MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 73426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	GGC	2	6	16	21	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015577	A	6	6	85	90	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015577	TATAA	2	10	143	152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015577	GAA	3	9	367	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
5	NC_015577	T	8	8	448	455	0 %	100 %	0 %	0 %	333992988
6	NC_015577	A	6	6	520	525	100 %	0 %	0 %	0 %	333992988
7	NC_015577	AGA	2	6	575	580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
8	NC_015577	GCC	2	6	609	614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992988
9	NC_015577	GCT	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992988
10	NC_015577	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992988
11	NC_015577	AAC	2	6	868	873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992988
12	NC_015577	TCG	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992988
13	NC_015577	AAG	3	9	961	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
14	NC_015577	GAC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992988
15	NC_015577	CCATA	2	10	1005	1014	40 %	20 %	0 %	40 %	333992988
16	NC_015577	AGG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992988
17	NC_015577	ACAAAA	2	12	1067	1078	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	333992988
18	NC_015577	AGA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992988
19	NC_015577	CAA	2	6	1314	1319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992988
20	NC_015577	ACTG	2	8	1320	1327	25 %	25 %	25 %	25 %	333992988
21	NC_015577	TTC	2	6	1398	1403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992988
22	NC_015577	CCATA	2	10	1497	1506	40 %	20 %	0 %	40 %	333992988
23	NC_015577	CTGA	2	8	1546	1553	25 %	25 %	25 %	25 %	333992988
24	NC_015577	AGATCG	2	12	1625	1636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333992988
25	NC_015577	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015577	ATAA	2	8	1758	1765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015577	TAC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015577	TA	5	10	1917	1926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015577	TGC	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992989
30	NC_015577	GAC	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
31	NC_015577	TCAAT	2	10	2190	2199	40 %	40 %	0 %	20 %	333992989
32	NC_015577	AGC	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
33	NC_015577	A	6	6	2261	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	333992989
34	NC_015577	CCG	3	9	2316	2324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992989
35	NC_015577	T	7	7	2332	2338	0 %	100 %	0 %	0 %	333992989
36	NC_015577	A	6	6	2436	2441	100 %	0 %	0 %	0 %	333992989
37	NC_015577	GCC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992989
38	NC_015577	ATC	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992989
39	NC_015577	TGA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992989
40	NC_015577	GC	3	6	2572	2577	0 %	0 %	50 %	50 %	333992989
41	NC_015577	CGA	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992989
42	NC_015577	ATC	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992989
43	NC_015577	TCT	2	6	2651	2656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992989
44	NC_015577	TGG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992989
45	NC_015577	GAG	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992989
46	NC_015577	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992989
47	NC_015577	CTT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992989
48	NC_015577	CTTC	2	8	3232	3239	0 %	50 %	0 %	50 %	333992990
49	NC_015577	AGGG	2	8	3342	3349	25 %	0 %	75 %	0 %	333992990
50	NC_015577	A	6	6	3351	3356	100 %	0 %	0 %	0 %	333992990
51	NC_015577	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	333992990
52	NC_015577	CTG	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
53	NC_015577	CTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
54	NC_015577	CTC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992990
55	NC_015577	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992990
56	NC_015577	GGCT	2	8	3811	3818	0 %	25 %	50 %	25 %	333992990
57	NC_015577	GGC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992990
58	NC_015577	A	6	6	3985	3990	100 %	0 %	0 %	0 %	333992990
59	NC_015577	GTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992990
60	NC_015577	AAGG	2	8	4161	4168	50 %	0 %	50 %	0 %	333992990
61	NC_015577	GGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992990
62	NC_015577	T	6	6	4281	4286	0 %	100 %	0 %	0 %	333992991
63	NC_015577	GCA	4	12	4295	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992991
64	NC_015577	TTG	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333992991
65	NC_015577	AGGAAG	2	12	4536	4547	50 %	0 %	50 %	0 %	333992991
66	NC_015577	AGC	3	9	4555	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992991
67	NC_015577	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992991
68	NC_015577	AAGC	2	8	4641	4648	50 %	0 %	25 %	25 %	333992991
69	NC_015577	AAG	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992991
70	NC_015577	CAT	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992992
71	NC_015577	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
72	NC_015577	CAG	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992992
73	NC_015577	G	6	6	4847	4852	0 %	0 %	100 %	0 %	333992992
74	NC_015577	GCG	2	6	5068	5073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
75	NC_015577	TAT	2	6	5114	5119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992992
76	NC_015577	ATG	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992992
77	NC_015577	TTC	2	6	5227	5232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992992
78	NC_015577	CGG	2	6	5261	5266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992992
79	NC_015577	A	7	7	5272	5278	100 %	0 %	0 %	0 %	333992992
80	NC_015577	GCTGG	2	10	5382	5391	0 %	20 %	60 %	20 %	333992992
81	NC_015577	CCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992992
82	NC_015577	GCTGG	2	10	5508	5517	0 %	20 %	60 %	20 %	333992992
83	NC_015577	TAA	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992992
84	NC_015577	C	7	7	5690	5696	0 %	0 %	0 %	100 %	333992993
85	NC_015577	TCT	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
86	NC_015577	TGA	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992993
87	NC_015577	TTC	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
88	NC_015577	AAG	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992993
89	NC_015577	CGG	2	6	5971	5976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992993
90	NC_015577	TTTC	2	8	6037	6044	0 %	75 %	0 %	25 %	333992993
91	NC_015577	GCTG	2	8	6054	6061	0 %	25 %	50 %	25 %	333992993
92	NC_015577	CTT	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992993
93	NC_015577	GACAA	2	10	6152	6161	60 %	0 %	20 %	20 %	333992993
94	NC_015577	TGT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333992993
95	NC_015577	GGC	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992993
96	NC_015577	G	6	6	6234	6239	0 %	0 %	100 %	0 %	333992993
97	NC_015577	CAC	2	6	6283	6288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333992993
98	NC_015577	T	6	6	6294	6299	0 %	100 %	0 %	0 %	333992993
99	NC_015577	TAT	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992993
100	NC_015577	GCC	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992993
101	NC_015577	CAAG	2	8	6404	6411	50 %	0 %	25 %	25 %	333992993
102	NC_015577	TGG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992993
103	NC_015577	CAGGT	2	10	6566	6575	20 %	20 %	40 %	20 %	333992993
104	NC_015577	TCA	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992993
105	NC_015577	CCGAT	2	10	6598	6607	20 %	20 %	20 %	40 %	333992993
106	NC_015577	C	6	6	6615	6620	0 %	0 %	0 %	100 %	333992993
107	NC_015577	GAA	2	6	6673	6678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992993
108	NC_015577	A	7	7	6726	6732	100 %	0 %	0 %	0 %	333992994
109	NC_015577	AAG	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
110	NC_015577	CGG	2	6	6828	6833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
111	NC_015577	ATG	2	6	6989	6994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333992994
112	NC_015577	CGC	2	6	7015	7020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
113	NC_015577	T	6	6	7159	7164	0 %	100 %	0 %	0 %	333992994
114	NC_015577	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333992994
115	NC_015577	TTA	2	6	7196	7201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333992994
116	NC_015577	TAC	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992994
117	NC_015577	AAG	2	6	7225	7230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
118	NC_015577	TGG	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992994
119	NC_015577	CAA	2	6	7272	7277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333992994
120	NC_015577	CGCC	2	8	7278	7285	0 %	0 %	25 %	75 %	333992994
121	NC_015577	AGCG	2	8	7288	7295	25 %	0 %	50 %	25 %	333992994
122	NC_015577	A	7	7	7300	7306	100 %	0 %	0 %	0 %	333992994
123	NC_015577	T	6	6	7319	7324	0 %	100 %	0 %	0 %	333992994
124	NC_015577	AG	3	6	7356	7361	50 %	0 %	50 %	0 %	333992994
125	NC_015577	AT	3	6	7427	7432	50 %	50 %	0 %	0 %	333992994
126	NC_015577	GGC	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
127	NC_015577	CCT	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333992994
128	NC_015577	CTTC	2	8	7617	7624	0 %	50 %	0 %	50 %	333992994
129	NC_015577	TGC	2	6	7634	7639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992994
130	NC_015577	CAT	2	6	7701	7706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333992994
131	NC_015577	GAG	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992994
132	NC_015577	GAG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333992994
133	NC_015577	CGG	2	6	7793	7798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333992994
134	NC_015577	GAA	2	6	7807	7812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
135	NC_015577	GAA	3	9	7825	7833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
136	NC_015577	AGA	3	9	7848	7856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333992994
137	NC_015577	A	6	6	7856	7861	100 %	0 %	0 %	0 %	333992994
138	NC_015577	AGCG	2	8	7865	7872	25 %	0 %	50 %	25 %	333992994
139	NC_015577	AAAG	2	8	7887	7894	75 %	0 %	25 %	0 %	333992994
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141	NC_015577	A	6	6	8005	8010	100 %	0 %	0 %	0 %	333992994
142	NC_015577	GCA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333992994
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146	NC_015577	AT	3	6	8235	8240	50 %	50 %	0 %	0 %	333992994
147	NC_015577	CCG	2	6	8258	8263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
148	NC_015577	AGGAG	2	10	8264	8273	40 %	0 %	60 %	0 %	333992994
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151	NC_015577	CCG	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333992994
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249	NC_015577	AG	3	6	13261	13266	50 %	0 %	50 %	0 %	333992998
250	NC_015577	GCT	2	6	13269	13274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333992998
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253	NC_015577	ATA	2	6	13422	13427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992998
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259	NC_015577	ATA	2	6	13668	13673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333992998
260	NC_015577	GGCA	2	8	13741	13748	25 %	0 %	50 %	25 %	333992998
261	NC_015577	T	7	7	13777	13783	0 %	100 %	0 %	0 %	333992998
262	NC_015577	GGCAA	2	10	13793	13802	40 %	0 %	40 %	20 %	333992998
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266	NC_015577	TGG	2	6	14205	14210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333992999
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393	NC_015577	TCTG	2	8	19967	19974	0 %	50 %	25 %	25 %	333993003
394	NC_015577	A	6	6	19976	19981	100 %	0 %	0 %	0 %	333993003
395	NC_015577	TA	3	6	20095	20100	50 %	50 %	0 %	0 %	333993003
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