MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_015315	ACG	2	6	1845708	1845713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312009
44503	NC_015315	TA	3	6	1845757	1845762	50 %	50 %	0 %	0 %	327312009
44504	NC_015315	CGC	2	6	1845767	1845772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44505	NC_015315	GTT	3	9	1845797	1845805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327312010
44506	NC_015315	CT	4	8	1845837	1845844	0 %	50 %	0 %	50 %	327312010
44507	NC_015315	CGG	2	6	1845866	1845871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312010
44508	NC_015315	CGT	2	6	1845881	1845886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327312010
44509	NC_015315	CCG	2	6	1845895	1845900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44510	NC_015315	TCG	2	6	1845937	1845942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327312010
44511	NC_015315	GCG	2	6	1845948	1845953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312010
44512	NC_015315	CCTCTC	2	12	1845966	1845977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312010
44513	NC_015315	CGC	2	6	1845980	1845985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44514	NC_015315	CTA	2	6	1845989	1845994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327312010
44515	NC_015315	CGC	2	6	1846034	1846039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44516	NC_015315	CGC	2	6	1846058	1846063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44517	NC_015315	TCC	2	6	1846090	1846095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312010
44518	NC_015315	CT	3	6	1846111	1846116	0 %	50 %	0 %	50 %	327312010
44519	NC_015315	CGG	2	6	1846163	1846168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312010
44520	NC_015315	CGGC	2	8	1846201	1846208	0 %	0 %	50 %	50 %	327312010
44521	NC_015315	GAG	2	6	1846248	1846253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312010
44522	NC_015315	ATATA	2	10	1846264	1846273	60 %	40 %	0 %	0 %	327312010
44523	NC_015315	GGGGA	2	10	1846313	1846322	20 %	0 %	80 %	0 %	327312010
44524	NC_015315	AT	3	6	1846334	1846339	50 %	50 %	0 %	0 %	327312010
44525	NC_015315	TATC	2	8	1846357	1846364	25 %	50 %	0 %	25 %	327312010
44526	NC_015315	CGA	2	6	1846370	1846375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312010
44527	NC_015315	GCC	2	6	1846392	1846397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312010
44528	NC_015315	GAG	2	6	1846398	1846403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312010
44529	NC_015315	ATA	2	6	1846440	1846445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327312010
44530	NC_015315	CCTACG	2	12	1846447	1846458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327312010
44531	NC_015315	GGC	2	6	1846481	1846486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312010
44532	NC_015315	GCCCTC	2	12	1846497	1846508	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	327312010
44533	NC_015315	GAA	2	6	1846523	1846528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327312010
44534	NC_015315	GAGG	2	8	1846585	1846592	25 %	0 %	75 %	0 %	327312011
44535	NC_015315	TAC	2	6	1846613	1846618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327312011
44536	NC_015315	CGT	2	6	1846633	1846638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327312011
44537	NC_015315	GGC	2	6	1846651	1846656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312011
44538	NC_015315	CGG	2	6	1846666	1846671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312011
44539	NC_015315	CCT	2	6	1846711	1846716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312011
44540	NC_015315	CAG	2	6	1846729	1846734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312011
44541	NC_015315	AGG	2	6	1846754	1846759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312011
44542	NC_015315	CCT	2	6	1846777	1846782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312011
44543	NC_015315	GAG	2	6	1846826	1846831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312011
44544	NC_015315	TCC	2	6	1846866	1846871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312011
44545	NC_015315	CGA	2	6	1846876	1846881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312011
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44548	NC_015315	CTT	2	6	1846981	1846986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327312011
44549	NC_015315	CCTG	2	8	1847032	1847039	0 %	25 %	25 %	50 %	327312011
44550	NC_015315	CT	4	8	1847069	1847076	0 %	50 %	0 %	50 %	327312011
44551	NC_015315	GAC	2	6	1847087	1847092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312011
44552	NC_015315	AAG	2	6	1847093	1847098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327312011
44553	NC_015315	TGGCG	2	10	1847115	1847124	0 %	20 %	60 %	20 %	327312011
44554	NC_015315	GAC	2	6	1847129	1847134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312011
44555	NC_015315	CAA	2	6	1847161	1847166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327312011
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44557	NC_015315	GTC	2	6	1847188	1847193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327312011
44558	NC_015315	GGA	2	6	1847197	1847202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312011
44559	NC_015315	CGC	2	6	1847245	1847250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327312011
44560	NC_015315	GCG	2	6	1847273	1847278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312011
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44567	NC_015315	GAC	2	6	1847752	1847757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312012
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44570	NC_015315	CGG	2	6	1847924	1847929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312012
44571	NC_015315	GAGGTG	2	12	1847932	1847943	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	327312012
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44587	NC_015315	CGCC	2	8	1848609	1848616	0 %	0 %	25 %	75 %	327312012
44588	NC_015315	GCG	2	6	1848642	1848647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312013
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44600	NC_015315	CCTC	2	8	1849057	1849064	0 %	25 %	0 %	75 %	327312013
44601	NC_015315	TA	3	6	1849235	1849240	50 %	50 %	0 %	0 %	327312014
44602	NC_015315	CCT	2	6	1849246	1849251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312014
44603	NC_015315	GGC	2	6	1849305	1849310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312014
44604	NC_015315	ACTT	2	8	1849365	1849372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44605	NC_015315	AAT	2	6	1849391	1849396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44606	NC_015315	AAAAT	2	10	1849397	1849406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44607	NC_015315	T	6	6	1849408	1849413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44608	NC_015315	CG	3	6	1849448	1849453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44609	NC_015315	TCA	2	6	1849468	1849473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44610	NC_015315	TAAAA	2	10	1849491	1849500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44611	NC_015315	TGA	2	6	1849515	1849520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44612	NC_015315	CT	3	6	1849566	1849571	0 %	50 %	0 %	50 %	327312015
44613	NC_015315	CGT	2	6	1849625	1849630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327312015
44614	NC_015315	CCT	2	6	1849664	1849669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312015
44615	NC_015315	GAC	2	6	1849680	1849685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312015
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44617	NC_015315	GAA	2	6	1849836	1849841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327312015
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44648	NC_015315	CGA	2	6	1851253	1851258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312016
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44726	NC_015315	TTTA	2	8	1854482	1854489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44729	NC_015315	TAGT	2	8	1854511	1854518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44730	NC_015315	GATTA	2	10	1854539	1854548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44731	NC_015315	GA	3	6	1854605	1854610	50 %	0 %	50 %	0 %	327312019
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44850	NC_015315	AG	3	6	1860571	1860576	50 %	0 %	50 %	0 %	327312023
44851	NC_015315	GAG	2	6	1860579	1860584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327312023
44852	NC_015315	GAA	2	6	1860591	1860596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327312023
44853	NC_015315	TA	3	6	1860600	1860605	50 %	50 %	0 %	0 %	327312023
44854	NC_015315	GAC	2	6	1860696	1860701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312023
44855	NC_015315	T	6	6	1860741	1860746	0 %	100 %	0 %	0 %	327312023
44856	NC_015315	CTC	2	6	1860780	1860785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327312024
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44862	NC_015315	TA	3	6	1860993	1860998	50 %	50 %	0 %	0 %	327312024
44863	NC_015315	GGC	2	6	1861015	1861020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327312024
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44887	NC_015315	GCCG	2	8	1862019	1862026	0 %	0 %	50 %	50 %	327312026
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44962	NC_015315	ACG	2	6	1864845	1864850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327312029
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