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143418
8032	NC_015581	GCA	2	6	406506	406511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143418
8033	NC_015581	TTGGC	2	10	406583	406592	0 %	40 %	40 %	20 %	334143418
8034	NC_015581	GTT	2	6	406638	406643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143418
8035	NC_015581	GCA	2	6	406768	406773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143418
8036	NC_015581	CCG	2	6	406797	406802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143418
8037	NC_015581	CCA	2	6	406869	406874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143418
8038	NC_015581	GTA	2	6	406881	406886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143418
8039	NC_015581	TTG	2	6	407035	407040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143418
8040	NC_015581	AAT	2	6	407041	407046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143418
8041	NC_015581	TCA	2	6	407080	407085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143419
8042	NC_015581	GCG	2	6	407125	407130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143419
8043	NC_015581	ATA	2	6	407137	407142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143419
8044	NC_015581	TTG	2	6	407184	407189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143419
8045	NC_015581	CCG	2	6	407219	407224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143419
8046	NC_015581	TTTGG	2	10	407275	407284	0 %	60 %	40 %	0 %	334143419
8047	NC_015581	TTC	2	6	407298	407303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143419
8048	NC_015581	GTA	2	6	407342	407347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143419
8049	NC_015581	GCA	2	6	407378	407383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143419
8050	NC_015581	CAC	2	6	407388	407393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143419
8051	NC_015581	GAG	2	6	407681	407686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143419
8052	NC_015581	A	6	6	407700	407705	100 %	0 %	0 %	0 %	334143419
8053	NC_015581	TAC	2	6	407733	407738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143419
8054	NC_015581	T	6	6	407796	407801	0 %	100 %	0 %	0 %	334143419
8055	NC_015581	CTG	2	6	407837	407842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143419
8056	NC_015581	CTT	2	6	407937	407942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143419
8057	NC_015581	TAA	2	6	407963	407968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143419
8058	NC_015581	TGC	2	6	408001	408006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143419
8059	NC_015581	TCC	2	6	408099	408104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143420
8060	NC_015581	CGG	2	6	408163	408168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143420
8061	NC_015581	GGCATA	2	12	408170	408181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334143420
8062	NC_015581	CG	3	6	408205	408210	0 %	0 %	50 %	50 %	334143420
8063	NC_015581	AAT	2	6	408239	408244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143420
8064	NC_015581	TCAT	2	8	408273	408280	25 %	50 %	0 %	25 %	334143420
8065	NC_015581	GGC	2	6	408281	408286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143420
8066	NC_015581	ATGA	2	8	408305	408312	50 %	25 %	25 %	0 %	334143420
8067	NC_015581	GC	3	6	408376	408381	0 %	0 %	50 %	50 %	334143420
8068	NC_015581	TGG	2	6	408391	408396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143420
8069	NC_015581	AT	3	6	408477	408482	50 %	50 %	0 %	0 %	334143420
8070	NC_015581	CGC	2	6	408484	408489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143420
8071	NC_015581	A	7	7	408524	408530	100 %	0 %	0 %	0 %	334143420
8072	NC_015581	CCAG	2	8	408606	408613	25 %	0 %	25 %	50 %	334143421
8073	NC_015581	GGC	2	6	408631	408636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143421
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8076	NC_015581	GCT	2	6	408705	408710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143421
8077	NC_015581	CCG	2	6	408711	408716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143421
8078	NC_015581	GTT	2	6	408729	408734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143421
8079	NC_015581	CCA	2	6	408767	408772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143421
8080	NC_015581	TCG	2	6	408815	408820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143421
8081	NC_015581	ACCA	2	8	408841	408848	50 %	0 %	0 %	50 %	334143421
8082	NC_015581	GACC	2	8	408852	408859	25 %	0 %	25 %	50 %	334143421
8083	NC_015581	GACC	2	8	408960	408967	25 %	0 %	25 %	50 %	334143421
8084	NC_015581	GGCC	2	8	409066	409073	0 %	0 %	50 %	50 %	334143422
8085	NC_015581	GCT	2	6	409076	409081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143422
8086	NC_015581	A	6	6	409083	409088	100 %	0 %	0 %	0 %	334143422
8087	NC_015581	AAGCG	2	10	409103	409112	40 %	0 %	40 %	20 %	334143422
8088	NC_015581	TTC	2	6	409199	409204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143422
8089	NC_015581	TCA	2	6	409320	409325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143422
8090	NC_015581	CATT	2	8	409344	409351	25 %	50 %	0 %	25 %	334143422
8091	NC_015581	TTTA	2	8	409508	409515	25 %	75 %	0 %	0 %	334143422
8092	NC_015581	TGT	2	6	409533	409538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143422
8093	NC_015581	AAATTT	2	12	409690	409701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_015581	TTG	2	6	409769	409774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143423
8095	NC_015581	AGTA	2	8	409782	409789	50 %	25 %	25 %	0 %	334143423
8096	NC_015581	CTGGGT	2	12	409876	409887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334143423
8097	NC_015581	CAC	2	6	410122	410127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143423
8098	NC_015581	TAA	2	6	410134	410139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143423
8099	NC_015581	TTC	2	6	410159	410164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143423
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8102	NC_015581	GTT	2	6	410231	410236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143423
8103	NC_015581	GTT	2	6	410248	410253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143423
8104	NC_015581	GTG	2	6	410323	410328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143423
8105	NC_015581	TTG	2	6	410426	410431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143423
8106	NC_015581	CGG	2	6	410449	410454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143423
8107	NC_015581	A	6	6	410547	410552	100 %	0 %	0 %	0 %	334143423
8108	NC_015581	TGT	2	6	410553	410558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143423
8109	NC_015581	CGC	2	6	410573	410578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143423
8110	NC_015581	GGGTT	2	10	410658	410667	0 %	40 %	60 %	0 %	334143423
8111	NC_015581	TTAG	2	8	410724	410731	25 %	50 %	25 %	0 %	334143423
8112	NC_015581	TTC	2	6	410781	410786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143424
8113	NC_015581	CG	3	6	410956	410961	0 %	0 %	50 %	50 %	334143424
8114	NC_015581	CACC	2	8	411004	411011	25 %	0 %	0 %	75 %	334143424
8115	NC_015581	GGC	2	6	411012	411017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143424
8116	NC_015581	CGCC	2	8	411035	411042	0 %	0 %	25 %	75 %	334143424
8117	NC_015581	GCC	2	6	411149	411154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143424
8118	NC_015581	CAC	2	6	411224	411229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143424
8119	NC_015581	CAA	2	6	411272	411277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143424
8120	NC_015581	GTT	2	6	411287	411292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143424
8121	NC_015581	ACC	2	6	411388	411393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143424
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8123	NC_015581	GCT	2	6	411503	411508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143424
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8229	NC_015581	A	6	6	416953	416958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8233	NC_015581	GTTT	2	8	417057	417064	0 %	75 %	25 %	0 %	334143429
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8244	NC_015581	TAA	2	6	417690	417695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143431
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8493	NC_015581	GGT	2	6	430861	430866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143445
8494	NC_015581	GCT	2	6	430886	430891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143445
8495	NC_015581	ATT	2	6	431075	431080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143445
8496	NC_015581	AACTT	2	10	431133	431142	40 %	40 %	0 %	20 %	334143445
8497	NC_015581	GAT	2	6	431185	431190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143445
8498	NC_015581	GTG	2	6	431238	431243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143445
8499	NC_015581	CAA	2	6	431260	431265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143445
8500	NC_015581	GT	3	6	431322	431327	0 %	50 %	50 %	0 %	334143445

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