MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015581	TTA	2	6	261787	261792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015581	TAG	2	6	261800	261805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015581	GAA	2	6	261922	261927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015581	AGAT	2	8	261963	261970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015581	TGC	2	6	261998	262003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015581	GTC	2	6	262010	262015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015581	TCGTG	2	10	262019	262028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5008	NC_015581	GGA	2	6	262122	262127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015581	GAC	2	6	262135	262140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_015581	TCA	2	6	262147	262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_015581	ATGGG	2	10	262161	262170	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015581	AC	3	6	262173	262178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_015581	GGT	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015581	A	6	6	262233	262238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015581	AC	3	6	262342	262347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_015581	GGA	2	6	262402	262407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015581	CCT	2	6	262483	262488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_015581	GGT	2	6	262633	262638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015581	CAC	2	6	262656	262661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015581	GCCT	2	8	262689	262696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_015581	AGG	2	6	262704	262709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015581	CGG	2	6	262711	262716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015581	CCA	2	6	262734	262739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_015581	TGA	2	6	262766	262771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015581	TTA	2	6	262806	262811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015581	TGA	2	6	262902	262907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_015581	TGA	2	6	262972	262977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_015581	GAA	2	6	263002	263007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015581	TTGA	2	8	263041	263048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015581	AGGTCA	2	12	263077	263088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5031	NC_015581	AGTT	2	8	263092	263099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015581	TAA	2	6	263103	263108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015581	GGA	2	6	263319	263324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015581	GCG	2	6	263353	263358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_015581	CGA	2	6	263417	263422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015581	G	6	6	263505	263510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015581	ACC	2	6	263511	263516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_015581	CT	3	6	263532	263537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_015581	ACCG	2	8	263538	263545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015581	AGG	2	6	263587	263592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015581	GTAC	2	8	263618	263625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_015581	AGT	2	6	263661	263666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015581	AGCGA	2	10	263700	263709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5044	NC_015581	A	6	6	263718	263723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015581	TG	3	6	263788	263793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015581	TAG	2	6	263849	263854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015581	AGC	2	6	264091	264096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_015581	CAA	2	6	264117	264122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_015581	GACA	2	8	264137	264144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_015581	AAC	2	6	264175	264180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015581	AGG	2	6	264248	264253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015581	AGC	2	6	264264	264269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015581	AAAG	2	8	264278	264285	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015581	CGT	2	6	264382	264387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015581	TGA	2	6	264706	264711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015581	TCT	2	6	264757	264762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015581	GA	3	6	264833	264838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015581	TGAAGG	2	12	264896	264907	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015581	TTA	2	6	264959	264964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015581	CGG	2	6	265085	265090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_015581	ACC	2	6	265356	265361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_015581	TGG	2	6	265417	265422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015581	TCC	2	6	265443	265448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_015581	GGA	2	6	265460	265465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015581	GACA	2	8	265537	265544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_015581	GGT	2	6	265580	265585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015581	TG	3	6	265588	265593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015581	CGG	2	6	265667	265672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015581	TCA	2	6	265695	265700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_015581	CGT	2	6	265775	265780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015581	G	6	6	265824	265829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015581	CTG	2	6	265896	265901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_015581	TCT	2	6	265985	265990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015581	TG	3	6	266044	266049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015581	TG	3	6	266112	266117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015581	ACC	2	6	266252	266257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_015581	T	9	9	266374	266382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_015581	T	6	6	266388	266393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015581	TTTA	2	8	266414	266421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015581	AAT	2	6	266492	266497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143362
5081	NC_015581	CAA	2	6	266554	266559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143362
5082	NC_015581	CCA	2	6	266789	266794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143362
5083	NC_015581	AATTG	2	10	266858	266867	40 %	40 %	20 %	0 %	334143362
5084	NC_015581	GC	3	6	266870	266875	0 %	0 %	50 %	50 %	334143362
5085	NC_015581	ATT	2	6	266895	266900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143362
5086	NC_015581	ACC	2	6	266924	266929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143362
5087	NC_015581	ACA	2	6	266933	266938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143362
5088	NC_015581	GGTT	2	8	266961	266968	0 %	50 %	50 %	0 %	334143362
5089	NC_015581	TAAACG	2	12	267064	267075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	334143362
5090	NC_015581	CTA	2	6	267152	267157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143362
5091	NC_015581	TAT	2	6	267192	267197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143362
5092	NC_015581	TTA	2	6	267326	267331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143363
5093	NC_015581	GAAC	2	8	267333	267340	50 %	0 %	25 %	25 %	334143363
5094	NC_015581	CAA	2	6	267466	267471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143363
5095	NC_015581	ACT	2	6	267477	267482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5096	NC_015581	ACT	2	6	267486	267491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5097	NC_015581	TTA	2	6	267554	267559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143363
5098	NC_015581	ATCG	2	8	267589	267596	25 %	25 %	25 %	25 %	334143363
5099	NC_015581	TTA	2	6	267607	267612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143363
5100	NC_015581	GT	3	6	267639	267644	0 %	50 %	50 %	0 %	334143363
5101	NC_015581	TTG	2	6	267647	267652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143363
5102	NC_015581	TCA	3	9	267696	267704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5103	NC_015581	TGG	2	6	267705	267710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143363
5104	NC_015581	TAC	2	6	267716	267721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5105	NC_015581	TCA	2	6	267786	267791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5106	NC_015581	TAC	2	6	267840	267845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5107	NC_015581	CAT	2	6	267938	267943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143363
5108	NC_015581	TGG	2	6	267978	267983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143363
5109	NC_015581	AACT	2	8	268093	268100	50 %	25 %	0 %	25 %	334143363
5110	NC_015581	TTAA	2	8	268138	268145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015581	GC	3	6	268160	268165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_015581	CAC	2	6	268240	268245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_015581	ATG	2	6	268296	268301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015581	ATA	2	6	268344	268349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015581	A	6	6	268367	268372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015581	CAA	2	6	268380	268385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143364
5117	NC_015581	GTG	2	6	268423	268428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143364
5118	NC_015581	ATT	2	6	268430	268435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143364
5119	NC_015581	CAT	2	6	268529	268534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143364
5120	NC_015581	T	6	6	268569	268574	0 %	100 %	0 %	0 %	334143364
5121	NC_015581	T	6	6	268646	268651	0 %	100 %	0 %	0 %	334143364
5122	NC_015581	GGT	2	6	268665	268670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143364
5123	NC_015581	A	7	7	268736	268742	100 %	0 %	0 %	0 %	334143364
5124	NC_015581	TTGT	2	8	268812	268819	0 %	75 %	25 %	0 %	334143364
5125	NC_015581	TCA	2	6	268904	268909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143365
5126	NC_015581	A	6	6	268942	268947	100 %	0 %	0 %	0 %	334143365
5127	NC_015581	TTG	2	6	268988	268993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143365
5128	NC_015581	GAA	2	6	269062	269067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143365
5129	NC_015581	AAC	2	6	269081	269086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143365
5130	NC_015581	TAT	2	6	269190	269195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143365
5131	NC_015581	GGT	2	6	269209	269214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143365
5132	NC_015581	AACTCA	2	12	269218	269229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334143365
5133	NC_015581	GCA	2	6	269303	269308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143365
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5135	NC_015581	ACT	2	6	269354	269359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143365
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5137	NC_015581	GGT	2	6	269449	269454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143365
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5140	NC_015581	GGTGGC	2	12	269584	269595	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	334143365
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5147	NC_015581	CTAT	2	8	270017	270024	25 %	50 %	0 %	25 %	334143365
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5150	NC_015581	AAT	2	6	270145	270150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_015581	AC	3	6	270170	270175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5152	NC_015581	T	6	6	270179	270184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5155	NC_015581	A	6	6	270233	270238	100 %	0 %	0 %	0 %	334143366
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5161	NC_015581	TAT	2	6	270889	270894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_015581	TAA	2	6	270902	270907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5183	NC_015581	A	7	7	271989	271995	100 %	0 %	0 %	0 %	334143367
5184	NC_015581	TAT	2	6	272072	272077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5185	NC_015581	T	6	6	272091	272096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5237	NC_015581	CAGC	3	12	275215	275226	25 %	0 %	25 %	50 %	334143370
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5240	NC_015581	CAA	2	6	275464	275469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143370
5241	NC_015581	TCA	2	6	275591	275596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143371
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5243	NC_015581	TTTAG	2	10	275665	275674	20 %	60 %	20 %	0 %	334143371
5244	NC_015581	CAG	2	6	275695	275700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143371
5245	NC_015581	GTTG	2	8	275748	275755	0 %	50 %	50 %	0 %	334143371
5246	NC_015581	TGCG	2	8	275798	275805	0 %	25 %	50 %	25 %	334143371
5247	NC_015581	GCCA	2	8	275857	275864	25 %	0 %	25 %	50 %	334143371
5248	NC_015581	ATC	2	6	275910	275915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143371
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5250	NC_015581	TGA	2	6	276063	276068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143372
5251	NC_015581	CGG	2	6	276069	276074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143372
5252	NC_015581	TTA	2	6	276096	276101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143372
5253	NC_015581	CTC	2	6	276113	276118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143372
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5375	NC_015581	CTC	2	6	281974	281979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143378
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5377	NC_015581	TCG	2	6	282048	282053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143378
5378	NC_015581	CATC	2	8	282054	282061	25 %	25 %	0 %	50 %	334143378
5379	NC_015581	CGC	2	6	282084	282089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143378
5380	NC_015581	GTT	2	6	282093	282098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143378
5381	NC_015581	GC	3	6	282244	282249	0 %	0 %	50 %	50 %	334143378
5382	NC_015581	CGG	2	6	282276	282281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143378
5383	NC_015581	CAT	2	6	282288	282293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143378
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5389	NC_015581	CTT	3	9	282468	282476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143378
5390	NC_015581	AAT	2	6	282484	282489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143378
5391	NC_015581	ATG	2	6	282496	282501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143378
5392	NC_015581	CGG	2	6	282516	282521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143378
5393	NC_015581	GGC	2	6	282787	282792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143378
5394	NC_015581	T	6	6	282830	282835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_015581	AAGG	2	8	282849	282856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5428	NC_015581	T	6	6	284017	284022	0 %	100 %	0 %	0 %	334143379
5429	NC_015581	AAAC	2	8	284029	284036	75 %	0 %	0 %	25 %	334143379
5430	NC_015581	CGGCTT	2	12	284056	284067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143379
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5451	NC_015581	ATT	2	6	285099	285104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5452	NC_015581	TGA	2	6	285146	285151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5453	NC_015581	TTA	2	6	285189	285194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5454	NC_015581	GACA	2	8	285222	285229	50 %	0 %	25 %	25 %	334143380
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5477	NC_015581	GGCT	2	8	286114	286121	0 %	25 %	50 %	25 %	334143380
5478	NC_015581	ACG	2	6	286190	286195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143380
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5480	NC_015581	ACG	2	6	286226	286231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143380
5481	NC_015581	CGC	2	6	286232	286237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143380
5482	NC_015581	AAAATT	2	12	286280	286291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143380
5483	NC_015581	T	6	6	286315	286320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_015581	A	8	8	286325	286332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_015581	A	6	6	286364	286369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_015581	A	6	6	286441	286446	100 %	0 %	0 %	0 %	334143381
5487	NC_015581	TGTT	2	8	286484	286491	0 %	75 %	25 %	0 %	334143381
5488	NC_015581	CT	3	6	286512	286517	0 %	50 %	0 %	50 %	334143381
5489	NC_015581	CGA	2	6	286651	286656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143381
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5493	NC_015581	CCTA	2	8	286839	286846	25 %	25 %	0 %	50 %	334143381
5494	NC_015581	ATC	2	6	286877	286882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143381
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5497	NC_015581	CAG	2	6	286972	286977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143381
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5499	NC_015581	A	6	6	287026	287031	100 %	0 %	0 %	0 %	334143381
5500	NC_015581	GAT	2	6	287102	287107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143381

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