MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_015315	GGGGC	2	10	1801363	1801372	0 %	0 %	80 %	20 %	327311953
43502	NC_015315	TGT	2	6	1801410	1801415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311953
43503	NC_015315	GAC	2	6	1801426	1801431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311953
43504	NC_015315	ATA	2	6	1801466	1801471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311953
43505	NC_015315	CGG	2	6	1801476	1801481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311953
43506	NC_015315	TTC	2	6	1801493	1801498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311953
43507	NC_015315	TCTA	2	8	1801509	1801516	25 %	50 %	0 %	25 %	327311953
43508	NC_015315	GTG	2	6	1801603	1801608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311953
43509	NC_015315	CTG	2	6	1801664	1801669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311953
43510	NC_015315	GGC	2	6	1801759	1801764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311953
43511	NC_015315	TTC	2	6	1801790	1801795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311953
43512	NC_015315	AAC	2	6	1801838	1801843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311953
43513	NC_015315	CTC	2	6	1801847	1801852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311953
43514	NC_015315	TGT	2	6	1801878	1801883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311953
43515	NC_015315	CTAGCC	2	12	1801940	1801951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327311953
43516	NC_015315	ATA	2	6	1802060	1802065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311953
43517	NC_015315	TAAGG	2	10	1802101	1802110	40 %	20 %	40 %	0 %	327311953
43518	NC_015315	AG	3	6	1802129	1802134	50 %	0 %	50 %	0 %	327311953
43519	NC_015315	GGC	2	6	1802137	1802142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311953
43520	NC_015315	CTG	2	6	1802196	1802201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311953
43521	NC_015315	ATA	2	6	1802210	1802215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311953
43522	NC_015315	TA	3	6	1802261	1802266	50 %	50 %	0 %	0 %	327311953
43523	NC_015315	CTATCG	2	12	1802291	1802302	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327311953
43524	NC_015315	TA	3	6	1802308	1802313	50 %	50 %	0 %	0 %	327311953
43525	NC_015315	ACT	2	6	1802316	1802321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311953
43526	NC_015315	TA	3	6	1802324	1802329	50 %	50 %	0 %	0 %	327311953
43527	NC_015315	TA	3	6	1802333	1802338	50 %	50 %	0 %	0 %	327311953
43528	NC_015315	AATA	2	8	1802342	1802349	75 %	25 %	0 %	0 %	327311953
43529	NC_015315	CCTC	2	8	1802410	1802417	0 %	25 %	0 %	75 %	327311954
43530	NC_015315	TTC	2	6	1802482	1802487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311954
43531	NC_015315	TTA	2	6	1802539	1802544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311954
43532	NC_015315	CAAA	2	8	1802560	1802567	75 %	0 %	0 %	25 %	327311954
43533	NC_015315	AT	4	8	1802583	1802590	50 %	50 %	0 %	0 %	327311954
43534	NC_015315	CGG	2	6	1802602	1802607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311954
43535	NC_015315	G	6	6	1802623	1802628	0 %	0 %	100 %	0 %	327311954
43536	NC_015315	GCG	2	6	1802743	1802748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311954
43537	NC_015315	GAA	2	6	1802930	1802935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311954
43538	NC_015315	GTC	2	6	1802975	1802980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311954
43539	NC_015315	GTT	2	6	1802981	1802986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311954
43540	NC_015315	ATC	2	6	1802991	1802996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311954
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43542	NC_015315	TTA	2	6	1803099	1803104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311954
43543	NC_015315	ACGA	2	8	1803253	1803260	50 %	0 %	25 %	25 %	327311955
43544	NC_015315	TGT	2	6	1803290	1803295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311955
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43551	NC_015315	TCG	2	6	1803701	1803706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311955
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43554	NC_015315	AGG	2	6	1803829	1803834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311955
43555	NC_015315	GCG	2	6	1803848	1803853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311955
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43558	NC_015315	CGC	2	6	1803990	1803995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311955
43559	NC_015315	TCG	2	6	1804010	1804015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311955
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43561	NC_015315	ATG	2	6	1804102	1804107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43562	NC_015315	GAA	2	6	1804113	1804118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43563	NC_015315	AGGA	2	8	1804180	1804187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43564	NC_015315	GTAC	2	8	1804226	1804233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43565	NC_015315	ACC	2	6	1804300	1804305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311956
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43570	NC_015315	TG	3	6	1804476	1804481	0 %	50 %	50 %	0 %	327311956
43571	NC_015315	TCGC	2	8	1804562	1804569	0 %	25 %	25 %	50 %	327311956
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43588	NC_015315	CGA	2	6	1805409	1805414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311957
43589	NC_015315	CGA	2	6	1805423	1805428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311957
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43591	NC_015315	CCT	2	6	1805558	1805563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311957
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43598	NC_015315	CCGC	2	8	1806145	1806152	0 %	0 %	25 %	75 %	327311957
43599	NC_015315	AG	3	6	1806181	1806186	50 %	0 %	50 %	0 %	327311957
43600	NC_015315	GCC	2	6	1806198	1806203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311957
43601	NC_015315	CCTT	2	8	1806215	1806222	0 %	50 %	0 %	50 %	327311957
43602	NC_015315	CTT	2	6	1806297	1806302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311958
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43606	NC_015315	C	6	6	1806598	1806603	0 %	0 %	0 %	100 %	327311958
43607	NC_015315	TCGGCC	2	12	1806604	1806615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327311958
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43615	NC_015315	ATAA	2	8	1806971	1806978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43793	NC_015315	GTC	2	6	1815818	1815823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43849	NC_015315	CG	3	6	1818316	1818321	0 %	0 %	50 %	50 %	327311972
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43969	NC_015315	CTC	2	6	1823408	1823413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311979
43970	NC_015315	GCC	2	6	1823428	1823433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311979
43971	NC_015315	TCCT	2	8	1823492	1823499	0 %	50 %	0 %	50 %	327311979
43972	NC_015315	CT	3	6	1823531	1823536	0 %	50 %	0 %	50 %	327311979
43973	NC_015315	CTC	2	6	1823566	1823571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311979
43974	NC_015315	CCA	2	6	1823736	1823741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311979
43975	NC_015315	TCC	2	6	1823760	1823765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311979
43976	NC_015315	ACG	2	6	1823813	1823818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311979
43977	NC_015315	CGG	2	6	1823880	1823885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311979
43978	NC_015315	CGCC	2	8	1824023	1824030	0 %	0 %	25 %	75 %	327311980
43979	NC_015315	ACG	2	6	1824070	1824075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311980
43980	NC_015315	TCG	2	6	1824118	1824123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311980
43981	NC_015315	TGCCTA	2	12	1824224	1824235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327311980
43982	NC_015315	GTCT	2	8	1824300	1824307	0 %	50 %	25 %	25 %	327311980
43983	NC_015315	CGC	2	6	1824396	1824401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311980
43984	NC_015315	CCT	2	6	1824431	1824436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311980
43985	NC_015315	GA	3	6	1824585	1824590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43986	NC_015315	ACC	2	6	1824647	1824652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311981
43987	NC_015315	CTC	2	6	1824711	1824716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311981
43988	NC_015315	TAT	2	6	1824717	1824722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311981
43989	NC_015315	CGC	2	6	1824752	1824757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311981
43990	NC_015315	CAAT	2	8	1824773	1824780	50 %	25 %	0 %	25 %	327311981
43991	NC_015315	AT	3	6	1824779	1824784	50 %	50 %	0 %	0 %	327311981
43992	NC_015315	CGA	2	6	1824905	1824910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311981
43993	NC_015315	CTC	2	6	1824916	1824921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311981
43994	NC_015315	GCC	2	6	1825002	1825007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311982
43995	NC_015315	TCC	2	6	1825014	1825019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311982
43996	NC_015315	CGCCT	2	10	1825020	1825029	0 %	20 %	20 %	60 %	327311982
43997	NC_015315	CTT	2	6	1825091	1825096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311982
43998	NC_015315	CCA	2	6	1825135	1825140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311982
43999	NC_015315	AGA	2	6	1825149	1825154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311982
44000	NC_015315	GC	3	6	1825280	1825285	0 %	0 %	50 %	50 %	327311982

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