MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 70964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_015500	GCT	2	6	108346	108351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296759
2503	NC_015500	GCCG	2	8	108377	108384	0 %	0 %	50 %	50 %	332296759
2504	NC_015500	AAAT	2	8	108420	108427	75 %	25 %	0 %	0 %	332296759
2505	NC_015500	TCG	2	6	108432	108437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296759
2506	NC_015500	TATG	2	8	108671	108678	25 %	50 %	25 %	0 %	332296760
2507	NC_015500	TCG	2	6	108716	108721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296760
2508	NC_015500	TAAAAG	2	12	108761	108772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332296760
2509	NC_015500	CG	3	6	108836	108841	0 %	0 %	50 %	50 %	332296760
2510	NC_015500	GCCG	2	8	108888	108895	0 %	0 %	50 %	50 %	332296760
2511	NC_015500	GTC	2	6	108916	108921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296760
2512	NC_015500	GCT	2	6	108947	108952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296760
2513	NC_015500	GCA	2	6	108959	108964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296760
2514	NC_015500	CTG	2	6	108978	108983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296760
2515	NC_015500	CGG	2	6	109017	109022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296760
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2519	NC_015500	CGGAA	2	10	109308	109317	40 %	0 %	40 %	20 %	332296760
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2521	NC_015500	CGG	2	6	109347	109352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296760
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2526	NC_015500	GCG	2	6	109707	109712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2529	NC_015500	TAT	2	6	109755	109760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015500	GACA	2	8	109786	109793	50 %	0 %	25 %	25 %	332296761
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2548	NC_015500	CCCG	2	8	110477	110484	0 %	0 %	25 %	75 %	332296761
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2552	NC_015500	ACCGTT	2	12	110567	110578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2555	NC_015500	CGT	2	6	110737	110742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296762
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2557	NC_015500	AGCGG	2	10	110822	110831	20 %	0 %	60 %	20 %	332296762
2558	NC_015500	GCG	2	6	110835	110840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296762
2559	NC_015500	TCA	2	6	110976	110981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296762
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2562	NC_015500	ATA	2	6	111128	111133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296762
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2565	NC_015500	GGC	2	6	111262	111267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296762
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2568	NC_015500	TA	3	6	111468	111473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015500	T	7	7	111509	111515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2594	NC_015500	GAT	2	6	112595	112600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296765
2595	NC_015500	GAC	2	6	112607	112612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296765
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2604	NC_015500	CTT	2	6	112989	112994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_015500	AAC	2	6	113023	113028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_015500	GCC	2	6	113132	113137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296766
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2608	NC_015500	TTTC	2	8	113259	113266	0 %	75 %	0 %	25 %	332296766
2609	NC_015500	CGT	2	6	113280	113285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296766
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2612	NC_015500	GC	3	6	113413	113418	0 %	0 %	50 %	50 %	332296766
2613	NC_015500	AGC	2	6	113432	113437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296766
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2621	NC_015500	TTTTA	2	10	113776	113785	20 %	80 %	0 %	0 %	332296766
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2624	NC_015500	GTT	2	6	113914	113919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296766
2625	NC_015500	GAA	2	6	113939	113944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296766
2626	NC_015500	TTG	2	6	113975	113980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296766
2627	NC_015500	CGGT	2	8	114047	114054	0 %	25 %	50 %	25 %	332296766
2628	NC_015500	CCG	2	6	114153	114158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296766
2629	NC_015500	GTC	2	6	114160	114165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296766
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2631	NC_015500	AAAT	2	8	114358	114365	75 %	25 %	0 %	0 %	332296767
2632	NC_015500	AGA	2	6	114380	114385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296767
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2643	NC_015500	CAT	2	6	114945	114950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296767
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2709	NC_015500	AT	5	10	117601	117610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2712	NC_015500	TAT	2	6	117699	117704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2713	NC_015500	GAA	2	6	117734	117739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296770
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2717	NC_015500	TATTC	2	10	117922	117931	20 %	60 %	0 %	20 %	332296770
2718	NC_015500	CCGATA	2	12	117957	117968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332296770
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2720	NC_015500	GCGGA	2	10	117990	117999	20 %	0 %	60 %	20 %	332296770
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2728	NC_015500	CGT	2	6	118645	118650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296771
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2731	NC_015500	A	7	7	118836	118842	100 %	0 %	0 %	0 %	332296772
2732	NC_015500	TCT	2	6	118955	118960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296772
2733	NC_015500	T	6	6	118983	118988	0 %	100 %	0 %	0 %	332296772
2734	NC_015500	CTT	2	6	119025	119030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296772
2735	NC_015500	CGT	2	6	119061	119066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296772
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2738	NC_015500	ATG	2	6	119150	119155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296772
2739	NC_015500	A	6	6	119191	119196	100 %	0 %	0 %	0 %	332296772
2740	NC_015500	TTC	2	6	119272	119277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296772
2741	NC_015500	TCT	2	6	119282	119287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296772
2742	NC_015500	T	6	6	119393	119398	0 %	100 %	0 %	0 %	332296772
2743	NC_015500	TGC	2	6	119429	119434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296772
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2745	NC_015500	ACG	2	6	119516	119521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296772
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2992	NC_015500	GTT	2	6	130569	130574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296779
2993	NC_015500	CCG	2	6	130593	130598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296779
2994	NC_015500	GACCG	2	10	130768	130777	20 %	0 %	40 %	40 %	332296779
2995	NC_015500	TGA	2	6	130800	130805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296779
2996	NC_015500	CCG	2	6	130820	130825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296779
2997	NC_015500	GAA	2	6	130910	130915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296779
2998	NC_015500	GC	3	6	130920	130925	0 %	0 %	50 %	50 %	332296779
2999	NC_015500	ACG	2	6	130964	130969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296779
3000	NC_015500	CCG	2	6	130970	130975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296779

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