MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_015315	GGCGG	2	10	1271726	1271735	0 %	0 %	80 %	20 %	327311360
31002	NC_015315	CCT	2	6	1271749	1271754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311360
31003	NC_015315	TCG	2	6	1271793	1271798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311360
31004	NC_015315	GAG	2	6	1271909	1271914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311360
31005	NC_015315	CCT	3	9	1271926	1271934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311360
31006	NC_015315	CCTC	2	8	1271938	1271945	0 %	25 %	0 %	75 %	327311360
31007	NC_015315	GCC	2	6	1271984	1271989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311360
31008	NC_015315	GAG	2	6	1272044	1272049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311360
31009	NC_015315	CGG	2	6	1272079	1272084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311360
31010	NC_015315	GGCA	2	8	1272101	1272108	25 %	0 %	50 %	25 %	327311360
31011	NC_015315	CCT	2	6	1272195	1272200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31012	NC_015315	CCG	2	6	1272285	1272290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311361
31013	NC_015315	CCT	2	6	1272298	1272303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311361
31014	NC_015315	AGG	2	6	1272318	1272323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311361
31015	NC_015315	CCG	2	6	1272447	1272452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311361
31016	NC_015315	AG	3	6	1272613	1272618	50 %	0 %	50 %	0 %	327311362
31017	NC_015315	ATA	2	6	1272622	1272627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311362
31018	NC_015315	TCC	2	6	1272632	1272637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311362
31019	NC_015315	TCC	2	6	1272640	1272645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311362
31020	NC_015315	CGC	2	6	1272678	1272683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311362
31021	NC_015315	CCG	2	6	1272697	1272702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311362
31022	NC_015315	ACG	2	6	1272713	1272718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311362
31023	NC_015315	GTG	2	6	1272769	1272774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311362
31024	NC_015315	GCC	2	6	1272870	1272875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311362
31025	NC_015315	ATG	2	6	1273077	1273082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311363
31026	NC_015315	GAG	2	6	1273113	1273118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311363
31027	NC_015315	A	6	6	1273141	1273146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_015315	GCG	2	6	1273241	1273246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311364
31029	NC_015315	CCG	2	6	1273255	1273260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311364
31030	NC_015315	AAG	2	6	1273306	1273311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311364
31031	NC_015315	TCTCCC	2	12	1273331	1273342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31032	NC_015315	CCG	2	6	1273358	1273363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31033	NC_015315	CCCG	2	8	1273484	1273491	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31034	NC_015315	AAT	2	6	1273521	1273526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31035	NC_015315	AACG	2	8	1273535	1273542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31036	NC_015315	GGCC	2	8	1273621	1273628	0 %	0 %	50 %	50 %	327311365
31037	NC_015315	GCCTC	2	10	1273656	1273665	0 %	20 %	20 %	60 %	327311365
31038	NC_015315	CAG	2	6	1273756	1273761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311365
31039	NC_015315	CTC	3	9	1273798	1273806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311365
31040	NC_015315	CGA	2	6	1273842	1273847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311365
31041	NC_015315	CTC	3	9	1273852	1273860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311365
31042	NC_015315	CGA	2	6	1273875	1273880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311365
31043	NC_015315	CGG	2	6	1273888	1273893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311365
31044	NC_015315	GC	3	6	1273912	1273917	0 %	0 %	50 %	50 %	327311365
31045	NC_015315	CGT	2	6	1273959	1273964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311365
31046	NC_015315	G	6	6	1273994	1273999	0 %	0 %	100 %	0 %	327311365
31047	NC_015315	CGG	3	9	1274124	1274132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311365
31048	NC_015315	GAG	2	6	1274149	1274154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311365
31049	NC_015315	CGA	2	6	1274160	1274165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311365
31050	NC_015315	CGC	2	6	1274181	1274186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311365
31051	NC_015315	GC	3	6	1274206	1274211	0 %	0 %	50 %	50 %	327311365
31052	NC_015315	GGC	2	6	1274212	1274217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311365
31053	NC_015315	GAG	2	6	1274227	1274232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311365
31054	NC_015315	GAG	2	6	1274257	1274262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311365
31055	NC_015315	CGGCG	2	10	1274454	1274463	0 %	0 %	60 %	40 %	327311366
31056	NC_015315	GA	3	6	1274500	1274505	50 %	0 %	50 %	0 %	327311366
31057	NC_015315	TCG	2	6	1274510	1274515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311366
31058	NC_015315	TGGC	2	8	1274516	1274523	0 %	25 %	50 %	25 %	327311366
31059	NC_015315	CGG	2	6	1274535	1274540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311366
31060	NC_015315	CGGGG	2	10	1274571	1274580	0 %	0 %	80 %	20 %	327311366
31061	NC_015315	AGG	2	6	1274582	1274587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311366
31062	NC_015315	GAGG	2	8	1274613	1274620	25 %	0 %	75 %	0 %	327311366
31063	NC_015315	GAG	2	6	1274649	1274654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311366
31064	NC_015315	CG	3	6	1274657	1274662	0 %	0 %	50 %	50 %	327311366
31065	NC_015315	GGC	2	6	1274676	1274681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311366
31066	NC_015315	GAG	2	6	1274689	1274694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311366
31067	NC_015315	TGA	2	6	1274804	1274809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311366
31068	NC_015315	GGCCCC	2	12	1274814	1274825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311366
31069	NC_015315	CGTC	2	8	1274897	1274904	0 %	25 %	25 %	50 %	327311366
31070	NC_015315	AG	3	6	1274927	1274932	50 %	0 %	50 %	0 %	327311366
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31074	NC_015315	GAG	2	6	1275051	1275056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311366
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31079	NC_015315	GGCC	2	8	1275263	1275270	0 %	0 %	50 %	50 %	327311366
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31083	NC_015315	TCG	2	6	1275455	1275460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311366
31084	NC_015315	CGC	2	6	1275467	1275472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311366
31085	NC_015315	CGT	2	6	1275537	1275542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311366
31086	NC_015315	GGC	2	6	1275552	1275557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311366
31087	NC_015315	ACG	2	6	1275593	1275598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311366
31088	NC_015315	GGTCAA	2	12	1275618	1275629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327311366
31089	NC_015315	GGC	3	9	1275723	1275731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311366
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31091	NC_015315	TA	3	6	1275820	1275825	50 %	50 %	0 %	0 %	327311366
31092	NC_015315	TAT	2	6	1275831	1275836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311366
31093	NC_015315	CGA	2	6	1275849	1275854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311366
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31096	NC_015315	GGC	2	6	1276079	1276084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311367
31097	NC_015315	GATCGG	2	12	1276091	1276102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327311367
31098	NC_015315	GCG	2	6	1276213	1276218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311367
31099	NC_015315	CGTC	2	8	1276243	1276250	0 %	25 %	25 %	50 %	327311367
31100	NC_015315	GGC	2	6	1276284	1276289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311367
31101	NC_015315	GAG	2	6	1276332	1276337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311367
31102	NC_015315	GTC	2	6	1276362	1276367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311367
31103	NC_015315	CGG	2	6	1276489	1276494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311367
31104	NC_015315	GGA	2	6	1276502	1276507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311367
31105	NC_015315	ACA	2	6	1276543	1276548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311367
31106	NC_015315	TGG	3	9	1276549	1276557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311367
31107	NC_015315	GCC	2	6	1276631	1276636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311367
31108	NC_015315	AGG	2	6	1276678	1276683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311367
31109	NC_015315	TAC	2	6	1276707	1276712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311367
31110	NC_015315	CGA	2	6	1276736	1276741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311367
31111	NC_015315	CTA	2	6	1276745	1276750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311367
31112	NC_015315	CGC	3	9	1276760	1276768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311367
31113	NC_015315	CTC	2	6	1276797	1276802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311367
31114	NC_015315	CAA	2	6	1276817	1276822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311367
31115	NC_015315	CCTACT	2	12	1276831	1276842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	327311367
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31117	NC_015315	CGC	2	6	1277180	1277185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31232	NC_015315	TTAAG	2	10	1281372	1281381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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31240	NC_015315	TTA	2	6	1281631	1281636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31469	NC_015315	GGCC	2	8	1291273	1291280	0 %	0 %	50 %	50 %	327311379
31470	NC_015315	AAG	2	6	1291308	1291313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311379
31471	NC_015315	CCAA	2	8	1291382	1291389	50 %	0 %	0 %	50 %	327311379
31472	NC_015315	CTT	2	6	1291412	1291417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311379
31473	NC_015315	CTC	2	6	1291423	1291428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311380
31474	NC_015315	TCCTA	2	10	1291438	1291447	20 %	40 %	0 %	40 %	327311380
31475	NC_015315	ACA	2	6	1291449	1291454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311380
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31477	NC_015315	GTC	2	6	1291531	1291536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311380
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31480	NC_015315	ACG	2	6	1291691	1291696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311380
31481	NC_015315	CCT	2	6	1291716	1291721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311380
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31483	NC_015315	CGA	2	6	1291768	1291773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311380
31484	NC_015315	CA	3	6	1291784	1291789	50 %	0 %	0 %	50 %	327311380
31485	NC_015315	TCG	2	6	1291826	1291831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311380
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31490	NC_015315	TCCC	2	8	1291913	1291920	0 %	25 %	0 %	75 %	327311380
31491	NC_015315	CGC	2	6	1291967	1291972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311380
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31496	NC_015315	AGT	2	6	1292173	1292178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311380
31497	NC_015315	GCG	2	6	1292288	1292293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311380
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31499	NC_015315	GCC	2	6	1292340	1292345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311381
31500	NC_015315	CTC	2	6	1292457	1292462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311381

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