MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 58930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015555	TTA	2	6	553659	553664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896379
12502	NC_015555	TCTTG	2	10	553665	553674	0 %	60 %	20 %	20 %	333896379
12503	NC_015555	TTC	2	6	553798	553803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896379
12504	NC_015555	TCA	2	6	553817	553822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896379
12505	NC_015555	CCA	2	6	553831	553836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333896379
12506	NC_015555	TCT	2	6	553850	553855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896379
12507	NC_015555	CGG	2	6	553914	553919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333896379
12508	NC_015555	GAAT	2	8	553933	553940	50 %	25 %	25 %	0 %	333896379
12509	NC_015555	CAA	3	9	553944	553952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896379
12510	NC_015555	TGCTAT	2	12	554029	554040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333896379
12511	NC_015555	T	7	7	554089	554095	0 %	100 %	0 %	0 %	333896379
12512	NC_015555	TAT	2	6	554127	554132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896379
12513	NC_015555	TCC	2	6	554134	554139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333896379
12514	NC_015555	TAT	2	6	554197	554202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896379
12515	NC_015555	TCA	2	6	554246	554251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896379
12516	NC_015555	ATC	2	6	554347	554352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896379
12517	NC_015555	T	6	6	554394	554399	0 %	100 %	0 %	0 %	333896379
12518	NC_015555	GAT	2	6	554425	554430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896379
12519	NC_015555	T	7	7	554460	554466	0 %	100 %	0 %	0 %	333896379
12520	NC_015555	CCT	2	6	554476	554481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_015555	TATT	2	8	554484	554491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_015555	CAA	2	6	554518	554523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_015555	ATAA	2	8	554524	554531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_015555	TAA	2	6	554549	554554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_015555	TTC	2	6	554575	554580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_015555	GT	3	6	554582	554587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_015555	AT	3	6	554605	554610	50 %	50 %	0 %	0 %	333896380
12528	NC_015555	TCAG	2	8	554620	554627	25 %	25 %	25 %	25 %	333896380
12529	NC_015555	T	8	8	554661	554668	0 %	100 %	0 %	0 %	333896380
12530	NC_015555	TTG	2	6	554737	554742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896380
12531	NC_015555	TCA	2	6	554818	554823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896380
12532	NC_015555	ATA	2	6	554835	554840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896380
12533	NC_015555	TCTA	2	8	554880	554887	25 %	50 %	0 %	25 %	333896380
12534	NC_015555	T	7	7	554888	554894	0 %	100 %	0 %	0 %	333896380
12535	NC_015555	GA	4	8	554908	554915	50 %	0 %	50 %	0 %	333896380
12536	NC_015555	CTA	3	9	554975	554983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896380
12537	NC_015555	ATTT	2	8	554988	554995	25 %	75 %	0 %	0 %	333896380
12538	NC_015555	CATT	2	8	555008	555015	25 %	50 %	0 %	25 %	333896380
12539	NC_015555	CTA	2	6	555110	555115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896380
12540	NC_015555	CTG	2	6	555122	555127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896380
12541	NC_015555	TTC	2	6	555252	555257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896380
12542	NC_015555	GAT	2	6	555319	555324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896380
12543	NC_015555	TTC	2	6	555347	555352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896380
12544	NC_015555	TTC	2	6	555408	555413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896380
12545	NC_015555	ATG	2	6	555448	555453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896380
12546	NC_015555	CTG	2	6	555491	555496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896380
12547	NC_015555	CAT	2	6	555575	555580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896380
12548	NC_015555	T	6	6	555580	555585	0 %	100 %	0 %	0 %	333896380
12549	NC_015555	TAT	2	6	555622	555627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_015555	AAT	2	6	555636	555641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_015555	CAA	2	6	555645	555650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_015555	ATTT	2	8	555671	555678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_015555	ATA	2	6	555695	555700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_015555	TAAT	2	8	555701	555708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_015555	CAG	2	6	555717	555722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_015555	AGG	2	6	555731	555736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_015555	TTAA	2	8	555769	555776	50 %	50 %	0 %	0 %	333896381
12558	NC_015555	TAG	2	6	555797	555802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896381
12559	NC_015555	AG	4	8	555888	555895	50 %	0 %	50 %	0 %	333896381
12560	NC_015555	T	6	6	555973	555978	0 %	100 %	0 %	0 %	333896381
12561	NC_015555	ATC	2	6	556083	556088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896381
12562	NC_015555	ATTA	2	8	556111	556118	50 %	50 %	0 %	0 %	333896381
12563	NC_015555	GAA	2	6	556123	556128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896381
12564	NC_015555	TGA	2	6	556266	556271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896381
12565	NC_015555	ATA	2	6	556327	556332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896381
12566	NC_015555	TA	3	6	556339	556344	50 %	50 %	0 %	0 %	333896381
12567	NC_015555	AGGAAT	2	12	556353	556364	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333896381
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12569	NC_015555	GGA	2	6	556437	556442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896381
12570	NC_015555	TGA	2	6	556479	556484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896381
12571	NC_015555	ATA	2	6	556558	556563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896381
12572	NC_015555	GCT	2	6	556612	556617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896381
12573	NC_015555	TAA	2	6	556626	556631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896381
12574	NC_015555	A	6	6	556630	556635	100 %	0 %	0 %	0 %	333896381
12575	NC_015555	TTG	2	6	556636	556641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896381
12576	NC_015555	TTG	2	6	556667	556672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_015555	TGA	2	6	556716	556721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896382
12578	NC_015555	ATACAC	2	12	556734	556745	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333896382
12579	NC_015555	AAT	2	6	556777	556782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896382
12580	NC_015555	TGG	2	6	556855	556860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896382
12581	NC_015555	AT	3	6	556907	556912	50 %	50 %	0 %	0 %	333896382
12582	NC_015555	GAA	2	6	556990	556995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896382
12583	NC_015555	TG	3	6	557026	557031	0 %	50 %	50 %	0 %	333896382
12584	NC_015555	ATC	2	6	557069	557074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896382
12585	NC_015555	TTTG	2	8	557125	557132	0 %	75 %	25 %	0 %	333896382
12586	NC_015555	ATACG	2	10	557170	557179	40 %	20 %	20 %	20 %	333896382
12587	NC_015555	ACA	2	6	557193	557198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896382
12588	NC_015555	A	6	6	557252	557257	100 %	0 %	0 %	0 %	333896382
12589	NC_015555	AT	3	6	557301	557306	50 %	50 %	0 %	0 %	333896382
12590	NC_015555	AGG	2	6	557445	557450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_015555	AGG	2	6	557479	557484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896383
12592	NC_015555	AACA	2	8	557485	557492	75 %	0 %	0 %	25 %	333896383
12593	NC_015555	ATGG	2	8	557513	557520	25 %	25 %	50 %	0 %	333896383
12594	NC_015555	TAG	2	6	557526	557531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896383
12595	NC_015555	TGC	2	6	557569	557574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896383
12596	NC_015555	AGC	2	6	557797	557802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896383
12597	NC_015555	GA	3	6	558090	558095	50 %	0 %	50 %	0 %	333896383
12598	NC_015555	TGC	2	6	558127	558132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896383
12599	NC_015555	TGA	2	6	558142	558147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896383
12600	NC_015555	AGT	2	6	558229	558234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896383
12601	NC_015555	ATA	2	6	558236	558241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896383
12602	NC_015555	AGA	2	6	558289	558294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896383
12603	NC_015555	ATG	2	6	558360	558365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896383
12604	NC_015555	AAT	2	6	558370	558375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896383
12605	NC_015555	GCA	2	6	558380	558385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896383
12606	NC_015555	T	6	6	558426	558431	0 %	100 %	0 %	0 %	333896384
12607	NC_015555	A	6	6	558552	558557	100 %	0 %	0 %	0 %	333896384
12608	NC_015555	T	6	6	558601	558606	0 %	100 %	0 %	0 %	333896384
12609	NC_015555	GAA	2	6	558669	558674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896384
12610	NC_015555	AT	3	6	558745	558750	50 %	50 %	0 %	0 %	333896384
12611	NC_015555	A	6	6	558773	558778	100 %	0 %	0 %	0 %	333896384
12612	NC_015555	TAG	2	6	558781	558786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896384
12613	NC_015555	A	7	7	558807	558813	100 %	0 %	0 %	0 %	333896384
12614	NC_015555	GAT	2	6	558825	558830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896384
12615	NC_015555	GAT	3	9	558849	558857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896384
12616	NC_015555	TA	3	6	558874	558879	50 %	50 %	0 %	0 %	333896384
12617	NC_015555	GATG	2	8	558950	558957	25 %	25 %	50 %	0 %	333896384
12618	NC_015555	GAT	2	6	558978	558983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896384
12619	NC_015555	GCA	2	6	559057	559062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896384
12620	NC_015555	GAA	2	6	559257	559262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896384
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12989	NC_015555	AT	3	6	576598	576603	50 %	50 %	0 %	0 %	333896400
12990	NC_015555	TATG	2	8	576756	576763	25 %	50 %	25 %	0 %	333896400
12991	NC_015555	GCA	2	6	576770	576775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896400
12992	NC_015555	TAT	2	6	576824	576829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896400
12993	NC_015555	TAT	2	6	576858	576863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896400
12994	NC_015555	TCA	2	6	576916	576921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896400
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12996	NC_015555	TTG	2	6	577043	577048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896400
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12999	NC_015555	TAC	2	6	577116	577121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896400
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