MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 58930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44101	NC_015555	AT	3	6	1883376	1883381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44102	NC_015555	TTA	2	6	1883389	1883394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44103	NC_015555	A	6	6	1883452	1883457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44104	NC_015555	CTT	2	6	1883485	1883490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897632
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44108	NC_015555	TATC	2	8	1883734	1883741	25 %	50 %	0 %	25 %	333897632
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44110	NC_015555	GTA	2	6	1884074	1884079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897632
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44112	NC_015555	TATGCT	2	12	1884134	1884145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333897632
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44116	NC_015555	GCT	2	6	1884249	1884254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897632
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44118	NC_015555	ACAG	2	8	1884306	1884313	50 %	0 %	25 %	25 %	333897632
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44215	NC_015555	AAT	2	6	1888856	1888861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44226	NC_015555	TA	3	6	1889506	1889511	50 %	50 %	0 %	0 %	333897636
44227	NC_015555	GGC	2	6	1889525	1889530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333897636
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44240	NC_015555	AGA	3	9	1890328	1890336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333897636
44241	NC_015555	ATG	2	6	1890369	1890374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897636
44242	NC_015555	AGCA	2	8	1890429	1890436	50 %	0 %	25 %	25 %	333897636
44243	NC_015555	CAC	2	6	1890454	1890459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333897636
44244	NC_015555	A	6	6	1890540	1890545	100 %	0 %	0 %	0 %	333897637
44245	NC_015555	GTA	2	6	1890603	1890608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897637
44246	NC_015555	A	6	6	1890608	1890613	100 %	0 %	0 %	0 %	333897637
44247	NC_015555	T	6	6	1890641	1890646	0 %	100 %	0 %	0 %	333897637
44248	NC_015555	GCT	2	6	1890701	1890706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897637
44249	NC_015555	T	7	7	1890757	1890763	0 %	100 %	0 %	0 %	333897637
44250	NC_015555	TTA	2	6	1890820	1890825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897637
44251	NC_015555	CAT	2	6	1890892	1890897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897637
44252	NC_015555	TAT	2	6	1890907	1890912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897637
44253	NC_015555	CCT	2	6	1890983	1890988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333897637
44254	NC_015555	AAT	2	6	1891064	1891069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333897637
44255	NC_015555	TCG	2	6	1891078	1891083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897637
44256	NC_015555	GTTTG	2	10	1891149	1891158	0 %	60 %	40 %	0 %	333897637
44257	NC_015555	TGC	2	6	1891241	1891246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897637
44258	NC_015555	CAT	2	6	1891247	1891252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897637
44259	NC_015555	T	6	6	1891270	1891275	0 %	100 %	0 %	0 %	333897637
44260	NC_015555	CAT	2	6	1891325	1891330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897637
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44263	NC_015555	GTC	2	6	1891468	1891473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897638
44264	NC_015555	TAT	2	6	1891489	1891494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897638
44265	NC_015555	GTA	2	6	1891510	1891515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897638
44266	NC_015555	TCCATC	2	12	1891633	1891644	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333897638
44267	NC_015555	TGT	2	6	1891680	1891685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333897638
44268	NC_015555	TGC	2	6	1892029	1892034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897638
44269	NC_015555	TAT	2	6	1892149	1892154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897638
44270	NC_015555	T	7	7	1892370	1892376	0 %	100 %	0 %	0 %	333897638
44271	NC_015555	TCT	2	6	1892423	1892428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897638
44272	NC_015555	GTACTT	2	12	1892482	1892493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333897638
44273	NC_015555	TTC	2	6	1892527	1892532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897638
44274	NC_015555	TTG	2	6	1892567	1892572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333897638
44275	NC_015555	TTA	2	6	1892601	1892606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897638
44276	NC_015555	ACAGTG	2	12	1892627	1892638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333897638
44277	NC_015555	T	6	6	1892657	1892662	0 %	100 %	0 %	0 %	333897638
44278	NC_015555	TTTC	2	8	1892748	1892755	0 %	75 %	0 %	25 %	333897638
44279	NC_015555	CTT	3	9	1892769	1892777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897638
44280	NC_015555	T	6	6	1892860	1892865	0 %	100 %	0 %	0 %	333897638
44281	NC_015555	TGG	2	6	1892935	1892940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44282	NC_015555	TA	3	6	1892951	1892956	50 %	50 %	0 %	0 %	333897639
44283	NC_015555	T	7	7	1892965	1892971	0 %	100 %	0 %	0 %	333897639
44284	NC_015555	TGC	2	6	1893004	1893009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897639
44285	NC_015555	CTTTT	2	10	1893035	1893044	0 %	80 %	0 %	20 %	333897639
44286	NC_015555	CT	4	8	1893063	1893070	0 %	50 %	0 %	50 %	333897639
44287	NC_015555	GCT	2	6	1893074	1893079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897639
44288	NC_015555	GCA	2	6	1893116	1893121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333897639
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44290	NC_015555	T	6	6	1893200	1893205	0 %	100 %	0 %	0 %	333897639
44291	NC_015555	GTA	2	6	1893281	1893286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897639
44292	NC_015555	TCC	2	6	1893296	1893301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333897639
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44295	NC_015555	TGC	2	6	1893431	1893436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897640
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44300	NC_015555	CTG	2	6	1893757	1893762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897640
44301	NC_015555	AT	3	6	1893764	1893769	50 %	50 %	0 %	0 %	333897640
44302	NC_015555	CTT	2	6	1893786	1893791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897640
44303	NC_015555	TGCAGG	2	12	1893830	1893841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333897640
44304	NC_015555	CTT	2	6	1893897	1893902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897640
44305	NC_015555	TTC	2	6	1893976	1893981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897640
44306	NC_015555	AAG	2	6	1893983	1893988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333897640
44307	NC_015555	GGC	2	6	1894122	1894127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333897640
44308	NC_015555	TCAT	2	8	1894128	1894135	25 %	50 %	0 %	25 %	333897640
44309	NC_015555	TGTCT	2	10	1894154	1894163	0 %	60 %	20 %	20 %	333897640
44310	NC_015555	CCA	2	6	1894245	1894250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333897640
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44312	NC_015555	AAG	2	6	1894352	1894357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333897640
44313	NC_015555	CT	3	6	1894567	1894572	0 %	50 %	0 %	50 %	333897640
44314	NC_015555	GAC	2	6	1894587	1894592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333897640
44315	NC_015555	AC	3	6	1894599	1894604	50 %	0 %	0 %	50 %	333897640
44316	NC_015555	TCA	2	6	1894650	1894655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897640
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44318	NC_015555	GGC	2	6	1894689	1894694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333897640
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44320	NC_015555	CAA	2	6	1894717	1894722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333897640
44321	NC_015555	TA	3	6	1894742	1894747	50 %	50 %	0 %	0 %	333897640
44322	NC_015555	GCCT	2	8	1894843	1894850	0 %	25 %	25 %	50 %	333897641
44323	NC_015555	ATC	2	6	1894882	1894887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897641
44324	NC_015555	TCCA	2	8	1894908	1894915	25 %	25 %	0 %	50 %	333897641
44325	NC_015555	AAC	2	6	1895145	1895150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333897641
44326	NC_015555	TAT	2	6	1895163	1895168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897641
44327	NC_015555	TA	3	6	1895179	1895184	50 %	50 %	0 %	0 %	333897641
44328	NC_015555	TAA	2	6	1895190	1895195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333897641
44329	NC_015555	CTG	3	9	1895210	1895218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897641
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44332	NC_015555	T	7	7	1895349	1895355	0 %	100 %	0 %	0 %	333897641
44333	NC_015555	AAT	2	6	1895453	1895458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333897641
44334	NC_015555	CTC	2	6	1895687	1895692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333897642
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44336	NC_015555	ATC	2	6	1895720	1895725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897642
44337	NC_015555	GAT	2	6	1895767	1895772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897642
44338	NC_015555	CAA	2	6	1895789	1895794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333897642
44339	NC_015555	CTT	2	6	1895807	1895812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897642
44340	NC_015555	CAA	2	6	1895920	1895925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333897642
44341	NC_015555	TC	3	6	1895927	1895932	0 %	50 %	0 %	50 %	333897642
44342	NC_015555	CAGAT	2	10	1895966	1895975	40 %	20 %	20 %	20 %	333897642
44343	NC_015555	TTC	2	6	1896028	1896033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897642
44344	NC_015555	T	6	6	1896041	1896046	0 %	100 %	0 %	0 %	333897642
44345	NC_015555	T	6	6	1896053	1896058	0 %	100 %	0 %	0 %	333897642
44346	NC_015555	AGC	2	6	1896062	1896067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333897642
44347	NC_015555	ACC	2	6	1896068	1896073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333897642
44348	NC_015555	TAT	2	6	1896215	1896220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333897642
44349	NC_015555	GCC	2	6	1896239	1896244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333897642
44350	NC_015555	GTC	2	6	1896251	1896256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897642
44351	NC_015555	CT	3	6	1896320	1896325	0 %	50 %	0 %	50 %	333897642
44352	NC_015555	TGG	2	6	1896329	1896334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333897642
44353	NC_015555	AAG	2	6	1896344	1896349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333897642
44354	NC_015555	GTC	2	6	1896386	1896391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897642
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44356	NC_015555	GCT	2	6	1896474	1896479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333897642
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44475	NC_015555	TC	3	6	1901807	1901812	0 %	50 %	0 %	50 %	333897648
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44479	NC_015555	TGA	2	6	1901941	1901946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897648
44480	NC_015555	TA	3	6	1901953	1901958	50 %	50 %	0 %	0 %	333897648
44481	NC_015555	TTC	2	6	1901959	1901964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333897648
44482	NC_015555	TCA	2	6	1901985	1901990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333897648
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44485	NC_015555	T	6	6	1902077	1902082	0 %	100 %	0 %	0 %	333897648
44486	NC_015555	CTCTG	2	10	1902085	1902094	0 %	40 %	20 %	40 %	333897648
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