MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015581	ATTT	2	8	233962	233969	25 %	75 %	0 %	0 %	334143339
4502	NC_015581	AAAG	2	8	233978	233985	75 %	0 %	25 %	0 %	334143339
4503	NC_015581	ACC	2	6	234055	234060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143339
4504	NC_015581	GCC	2	6	234062	234067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143339
4505	NC_015581	TTGG	2	8	234069	234076	0 %	50 %	50 %	0 %	334143339
4506	NC_015581	CGT	2	6	234081	234086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143339
4507	NC_015581	ATT	2	6	234135	234140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143339
4508	NC_015581	A	7	7	234339	234345	100 %	0 %	0 %	0 %	334143339
4509	NC_015581	TAA	2	6	234369	234374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143339
4510	NC_015581	AAC	2	6	234378	234383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015581	A	6	6	234449	234454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015581	GA	3	6	234492	234497	50 %	0 %	50 %	0 %	334143340
4513	NC_015581	GTT	2	6	234647	234652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143340
4514	NC_015581	GAT	2	6	234674	234679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4515	NC_015581	CTG	2	6	234680	234685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143340
4516	NC_015581	CAT	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143340
4517	NC_015581	ATA	2	6	234759	234764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143340
4518	NC_015581	AAG	2	6	234798	234803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143340
4519	NC_015581	CAG	2	6	234833	234838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143340
4520	NC_015581	GGC	2	6	234905	234910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4521	NC_015581	ACTG	2	8	234941	234948	25 %	25 %	25 %	25 %	334143340
4522	NC_015581	TGG	2	6	234966	234971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4523	NC_015581	CGG	2	6	234999	235004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4524	NC_015581	ATT	2	6	235040	235045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143340
4525	NC_015581	TGG	2	6	235072	235077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4526	NC_015581	CGG	2	6	235101	235106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4527	NC_015581	TCA	2	6	235107	235112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143340
4528	NC_015581	GGT	2	6	235204	235209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4529	NC_015581	TGGTT	2	10	235243	235252	0 %	60 %	40 %	0 %	334143340
4530	NC_015581	ATG	2	6	235275	235280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4531	NC_015581	GGC	2	6	235292	235297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4532	NC_015581	CGG	2	6	235315	235320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4533	NC_015581	A	6	6	235322	235327	100 %	0 %	0 %	0 %	334143340
4534	NC_015581	GTTG	2	8	235392	235399	0 %	50 %	50 %	0 %	334143340
4535	NC_015581	GTG	2	6	235403	235408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4536	NC_015581	AAGG	2	8	235601	235608	50 %	0 %	50 %	0 %	334143340
4537	NC_015581	GT	3	6	235673	235678	0 %	50 %	50 %	0 %	334143340
4538	NC_015581	A	6	6	235751	235756	100 %	0 %	0 %	0 %	334143340
4539	NC_015581	TTG	2	6	235769	235774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143340
4540	NC_015581	GCGG	2	8	235807	235814	0 %	0 %	75 %	25 %	334143340
4541	NC_015581	ACA	2	6	235821	235826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143340
4542	NC_015581	TCG	2	6	235837	235842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143340
4543	NC_015581	A	6	6	235934	235939	100 %	0 %	0 %	0 %	334143340
4544	NC_015581	CAGT	2	8	235962	235969	25 %	25 %	25 %	25 %	334143340
4545	NC_015581	GTG	2	6	236057	236062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4546	NC_015581	CGG	2	6	236229	236234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4547	NC_015581	ATG	2	6	236307	236312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4548	NC_015581	GTG	2	6	236420	236425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143340
4549	NC_015581	TCG	2	6	236431	236436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143340
4550	NC_015581	AAAC	2	8	236456	236463	75 %	0 %	0 %	25 %	334143340
4551	NC_015581	GAT	2	6	236488	236493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4552	NC_015581	GC	3	6	236531	236536	0 %	0 %	50 %	50 %	334143340
4553	NC_015581	TTGT	2	8	236537	236544	0 %	75 %	25 %	0 %	334143340
4554	NC_015581	AAC	2	6	236603	236608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143340
4555	NC_015581	TGA	2	6	236649	236654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4556	NC_015581	GGC	2	6	236672	236677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4557	NC_015581	A	6	6	236733	236738	100 %	0 %	0 %	0 %	334143340
4558	NC_015581	TTG	2	6	236748	236753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143340
4559	NC_015581	TAA	2	6	236788	236793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143340
4560	NC_015581	CCT	2	6	236838	236843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334143340
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4562	NC_015581	CGC	2	6	236985	236990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143340
4563	NC_015581	TAA	2	6	236992	236997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143340
4564	NC_015581	CTT	2	6	237028	237033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143340
4565	NC_015581	CAT	2	6	237068	237073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143340
4566	NC_015581	ATGA	2	8	237083	237090	50 %	25 %	25 %	0 %	334143340
4567	NC_015581	CAC	2	6	237106	237111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143340
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4569	NC_015581	GCC	2	6	237227	237232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143340
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4571	NC_015581	G	6	6	237297	237302	0 %	0 %	100 %	0 %	334143340
4572	NC_015581	GC	3	6	237463	237468	0 %	0 %	50 %	50 %	334143340
4573	NC_015581	TTA	2	6	237470	237475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143340
4574	NC_015581	TGT	2	6	237659	237664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143340
4575	NC_015581	CCG	2	6	237678	237683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143340
4576	NC_015581	GCG	2	6	237692	237697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143340
4577	NC_015581	CAC	2	6	237712	237717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143340
4578	NC_015581	AT	3	6	237919	237924	50 %	50 %	0 %	0 %	334143340
4579	NC_015581	A	6	6	237953	237958	100 %	0 %	0 %	0 %	334143340
4580	NC_015581	CCA	2	6	237966	237971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143340
4581	NC_015581	TGC	2	6	238019	238024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143340
4582	NC_015581	AGA	3	9	238087	238095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143340
4583	NC_015581	GAA	2	6	238273	238278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143340
4584	NC_015581	TTA	2	6	238284	238289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143340
4585	NC_015581	AGT	2	6	238330	238335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143340
4586	NC_015581	A	6	6	238359	238364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015581	GTG	2	6	238414	238419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143341
4588	NC_015581	AAT	2	6	238429	238434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143341
4589	NC_015581	TCG	2	6	238458	238463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143341
4590	NC_015581	GCC	2	6	238482	238487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143341
4591	NC_015581	TAC	2	6	238580	238585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143341
4592	NC_015581	T	7	7	238708	238714	0 %	100 %	0 %	0 %	334143341
4593	NC_015581	GCG	2	6	238794	238799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_015581	AAG	2	6	238811	238816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143342
4595	NC_015581	AGC	2	6	238824	238829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143342
4596	NC_015581	TCA	2	6	238939	238944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143342
4597	NC_015581	ACC	2	6	238974	238979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143342
4598	NC_015581	T	7	7	239102	239108	0 %	100 %	0 %	0 %	334143342
4599	NC_015581	A	6	6	239135	239140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_015581	TCT	2	6	239267	239272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_015581	T	6	6	239272	239277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015581	TAGT	2	8	239298	239305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015581	TAA	2	6	239335	239340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143343
4604	NC_015581	GTAT	2	8	239381	239388	25 %	50 %	25 %	0 %	334143343
4605	NC_015581	TAA	2	6	239399	239404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143343
4606	NC_015581	TTTTG	2	10	239428	239437	0 %	80 %	20 %	0 %	334143343
4607	NC_015581	GGTCAT	2	12	239438	239449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334143343
4608	NC_015581	TTTAT	2	10	239470	239479	20 %	80 %	0 %	0 %	334143343
4609	NC_015581	GCC	2	6	239493	239498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143343
4610	NC_015581	T	6	6	239503	239508	0 %	100 %	0 %	0 %	334143344
4611	NC_015581	ATA	2	6	239667	239672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143344
4612	NC_015581	GCG	2	6	239712	239717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143344
4613	NC_015581	AAT	2	6	239733	239738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143344
4614	NC_015581	CAC	2	6	239741	239746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143344
4615	NC_015581	CGCAG	2	10	239747	239756	20 %	0 %	40 %	40 %	334143344
4616	NC_015581	TGG	3	9	239774	239782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143344
4617	NC_015581	ATTA	2	8	239850	239857	50 %	50 %	0 %	0 %	334143344
4618	NC_015581	T	6	6	239900	239905	0 %	100 %	0 %	0 %	334143344
4619	NC_015581	ATC	2	6	239925	239930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143344
4620	NC_015581	TCA	2	6	239980	239985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143344
4621	NC_015581	CAT	2	6	240020	240025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143344
4622	NC_015581	GCG	2	6	240082	240087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143344
4623	NC_015581	GCA	2	6	240166	240171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143344
4624	NC_015581	A	6	6	240272	240277	100 %	0 %	0 %	0 %	334143344
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4747	NC_015581	CGA	2	6	246743	246748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143351
4748	NC_015581	CGC	3	9	246813	246821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143351
4749	NC_015581	TGCC	2	8	246840	246847	0 %	25 %	25 %	50 %	334143351
4750	NC_015581	ACCA	2	8	246901	246908	50 %	0 %	0 %	50 %	334143351
4751	NC_015581	CAT	2	6	246999	247004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143351
4752	NC_015581	CGG	2	6	247088	247093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143351
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4754	NC_015581	GCT	2	6	247214	247219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143351
4755	NC_015581	CTG	2	6	247227	247232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143351
4756	NC_015581	AAT	2	6	247243	247248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143351
4757	NC_015581	AAC	2	6	247270	247275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143351
4758	NC_015581	CA	3	6	247419	247424	50 %	0 %	0 %	50 %	334143351
4759	NC_015581	TTC	2	6	247612	247617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143351
4760	NC_015581	T	6	6	247648	247653	0 %	100 %	0 %	0 %	334143351
4761	NC_015581	CAT	2	6	247720	247725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143352
4762	NC_015581	AT	3	6	247791	247796	50 %	50 %	0 %	0 %	334143352
4763	NC_015581	TTA	2	6	247858	247863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143352
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4766	NC_015581	CAA	2	6	248080	248085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143352
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4768	NC_015581	TGA	2	6	248230	248235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143352
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4770	NC_015581	ATGCC	2	10	248371	248380	20 %	20 %	20 %	40 %	334143352
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4775	NC_015581	CAA	2	6	248734	248739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143352
4776	NC_015581	AGT	2	6	248746	248751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143352
4777	NC_015581	ATC	2	6	248871	248876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143352
4778	NC_015581	TCCAAA	2	12	248885	248896	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	334143352
4779	NC_015581	CAC	2	6	248924	248929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143352
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4787	NC_015581	GAGC	2	8	249504	249511	25 %	0 %	50 %	25 %	334143352
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4794	NC_015581	CTT	2	6	249853	249858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143352
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4796	NC_015581	GGTAG	2	10	249996	250005	20 %	20 %	60 %	0 %	334143352
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4811	NC_015581	CAT	2	6	250702	250707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143352
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4813	NC_015581	TTC	2	6	250856	250861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143352
4814	NC_015581	CATC	2	8	250879	250886	25 %	25 %	0 %	50 %	334143352
4815	NC_015581	TCA	2	6	250920	250925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143352
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4819	NC_015581	TAA	2	6	251137	251142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143352
4820	NC_015581	CTG	2	6	251149	251154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143352
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4827	NC_015581	TGA	2	6	251514	251519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143352
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4830	NC_015581	CGC	2	6	251771	251776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143352
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4832	NC_015581	TTTGC	2	10	251863	251872	0 %	60 %	20 %	20 %	334143352
4833	NC_015581	TGC	2	6	251876	251881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143352
4834	NC_015581	CTTA	2	8	251894	251901	25 %	50 %	0 %	25 %	334143352
4835	NC_015581	CTT	2	6	251956	251961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143352
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4842	NC_015581	GGT	2	6	252330	252335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4845	NC_015581	GC	3	6	252438	252443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4846	NC_015581	A	6	6	252444	252449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4847	NC_015581	AATA	2	8	252525	252532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4848	NC_015581	AGA	2	6	252547	252552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143353
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4855	NC_015581	TTA	2	6	252852	252857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143353
4856	NC_015581	GGT	2	6	252914	252919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143353
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4863	NC_015581	GC	3	6	253214	253219	0 %	0 %	50 %	50 %	334143353
4864	NC_015581	A	6	6	253238	253243	100 %	0 %	0 %	0 %	334143353
4865	NC_015581	TCGGGT	2	12	253253	253264	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334143353
4866	NC_015581	AAG	2	6	253389	253394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143353
4867	NC_015581	AGCA	2	8	253614	253621	50 %	0 %	25 %	25 %	334143353
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4996	NC_015581	GAG	2	6	261392	261397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_015581	AGTT	2	8	261405	261412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_015581	CAG	2	6	261467	261472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5000	NC_015581	TAG	2	6	261607	261612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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