MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015581	TGC	2	6	332662	332667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6502	NC_015581	TCG	2	6	332718	332723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6503	NC_015581	CAC	2	6	332785	332790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6504	NC_015581	CTC	2	6	332830	332835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143384
6505	NC_015581	CGC	2	6	332857	332862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
6506	NC_015581	GTGAC	2	10	332934	332943	20 %	20 %	40 %	20 %	334143384
6507	NC_015581	TCG	2	6	332955	332960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6508	NC_015581	GTG	2	6	332961	332966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6509	NC_015581	CGG	2	6	333036	333041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6510	NC_015581	CAC	2	6	333049	333054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6511	NC_015581	GGT	2	6	333062	333067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6512	NC_015581	TGG	2	6	333082	333087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6513	NC_015581	ACC	3	9	333095	333103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6514	NC_015581	GCC	2	6	333176	333181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
6515	NC_015581	TAA	2	6	333184	333189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143384
6516	NC_015581	CAA	2	6	333223	333228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6517	NC_015581	TCA	2	6	333267	333272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143384
6518	NC_015581	GGCG	2	8	333298	333305	0 %	0 %	75 %	25 %	334143384
6519	NC_015581	CTGGAT	2	12	333440	333451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334143384
6520	NC_015581	CAA	2	6	333595	333600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6521	NC_015581	GCAG	2	8	333641	333648	25 %	0 %	50 %	25 %	334143384
6522	NC_015581	CGG	2	6	333715	333720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6523	NC_015581	CA	3	6	333721	333726	50 %	0 %	0 %	50 %	334143384
6524	NC_015581	ACG	2	6	333779	333784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6525	NC_015581	GTA	2	6	333879	333884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6526	NC_015581	GCG	2	6	333917	333922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6527	NC_015581	CAC	2	6	333994	333999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6528	NC_015581	TTG	2	6	334037	334042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143384
6529	NC_015581	TAA	2	6	334129	334134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143384
6530	NC_015581	CAC	3	9	334162	334170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6531	NC_015581	GCAA	2	8	334210	334217	50 %	0 %	25 %	25 %	334143384
6532	NC_015581	CGGTG	2	10	334228	334237	0 %	20 %	60 %	20 %	334143384
6533	NC_015581	CCA	2	6	334260	334265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6534	NC_015581	CAG	2	6	334275	334280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6535	NC_015581	CTG	2	6	334301	334306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6536	NC_015581	ACC	2	6	334316	334321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6537	NC_015581	ATA	2	6	334374	334379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143384
6538	NC_015581	GTG	2	6	334452	334457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6539	NC_015581	CGG	2	6	334525	334530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6540	NC_015581	TGG	2	6	334594	334599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6541	NC_015581	CGGTG	2	10	334648	334657	0 %	20 %	60 %	20 %	334143384
6542	NC_015581	CG	3	6	334737	334742	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
6543	NC_015581	ATG	2	6	334797	334802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6544	NC_015581	ACA	2	6	334905	334910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6545	NC_015581	ACC	2	6	334925	334930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6546	NC_015581	GTG	2	6	335021	335026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6547	NC_015581	CGC	2	6	335053	335058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
6548	NC_015581	TAA	2	6	335155	335160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143384
6549	NC_015581	TTA	2	6	335166	335171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143384
6550	NC_015581	CCA	2	6	335238	335243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6551	NC_015581	GGC	2	6	335255	335260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6552	NC_015581	AAC	2	6	335318	335323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6553	NC_015581	GGC	2	6	335341	335346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6554	NC_015581	CAA	2	6	335347	335352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6555	NC_015581	CAA	2	6	335401	335406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6556	NC_015581	GTG	2	6	335457	335462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6557	NC_015581	CAA	2	6	335464	335469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6558	NC_015581	TGG	2	6	335677	335682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6559	NC_015581	ACC	2	6	335696	335701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6560	NC_015581	GCG	2	6	335726	335731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6561	NC_015581	CGG	2	6	335749	335754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6562	NC_015581	ATT	2	6	335756	335761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143384
6563	NC_015581	ACG	2	6	335793	335798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6564	NC_015581	TAC	2	6	335818	335823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143384
6565	NC_015581	TGG	2	6	335917	335922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6566	NC_015581	TGT	2	6	335923	335928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143384
6567	NC_015581	GCG	2	6	335972	335977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6568	NC_015581	GGT	2	6	335996	336001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6569	NC_015581	CAC	2	6	336007	336012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6570	NC_015581	GGCA	2	8	336022	336029	25 %	0 %	50 %	25 %	334143384
6571	NC_015581	GATT	2	8	336109	336116	25 %	50 %	25 %	0 %	334143384
6572	NC_015581	GC	3	6	336131	336136	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
6573	NC_015581	TCT	2	6	336172	336177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143384
6574	NC_015581	GCC	2	6	336227	336232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
6575	NC_015581	GC	3	6	336253	336258	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
6576	NC_015581	GCA	2	6	336350	336355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6577	NC_015581	TCA	2	6	336363	336368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143384
6578	NC_015581	CCA	2	6	336435	336440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6579	NC_015581	AGC	2	6	336635	336640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6580	NC_015581	GAA	2	6	336648	336653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143384
6581	NC_015581	CCGGCA	2	12	336672	336683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334143384
6582	NC_015581	AGG	2	6	336706	336711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143384
6583	NC_015581	ACA	2	6	336723	336728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6584	NC_015581	TGAGT	2	10	336757	336766	20 %	40 %	40 %	0 %	334143384
6585	NC_015581	ATG	2	6	336774	336779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6586	NC_015581	T	6	6	336822	336827	0 %	100 %	0 %	0 %	334143384
6587	NC_015581	AGG	2	6	336858	336863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143384
6588	NC_015581	CTG	2	6	336909	336914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6589	NC_015581	CCAG	2	8	336966	336973	25 %	0 %	25 %	50 %	334143384
6590	NC_015581	TGA	2	6	337012	337017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6591	NC_015581	AAC	2	6	337088	337093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6592	NC_015581	CGA	3	9	337123	337131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6593	NC_015581	ATG	2	6	337143	337148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6594	NC_015581	GCG	2	6	337149	337154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6595	NC_015581	AATT	2	8	337159	337166	50 %	50 %	0 %	0 %	334143384
6596	NC_015581	CGG	2	6	337309	337314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
6597	NC_015581	AGT	2	6	337328	337333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6598	NC_015581	ATCG	2	8	337346	337353	25 %	25 %	25 %	25 %	334143384
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6600	NC_015581	GGT	2	6	337424	337429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6601	NC_015581	GTCA	2	8	337432	337439	25 %	25 %	25 %	25 %	334143384
6602	NC_015581	ACG	2	6	337473	337478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6603	NC_015581	TGG	2	6	337555	337560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6604	NC_015581	GAT	2	6	337577	337582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
6605	NC_015581	TCACGC	2	12	337605	337616	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334143384
6606	NC_015581	TGT	2	6	337744	337749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143384
6607	NC_015581	TGG	2	6	337750	337755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
6608	NC_015581	ATCA	2	8	337781	337788	50 %	25 %	0 %	25 %	334143384
6609	NC_015581	GGCACG	2	12	337856	337867	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334143384
6610	NC_015581	CAG	2	6	337915	337920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6611	NC_015581	ACG	2	6	337949	337954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6612	NC_015581	GGC	2	6	338000	338005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
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6615	NC_015581	AGC	2	6	338153	338158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6616	NC_015581	ACC	3	9	338177	338185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6617	NC_015581	CAC	2	6	338215	338220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6618	NC_015581	GCGAC	2	10	338229	338238	20 %	0 %	40 %	40 %	334143384
6619	NC_015581	ATG	2	6	338250	338255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
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6982	NC_015581	CAC	2	6	355858	355863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6983	NC_015581	CCA	2	6	356043	356048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
6984	NC_015581	CAGC	2	8	356091	356098	25 %	0 %	25 %	50 %	334143384
6985	NC_015581	GC	3	6	356121	356126	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
6986	NC_015581	CTG	2	6	356136	356141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6987	NC_015581	AGC	2	6	356192	356197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
6988	NC_015581	ACTG	2	8	356203	356210	25 %	25 %	25 %	25 %	334143384
6989	NC_015581	GAACA	2	10	356225	356234	60 %	0 %	20 %	20 %	334143384
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6994	NC_015581	CTCTG	2	10	356548	356557	0 %	40 %	20 %	40 %	334143384
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7000	NC_015581	CAC	2	6	356890	356895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384

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