MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 70964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015500	TAA	2	6	22331	22336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296689
502	NC_015500	TCG	2	6	22339	22344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
503	NC_015500	CGC	2	6	22380	22385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
504	NC_015500	TAT	2	6	22441	22446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296689
505	NC_015500	CGG	2	6	22498	22503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
506	NC_015500	AT	3	6	22545	22550	50 %	50 %	0 %	0 %	332296689
507	NC_015500	T	6	6	22553	22558	0 %	100 %	0 %	0 %	332296689
508	NC_015500	A	7	7	22593	22599	100 %	0 %	0 %	0 %	332296689
509	NC_015500	TGAT	2	8	22616	22623	25 %	50 %	25 %	0 %	332296689
510	NC_015500	GC	3	6	22653	22658	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
511	NC_015500	GCT	2	6	22695	22700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
512	NC_015500	AC	3	6	22716	22721	50 %	0 %	0 %	50 %	332296689
513	NC_015500	GAC	2	6	22744	22749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
514	NC_015500	TCT	2	6	22756	22761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296689
515	NC_015500	CCG	2	6	22879	22884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
516	NC_015500	AAGG	2	8	22903	22910	50 %	0 %	50 %	0 %	332296689
517	NC_015500	CTG	2	6	22960	22965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
518	NC_015500	ACG	2	6	22982	22987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
519	NC_015500	GCG	2	6	22988	22993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
520	NC_015500	TGCG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	332296689
521	NC_015500	CAG	2	6	23019	23024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
522	NC_015500	CGG	2	6	23084	23089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
523	NC_015500	T	6	6	23107	23112	0 %	100 %	0 %	0 %	332296689
524	NC_015500	GCT	2	6	23226	23231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
525	NC_015500	GACG	2	8	23373	23380	25 %	0 %	50 %	25 %	332296689
526	NC_015500	GCG	2	6	23452	23457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
527	NC_015500	TACG	2	8	23502	23509	25 %	25 %	25 %	25 %	332296689
528	NC_015500	CGA	2	6	23511	23516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
529	NC_015500	CTG	2	6	23551	23556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
530	NC_015500	A	6	6	23561	23566	100 %	0 %	0 %	0 %	332296689
531	NC_015500	GCG	2	6	23600	23605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
532	NC_015500	CGT	2	6	23616	23621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
533	NC_015500	CCG	2	6	23650	23655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
534	NC_015500	GT	3	6	23683	23688	0 %	50 %	50 %	0 %	332296689
535	NC_015500	CCG	2	6	23705	23710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
536	NC_015500	CGC	2	6	23711	23716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
537	NC_015500	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
538	NC_015500	GTG	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296689
539	NC_015500	GGA	2	6	23772	23777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296689
540	NC_015500	CTG	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
541	NC_015500	ACG	2	6	23855	23860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
542	NC_015500	CG	3	6	23872	23877	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
543	NC_015500	CGGA	2	8	23944	23951	25 %	0 %	50 %	25 %	332296689
544	NC_015500	A	6	6	23951	23956	100 %	0 %	0 %	0 %	332296689
545	NC_015500	ATCG	2	8	24027	24034	25 %	25 %	25 %	25 %	332296689
546	NC_015500	GAA	2	6	24103	24108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296689
547	NC_015500	TGC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
548	NC_015500	GAA	2	6	24187	24192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296689
549	NC_015500	TG	3	6	24206	24211	0 %	50 %	50 %	0 %	332296689
550	NC_015500	GCC	2	6	24306	24311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
551	NC_015500	GC	3	6	24320	24325	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
552	NC_015500	CGC	2	6	24360	24365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
553	NC_015500	CGA	2	6	24494	24499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
554	NC_015500	CGA	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
555	NC_015500	CCG	2	6	24604	24609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
556	NC_015500	CG	3	6	24634	24639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_015500	CCG	2	6	24640	24645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_015500	GCC	2	6	24672	24677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_015500	GCG	2	6	24697	24702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015500	AAT	2	6	24744	24749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015500	AGGTT	2	10	24791	24800	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015500	ACAA	2	8	24805	24812	75 %	0 %	0 %	25 %	332296690
563	NC_015500	TGC	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
564	NC_015500	A	6	6	24837	24842	100 %	0 %	0 %	0 %	332296690
565	NC_015500	TAC	2	6	24894	24899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
566	NC_015500	ATT	2	6	24900	24905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296690
567	NC_015500	TTC	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296690
568	NC_015500	CTG	2	6	25038	25043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
569	NC_015500	T	6	6	25054	25059	0 %	100 %	0 %	0 %	332296690
570	NC_015500	GCT	2	6	25073	25078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
571	NC_015500	CCCG	2	8	25129	25136	0 %	0 %	25 %	75 %	332296690
572	NC_015500	CGG	2	6	25265	25270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296690
573	NC_015500	GGAA	2	8	25336	25343	50 %	0 %	50 %	0 %	332296690
574	NC_015500	ATC	2	6	25359	25364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
575	NC_015500	CGC	2	6	25370	25375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296690
576	NC_015500	CGAT	2	8	25384	25391	25 %	25 %	25 %	25 %	332296690
577	NC_015500	TGG	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296690
578	NC_015500	TCCG	2	8	25468	25475	0 %	25 %	25 %	50 %	332296690
579	NC_015500	TGT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296690
580	NC_015500	ATC	2	6	25578	25583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
581	NC_015500	TAT	2	6	25658	25663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296690
582	NC_015500	CAA	2	6	25688	25693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296690
583	NC_015500	TCA	2	6	25716	25721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
584	NC_015500	TCG	3	9	25837	25845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
585	NC_015500	ACG	2	6	25872	25877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296691
586	NC_015500	CCG	2	6	25948	25953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296691
587	NC_015500	GCT	2	6	25964	25969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
588	NC_015500	ACG	2	6	25975	25980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296691
589	NC_015500	TCG	2	6	26017	26022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
590	NC_015500	TTA	2	6	26029	26034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296691
591	NC_015500	TGTC	2	8	26067	26074	0 %	50 %	25 %	25 %	332296691
592	NC_015500	GTTC	2	8	26111	26118	0 %	50 %	25 %	25 %	332296691
593	NC_015500	T	6	6	26253	26258	0 %	100 %	0 %	0 %	332296691
594	NC_015500	TGA	2	6	26326	26331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296691
595	NC_015500	ATC	2	6	26355	26360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296691
596	NC_015500	CTT	2	6	26402	26407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296691
597	NC_015500	ACA	2	6	26431	26436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296691
598	NC_015500	GCG	2	6	26544	26549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296691
599	NC_015500	AGG	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015500	CTG	2	6	26761	26766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296692
601	NC_015500	TGC	2	6	26780	26785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296692
602	NC_015500	CCG	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
603	NC_015500	CGAA	2	8	26954	26961	50 %	0 %	25 %	25 %	332296692
604	NC_015500	CGC	2	6	26985	26990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
605	NC_015500	CGC	2	6	27028	27033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
606	NC_015500	GAT	2	6	27093	27098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296692
607	NC_015500	ACG	2	6	27122	27127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296692
608	NC_015500	ACG	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296692
609	NC_015500	CGTTCA	2	12	27290	27301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332296692
610	NC_015500	TACG	2	8	27330	27337	25 %	25 %	25 %	25 %	332296692
611	NC_015500	GAA	2	6	27370	27375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296692
612	NC_015500	GCC	2	6	27383	27388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
613	NC_015500	TTC	2	6	27400	27405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296692
614	NC_015500	TTA	2	6	27477	27482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296692
615	NC_015500	CTGG	2	8	27537	27544	0 %	25 %	50 %	25 %	332296692
616	NC_015500	AAGA	2	8	27550	27557	75 %	0 %	25 %	0 %	332296692
617	NC_015500	CGC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
618	NC_015500	CAT	2	6	27594	27599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296692
619	NC_015500	CGC	2	6	27612	27617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
620	NC_015500	CCG	2	6	27688	27693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
621	NC_015500	TCGG	2	8	27715	27722	0 %	25 %	50 %	25 %	332296692
622	NC_015500	GCG	2	6	27766	27771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296692
623	NC_015500	CGA	2	6	27893	27898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296692
624	NC_015500	CG	3	6	28002	28007	0 %	0 %	50 %	50 %	332296692
625	NC_015500	CCA	2	6	28094	28099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332296692
626	NC_015500	CCGAAC	2	12	28117	28128	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332296692
627	NC_015500	CGT	2	6	28158	28163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296692
628	NC_015500	ACGC	2	8	28182	28189	25 %	0 %	25 %	50 %	332296692
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