MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_015315	CAA	2	6	1438728	1438733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311542
35003	NC_015315	GAG	2	6	1438829	1438834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311543
35004	NC_015315	AGG	2	6	1438896	1438901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311543
35005	NC_015315	TCG	2	6	1438977	1438982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311543
35006	NC_015315	GTA	2	6	1438991	1438996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311543
35007	NC_015315	CTT	2	6	1438997	1439002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311543
35008	NC_015315	GGC	2	6	1439205	1439210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311543
35009	NC_015315	GGA	2	6	1439315	1439320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311544
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35011	NC_015315	AGG	2	6	1439453	1439458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311544
35012	NC_015315	AGA	2	6	1439497	1439502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311544
35013	NC_015315	CGA	2	6	1439520	1439525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311544
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35015	NC_015315	GCC	2	6	1439682	1439687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311544
35016	NC_015315	CGC	2	6	1439709	1439714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311544
35017	NC_015315	CGT	2	6	1439736	1439741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311544
35018	NC_015315	CGG	2	6	1439754	1439759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311544
35019	NC_015315	CCT	2	6	1439844	1439849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35020	NC_015315	CCG	2	6	1439912	1439917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35021	NC_015315	CGG	2	6	1439951	1439956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35022	NC_015315	CTC	2	6	1440024	1440029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35023	NC_015315	GGC	2	6	1440056	1440061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35024	NC_015315	ATG	3	9	1440198	1440206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35025	NC_015315	TTG	2	6	1440254	1440259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311545
35026	NC_015315	CT	3	6	1440307	1440312	0 %	50 %	0 %	50 %	327311545
35027	NC_015315	ACA	2	6	1440502	1440507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311545
35028	NC_015315	CGG	2	6	1440517	1440522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311545
35029	NC_015315	AGT	2	6	1440535	1440540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311545
35030	NC_015315	ATC	3	9	1440570	1440578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311545
35031	NC_015315	GC	3	6	1440703	1440708	0 %	0 %	50 %	50 %	327311545
35032	NC_015315	GCCA	2	8	1440722	1440729	25 %	0 %	25 %	50 %	327311546
35033	NC_015315	TTA	2	6	1440750	1440755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311546
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35037	NC_015315	CAT	2	6	1440847	1440852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311546
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35040	NC_015315	CGT	3	9	1441029	1441037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311546
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35042	NC_015315	ACCG	2	8	1441180	1441187	25 %	0 %	25 %	50 %	327311546
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35052	NC_015315	AT	3	6	1441710	1441715	50 %	50 %	0 %	0 %	327311546
35053	NC_015315	GAG	2	6	1441735	1441740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311546
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35055	NC_015315	GTA	2	6	1441753	1441758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311546
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35057	NC_015315	CGA	2	6	1441830	1441835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311546
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35100	NC_015315	CGG	2	6	1443575	1443580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35101	NC_015315	CGG	2	6	1443599	1443604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35102	NC_015315	A	6	6	1443625	1443630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35103	NC_015315	CG	3	6	1443776	1443781	0 %	0 %	50 %	50 %	327311550
35104	NC_015315	CGGAG	2	10	1443866	1443875	20 %	0 %	60 %	20 %	327311550
35105	NC_015315	CGT	2	6	1443915	1443920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311550
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35113	NC_015315	TA	3	6	1444171	1444176	50 %	50 %	0 %	0 %	327311550
35114	NC_015315	CTC	2	6	1444206	1444211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311551
35115	NC_015315	ACC	2	6	1444285	1444290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311551
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35117	NC_015315	CGG	2	6	1444455	1444460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311551
35118	NC_015315	GCC	2	6	1444492	1444497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311551
35119	NC_015315	GCC	2	6	1444513	1444518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311551
35120	NC_015315	GCC	2	6	1444552	1444557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311551
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35209	NC_015315	CCA	2	6	1448111	1448116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35215	NC_015315	CGG	2	6	1448243	1448248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35216	NC_015315	ACGTCC	2	12	1448308	1448319	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35217	NC_015315	CT	3	6	1448324	1448329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35220	NC_015315	GTC	2	6	1448521	1448526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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35223	NC_015315	CGC	2	6	1448553	1448558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35224	NC_015315	GGCC	2	8	1448567	1448574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35225	NC_015315	CAA	2	6	1448613	1448618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35226	NC_015315	CGA	2	6	1448627	1448632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35227	NC_015315	GCC	2	6	1448635	1448640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35228	NC_015315	TCG	2	6	1448744	1448749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35229	NC_015315	GCC	2	6	1448758	1448763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35230	NC_015315	GCT	2	6	1448784	1448789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311556
35231	NC_015315	GGCGTA	2	12	1448825	1448836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327311556
35232	NC_015315	CAG	2	6	1448870	1448875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311556
35233	NC_015315	TA	3	6	1448877	1448882	50 %	50 %	0 %	0 %	327311556
35234	NC_015315	CCT	3	9	1449032	1449040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311556
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35236	NC_015315	GCCA	2	8	1449135	1449142	25 %	0 %	25 %	50 %	327311556
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35347	NC_015315	CG	3	6	1454338	1454343	0 %	0 %	50 %	50 %	327311565
35348	NC_015315	CGT	2	6	1454359	1454364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311565
35349	NC_015315	CGT	2	6	1454389	1454394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311565
35350	NC_015315	ACGCCC	2	12	1454403	1454414	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	327311565
35351	NC_015315	GC	3	6	1454415	1454420	0 %	0 %	50 %	50 %	327311565
35352	NC_015315	TCC	2	6	1454486	1454491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311565
35353	NC_015315	GCC	2	6	1454507	1454512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311565
35354	NC_015315	CAA	2	6	1454555	1454560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311565
35355	NC_015315	CAA	2	6	1454567	1454572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311565
35356	NC_015315	GAG	2	6	1454588	1454593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311565
35357	NC_015315	AAG	2	6	1454594	1454599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311565
35358	NC_015315	GAG	2	6	1454600	1454605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311565
35359	NC_015315	GCCG	2	8	1454608	1454615	0 %	0 %	50 %	50 %	327311565
35360	NC_015315	AGG	2	6	1454616	1454621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311565
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35362	NC_015315	GTC	2	6	1454704	1454709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311566
35363	NC_015315	GCACG	2	10	1454850	1454859	20 %	0 %	40 %	40 %	327311566
35364	NC_015315	GCGCA	2	10	1454861	1454870	20 %	0 %	40 %	40 %	327311566
35365	NC_015315	GAG	2	6	1454926	1454931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311566
35366	NC_015315	CGC	2	6	1454946	1454951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311566
35367	NC_015315	G	6	6	1454966	1454971	0 %	0 %	100 %	0 %	327311566
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35370	NC_015315	G	6	6	1455151	1455156	0 %	0 %	100 %	0 %	327311566
35371	NC_015315	CCG	2	6	1455189	1455194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311566
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35373	NC_015315	GCC	2	6	1455326	1455331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311566
35374	NC_015315	TCG	2	6	1455332	1455337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311566
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35378	NC_015315	ACG	2	6	1455437	1455442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311566
35379	NC_015315	TGA	2	6	1455446	1455451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311566
35380	NC_015315	G	6	6	1455481	1455486	0 %	0 %	100 %	0 %	327311566
35381	NC_015315	CGG	2	6	1455507	1455512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311566
35382	NC_015315	TTG	2	6	1455523	1455528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311566
35383	NC_015315	AGG	2	6	1455535	1455540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311566
35384	NC_015315	GAGG	2	8	1455549	1455556	25 %	0 %	75 %	0 %	327311566
35385	NC_015315	GTA	2	6	1455616	1455621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311566
35386	NC_015315	GGT	2	6	1455629	1455634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311567
35387	NC_015315	G	6	6	1455662	1455667	0 %	0 %	100 %	0 %	327311567
35388	NC_015315	CCTCCC	2	12	1455696	1455707	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	327311567
35389	NC_015315	CAC	2	6	1455716	1455721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311567
35390	NC_015315	CGC	2	6	1455758	1455763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311567
35391	NC_015315	GA	4	8	1455768	1455775	50 %	0 %	50 %	0 %	327311567
35392	NC_015315	CGT	2	6	1455776	1455781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311567
35393	NC_015315	CAC	2	6	1455785	1455790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311567
35394	NC_015315	CGC	2	6	1455797	1455802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311567
35395	NC_015315	CGG	2	6	1455805	1455810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311567
35396	NC_015315	CGG	2	6	1455843	1455848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311567
35397	NC_015315	AGG	2	6	1455860	1455865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311567
35398	NC_015315	GTC	2	6	1455902	1455907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311568
35399	NC_015315	GGC	2	6	1455908	1455913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311568
35400	NC_015315	GGC	2	6	1456024	1456029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311568
35401	NC_015315	GGCTCC	2	12	1456103	1456114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327311568
35402	NC_015315	GAG	2	6	1456130	1456135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311568
35403	NC_015315	GGC	2	6	1456141	1456146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311568
35404	NC_015315	TCA	2	6	1456161	1456166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311568
35405	NC_015315	CAC	2	6	1456174	1456179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311568
35406	NC_015315	ATA	2	6	1456217	1456222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311568
35407	NC_015315	CCG	2	6	1456281	1456286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311568
35408	NC_015315	CAC	2	6	1456346	1456351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311568
35409	NC_015315	AGT	2	6	1456465	1456470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311568
35410	NC_015315	CGG	2	6	1456531	1456536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311568
35411	NC_015315	CGA	2	6	1456567	1456572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311568
35412	NC_015315	GGA	2	6	1456594	1456599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311568
35413	NC_015315	GAT	2	6	1456653	1456658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311568
35414	NC_015315	AT	4	8	1456669	1456676	50 %	50 %	0 %	0 %	327311569
35415	NC_015315	GAG	2	6	1456789	1456794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311569
35416	NC_015315	GGC	2	6	1456824	1456829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311569
35417	NC_015315	TGG	2	6	1456844	1456849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311569
35418	NC_015315	CGA	2	6	1456854	1456859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311569
35419	NC_015315	GCC	2	6	1456876	1456881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311569
35420	NC_015315	GACGTG	2	12	1456919	1456930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327311570
35421	NC_015315	ACA	2	6	1456944	1456949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311570
35422	NC_015315	GGC	2	6	1457014	1457019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311570
35423	NC_015315	TCGGC	2	10	1457031	1457040	0 %	20 %	40 %	40 %	327311570
35424	NC_015315	CAG	2	6	1457045	1457050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311570
35425	NC_015315	GTC	2	6	1457147	1457152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311570
35426	NC_015315	CGGG	2	8	1457203	1457210	0 %	0 %	75 %	25 %	327311570
35427	NC_015315	GTG	2	6	1457219	1457224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311570
35428	NC_015315	GGA	3	9	1457290	1457298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311570
35429	NC_015315	GTCGG	2	10	1457300	1457309	0 %	20 %	60 %	20 %	327311570
35430	NC_015315	TA	3	6	1457331	1457336	50 %	50 %	0 %	0 %	327311570
35431	NC_015315	GAG	3	9	1457341	1457349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311570
35432	NC_015315	CTT	2	6	1457398	1457403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311571
35433	NC_015315	GGC	2	6	1457434	1457439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311571
35434	NC_015315	CTT	2	6	1457479	1457484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311571
35435	NC_015315	CG	3	6	1457535	1457540	0 %	0 %	50 %	50 %	327311571
35436	NC_015315	TAGA	2	8	1457546	1457553	50 %	25 %	25 %	0 %	327311571
35437	NC_015315	CCA	2	6	1457589	1457594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311571
35438	NC_015315	CGT	2	6	1457598	1457603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311571
35439	NC_015315	TGG	3	9	1457658	1457666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311571
35440	NC_015315	GAC	2	6	1457671	1457676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311571
35441	NC_015315	CTC	2	6	1457677	1457682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311571
35442	NC_015315	TCG	2	6	1457711	1457716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311571
35443	NC_015315	TCC	2	6	1457721	1457726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311571
35444	NC_015315	GAC	2	6	1457758	1457763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35445	NC_015315	TA	3	6	1457817	1457822	50 %	50 %	0 %	0 %	327311572
35446	NC_015315	GCGCG	2	10	1457823	1457832	0 %	0 %	60 %	40 %	327311572
35447	NC_015315	GCG	2	6	1457923	1457928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311572
35448	NC_015315	CCTC	2	8	1458016	1458023	0 %	25 %	0 %	75 %	327311572
35449	NC_015315	ACG	2	6	1458073	1458078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311572
35450	NC_015315	TCC	2	6	1458082	1458087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311572
35451	NC_015315	AGA	2	6	1458151	1458156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311572
35452	NC_015315	GCG	2	6	1458205	1458210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311572
35453	NC_015315	TGG	2	6	1458222	1458227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311572
35454	NC_015315	CTC	3	9	1458231	1458239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311572
35455	NC_015315	TCT	2	6	1458247	1458252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311572
35456	NC_015315	CCG	2	6	1458253	1458258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311572
35457	NC_015315	CCCT	2	8	1458303	1458310	0 %	25 %	0 %	75 %	327311572
35458	NC_015315	CGT	2	6	1458316	1458321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311572
35459	NC_015315	GCCAC	2	10	1458348	1458357	20 %	0 %	20 %	60 %	327311572
35460	NC_015315	GAG	2	6	1458450	1458455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311572
35461	NC_015315	CCGG	2	8	1458469	1458476	0 %	0 %	50 %	50 %	327311572
35462	NC_015315	ATC	2	6	1458477	1458482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311572
35463	NC_015315	CCG	2	6	1458510	1458515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311572
35464	NC_015315	GGT	2	6	1458578	1458583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311572
35465	NC_015315	TTG	2	6	1458603	1458608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311572
35466	NC_015315	TTC	2	6	1458657	1458662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311572
35467	NC_015315	GTCGT	2	10	1458666	1458675	0 %	40 %	40 %	20 %	327311572
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