MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 80300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_015578	TCC	2	6	2099163	2099168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42002	NC_015578	ATT	2	6	2099232	2099237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42003	NC_015578	TAC	2	6	2099239	2099244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42004	NC_015578	TTTCC	2	10	2099267	2099276	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42005	NC_015578	CAAA	2	8	2099338	2099345	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42006	NC_015578	A	6	6	2099376	2099381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42007	NC_015578	A	6	6	2099385	2099390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42008	NC_015578	CGG	2	6	2099396	2099401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42009	NC_015578	G	9	9	2099436	2099444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42010	NC_015578	GCG	2	6	2099663	2099668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998313
42011	NC_015578	TGG	2	6	2099708	2099713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998313
42012	NC_015578	CGG	2	6	2099714	2099719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998313
42013	NC_015578	ATG	2	6	2099793	2099798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42014	NC_015578	GCAG	2	8	2099821	2099828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42015	NC_015578	CTG	2	6	2099843	2099848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42016	NC_015578	CTT	2	6	2099876	2099881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998314
42017	NC_015578	CTT	2	6	2099891	2099896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998314
42018	NC_015578	TGATC	2	10	2099915	2099924	20 %	40 %	20 %	20 %	333998314
42019	NC_015578	TCG	2	6	2099983	2099988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998314
42020	NC_015578	A	6	6	2100045	2100050	100 %	0 %	0 %	0 %	333998314
42021	NC_015578	ATC	2	6	2100054	2100059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998314
42022	NC_015578	GCA	2	6	2100068	2100073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333998314
42023	NC_015578	CCT	2	6	2100080	2100085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42024	NC_015578	A	7	7	2100086	2100092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42025	NC_015578	TAA	2	6	2100095	2100100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42026	NC_015578	AG	3	6	2100141	2100146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42027	NC_015578	C	6	6	2100150	2100155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42028	NC_015578	GTGG	2	8	2100168	2100175	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42029	NC_015578	CTG	2	6	2100195	2100200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42030	NC_015578	GTA	2	6	2100237	2100242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42031	NC_015578	AGGG	2	8	2100259	2100266	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42032	NC_015578	G	6	6	2100264	2100269	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42033	NC_015578	GA	3	6	2100293	2100298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42034	NC_015578	GCA	2	6	2100306	2100311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42035	NC_015578	ATG	2	6	2100324	2100329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42036	NC_015578	AAT	2	6	2100356	2100361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42037	NC_015578	ATGG	2	8	2100375	2100382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42038	NC_015578	TAG	2	6	2100405	2100410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42039	NC_015578	ATA	2	6	2100445	2100450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42040	NC_015578	CAA	2	6	2100460	2100465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42041	NC_015578	CTG	2	6	2100494	2100499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42042	NC_015578	T	6	6	2100553	2100558	0 %	100 %	0 %	0 %	333998315
42043	NC_015578	TAT	2	6	2100567	2100572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998315
42044	NC_015578	GGA	2	6	2100635	2100640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998315
42045	NC_015578	CTT	2	6	2100655	2100660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998315
42046	NC_015578	TAC	2	6	2100732	2100737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333998316
42047	NC_015578	C	9	9	2100811	2100819	0 %	0 %	0 %	100 %	333998316
42048	NC_015578	ATTTC	2	10	2100868	2100877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42049	NC_015578	ATT	2	6	2100885	2100890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42050	NC_015578	T	6	6	2100946	2100951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42051	NC_015578	AGT	2	6	2101073	2101078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42052	NC_015578	AAT	2	6	2101161	2101166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42053	NC_015578	TA	4	8	2101252	2101259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42054	NC_015578	TCA	2	6	2101275	2101280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42055	NC_015578	TTC	2	6	2101322	2101327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42056	NC_015578	TATGG	2	10	2101431	2101440	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42057	NC_015578	GA	3	6	2101455	2101460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42058	NC_015578	GCT	2	6	2101466	2101471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42059	NC_015578	ACA	2	6	2101502	2101507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42060	NC_015578	A	6	6	2101528	2101533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42061	NC_015578	GATTAC	2	12	2101564	2101575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42062	NC_015578	TGTC	2	8	2101609	2101616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42063	NC_015578	T	6	6	2101618	2101623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42064	NC_015578	TGT	2	6	2101639	2101644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42065	NC_015578	G	6	6	2101763	2101768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42066	NC_015578	C	7	7	2101797	2101803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42067	NC_015578	GAT	2	6	2101834	2101839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42068	NC_015578	TA	3	6	2101847	2101852	50 %	50 %	0 %	0 %	333998317
42069	NC_015578	CCG	2	6	2101860	2101865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998317
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42073	NC_015578	GGT	3	9	2101912	2101920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998317
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42078	NC_015578	GTGACG	2	12	2102201	2102212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333998317
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42080	NC_015578	TGG	2	6	2102235	2102240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998317
42081	NC_015578	TGC	2	6	2102241	2102246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998317
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42083	NC_015578	CGT	2	6	2102283	2102288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998317
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42090	NC_015578	TA	3	6	2102716	2102721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42091	NC_015578	CAAG	2	8	2102755	2102762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42092	NC_015578	TTA	2	6	2102790	2102795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998318
42093	NC_015578	CAG	2	6	2102817	2102822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333998318
42094	NC_015578	TTC	2	6	2102842	2102847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333998318
42095	NC_015578	TGCCGC	2	12	2102855	2102866	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333998318
42096	NC_015578	TGG	2	6	2102903	2102908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333998318
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42105	NC_015578	GCC	2	6	2103135	2103140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998318
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42107	NC_015578	ACG	2	6	2103163	2103168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333998318
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42109	NC_015578	TTG	2	6	2103232	2103237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333998318
42110	NC_015578	CT	3	6	2103276	2103281	0 %	50 %	0 %	50 %	333998318
42111	NC_015578	CAC	2	6	2103291	2103296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333998318
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42170	NC_015578	TTA	2	6	2105923	2105928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333998319
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42199	NC_015578	GCTG	2	8	2106766	2106773	0 %	25 %	50 %	25 %	333998319
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42208	NC_015578	AGGGTG	2	12	2107253	2107264	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333998319
42209	NC_015578	CGG	2	6	2107272	2107277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998319
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42221	NC_015578	GTA	2	6	2107852	2107857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333998319
42222	NC_015578	C	6	6	2107946	2107951	0 %	0 %	0 %	100 %	333998319
42223	NC_015578	CAA	2	6	2107971	2107976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333998319
42224	NC_015578	GGA	3	9	2108043	2108051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998319
42225	NC_015578	CT	3	6	2108105	2108110	0 %	50 %	0 %	50 %	333998319
42226	NC_015578	CCA	2	6	2108112	2108117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333998319
42227	NC_015578	CTG	2	6	2108199	2108204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998319
42228	NC_015578	CGC	2	6	2108220	2108225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998319
42229	NC_015578	CCG	2	6	2108256	2108261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333998319
42230	NC_015578	GCCCGG	2	12	2108289	2108300	0 %	0 %	50 %	50 %	333998319
42231	NC_015578	GCT	2	6	2108344	2108349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998319
42232	NC_015578	C	7	7	2108383	2108389	0 %	0 %	0 %	100 %	333998319
42233	NC_015578	GCG	4	12	2108397	2108408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998319
42234	NC_015578	GGC	2	6	2108437	2108442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998319
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42236	NC_015578	CGC	2	6	2108550	2108555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42311	NC_015578	T	7	7	2111907	2111913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42473	NC_015578	GCA	2	6	2119927	2119932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333998331
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42475	NC_015578	GGC	2	6	2120033	2120038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998331
42476	NC_015578	GGC	2	6	2120066	2120071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998331
42477	NC_015578	G	6	6	2120095	2120100	0 %	0 %	100 %	0 %	333998331
42478	NC_015578	GGC	2	6	2120123	2120128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998331
42479	NC_015578	GCG	2	6	2120270	2120275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998331
42480	NC_015578	GAG	2	6	2120292	2120297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333998331
42481	NC_015578	CGG	2	6	2120311	2120316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998331
42482	NC_015578	GATT	2	8	2120433	2120440	25 %	50 %	25 %	0 %	333998332
42483	NC_015578	CGG	2	6	2120441	2120446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998332
42484	NC_015578	CGG	2	6	2120489	2120494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998332
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42488	NC_015578	CTG	2	6	2120606	2120611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333998332
42489	NC_015578	TG	3	6	2120634	2120639	0 %	50 %	50 %	0 %	333998332
42490	NC_015578	CAGTAT	2	12	2120682	2120693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333998333
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42493	NC_015578	TGA	2	6	2120753	2120758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333998333
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42495	NC_015578	T	6	6	2120823	2120828	0 %	100 %	0 %	0 %	333998333
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42499	NC_015578	GTA	2	6	2121146	2121151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333998334
42500	NC_015578	CGG	2	6	2121305	2121310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333998334

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