MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015315	GGC	2	6	23	28	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015315	CCG	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015315	CTCGG	2	10	122	131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015315	CGC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015315	GAC	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
6	NC_015315	ACG	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
7	NC_015315	CGG	2	6	224	229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
8	NC_015315	GAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309923
9	NC_015315	GGAG	2	8	263	270	25 %	0 %	75 %	0 %	327309923
10	NC_015315	CG	3	6	293	298	0 %	0 %	50 %	50 %	327309923
11	NC_015315	CGG	2	6	301	306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
12	NC_015315	CG	3	6	390	395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015315	CGG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015315	CAG	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015315	CGG	2	6	467	472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015315	GGC	2	6	515	520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015315	GGCT	2	8	542	549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015315	GA	3	6	554	559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015315	GCCT	2	8	564	571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015315	GCG	2	6	572	577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015315	TGG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309924
22	NC_015315	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
23	NC_015315	ACAGC	2	10	662	671	40 %	0 %	20 %	40 %	327309924
24	NC_015315	GA	3	6	674	679	50 %	0 %	50 %	0 %	327309924
25	NC_015315	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
26	NC_015315	AGG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
27	NC_015315	AGG	3	9	921	929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
28	NC_015315	A	6	6	941	946	100 %	0 %	0 %	0 %	327309924
29	NC_015315	CGA	2	6	952	957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309924
30	NC_015315	GAG	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
31	NC_015315	GTC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
32	NC_015315	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309924
33	NC_015315	AGG	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
34	NC_015315	AAC	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309924
35	NC_015315	CGC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309925
36	NC_015315	CGT	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309925
37	NC_015315	CCG	2	6	1376	1381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015315	GCC	2	6	1387	1392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015315	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015315	CGA	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015315	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015315	CGC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015315	TCG	2	6	1494	1499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
44	NC_015315	GACGAG	2	12	1570	1581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	327309926
45	NC_015315	CTC	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
46	NC_015315	GTC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
47	NC_015315	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
48	NC_015315	CCT	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
49	NC_015315	GA	3	6	1776	1781	50 %	0 %	50 %	0 %	327309926
50	NC_015315	GAC	3	9	1795	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309926
51	NC_015315	GC	3	6	1822	1827	0 %	0 %	50 %	50 %	327309926
52	NC_015315	CGC	2	6	1834	1839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
53	NC_015315	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
54	NC_015315	GGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309926
55	NC_015315	TCC	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
56	NC_015315	CCTC	2	8	1941	1948	0 %	25 %	0 %	75 %	327309926
57	NC_015315	CGC	3	9	1954	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
58	NC_015315	TCG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
59	NC_015315	GCC	2	6	1988	1993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
60	NC_015315	C	6	6	2099	2104	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
61	NC_015315	GGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
62	NC_015315	GTC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
63	NC_015315	CCGG	2	8	2201	2208	0 %	0 %	50 %	50 %	327309927
64	NC_015315	C	6	6	2249	2254	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
65	NC_015315	ACCG	2	8	2257	2264	25 %	0 %	25 %	50 %	327309927
66	NC_015315	GA	3	6	2319	2324	50 %	0 %	50 %	0 %	327309927
67	NC_015315	CCT	3	9	2331	2339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
68	NC_015315	ATC	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309927
69	NC_015315	CCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
70	NC_015315	GAC	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
71	NC_015315	CG	3	6	2416	2421	0 %	0 %	50 %	50 %	327309927
72	NC_015315	TAG	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309927
73	NC_015315	CCA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
74	NC_015315	CGA	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
75	NC_015315	C	6	6	2483	2488	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
76	NC_015315	AGGAG	2	10	2507	2516	40 %	0 %	60 %	0 %	327309927
77	NC_015315	TCG	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
78	NC_015315	GTG	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309927
79	NC_015315	CCCAC	2	10	2777	2786	20 %	0 %	0 %	80 %	327309927
80	NC_015315	CCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
81	NC_015315	CCA	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
82	NC_015315	CCT	3	9	2852	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
83	NC_015315	CGG	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
84	NC_015315	GCC	2	6	2936	2941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
85	NC_015315	AAG	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309927
86	NC_015315	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
87	NC_015315	CGG	2	6	2997	3002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
88	NC_015315	CAC	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
89	NC_015315	ACG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
90	NC_015315	CGC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
91	NC_015315	C	6	6	3203	3208	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
92	NC_015315	A	6	6	3335	3340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015315	CCG	2	6	3410	3415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015315	CATC	2	8	3429	3436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015315	AC	3	6	3454	3459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015315	AAAAC	2	10	3548	3557	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015315	GAC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015315	GTT	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309928
99	NC_015315	GCG	2	6	3665	3670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309928
100	NC_015315	C	6	6	3674	3679	0 %	0 %	0 %	100 %	327309928
101	NC_015315	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309928
102	NC_015315	CCG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309928
103	NC_015315	AGA	2	6	3814	3819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
104	NC_015315	AGA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
105	NC_015315	ACC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
106	NC_015315	TC	3	6	4089	4094	0 %	50 %	0 %	50 %	327309929
107	NC_015315	ACA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
108	NC_015315	TGT	2	6	4159	4164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309929
109	NC_015315	GA	3	6	4231	4236	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
110	NC_015315	GCC	2	6	4262	4267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
111	NC_015315	TC	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	327309929
112	NC_015315	GA	3	6	4325	4330	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
113	NC_015315	TGA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309929
114	NC_015315	CAT	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
115	NC_015315	ACC	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
116	NC_015315	CTA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
117	NC_015315	CCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
118	NC_015315	ACA	2	6	4614	4619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
119	NC_015315	ATC	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
120	NC_015315	CTC	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
121	NC_015315	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	327309929
122	NC_015315	CTC	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
123	NC_015315	AG	3	6	4749	4754	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
124	NC_015315	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
125	NC_015315	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309929
126	NC_015315	GCC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
127	NC_015315	ACC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
128	NC_015315	ACA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
129	NC_015315	AG	3	6	4979	4984	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
130	NC_015315	CTA	2	6	5034	5039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015315	TC	3	6	5045	5050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015315	CGC	2	6	5138	5143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015315	AC	3	6	5155	5160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015315	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015315	GCG	2	6	5260	5265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015315	ACTCTA	2	12	5294	5305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015315	GAA	3	9	5319	5327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015315	A	6	6	5326	5331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015315	GGA	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015315	CATGTC	2	12	5390	5401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015315	CTTTA	2	10	5406	5415	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015315	AGTA	2	8	5556	5563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015315	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015315	CAA	2	6	5681	5686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015315	CCG	2	6	5810	5815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_015315	TGG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015315	CGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015315	CTG	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015315	TAT	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015315	GAG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015315	GGC	2	6	6025	6030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015315	TCG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015315	TGG	2	6	6058	6063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015315	CTT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015315	TCG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015315	GGC	3	9	6154	6162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_015315	GCG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015315	G	6	6	6223	6228	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015315	ATG	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015315	CT	3	6	6342	6347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_015315	TGG	2	6	6381	6386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_015315	AGC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_015315	TTA	2	6	6550	6555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_015315	AAG	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015315	G	6	6	6615	6620	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015315	TGTA	2	8	6622	6629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_015315	CAT	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309930
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264	NC_015315	TAA	2	6	10677	10682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309932
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271	NC_015315	ACA	2	6	11049	11054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309932
272	NC_015315	AAT	2	6	11063	11068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309932
273	NC_015315	TCA	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309932
274	NC_015315	T	6	6	11137	11142	0 %	100 %	0 %	0 %	327309932
275	NC_015315	ATA	2	6	11150	11155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309932
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277	NC_015315	T	6	6	11168	11173	0 %	100 %	0 %	0 %	327309932
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410	NC_015315	GTT	2	6	17700	17705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309939
411	NC_015315	G	6	6	17954	17959	0 %	0 %	100 %	0 %	327309940
412	NC_015315	CTG	2	6	18010	18015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309940
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439	NC_015315	ATT	2	6	19267	19272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309941
440	NC_015315	ATT	2	6	19279	19284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309941
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443	NC_015315	CTT	2	6	19437	19442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309941
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447	NC_015315	TA	3	6	19638	19643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015315	ATA	2	6	19664	19669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015315	ATT	2	6	19684	19689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015315	TTA	2	6	19699	19704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015315	TA	3	6	19735	19740	50 %	50 %	0 %	0 %	327309942
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500	NC_015315	CT	3	6	21850	21855	0 %	50 %	0 %	50 %	327309943

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