MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_015315	GCC	3	9	1188549	1188557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311270
29003	NC_015315	AGGA	2	8	1188570	1188577	50 %	0 %	50 %	0 %	327311270
29004	NC_015315	CTA	2	6	1188589	1188594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327311270
29005	NC_015315	AGCTTG	2	12	1188690	1188701	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327311270
29006	NC_015315	CGA	2	6	1188713	1188718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311270
29007	NC_015315	TGG	2	6	1188729	1188734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311270
29008	NC_015315	GCG	2	6	1188736	1188741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311270
29009	NC_015315	GCC	2	6	1188750	1188755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311270
29010	NC_015315	CCA	2	6	1188901	1188906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311270
29011	NC_015315	CTC	2	6	1188908	1188913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311270
29012	NC_015315	GAG	2	6	1189040	1189045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311270
29013	NC_015315	GCG	2	6	1189079	1189084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311270
29014	NC_015315	TCC	2	6	1189092	1189097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311270
29015	NC_015315	CG	3	6	1189102	1189107	0 %	0 %	50 %	50 %	327311270
29016	NC_015315	GCG	3	9	1189105	1189113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311270
29017	NC_015315	CT	3	6	1189130	1189135	0 %	50 %	0 %	50 %	327311270
29018	NC_015315	CCT	2	6	1189141	1189146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311270
29019	NC_015315	CG	3	6	1189198	1189203	0 %	0 %	50 %	50 %	327311271
29020	NC_015315	GGC	2	6	1189283	1189288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327311271
29021	NC_015315	CTC	2	6	1189346	1189351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311271
29022	NC_015315	TCC	2	6	1189353	1189358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311271
29023	NC_015315	CTC	2	6	1189409	1189414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311271
29024	NC_015315	CCTC	3	12	1189411	1189422	0 %	25 %	0 %	75 %	327311271
29025	NC_015315	TG	3	6	1189504	1189509	0 %	50 %	50 %	0 %	327311271
29026	NC_015315	CCT	2	6	1189523	1189528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311271
29027	NC_015315	GCT	2	6	1189555	1189560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311271
29028	NC_015315	CT	3	6	1189636	1189641	0 %	50 %	0 %	50 %	327311271
29029	NC_015315	CGC	2	6	1189673	1189678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311271
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29031	NC_015315	GAG	2	6	1189746	1189751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311272
29032	NC_015315	TC	3	6	1189788	1189793	0 %	50 %	0 %	50 %	327311272
29033	NC_015315	TA	3	6	1189794	1189799	50 %	50 %	0 %	0 %	327311272
29034	NC_015315	GA	3	6	1189822	1189827	50 %	0 %	50 %	0 %	327311272
29035	NC_015315	TCG	2	6	1189840	1189845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311272
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29037	NC_015315	ACA	2	6	1189901	1189906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311272
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29039	NC_015315	CGC	2	6	1189955	1189960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327311272
29040	NC_015315	CT	3	6	1189966	1189971	0 %	50 %	0 %	50 %	327311272
29041	NC_015315	T	7	7	1189971	1189977	0 %	100 %	0 %	0 %	327311272
29042	NC_015315	TA	3	6	1190037	1190042	50 %	50 %	0 %	0 %	327311272
29043	NC_015315	GTATCT	2	12	1190096	1190107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	327311272
29044	NC_015315	TCC	3	9	1190125	1190133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311272
29045	NC_015315	TCC	2	6	1190146	1190151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311272
29046	NC_015315	ACG	2	6	1190155	1190160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311272
29047	NC_015315	CTC	2	6	1190161	1190166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311272
29048	NC_015315	TAAT	2	8	1190177	1190184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29049	NC_015315	CGA	2	6	1190251	1190256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29050	NC_015315	AGGTT	2	10	1190278	1190287	20 %	40 %	40 %	0 %	327311273
29051	NC_015315	ACG	3	9	1190300	1190308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311273
29052	NC_015315	CAC	2	6	1190353	1190358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327311273
29053	NC_015315	CAA	2	6	1190380	1190385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327311273
29054	NC_015315	CGT	2	6	1190406	1190411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311273
29055	NC_015315	GTA	3	9	1190422	1190430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311273
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29057	NC_015315	CGT	2	6	1190562	1190567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311273
29058	NC_015315	TGT	2	6	1190607	1190612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327311273
29059	NC_015315	GAA	2	6	1190617	1190622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311273
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29063	NC_015315	TCC	2	6	1190785	1190790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327311273
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29066	NC_015315	GTTGCC	2	12	1190866	1190877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311273
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29070	NC_015315	GTG	2	6	1191236	1191241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311273
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29078	NC_015315	GCCG	2	8	1191850	1191857	0 %	0 %	50 %	50 %	327311273
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29084	NC_015315	TA	3	6	1192064	1192069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29085	NC_015315	TAG	2	6	1192080	1192085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29086	NC_015315	AGG	2	6	1192086	1192091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29088	NC_015315	GGCTA	2	10	1192159	1192168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29089	NC_015315	CGC	2	6	1192177	1192182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29097	NC_015315	TTAGT	2	10	1192474	1192483	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29098	NC_015315	GCG	2	6	1192506	1192511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29099	NC_015315	CTG	2	6	1192518	1192523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29100	NC_015315	GA	3	6	1192551	1192556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29101	NC_015315	TA	3	6	1192589	1192594	50 %	50 %	0 %	0 %	327311275
29102	NC_015315	GAG	2	6	1192595	1192600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327311275
29103	NC_015315	GTTC	2	8	1192609	1192616	0 %	50 %	25 %	25 %	327311275
29104	NC_015315	AGA	2	6	1192617	1192622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327311275
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29223	NC_015315	CGA	2	6	1198515	1198520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311285
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29226	NC_015315	GACG	2	8	1198597	1198604	25 %	0 %	50 %	25 %	327311285
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29352	NC_015315	AT	3	6	1204089	1204094	50 %	50 %	0 %	0 %	327311289
29353	NC_015315	ACG	2	6	1204095	1204100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311289
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29468	NC_015315	CGT	2	6	1208721	1208726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29469	NC_015315	CCT	2	6	1208741	1208746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29470	NC_015315	CGT	2	6	1208786	1208791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29471	NC_015315	AGG	2	6	1208829	1208834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29472	NC_015315	GGC	2	6	1208954	1208959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29473	NC_015315	GCC	2	6	1208987	1208992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29474	NC_015315	CG	3	6	1208995	1209000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29475	NC_015315	CG	3	6	1209023	1209028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29476	NC_015315	CCG	2	6	1209034	1209039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29477	NC_015315	CGC	2	6	1209048	1209053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29480	NC_015315	GTA	2	6	1209119	1209124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327311293
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29497	NC_015315	GTG	2	6	1209948	1209953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327311293
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29499	NC_015315	ACG	2	6	1209997	1210002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327311293
29500	NC_015315	CGT	2	6	1210007	1210012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327311293

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