MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015581	CAC	2	6	287113	287118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143381
5502	NC_015581	TGC	2	6	287136	287141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143381
5503	NC_015581	CGC	2	6	287145	287150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143381
5504	NC_015581	CGG	2	6	287182	287187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143381
5505	NC_015581	CTA	2	6	287188	287193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143381
5506	NC_015581	CAA	2	6	287230	287235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5507	NC_015581	ACC	2	6	287312	287317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143381
5508	NC_015581	CGA	2	6	287386	287391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143381
5509	NC_015581	GGC	2	6	287405	287410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143381
5510	NC_015581	CGGC	2	8	287412	287419	0 %	0 %	50 %	50 %	334143381
5511	NC_015581	ATT	2	6	287444	287449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143381
5512	NC_015581	ACT	2	6	287508	287513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143381
5513	NC_015581	CAA	2	6	287515	287520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5514	NC_015581	ACA	2	6	287544	287549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5515	NC_015581	CAA	2	6	287585	287590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5516	NC_015581	AGG	2	6	287596	287601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143381
5517	NC_015581	GCG	2	6	287631	287636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143381
5518	NC_015581	CGA	2	6	287659	287664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143381
5519	NC_015581	CAA	2	6	287689	287694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5520	NC_015581	CAA	3	9	287702	287710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143381
5521	NC_015581	A	6	6	287751	287756	100 %	0 %	0 %	0 %	334143381
5522	NC_015581	CCG	2	6	287823	287828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143381
5523	NC_015581	GGT	2	6	287873	287878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143381
5524	NC_015581	TAAT	2	8	287997	288004	50 %	50 %	0 %	0 %	334143381
5525	NC_015581	TGA	2	6	288133	288138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143381
5526	NC_015581	GTA	2	6	288153	288158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143381
5527	NC_015581	TGG	2	6	288218	288223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143381
5528	NC_015581	TTAA	2	8	288248	288255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015581	GAC	2	6	288280	288285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_015581	AAC	2	6	288309	288314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143382
5531	NC_015581	AC	3	6	288336	288341	50 %	0 %	0 %	50 %	334143382
5532	NC_015581	AGC	2	6	288493	288498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143382
5533	NC_015581	TCG	2	6	288596	288601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143382
5534	NC_015581	GTAT	2	8	288642	288649	25 %	50 %	25 %	0 %	334143382
5535	NC_015581	A	6	6	288678	288683	100 %	0 %	0 %	0 %	334143382
5536	NC_015581	AACC	2	8	288712	288719	50 %	0 %	0 %	50 %	334143382
5537	NC_015581	CTT	2	6	288743	288748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143382
5538	NC_015581	CAG	2	6	288827	288832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143382
5539	NC_015581	AAC	2	6	288984	288989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143382
5540	NC_015581	AAT	2	6	289026	289031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143382
5541	NC_015581	CAG	2	6	289039	289044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143382
5542	NC_015581	GCG	2	6	289053	289058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143382
5543	NC_015581	TAA	2	6	289097	289102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015581	T	9	9	289140	289148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015581	CAAT	2	8	289149	289156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_015581	CAA	3	9	289157	289165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015581	CCG	2	6	289258	289263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143383
5548	NC_015581	CAG	2	6	289267	289272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143383
5549	NC_015581	CGC	2	6	289286	289291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143383
5550	NC_015581	CGC	2	6	289315	289320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143383
5551	NC_015581	TGG	2	6	289438	289443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143383
5552	NC_015581	CTG	2	6	289484	289489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143383
5553	NC_015581	GCGA	2	8	289525	289532	25 %	0 %	50 %	25 %	334143383
5554	NC_015581	TAC	2	6	289558	289563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143383
5555	NC_015581	A	6	6	289653	289658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015581	AGAA	2	8	289674	289681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015581	A	7	7	289689	289695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015581	A	8	8	289724	289731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015581	GTT	2	6	289732	289737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015581	AGT	2	6	289806	289811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015581	GC	3	6	289855	289860	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
5562	NC_015581	AGGCAA	2	12	289936	289947	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	334143384
5563	NC_015581	GCG	2	6	289956	289961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5564	NC_015581	GTG	2	6	290037	290042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5565	NC_015581	TCA	2	6	290098	290103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143384
5566	NC_015581	TCA	2	6	290118	290123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143384
5567	NC_015581	CCAGC	2	10	290173	290182	20 %	0 %	20 %	60 %	334143384
5568	NC_015581	AAC	2	6	290216	290221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
5569	NC_015581	GGC	2	6	290318	290323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5570	NC_015581	ACA	2	6	290367	290372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
5571	NC_015581	GGC	2	6	290441	290446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5572	NC_015581	GCG	2	6	290481	290486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5573	NC_015581	GCG	2	6	290610	290615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5574	NC_015581	GTG	2	6	290639	290644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5575	NC_015581	GCCCAA	2	12	290654	290665	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	334143384
5576	NC_015581	ATCG	2	8	290716	290723	25 %	25 %	25 %	25 %	334143384
5577	NC_015581	GGC	2	6	290753	290758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5578	NC_015581	GGC	2	6	290819	290824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5579	NC_015581	ATCCTC	2	12	290828	290839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	334143384
5580	NC_015581	AAGCT	2	10	290865	290874	40 %	20 %	20 %	20 %	334143384
5581	NC_015581	CGG	3	9	290893	290901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5582	NC_015581	CGG	2	6	290914	290919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5583	NC_015581	CAAGGC	2	12	290927	290938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
5584	NC_015581	CCA	2	6	290952	290957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
5585	NC_015581	CGG	2	6	291013	291018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5586	NC_015581	GGC	2	6	291092	291097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5587	NC_015581	GCG	2	6	291105	291110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5588	NC_015581	GGC	2	6	291113	291118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5589	NC_015581	CTT	2	6	291136	291141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143384
5590	NC_015581	CCA	2	6	291168	291173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
5591	NC_015581	GGC	2	6	291191	291196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5592	NC_015581	GGC	2	6	291239	291244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5593	NC_015581	TGG	2	6	291265	291270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5594	NC_015581	CAC	2	6	291340	291345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
5595	NC_015581	GGC	2	6	291371	291376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5596	NC_015581	GCG	2	6	291404	291409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5597	NC_015581	GC	3	6	291528	291533	0 %	0 %	50 %	50 %	334143384
5598	NC_015581	CAC	2	6	291574	291579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143384
5599	NC_015581	CAA	2	6	291586	291591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
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5601	NC_015581	CGGTGG	2	12	291667	291678	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	334143384
5602	NC_015581	TGG	2	6	291706	291711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
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5604	NC_015581	GGC	2	6	291731	291736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5605	NC_015581	CGC	2	6	291768	291773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
5606	NC_015581	TGG	2	6	291793	291798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5607	NC_015581	TGG	2	6	291802	291807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5608	NC_015581	TGT	2	6	291820	291825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143384
5609	NC_015581	GGT	2	6	291872	291877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5610	NC_015581	GGC	2	6	291878	291883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5611	NC_015581	GGT	2	6	291884	291889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5612	NC_015581	TGA	2	6	291946	291951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143384
5613	NC_015581	GCG	2	6	291966	291971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5614	NC_015581	GTG	2	6	291972	291977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5615	NC_015581	GCT	2	6	291980	291985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
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5617	NC_015581	CAA	2	6	292051	292056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
5618	NC_015581	GTG	2	6	292059	292064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5619	NC_015581	TAGC	2	8	292083	292090	25 %	25 %	25 %	25 %	334143384
5620	NC_015581	TGG	5	15	292114	292128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
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5622	NC_015581	GGC	3	9	292172	292180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
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5857	NC_015581	ACGGT	2	10	302181	302190	20 %	20 %	40 %	20 %	334143384
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5860	NC_015581	ACCA	2	8	302372	302379	50 %	0 %	0 %	50 %	334143384
5861	NC_015581	GGC	2	6	302381	302386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
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5986	NC_015581	TAA	2	6	307810	307815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143384
5987	NC_015581	CGT	2	6	307825	307830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
5988	NC_015581	GGT	2	6	307841	307846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5989	NC_015581	GGC	2	6	307904	307909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5990	NC_015581	GGC	2	6	307931	307936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5991	NC_015581	CGGCAC	2	12	307999	308010	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334143384
5992	NC_015581	GGT	2	6	308092	308097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143384
5993	NC_015581	GCA	2	6	308215	308220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143384
5994	NC_015581	CAA	2	6	308272	308277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
5995	NC_015581	CCG	2	6	308310	308315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143384
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5997	NC_015581	CGT	2	6	308364	308369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143384
5998	NC_015581	GGC	2	6	308375	308380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143384
5999	NC_015581	AAC	2	6	308396	308401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143384
6000	NC_015581	GGCG	2	8	308485	308492	0 %	0 %	75 %	25 %	334143384

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