MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_015315	CGA	2	6	1419777	1419782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311518
34502	NC_015315	TAGC	2	8	1419805	1419812	25 %	25 %	25 %	25 %	327311518
34503	NC_015315	TCCT	2	8	1419849	1419856	0 %	50 %	0 %	50 %	327311519
34504	NC_015315	CTC	2	6	1419890	1419895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311519
34505	NC_015315	CCT	2	6	1419907	1419912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311519
34506	NC_015315	CTC	2	6	1419929	1419934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311519
34507	NC_015315	CCT	2	6	1419959	1419964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311519
34508	NC_015315	CG	3	6	1420021	1420026	0 %	0 %	50 %	50 %	327311519
34509	NC_015315	CTC	2	6	1420066	1420071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311520
34510	NC_015315	TTG	2	6	1420166	1420171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311520
34511	NC_015315	GCTG	2	8	1420224	1420231	0 %	25 %	50 %	25 %	327311520
34512	NC_015315	CTC	2	6	1420255	1420260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311520
34513	NC_015315	CAC	2	6	1420264	1420269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311520
34514	NC_015315	CAA	4	12	1420339	1420350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311520
34515	NC_015315	CGA	2	6	1420384	1420389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311520
34516	NC_015315	CCA	2	6	1420395	1420400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311520
34517	NC_015315	CCT	2	6	1420404	1420409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311520
34518	NC_015315	GTT	2	6	1420465	1420470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311520
34519	NC_015315	GGC	2	6	1420471	1420476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311520
34520	NC_015315	CTC	2	6	1420528	1420533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311520
34521	NC_015315	TCG	2	6	1420571	1420576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311520
34522	NC_015315	GATCT	2	10	1420627	1420636	20 %	40 %	20 %	20 %	327311520
34523	NC_015315	CGT	2	6	1420821	1420826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311520
34524	NC_015315	CTG	2	6	1420895	1420900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311520
34525	NC_015315	CAC	2	6	1420915	1420920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311520
34526	NC_015315	GCT	2	6	1420942	1420947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311520
34527	NC_015315	TGA	2	6	1420971	1420976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311520
34528	NC_015315	CGG	2	6	1421002	1421007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311520
34529	NC_015315	CCA	2	6	1421064	1421069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311520
34530	NC_015315	AT	3	6	1421117	1421122	50 %	50 %	0 %	0 %	327311520
34531	NC_015315	GTT	2	6	1421130	1421135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311520
34532	NC_015315	CTC	2	6	1421143	1421148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311520
34533	NC_015315	CGG	2	6	1421164	1421169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311520
34534	NC_015315	TAA	2	6	1421237	1421242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_015315	ACT	2	6	1421255	1421260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_015315	CT	3	6	1421259	1421264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34537	NC_015315	TAA	2	6	1421265	1421270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_015315	ACT	2	6	1421272	1421277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34539	NC_015315	CCT	2	6	1421297	1421302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34540	NC_015315	CG	3	6	1421360	1421365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34541	NC_015315	CGG	2	6	1421393	1421398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34542	NC_015315	GGCCG	2	10	1421433	1421442	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34543	NC_015315	CGA	2	6	1421464	1421469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34544	NC_015315	GCC	2	6	1421479	1421484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311521
34545	NC_015315	GCTT	2	8	1421515	1421522	0 %	50 %	25 %	25 %	327311521
34546	NC_015315	CGC	2	6	1421584	1421589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311521
34547	NC_015315	GTC	2	6	1421596	1421601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311521
34548	NC_015315	CAGC	2	8	1421717	1421724	25 %	0 %	25 %	50 %	327311521
34549	NC_015315	CGC	2	6	1421745	1421750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311521
34550	NC_015315	CGT	2	6	1421778	1421783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311521
34551	NC_015315	GGA	2	6	1421814	1421819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311521
34552	NC_015315	CTA	3	9	1421928	1421936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34553	NC_015315	TA	3	6	1422040	1422045	50 %	50 %	0 %	0 %	327311522
34554	NC_015315	GCC	2	6	1422062	1422067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311522
34555	NC_015315	GCC	2	6	1422077	1422082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311522
34556	NC_015315	AGGC	2	8	1422190	1422197	25 %	0 %	50 %	25 %	327311522
34557	NC_015315	CGT	3	9	1422203	1422211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311522
34558	NC_015315	GAG	2	6	1422242	1422247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311522
34559	NC_015315	TGT	2	6	1422297	1422302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311523
34560	NC_015315	GGC	2	6	1422352	1422357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311523
34561	NC_015315	AAG	2	6	1422359	1422364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311523
34562	NC_015315	TCG	2	6	1422375	1422380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311523
34563	NC_015315	GGT	2	6	1422460	1422465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311523
34564	NC_015315	CAT	2	6	1422526	1422531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311523
34565	NC_015315	CGT	2	6	1422571	1422576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311523
34566	NC_015315	TA	3	6	1422578	1422583	50 %	50 %	0 %	0 %	327311523
34567	NC_015315	CAA	2	6	1422625	1422630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311523
34568	NC_015315	CTA	2	6	1422661	1422666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311523
34569	NC_015315	GAC	2	6	1422701	1422706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311523
34570	NC_015315	AT	3	6	1422722	1422727	50 %	50 %	0 %	0 %	327311523
34571	NC_015315	AT	3	6	1422746	1422751	50 %	50 %	0 %	0 %	327311524
34572	NC_015315	CTC	2	6	1422763	1422768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311524
34573	NC_015315	CGT	2	6	1422809	1422814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311524
34574	NC_015315	ATC	2	6	1422832	1422837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311524
34575	NC_015315	GAC	2	6	1422927	1422932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311524
34576	NC_015315	ACAG	2	8	1422953	1422960	50 %	0 %	25 %	25 %	327311524
34577	NC_015315	CG	3	6	1422973	1422978	0 %	0 %	50 %	50 %	327311524
34578	NC_015315	CCT	2	6	1422986	1422991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311524
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34581	NC_015315	GGCGC	2	10	1423114	1423123	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34582	NC_015315	GAG	2	6	1423250	1423255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311525
34583	NC_015315	ACG	2	6	1423332	1423337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311525
34584	NC_015315	TGT	2	6	1423339	1423344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311525
34585	NC_015315	TCG	2	6	1423407	1423412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311525
34586	NC_015315	GTG	2	6	1423424	1423429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311525
34587	NC_015315	GCCGAG	2	12	1423484	1423495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	327311525
34588	NC_015315	GGC	2	6	1423503	1423508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311525
34589	NC_015315	GACG	2	8	1423534	1423541	25 %	0 %	50 %	25 %	327311525
34590	NC_015315	TTC	3	9	1423700	1423708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311525
34591	NC_015315	GTT	2	6	1423747	1423752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311525
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34593	NC_015315	G	6	6	1423809	1423814	0 %	0 %	100 %	0 %	327311525
34594	NC_015315	CGA	2	6	1423816	1423821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311525
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34597	NC_015315	ATG	2	6	1423883	1423888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311525
34598	NC_015315	TGG	2	6	1423890	1423895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311525
34599	NC_015315	ACG	2	6	1423908	1423913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311525
34600	NC_015315	CAG	2	6	1423924	1423929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311525
34601	NC_015315	GTG	2	6	1424033	1424038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311525
34602	NC_015315	ATA	2	6	1424105	1424110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311525
34603	NC_015315	GGA	2	6	1424119	1424124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311525
34604	NC_015315	GGC	2	6	1424147	1424152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311525
34605	NC_015315	ATA	3	9	1424189	1424197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311525
34606	NC_015315	CAGG	2	8	1424234	1424241	25 %	0 %	50 %	25 %	327311525
34607	NC_015315	GTC	2	6	1424249	1424254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311525
34608	NC_015315	ATA	2	6	1424335	1424340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311526
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34612	NC_015315	GAGG	2	8	1424520	1424527	25 %	0 %	75 %	0 %	327311526
34613	NC_015315	CCA	2	6	1424577	1424582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311526
34614	NC_015315	ATA	2	6	1424584	1424589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311526
34615	NC_015315	GGTC	2	8	1424591	1424598	0 %	25 %	50 %	25 %	327311526
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34617	NC_015315	TCG	2	6	1424750	1424755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311526
34618	NC_015315	GAC	2	6	1424773	1424778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311526
34619	NC_015315	CTT	2	6	1424900	1424905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311527
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34647	NC_015315	GTT	2	6	1426118	1426123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34723	NC_015315	CGT	2	6	1428475	1428480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311532
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34726	NC_015315	AT	3	6	1428572	1428577	50 %	50 %	0 %	0 %	327311532
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34731	NC_015315	CCG	2	6	1428918	1428923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311532
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