MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_015315	AGG	2	6	1230373	1230378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311317
30002	NC_015315	GAC	2	6	1230391	1230396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311317
30003	NC_015315	GGAG	2	8	1230455	1230462	25 %	0 %	75 %	0 %	327311317
30004	NC_015315	AG	3	6	1230481	1230486	50 %	0 %	50 %	0 %	327311317
30005	NC_015315	GCC	2	6	1230495	1230500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311317
30006	NC_015315	CGA	3	9	1230525	1230533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311317
30007	NC_015315	C	6	6	1230552	1230557	0 %	0 %	0 %	100 %	327311317
30008	NC_015315	CCG	2	6	1230584	1230589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311317
30009	NC_015315	GGAG	2	8	1230599	1230606	25 %	0 %	75 %	0 %	327311317
30010	NC_015315	GGCC	2	8	1230624	1230631	0 %	0 %	50 %	50 %	327311317
30011	NC_015315	GGC	2	6	1230642	1230647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311317
30012	NC_015315	CGG	2	6	1230692	1230697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311317
30013	NC_015315	TCT	2	6	1230747	1230752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311318
30014	NC_015315	CCT	2	6	1230780	1230785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311318
30015	NC_015315	CTC	2	6	1230859	1230864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311318
30016	NC_015315	CCT	2	6	1230895	1230900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311318
30017	NC_015315	CAG	2	6	1230964	1230969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311318
30018	NC_015315	TGA	2	6	1231011	1231016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311318
30019	NC_015315	TA	3	6	1231087	1231092	50 %	50 %	0 %	0 %	327311319
30020	NC_015315	ACA	2	6	1231108	1231113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311319
30021	NC_015315	TCTA	2	8	1231169	1231176	25 %	50 %	0 %	25 %	327311319
30022	NC_015315	GGAC	2	8	1231282	1231289	25 %	0 %	50 %	25 %	327311319
30023	NC_015315	GAC	2	6	1231293	1231298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311319
30024	NC_015315	CGG	2	6	1231375	1231380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311319
30025	NC_015315	GTA	2	6	1231424	1231429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311319
30026	NC_015315	GGCCC	2	10	1231465	1231474	0 %	0 %	40 %	60 %	327311319
30027	NC_015315	CCGCGT	2	12	1231552	1231563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327311319
30028	NC_015315	GCG	2	6	1231588	1231593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311319
30029	NC_015315	ATC	2	6	1231782	1231787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311319
30030	NC_015315	GTA	2	6	1231805	1231810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311319
30031	NC_015315	CAT	2	6	1231817	1231822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311319
30032	NC_015315	CGG	2	6	1231825	1231830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311319
30033	NC_015315	CGT	2	6	1231856	1231861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311319
30034	NC_015315	GGCT	2	8	1231896	1231903	0 %	25 %	50 %	25 %	327311319
30035	NC_015315	ATT	2	6	1231998	1232003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311319
30036	NC_015315	CAA	2	6	1232008	1232013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311319
30037	NC_015315	GCC	2	6	1232016	1232021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311319
30038	NC_015315	A	6	6	1232117	1232122	100 %	0 %	0 %	0 %	327311320
30039	NC_015315	TTG	2	6	1232171	1232176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311320
30040	NC_015315	TTC	2	6	1232234	1232239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311320
30041	NC_015315	CG	3	6	1232244	1232249	0 %	0 %	50 %	50 %	327311320
30042	NC_015315	CCT	2	6	1232272	1232277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311320
30043	NC_015315	GCC	2	6	1232335	1232340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311320
30044	NC_015315	TAG	2	6	1232358	1232363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311320
30045	NC_015315	CCG	2	6	1232466	1232471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311320
30046	NC_015315	ACT	2	6	1232475	1232480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311320
30047	NC_015315	AGCCA	2	10	1232567	1232576	40 %	0 %	20 %	40 %	327311320
30048	NC_015315	AGGCG	2	10	1232596	1232605	20 %	0 %	60 %	20 %	327311320
30049	NC_015315	GACG	2	8	1232635	1232642	25 %	0 %	50 %	25 %	327311320
30050	NC_015315	CAA	2	6	1232645	1232650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311320
30051	NC_015315	CTAC	2	8	1232671	1232678	25 %	25 %	0 %	50 %	327311320
30052	NC_015315	GTC	2	6	1232708	1232713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311320
30053	NC_015315	CGGC	2	8	1232730	1232737	0 %	0 %	50 %	50 %	327311320
30054	NC_015315	CGG	2	6	1232741	1232746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30055	NC_015315	TCC	2	6	1232749	1232754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30056	NC_015315	TA	3	6	1232765	1232770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30057	NC_015315	GC	3	6	1232784	1232789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30058	NC_015315	AGG	2	6	1232802	1232807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311321
30059	NC_015315	GTC	2	6	1232835	1232840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311321
30060	NC_015315	GAGG	2	8	1232996	1233003	25 %	0 %	75 %	0 %	327311321
30061	NC_015315	CGG	2	6	1233041	1233046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311321
30062	NC_015315	GCACG	2	10	1233269	1233278	20 %	0 %	40 %	40 %	327311321
30063	NC_015315	GCC	2	6	1233300	1233305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311321
30064	NC_015315	CGC	2	6	1233416	1233421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311321
30065	NC_015315	TA	3	6	1233486	1233491	50 %	50 %	0 %	0 %	327311321
30066	NC_015315	CTC	2	6	1233600	1233605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311321
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30070	NC_015315	GGAT	2	8	1233688	1233695	25 %	25 %	50 %	0 %	327311321
30071	NC_015315	AAT	2	6	1233701	1233706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327311321
30072	NC_015315	GTC	2	6	1233741	1233746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311321
30073	NC_015315	GAGG	2	8	1233770	1233777	25 %	0 %	75 %	0 %	327311321
30074	NC_015315	AG	3	6	1233796	1233801	50 %	0 %	50 %	0 %	327311321
30075	NC_015315	CCAG	2	8	1233832	1233839	25 %	0 %	25 %	50 %	327311321
30076	NC_015315	AG	3	6	1233882	1233887	50 %	0 %	50 %	0 %	327311321
30077	NC_015315	CGT	2	6	1233902	1233907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311321
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30081	NC_015315	GAG	2	6	1234028	1234033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311321
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30084	NC_015315	GGC	2	6	1234135	1234140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311322
30085	NC_015315	CTT	2	6	1234162	1234167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311322
30086	NC_015315	GGCCGA	2	12	1234267	1234278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	327311322
30087	NC_015315	CGT	2	6	1234309	1234314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311322
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30089	NC_015315	AAG	2	6	1234511	1234516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311322
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30091	NC_015315	CTG	2	6	1234547	1234552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311322
30092	NC_015315	CTAG	2	8	1234562	1234569	25 %	25 %	25 %	25 %	327311322
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30096	NC_015315	GC	3	6	1234712	1234717	0 %	0 %	50 %	50 %	327311323
30097	NC_015315	CAA	2	6	1234869	1234874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311323
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30100	NC_015315	GAC	2	6	1234911	1234916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311323
30101	NC_015315	GAA	2	6	1234953	1234958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311323
30102	NC_015315	CGT	2	6	1235018	1235023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311323
30103	NC_015315	CG	3	6	1235172	1235177	0 %	0 %	50 %	50 %	327311324
30104	NC_015315	CTG	2	6	1235285	1235290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311324
30105	NC_015315	TCT	2	6	1235328	1235333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311324
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30107	NC_015315	CT	3	6	1235472	1235477	0 %	50 %	0 %	50 %	327311325
30108	NC_015315	CGC	2	6	1235481	1235486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311325
30109	NC_015315	CGT	2	6	1235507	1235512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311325
30110	NC_015315	CTT	2	6	1235571	1235576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311325
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30115	NC_015315	CAC	2	6	1235760	1235765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311325
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30117	NC_015315	CCG	2	6	1235819	1235824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311325
30118	NC_015315	CT	3	6	1235844	1235849	0 %	50 %	0 %	50 %	327311325
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30126	NC_015315	GC	3	6	1236046	1236051	0 %	0 %	50 %	50 %	327311325
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30210	NC_015315	CGGCTA	2	12	1239374	1239385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327311330
30211	NC_015315	GGC	2	6	1239402	1239407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311330
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30220	NC_015315	CAG	2	6	1239883	1239888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311330
30221	NC_015315	CT	3	6	1239918	1239923	0 %	50 %	0 %	50 %	327311330
30222	NC_015315	CAA	2	6	1239969	1239974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311330
30223	NC_015315	CT	4	8	1239999	1240006	0 %	50 %	0 %	50 %	327311330
30224	NC_015315	CGA	2	6	1240011	1240016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311330
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30226	NC_015315	TA	3	6	1240039	1240044	50 %	50 %	0 %	0 %	327311330
30227	NC_015315	GCG	2	6	1240076	1240081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30228	NC_015315	GCCG	2	8	1240088	1240095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30229	NC_015315	AATT	2	8	1240121	1240128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30230	NC_015315	GCG	2	6	1240154	1240159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311331
30231	NC_015315	GAGG	2	8	1240160	1240167	25 %	0 %	75 %	0 %	327311331
30232	NC_015315	TCG	2	6	1240174	1240179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311331
30233	NC_015315	TTA	2	6	1240205	1240210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311331
30234	NC_015315	CGA	2	6	1240252	1240257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311331
30235	NC_015315	GGC	2	6	1240292	1240297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311331
30236	NC_015315	GTG	2	6	1240332	1240337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311331
30237	NC_015315	AGG	2	6	1240338	1240343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311331
30238	NC_015315	GTG	2	6	1240371	1240376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311331
30239	NC_015315	GCG	3	9	1240387	1240395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311331
30240	NC_015315	GCCG	2	8	1240424	1240431	0 %	0 %	50 %	50 %	327311331
30241	NC_015315	GGCC	2	8	1240550	1240557	0 %	0 %	50 %	50 %	327311331
30242	NC_015315	CCCT	2	8	1240593	1240600	0 %	25 %	0 %	75 %	327311331
30243	NC_015315	CTA	2	6	1240625	1240630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311331
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30247	NC_015315	TCT	2	6	1240864	1240869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311331
30248	NC_015315	GAG	2	6	1240946	1240951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311331
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30250	NC_015315	GACC	2	8	1241069	1241076	25 %	0 %	25 %	50 %	327311331
30251	NC_015315	GTC	2	6	1241088	1241093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311331
30252	NC_015315	CGAGGA	2	12	1241141	1241152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	327311331
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30255	NC_015315	GAG	2	6	1241203	1241208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30256	NC_015315	AG	3	6	1241212	1241217	50 %	0 %	50 %	0 %	327311332
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30258	NC_015315	CAA	2	6	1241240	1241245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311332
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30263	NC_015315	CCAGT	2	10	1241348	1241357	20 %	20 %	20 %	40 %	327311332
30264	NC_015315	TTA	2	6	1241377	1241382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327311332
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30281	NC_015315	CGA	2	6	1241833	1241838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311332
30282	NC_015315	A	6	6	1241897	1241902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30283	NC_015315	CTC	2	6	1241954	1241959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311333
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30293	NC_015315	ATA	2	6	1242330	1242335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30294	NC_015315	ATT	3	9	1242345	1242353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30295	NC_015315	AAT	2	6	1242378	1242383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30342	NC_015315	AAT	2	6	1244300	1244305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30343	NC_015315	GTAT	2	8	1244337	1244344	25 %	50 %	25 %	0 %	327311335
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30348	NC_015315	CGG	2	6	1244529	1244534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311335
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30350	NC_015315	GCC	2	6	1244643	1244648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311335
30351	NC_015315	CGA	2	6	1244670	1244675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30352	NC_015315	GTC	2	6	1244761	1244766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30353	NC_015315	GGCCAA	2	12	1244844	1244855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30354	NC_015315	GTC	2	6	1244866	1244871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30355	NC_015315	CGG	2	6	1244880	1244885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311335
30356	NC_015315	GC	3	6	1244934	1244939	0 %	0 %	50 %	50 %	327311335
30357	NC_015315	CGC	2	6	1244952	1244957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311335
30358	NC_015315	ACG	2	6	1244978	1244983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30359	NC_015315	ACG	2	6	1245002	1245007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
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30370	NC_015315	GAA	2	6	1245291	1245296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311335
30371	NC_015315	ACG	2	6	1245302	1245307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
30372	NC_015315	ACG	2	6	1245314	1245319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311335
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30397	NC_015315	TTA	2	6	1247081	1247086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30398	NC_015315	CCG	2	6	1247172	1247177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311336
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30402	NC_015315	GTC	2	6	1247384	1247389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311336
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30407	NC_015315	GGC	2	6	1247656	1247661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311337
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30463	NC_015315	CAA	2	6	1249717	1249722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311339
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30465	NC_015315	CCG	2	6	1249787	1249792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311339
30466	NC_015315	GGC	2	6	1249825	1249830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311339
30467	NC_015315	TGG	2	6	1249914	1249919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311339
30468	NC_015315	AGG	2	6	1250013	1250018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311339
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30470	NC_015315	TA	3	6	1250128	1250133	50 %	50 %	0 %	0 %	327311340
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30473	NC_015315	AGGGC	2	10	1250231	1250240	20 %	0 %	60 %	20 %	327311340
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30476	NC_015315	TCC	2	6	1250309	1250314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311340
30477	NC_015315	GTG	2	6	1250338	1250343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311340
30478	NC_015315	GTC	2	6	1250344	1250349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311340
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30485	NC_015315	TAAA	2	8	1250482	1250489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30486	NC_015315	AT	3	6	1250521	1250526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30487	NC_015315	TTA	2	6	1250558	1250563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30488	NC_015315	GGC	2	6	1250622	1250627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311341
30489	NC_015315	CGG	2	6	1250727	1250732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311341
30490	NC_015315	CGC	2	6	1250747	1250752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311341
30491	NC_015315	CCG	2	6	1250753	1250758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311341
30492	NC_015315	CCGGCT	2	12	1250765	1250776	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327311341
30493	NC_015315	CCGT	2	8	1250818	1250825	0 %	25 %	25 %	50 %	327311341
30494	NC_015315	GCC	2	6	1250833	1250838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311341
30495	NC_015315	CTT	2	6	1250844	1250849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327311341
30496	NC_015315	GTACAG	2	12	1250944	1250955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327311341
30497	NC_015315	GC	3	6	1251089	1251094	0 %	0 %	50 %	50 %	327311341
30498	NC_015315	GGT	2	6	1251162	1251167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311341
30499	NC_015315	GGT	2	6	1251195	1251200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311341
30500	NC_015315	GCG	2	6	1251226	1251231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311341

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