MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015315	GGC	2	6	139193	139198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310062
3502	NC_015315	CGT	2	6	139242	139247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3503	NC_015315	G	6	6	139266	139271	0 %	0 %	100 %	0 %	327310062
3504	NC_015315	CCTC	2	8	139281	139288	0 %	25 %	0 %	75 %	327310062
3505	NC_015315	CGGCG	2	10	139341	139350	0 %	0 %	60 %	40 %	327310062
3506	NC_015315	TCG	2	6	139452	139457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3507	NC_015315	CGA	2	6	139479	139484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3508	NC_015315	CGT	2	6	139500	139505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3509	NC_015315	CTT	2	6	139546	139551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310062
3510	NC_015315	CTC	2	6	139567	139572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310062
3511	NC_015315	TAT	2	6	139634	139639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310063
3512	NC_015315	CTCCCT	2	12	139659	139670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3513	NC_015315	CCT	2	6	139676	139681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3514	NC_015315	TCC	2	6	139723	139728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3515	NC_015315	GGC	2	6	139738	139743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3516	NC_015315	CGACG	2	10	139764	139773	20 %	0 %	40 %	40 %	327310063
3517	NC_015315	AG	3	6	139781	139786	50 %	0 %	50 %	0 %	327310063
3518	NC_015315	GAT	2	6	139795	139800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310063
3519	NC_015315	CGT	2	6	139922	139927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310063
3520	NC_015315	CTT	2	6	139956	139961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310063
3521	NC_015315	CAC	2	6	140001	140006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310063
3522	NC_015315	TCG	2	6	140026	140031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310063
3523	NC_015315	AGG	2	6	140056	140061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310063
3524	NC_015315	CCG	2	6	140092	140097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310063
3525	NC_015315	GAA	2	6	140220	140225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310063
3526	NC_015315	CTGG	2	8	140262	140269	0 %	25 %	50 %	25 %	327310063
3527	NC_015315	GCG	2	6	140289	140294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3528	NC_015315	CGG	2	6	140382	140387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3529	NC_015315	GAC	2	6	140532	140537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310063
3530	NC_015315	ACGCC	2	10	140561	140570	20 %	0 %	20 %	60 %	327310063
3531	NC_015315	TTTGC	2	10	140593	140602	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3532	NC_015315	TATGTA	2	12	140645	140656	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015315	ACG	2	6	140665	140670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310064
3534	NC_015315	TCC	2	6	140691	140696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310064
3535	NC_015315	C	6	6	140795	140800	0 %	0 %	0 %	100 %	327310064
3536	NC_015315	TCCT	2	8	140817	140824	0 %	50 %	0 %	50 %	327310064
3537	NC_015315	CGC	2	6	140836	140841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310064
3538	NC_015315	ACC	2	6	140897	140902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310065
3539	NC_015315	CCT	2	6	140919	140924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3540	NC_015315	CGT	2	6	140940	140945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3541	NC_015315	GCC	2	6	140951	140956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310065
3542	NC_015315	GCGGG	2	10	140998	141007	0 %	0 %	80 %	20 %	327310065
3543	NC_015315	ACG	2	6	141011	141016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3544	NC_015315	CTT	3	9	141043	141051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3545	NC_015315	CCT	2	6	141057	141062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3546	NC_015315	CCT	2	6	141186	141191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3547	NC_015315	CGG	2	6	141199	141204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310065
3548	NC_015315	CCT	2	6	141246	141251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3549	NC_015315	TTG	2	6	141313	141318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310065
3550	NC_015315	GCC	2	6	141338	141343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310065
3551	NC_015315	CTCC	2	8	141370	141377	0 %	25 %	0 %	75 %	327310065
3552	NC_015315	CTT	2	6	141391	141396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3553	NC_015315	CTC	2	6	141419	141424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3554	NC_015315	CCT	2	6	141489	141494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3555	NC_015315	ACC	2	6	141530	141535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310065
3556	NC_015315	TCG	2	6	141569	141574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3557	NC_015315	TCT	2	6	141603	141608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3558	NC_015315	CT	3	6	141682	141687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_015315	GGT	2	6	141772	141777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310066
3560	NC_015315	GAG	2	6	141827	141832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310066
3561	NC_015315	AG	4	8	141840	141847	50 %	0 %	50 %	0 %	327310066
3562	NC_015315	GCG	2	6	141867	141872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
3563	NC_015315	GTA	2	6	141889	141894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310066
3564	NC_015315	AT	3	6	141930	141935	50 %	50 %	0 %	0 %	327310066
3565	NC_015315	GGC	2	6	141937	141942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
3566	NC_015315	GTC	2	6	141989	141994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310066
3567	NC_015315	ACG	2	6	142082	142087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310066
3568	NC_015315	GAA	2	6	142117	142122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310066
3569	NC_015315	CGTC	2	8	142182	142189	0 %	25 %	25 %	50 %	327310066
3570	NC_015315	CGC	2	6	142239	142244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310066
3571	NC_015315	AGGGC	2	10	142275	142284	20 %	0 %	60 %	20 %	327310066
3572	NC_015315	AGGCC	2	10	142452	142461	20 %	0 %	40 %	40 %	327310066
3573	NC_015315	CAC	2	6	142550	142555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310066
3574	NC_015315	GGC	2	6	142574	142579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
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3576	NC_015315	CCT	2	6	142747	142752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310066
3577	NC_015315	CGG	2	6	142785	142790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
3578	NC_015315	GCC	2	6	142796	142801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310066
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3581	NC_015315	TAGG	2	8	142858	142865	25 %	25 %	50 %	0 %	327310066
3582	NC_015315	TAT	2	6	142912	142917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310066
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3586	NC_015315	ACG	2	6	143177	143182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310066
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3589	NC_015315	TCG	3	9	143537	143545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310066
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3592	NC_015315	AGGT	2	8	143570	143577	25 %	25 %	50 %	0 %	327310066
3593	NC_015315	CGG	2	6	143610	143615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
3594	NC_015315	AGT	2	6	143643	143648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310066
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3601	NC_015315	CGA	2	6	143967	143972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310066
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3603	NC_015315	GGA	2	6	144046	144051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_015315	TTA	2	6	144089	144094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015315	GTC	2	6	144152	144157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015315	CGC	2	6	144214	144219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_015315	CCT	2	6	144319	144324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310067
3608	NC_015315	CT	3	6	144323	144328	0 %	50 %	0 %	50 %	327310067
3609	NC_015315	GCC	2	6	144355	144360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310067
3610	NC_015315	TTA	2	6	144469	144474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310068
3611	NC_015315	GACAA	2	10	144509	144518	60 %	0 %	20 %	20 %	327310068
3612	NC_015315	CTCTC	2	10	144591	144600	0 %	40 %	0 %	60 %	327310068
3613	NC_015315	CG	3	6	144615	144620	0 %	0 %	50 %	50 %	327310068
3614	NC_015315	GCC	2	6	144623	144628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310068
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3617	NC_015315	T	7	7	144726	144732	0 %	100 %	0 %	0 %	327310068
3618	NC_015315	CGG	2	6	144741	144746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310068
3619	NC_015315	GGA	2	6	144837	144842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310068
3620	NC_015315	ACGCC	2	10	144894	144903	20 %	0 %	20 %	60 %	327310068
3621	NC_015315	CGC	2	6	144906	144911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310068
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3623	NC_015315	CCT	2	6	144970	144975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310068
3624	NC_015315	CCT	2	6	144978	144983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310068
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3855	NC_015315	CGA	2	6	154071	154076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310077
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3862	NC_015315	CGA	2	6	154455	154460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310077
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3982	NC_015315	CTC	2	6	159982	159987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310084
3983	NC_015315	C	6	6	160019	160024	0 %	0 %	0 %	100 %	327310084
3984	NC_015315	TA	3	6	160061	160066	50 %	50 %	0 %	0 %	327310084
3985	NC_015315	GGT	2	6	160077	160082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310084
3986	NC_015315	AGC	2	6	160206	160211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3987	NC_015315	G	6	6	160244	160249	0 %	0 %	100 %	0 %	327310085
3988	NC_015315	CGC	2	6	160265	160270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310085
3989	NC_015315	CGC	2	6	160330	160335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310085
3990	NC_015315	CTG	2	6	160338	160343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310085
3991	NC_015315	GTC	2	6	160356	160361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310085
3992	NC_015315	GCC	2	6	160368	160373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310085
3993	NC_015315	ACC	2	6	160495	160500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310085
3994	NC_015315	CT	3	6	160552	160557	0 %	50 %	0 %	50 %	327310085
3995	NC_015315	TGT	2	6	160579	160584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310085
3996	NC_015315	GAGG	2	8	160586	160593	25 %	0 %	75 %	0 %	327310085
3997	NC_015315	GCG	2	6	160723	160728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310085
3998	NC_015315	GTC	2	6	160743	160748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310085
3999	NC_015315	G	6	6	160754	160759	0 %	0 %	100 %	0 %	327310085
4000	NC_015315	ACT	2	6	160804	160809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310085

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