MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 80300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_015578	CAT	2	6	2302036	2302041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998451
46002	NC_015578	A	7	7	2302114	2302120	100 %	0 %	0 %	0 %	333998451
46003	NC_015578	A	6	6	2302194	2302199	100 %	0 %	0 %	0 %	333998451
46004	NC_015578	AT	3	6	2302293	2302298	50 %	50 %	0 %	0 %	333998451
46005	NC_015578	CGGGA	2	10	2302331	2302340	20 %	0 %	60 %	20 %	333998451
46006	NC_015578	CGC	2	6	2302377	2302382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46007	NC_015578	TTTG	2	8	2302387	2302394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46008	NC_015578	AAT	2	6	2302421	2302426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333998452
46009	NC_015578	GGC	2	6	2302434	2302439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998452
46010	NC_015578	AAC	2	6	2302457	2302462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333998452
46011	NC_015578	CTG	2	6	2302467	2302472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998452
46012	NC_015578	TCA	2	6	2302528	2302533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998452
46013	NC_015578	GCC	2	6	2302567	2302572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998452
46014	NC_015578	A	6	6	2302595	2302600	100 %	0 %	0 %	0 %	333998452
46015	NC_015578	CTG	2	6	2302619	2302624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998452
46016	NC_015578	GCC	2	6	2302647	2302652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998452
46017	NC_015578	ATC	2	6	2302689	2302694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998452
46018	NC_015578	ATT	2	6	2302758	2302763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998452
46019	NC_015578	ATT	2	6	2302857	2302862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998452
46020	NC_015578	AGG	2	6	2303010	2303015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998452
46021	NC_015578	CAT	2	6	2303046	2303051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998453
46022	NC_015578	ATC	2	6	2303062	2303067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998453
46023	NC_015578	ACGAAC	2	12	2303068	2303079	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333998453
46024	NC_015578	GGA	2	6	2303102	2303107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998453
46025	NC_015578	GAA	2	6	2303130	2303135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333998453
46026	NC_015578	GCG	2	6	2303166	2303171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998453
46027	NC_015578	GAA	2	6	2303223	2303228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333998453
46028	NC_015578	GTT	2	6	2303229	2303234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333998453
46029	NC_015578	CGG	2	6	2303240	2303245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998453
46030	NC_015578	ATA	2	6	2303247	2303252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333998453
46031	NC_015578	GTT	2	6	2303370	2303375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333998453
46032	NC_015578	ATT	2	6	2303412	2303417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998453
46033	NC_015578	TAT	2	6	2303486	2303491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46034	NC_015578	ATC	2	6	2303499	2303504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46035	NC_015578	TCC	2	6	2303553	2303558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333998454
46036	NC_015578	AC	3	6	2303716	2303721	50 %	0 %	0 %	50 %	333998454
46037	NC_015578	G	6	6	2303729	2303734	0 %	0 %	100 %	0 %	333998454
46038	NC_015578	TTTG	2	8	2303773	2303780	0 %	75 %	25 %	0 %	333998454
46039	NC_015578	AAAT	2	8	2303914	2303921	75 %	25 %	0 %	0 %	333998454
46040	NC_015578	TAC	2	6	2303924	2303929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998454
46041	NC_015578	TAT	2	6	2303996	2304001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998454
46042	NC_015578	TCA	2	6	2304039	2304044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998454
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46046	NC_015578	ACCCGG	2	12	2304249	2304260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333998454
46047	NC_015578	GA	3	6	2304266	2304271	50 %	0 %	50 %	0 %	333998454
46048	NC_015578	ACA	2	6	2304555	2304560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333998454
46049	NC_015578	ACT	2	6	2304659	2304664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998455
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46052	NC_015578	TCC	2	6	2304885	2304890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333998455
46053	NC_015578	CAC	3	9	2304911	2304919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333998455
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46057	NC_015578	T	6	6	2304983	2304988	0 %	100 %	0 %	0 %	333998455
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46069	NC_015578	C	6	6	2305731	2305736	0 %	0 %	0 %	100 %	333998456
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46117	NC_015578	AT	3	6	2307828	2307833	50 %	50 %	0 %	0 %	333998458
46118	NC_015578	GGT	2	6	2307859	2307864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998458
46119	NC_015578	GCT	3	9	2307894	2307902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998458
46120	NC_015578	CGC	2	6	2307915	2307920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998458
46121	NC_015578	GTG	3	9	2307938	2307946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998458
46122	NC_015578	GTC	2	6	2308063	2308068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998458
46123	NC_015578	ATC	2	6	2308120	2308125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998458
46124	NC_015578	GTG	2	6	2308325	2308330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998458
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46128	NC_015578	TTCCA	2	10	2308466	2308475	20 %	40 %	0 %	40 %	333998458
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46145	NC_015578	TATT	2	8	2309128	2309135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46146	NC_015578	ATTC	2	8	2309140	2309147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46147	NC_015578	TTA	2	6	2309259	2309264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46148	NC_015578	AT	3	6	2309279	2309284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46149	NC_015578	GAA	2	6	2309299	2309304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333998459
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46156	NC_015578	G	8	8	2309728	2309735	0 %	0 %	100 %	0 %	333998459
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46209	NC_015578	AT	3	6	2312166	2312171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46210	NC_015578	CTG	3	9	2312235	2312243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998463
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46233	NC_015578	T	6	6	2313311	2313316	0 %	100 %	0 %	0 %	333998465
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46235	NC_015578	GTC	2	6	2313540	2313545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998465
46236	NC_015578	ATG	2	6	2313601	2313606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333998465
46237	NC_015578	GAG	2	6	2313639	2313644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998465
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46239	NC_015578	ATA	2	6	2313691	2313696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333998465
46240	NC_015578	CTT	2	6	2313711	2313716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998465
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46243	NC_015578	TCA	2	6	2313845	2313850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998465
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46305	NC_015578	CTG	2	6	2318046	2318051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998472
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46346	NC_015578	GCC	2	6	2320214	2320219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998475
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46349	NC_015578	GAG	2	6	2320393	2320398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46350	NC_015578	CCA	2	6	2320522	2320527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333998476
46351	NC_015578	TCC	2	6	2320590	2320595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333998476
46352	NC_015578	TCA	2	6	2320677	2320682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998476
46353	NC_015578	GCT	2	6	2320729	2320734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998476
46354	NC_015578	ATC	2	6	2320776	2320781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998476
46355	NC_015578	AGG	2	6	2320782	2320787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998476
46356	NC_015578	ACC	2	6	2320905	2320910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333998476
46357	NC_015578	AT	3	6	2321136	2321141	50 %	50 %	0 %	0 %	333998476
46358	NC_015578	TCT	2	6	2321151	2321156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998476
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46362	NC_015578	TCC	2	6	2321280	2321285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333998476
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46368	NC_015578	AAG	2	6	2321487	2321492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333998477
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46383	NC_015578	ACA	2	6	2322286	2322291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46384	NC_015578	CCG	2	6	2322294	2322299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46385	NC_015578	AGC	2	6	2322414	2322419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333998478
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46422	NC_015578	C	6	6	2324105	2324110	0 %	0 %	0 %	100 %	333998478
46423	NC_015578	AG	3	6	2324136	2324141	50 %	0 %	50 %	0 %	333998478
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46426	NC_015578	A	6	6	2324245	2324250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46427	NC_015578	A	6	6	2324260	2324265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46428	NC_015578	ATT	2	6	2324280	2324285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46429	NC_015578	A	6	6	2324290	2324295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46430	NC_015578	TAT	2	6	2324297	2324302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46431	NC_015578	ACAA	2	8	2324317	2324324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46432	NC_015578	ACC	2	6	2324337	2324342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46433	NC_015578	A	6	6	2324352	2324357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46434	NC_015578	TTCT	2	8	2324380	2324387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46435	NC_015578	CTT	3	9	2324391	2324399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46436	NC_015578	TTC	2	6	2324435	2324440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998479
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46440	NC_015578	CATA	2	8	2324740	2324747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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46443	NC_015578	AT	3	6	2324929	2324934	50 %	50 %	0 %	0 %	333998480
46444	NC_015578	A	7	7	2324936	2324942	100 %	0 %	0 %	0 %	333998480
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46456	NC_015578	CTT	2	6	2325990	2325995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998481
46457	NC_015578	CATTA	2	10	2326004	2326013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46458	NC_015578	AGGA	2	8	2326036	2326043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46459	NC_015578	CGG	2	6	2326168	2326173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46460	NC_015578	GTTC	2	8	2326213	2326220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46461	NC_015578	GGA	2	6	2326238	2326243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46462	NC_015578	CCT	2	6	2326254	2326259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46463	NC_015578	AGG	2	6	2326320	2326325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46464	NC_015578	ATT	2	6	2326334	2326339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998482
46465	NC_015578	AGCTC	2	10	2326416	2326425	20 %	20 %	20 %	40 %	333998482
46466	NC_015578	CAA	2	6	2326438	2326443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333998482
46467	NC_015578	TGA	2	6	2326450	2326455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333998482
46468	NC_015578	A	6	6	2326479	2326484	100 %	0 %	0 %	0 %	333998482
46469	NC_015578	GT	3	6	2326536	2326541	0 %	50 %	50 %	0 %	333998482
46470	NC_015578	GAAC	2	8	2326810	2326817	50 %	0 %	25 %	25 %	333998482
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46472	NC_015578	TGC	2	6	2327023	2327028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998482
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