MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_015315	AGA	2	6	1354572	1354577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311449
33003	NC_015315	GC	4	8	1354676	1354683	0 %	0 %	50 %	50 %	327311449
33004	NC_015315	TCC	2	6	1354745	1354750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311449
33005	NC_015315	CCGC	2	8	1354863	1354870	0 %	0 %	25 %	75 %	327311449
33006	NC_015315	TCG	2	6	1354874	1354879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311449
33007	NC_015315	GTC	2	6	1354912	1354917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311449
33008	NC_015315	CCTC	2	8	1355022	1355029	0 %	25 %	0 %	75 %	327311449
33009	NC_015315	TCG	2	6	1355069	1355074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311449
33010	NC_015315	CTC	2	6	1355083	1355088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311449
33011	NC_015315	GTG	2	6	1355096	1355101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311449
33012	NC_015315	CGC	2	6	1355220	1355225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311449
33013	NC_015315	TTC	2	6	1355293	1355298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311449
33014	NC_015315	TCG	2	6	1355366	1355371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311449
33015	NC_015315	ACG	2	6	1355384	1355389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311449
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33017	NC_015315	TCA	2	6	1355424	1355429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311449
33018	NC_015315	CTT	2	6	1355452	1355457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311449
33019	NC_015315	TA	4	8	1355484	1355491	50 %	50 %	0 %	0 %	327311449
33020	NC_015315	ATTA	2	8	1355527	1355534	50 %	50 %	0 %	0 %	327311449
33021	NC_015315	ACT	2	6	1355567	1355572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311449
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33028	NC_015315	TA	4	8	1355874	1355881	50 %	50 %	0 %	0 %	327311450
33029	NC_015315	TA	3	6	1355883	1355888	50 %	50 %	0 %	0 %	327311450
33030	NC_015315	AAT	2	6	1355899	1355904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311450
33031	NC_015315	ATTT	2	8	1355915	1355922	25 %	75 %	0 %	0 %	327311450
33032	NC_015315	CTC	2	6	1355994	1355999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311450
33033	NC_015315	ACC	3	9	1356016	1356024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311450
33034	NC_015315	AT	3	6	1356100	1356105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33035	NC_015315	AT	3	6	1356153	1356158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33036	NC_015315	TA	3	6	1356159	1356164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33037	NC_015315	TAA	2	6	1356189	1356194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33038	NC_015315	AGA	3	9	1356206	1356214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33039	NC_015315	GAAA	2	8	1356260	1356267	75 %	0 %	25 %	0 %	327311451
33040	NC_015315	TAAA	2	8	1356373	1356380	75 %	25 %	0 %	0 %	327311451
33041	NC_015315	AAT	2	6	1356381	1356386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311451
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33043	NC_015315	TA	3	6	1356463	1356468	50 %	50 %	0 %	0 %	327311451
33044	NC_015315	TA	3	6	1356489	1356494	50 %	50 %	0 %	0 %	327311451
33045	NC_015315	ATATA	2	10	1356536	1356545	60 %	40 %	0 %	0 %	327311451
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33050	NC_015315	TG	3	6	1356703	1356708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33051	NC_015315	TC	4	8	1356789	1356796	0 %	50 %	0 %	50 %	327311452
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33054	NC_015315	AAT	2	6	1356829	1356834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311452
33055	NC_015315	AT	3	6	1356833	1356838	50 %	50 %	0 %	0 %	327311452
33056	NC_015315	TAA	2	6	1356841	1356846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311452
33057	NC_015315	A	6	6	1356861	1356866	100 %	0 %	0 %	0 %	327311452
33058	NC_015315	AT	3	6	1356874	1356879	50 %	50 %	0 %	0 %	327311452
33059	NC_015315	ATT	2	6	1356883	1356888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311452
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33069	NC_015315	TATT	2	8	1357254	1357261	25 %	75 %	0 %	0 %	327311453
33070	NC_015315	T	6	6	1357274	1357279	0 %	100 %	0 %	0 %	327311453
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33092	NC_015315	AT	3	6	1358134	1358139	50 %	50 %	0 %	0 %	327311453
33093	NC_015315	TAA	2	6	1358151	1358156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311454
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33104	NC_015315	CTCG	2	8	1358572	1358579	0 %	25 %	25 %	50 %	327311454
33105	NC_015315	CGT	2	6	1358596	1358601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311454
33106	NC_015315	GTA	2	6	1358609	1358614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311454
33107	NC_015315	TAC	2	6	1358672	1358677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311454
33108	NC_015315	TA	3	6	1358679	1358684	50 %	50 %	0 %	0 %	327311454
33109	NC_015315	TTG	2	6	1358712	1358717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33110	NC_015315	CTC	3	9	1358749	1358757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311455
33111	NC_015315	CTT	2	6	1358761	1358766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311455
33112	NC_015315	CTT	2	6	1358773	1358778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311455
33113	NC_015315	CTC	2	6	1358779	1358784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311455
33114	NC_015315	TAT	2	6	1358806	1358811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311455
33115	NC_015315	ATC	2	6	1358828	1358833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311455
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33117	NC_015315	CT	3	6	1359076	1359081	0 %	50 %	0 %	50 %	327311455
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33120	NC_015315	CGC	2	6	1359118	1359123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311455
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33219	NC_015315	TAG	2	6	1363411	1363416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311459
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33225	NC_015315	TAA	2	6	1363597	1363602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311459
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33230	NC_015315	GA	3	6	1363838	1363843	50 %	0 %	50 %	0 %	327311459
33231	NC_015315	GTC	2	6	1363887	1363892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311459
33232	NC_015315	CT	3	6	1363996	1364001	0 %	50 %	0 %	50 %	327311459
33233	NC_015315	GCG	2	6	1364064	1364069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33234	NC_015315	GAG	2	6	1364271	1364276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311460
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33350	NC_015315	GGCCT	2	10	1369862	1369871	0 %	20 %	40 %	40 %	327311466
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33473	NC_015315	TCC	2	6	1375142	1375147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311472
33474	NC_015315	GAG	2	6	1375176	1375181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311472
33475	NC_015315	CTG	2	6	1375206	1375211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311472
33476	NC_015315	AT	3	6	1375247	1375252	50 %	50 %	0 %	0 %	327311472
33477	NC_015315	CGTTGA	2	12	1375291	1375302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327311472
33478	NC_015315	ACA	2	6	1375393	1375398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311472
33479	NC_015315	CCGT	2	8	1375468	1375475	0 %	25 %	25 %	50 %	327311472
33480	NC_015315	GAC	2	6	1375491	1375496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311472
33481	NC_015315	GGCG	2	8	1375511	1375518	0 %	0 %	75 %	25 %	327311472
33482	NC_015315	GAG	2	6	1375548	1375553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311472
33483	NC_015315	CT	3	6	1375607	1375612	0 %	50 %	0 %	50 %	327311472
33484	NC_015315	G	6	6	1375626	1375631	0 %	0 %	100 %	0 %	327311472
33485	NC_015315	GTGCA	2	10	1375635	1375644	20 %	20 %	40 %	20 %	327311472
33486	NC_015315	CCT	2	6	1375676	1375681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311473
33487	NC_015315	GCCGTA	2	12	1375700	1375711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327311473
33488	NC_015315	CGA	2	6	1375741	1375746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311473
33489	NC_015315	GAA	2	6	1375796	1375801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311473
33490	NC_015315	TAT	2	6	1375922	1375927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311473
33491	NC_015315	CGC	2	6	1375960	1375965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311473
33492	NC_015315	TGG	2	6	1375995	1376000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311473
33493	NC_015315	TG	3	6	1376004	1376009	0 %	50 %	50 %	0 %	327311473
33494	NC_015315	CCA	2	6	1376026	1376031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311473
33495	NC_015315	CGC	2	6	1376188	1376193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311473
33496	NC_015315	CCT	2	6	1376241	1376246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311473
33497	NC_015315	AGG	2	6	1376275	1376280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311473
33498	NC_015315	CCCT	2	8	1376295	1376302	0 %	25 %	0 %	75 %	327311473
33499	NC_015315	C	6	6	1376322	1376327	0 %	0 %	0 %	100 %	327311473
33500	NC_015315	GGC	2	6	1376384	1376389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311473

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