MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 61443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_015519	TGTTTT	2	12	2506181	2506192	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332800315
56002	NC_015519	AGCA	2	8	2506200	2506207	50 %	0 %	25 %	25 %	332800315
56003	NC_015519	TCA	2	6	2506259	2506264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800315
56004	NC_015519	GCT	2	6	2506325	2506330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800315
56005	NC_015519	GATTT	2	10	2506390	2506399	20 %	60 %	20 %	0 %	332800315
56006	NC_015519	ATA	2	6	2506411	2506416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800315
56007	NC_015519	GA	3	6	2506546	2506551	50 %	0 %	50 %	0 %	332800315
56008	NC_015519	CTTT	2	8	2506621	2506628	0 %	75 %	0 %	25 %	332800316
56009	NC_015519	TTC	3	9	2506657	2506665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800316
56010	NC_015519	TGTCA	2	10	2506753	2506762	20 %	40 %	20 %	20 %	332800316
56011	NC_015519	CTT	2	6	2506771	2506776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800317
56012	NC_015519	CTA	2	6	2506777	2506782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800317
56013	NC_015519	GCT	2	6	2506804	2506809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800317
56014	NC_015519	CAG	2	6	2506841	2506846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800317
56015	NC_015519	AGTTTG	2	12	2506850	2506861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332800317
56016	NC_015519	GTT	2	6	2506867	2506872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332800317
56017	NC_015519	TGG	2	6	2506916	2506921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332800317
56018	NC_015519	TGT	2	6	2506995	2507000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332800317
56019	NC_015519	A	7	7	2507021	2507027	100 %	0 %	0 %	0 %	332800317
56020	NC_015519	CTT	2	6	2507029	2507034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800317
56021	NC_015519	T	6	6	2507069	2507074	0 %	100 %	0 %	0 %	332800317
56022	NC_015519	CT	3	6	2507103	2507108	0 %	50 %	0 %	50 %	332800317
56023	NC_015519	CCT	2	6	2507145	2507150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56024	NC_015519	TAT	2	6	2507232	2507237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800318
56025	NC_015519	GTCT	2	8	2507270	2507277	0 %	50 %	25 %	25 %	332800318
56026	NC_015519	AT	3	6	2507302	2507307	50 %	50 %	0 %	0 %	332800318
56027	NC_015519	A	6	6	2507308	2507313	100 %	0 %	0 %	0 %	332800318
56028	NC_015519	TA	3	6	2507431	2507436	50 %	50 %	0 %	0 %	332800318
56029	NC_015519	TGA	2	6	2507590	2507595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800318
56030	NC_015519	ACA	2	6	2507662	2507667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800318
56031	NC_015519	GTG	2	6	2507694	2507699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332800318
56032	NC_015519	TAGC	2	8	2507804	2507811	25 %	25 %	25 %	25 %	332800318
56033	NC_015519	A	6	6	2507822	2507827	100 %	0 %	0 %	0 %	332800318
56034	NC_015519	TCA	2	6	2507873	2507878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800318
56035	NC_015519	TGT	2	6	2507892	2507897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332800318
56036	NC_015519	TAA	2	6	2507928	2507933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800318
56037	NC_015519	GAA	2	6	2507990	2507995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800318
56038	NC_015519	TCATA	2	10	2508021	2508030	40 %	40 %	0 %	20 %	332800318
56039	NC_015519	AT	4	8	2508060	2508067	50 %	50 %	0 %	0 %	332800318
56040	NC_015519	AAC	2	6	2508088	2508093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800318
56041	NC_015519	GAG	2	6	2508096	2508101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332800318
56042	NC_015519	CTT	2	6	2508116	2508121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800318
56043	NC_015519	CTG	2	6	2508153	2508158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800318
56044	NC_015519	TAC	2	6	2508160	2508165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800318
56045	NC_015519	T	6	6	2508182	2508187	0 %	100 %	0 %	0 %	332800318
56046	NC_015519	CTAT	2	8	2508215	2508222	25 %	50 %	0 %	25 %	332800318
56047	NC_015519	TCA	2	6	2508225	2508230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800318
56048	NC_015519	CAC	2	6	2508234	2508239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332800319
56049	NC_015519	TAA	2	6	2508294	2508299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800319
56050	NC_015519	A	6	6	2508318	2508323	100 %	0 %	0 %	0 %	332800319
56051	NC_015519	CTT	2	6	2508350	2508355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800319
56052	NC_015519	AT	3	6	2508382	2508387	50 %	50 %	0 %	0 %	332800319
56053	NC_015519	ATC	2	6	2508393	2508398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56054	NC_015519	TCT	2	6	2508402	2508407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800319
56055	NC_015519	ACT	2	6	2508415	2508420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56056	NC_015519	CTT	2	6	2508474	2508479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800319
56057	NC_015519	T	6	6	2508478	2508483	0 %	100 %	0 %	0 %	332800319
56058	NC_015519	TCT	2	6	2508487	2508492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800319
56059	NC_015519	TCA	2	6	2508520	2508525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56060	NC_015519	TCA	2	6	2508565	2508570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56061	NC_015519	GTG	2	6	2508658	2508663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332800319
56062	NC_015519	GT	3	6	2508681	2508686	0 %	50 %	50 %	0 %	332800319
56063	NC_015519	TCA	2	6	2508718	2508723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56064	NC_015519	CTG	2	6	2508833	2508838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800319
56065	NC_015519	TAA	2	6	2509010	2509015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800319
56066	NC_015519	TCA	2	6	2509033	2509038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56067	NC_015519	TCC	2	6	2509059	2509064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800319
56068	NC_015519	TCA	2	6	2509111	2509116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800319
56069	NC_015519	TAG	2	6	2509123	2509128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800319
56070	NC_015519	A	6	6	2509155	2509160	100 %	0 %	0 %	0 %	332800319
56071	NC_015519	TCCT	2	8	2509184	2509191	0 %	50 %	0 %	50 %	332800320
56072	NC_015519	TA	3	6	2509313	2509318	50 %	50 %	0 %	0 %	332800320
56073	NC_015519	TC	3	6	2509330	2509335	0 %	50 %	0 %	50 %	332800320
56074	NC_015519	AT	3	6	2509374	2509379	50 %	50 %	0 %	0 %	332800320
56075	NC_015519	TCT	2	6	2509386	2509391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800320
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56077	NC_015519	AGCCTA	2	12	2509551	2509562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332800320
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56079	NC_015519	TAA	2	6	2509646	2509651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800320
56080	NC_015519	TGC	2	6	2509685	2509690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800320
56081	NC_015519	AT	3	6	2509890	2509895	50 %	50 %	0 %	0 %	332800320
56082	NC_015519	GTTA	2	8	2510018	2510025	25 %	50 %	25 %	0 %	332800320
56083	NC_015519	CCT	2	6	2510048	2510053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800321
56084	NC_015519	AGCT	2	8	2510064	2510071	25 %	25 %	25 %	25 %	332800321
56085	NC_015519	TTA	2	6	2510158	2510163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800321
56086	NC_015519	TA	3	6	2510195	2510200	50 %	50 %	0 %	0 %	332800321
56087	NC_015519	A	6	6	2510268	2510273	100 %	0 %	0 %	0 %	332800321
56088	NC_015519	GCA	2	6	2510296	2510301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800321
56089	NC_015519	TAA	2	6	2510324	2510329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800321
56090	NC_015519	TTC	2	6	2510496	2510501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800321
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56092	NC_015519	TCT	2	6	2510650	2510655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800321
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56100	NC_015519	TTC	2	6	2510925	2510930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800321
56101	NC_015519	T	6	6	2510968	2510973	0 %	100 %	0 %	0 %	332800321
56102	NC_015519	CAG	2	6	2510981	2510986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800321
56103	NC_015519	ATG	2	6	2511031	2511036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800321
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56105	NC_015519	TTC	2	6	2511111	2511116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800321
56106	NC_015519	T	6	6	2511140	2511145	0 %	100 %	0 %	0 %	332800321
56107	NC_015519	GTTT	2	8	2511199	2511206	0 %	75 %	25 %	0 %	332800321
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56111	NC_015519	TGC	2	6	2511272	2511277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800321
56112	NC_015519	TCA	2	6	2511442	2511447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800321
56113	NC_015519	TG	3	6	2511478	2511483	0 %	50 %	50 %	0 %	332800321
56114	NC_015519	CT	3	6	2511526	2511531	0 %	50 %	0 %	50 %	332800321
56115	NC_015519	TA	3	6	2511545	2511550	50 %	50 %	0 %	0 %	332800321
56116	NC_015519	CTG	2	6	2511560	2511565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800321
56117	NC_015519	CCT	2	6	2511574	2511579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800321
56118	NC_015519	AGC	2	6	2511654	2511659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800321
56119	NC_015519	GTA	2	6	2511670	2511675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800321
56120	NC_015519	TGA	2	6	2511699	2511704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800321
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56136	NC_015519	TAC	2	6	2512610	2512615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800322
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56188	NC_015519	TCC	2	6	2515122	2515127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56221	NC_015519	TCAC	2	8	2517005	2517012	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56222	NC_015519	GAA	2	6	2517056	2517061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800331
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56230	NC_015519	TCC	2	6	2517371	2517376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800331
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56234	NC_015519	GTAA	2	8	2517652	2517659	50 %	25 %	25 %	0 %	332800331
56235	NC_015519	TGC	2	6	2517907	2517912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800331
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56241	NC_015519	TCT	2	6	2518151	2518156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800331
56242	NC_015519	AGT	2	6	2518202	2518207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800331
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56244	NC_015519	CCTT	2	8	2518236	2518243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56245	NC_015519	T	6	6	2518286	2518291	0 %	100 %	0 %	0 %	332800332
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56334	NC_015519	CTT	2	6	2522144	2522149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800335
56335	NC_015519	CTGG	2	8	2522152	2522159	0 %	25 %	50 %	25 %	332800335
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56338	NC_015519	TCT	2	6	2522309	2522314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800336
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56340	NC_015519	TCT	3	9	2522451	2522459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800336
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56343	NC_015519	TG	3	6	2522596	2522601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56344	NC_015519	AC	3	6	2522626	2522631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56345	NC_015519	ATA	2	6	2522653	2522658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56346	NC_015519	A	6	6	2522756	2522761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56347	NC_015519	TCTA	2	8	2522865	2522872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56348	NC_015519	TTTC	2	8	2522876	2522883	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56349	NC_015519	TCT	2	6	2522953	2522958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56350	NC_015519	TCC	2	6	2522996	2523001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800337
56351	NC_015519	ATC	2	6	2523080	2523085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800337
56352	NC_015519	TGC	2	6	2523205	2523210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800337
56353	NC_015519	ATC	2	6	2523226	2523231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800337
56354	NC_015519	GCC	2	6	2523232	2523237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332800337
56355	NC_015519	GTC	2	6	2523332	2523337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800337
56356	NC_015519	GCA	2	6	2523356	2523361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800337
56357	NC_015519	T	6	6	2523403	2523408	0 %	100 %	0 %	0 %	332800337
56358	NC_015519	GCA	2	6	2523438	2523443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800337
56359	NC_015519	CAATG	2	10	2523493	2523502	40 %	20 %	20 %	20 %	332800337
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56362	NC_015519	CCA	2	6	2523594	2523599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332800337
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56364	NC_015519	TAAA	2	8	2523679	2523686	75 %	25 %	0 %	0 %	332800337
56365	NC_015519	CCT	2	6	2523749	2523754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56366	NC_015519	A	7	7	2523805	2523811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56367	NC_015519	ATT	2	6	2523827	2523832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800338
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56376	NC_015519	CTTT	2	8	2524115	2524122	0 %	75 %	0 %	25 %	332800338
56377	NC_015519	AC	3	6	2524173	2524178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56378	NC_015519	ATA	2	6	2524200	2524205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56411	NC_015519	T	6	6	2525669	2525674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56412	NC_015519	AGG	2	6	2525758	2525763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56413	NC_015519	A	7	7	2525778	2525784	100 %	0 %	0 %	0 %	332800340
56414	NC_015519	A	6	6	2525820	2525825	100 %	0 %	0 %	0 %	332800340
56415	NC_015519	CAAT	2	8	2525892	2525899	50 %	25 %	0 %	25 %	332800340
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56439	NC_015519	GGA	2	6	2527019	2527024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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56441	NC_015519	TAT	2	6	2527327	2527332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800344
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56451	NC_015519	TC	3	6	2527691	2527696	0 %	50 %	0 %	50 %	332800345
56452	NC_015519	ATG	2	6	2527787	2527792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800345
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56465	NC_015519	GAA	2	6	2528271	2528276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800346
56466	NC_015519	TCG	2	6	2528294	2528299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800346
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56469	NC_015519	GCA	2	6	2528345	2528350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800346
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56480	NC_015519	GTA	2	6	2528830	2528835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800346
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56493	NC_015519	ATC	2	6	2529456	2529461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56494	NC_015519	AT	3	6	2529494	2529499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56495	NC_015519	TA	4	8	2529521	2529528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56496	NC_015519	GT	4	8	2529530	2529537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56497	NC_015519	TA	3	6	2529562	2529567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56498	NC_015519	TGG	2	6	2529690	2529695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56499	NC_015519	GCT	2	6	2529766	2529771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800348
56500	NC_015519	TAG	2	6	2530012	2530017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800348

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