MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_015315	TA	3	6	457349	457354	50 %	50 %	0 %	0 %	327310435
11003	NC_015315	ACG	2	6	457381	457386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11004	NC_015315	CCG	2	6	457432	457437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310435
11005	NC_015315	GTA	2	6	457482	457487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310435
11006	NC_015315	CGA	2	6	457541	457546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11007	NC_015315	TAG	2	6	457576	457581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310435
11008	NC_015315	AAG	2	6	457596	457601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310435
11009	NC_015315	GTG	2	6	457611	457616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310435
11010	NC_015315	GGCC	2	8	457625	457632	0 %	0 %	50 %	50 %	327310435
11011	NC_015315	GAC	2	6	457683	457688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11012	NC_015315	CTGGAG	2	12	457719	457730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327310435
11013	NC_015315	GCC	2	6	457741	457746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310435
11014	NC_015315	GA	3	6	457853	457858	50 %	0 %	50 %	0 %	327310435
11015	NC_015315	GGC	2	6	457859	457864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310435
11016	NC_015315	GCG	2	6	457867	457872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310435
11017	NC_015315	GTG	2	6	457878	457883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310435
11018	NC_015315	CGC	2	6	457895	457900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310435
11019	NC_015315	GAC	2	6	457947	457952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11020	NC_015315	G	6	6	458055	458060	0 %	0 %	100 %	0 %	327310435
11021	NC_015315	GTG	2	6	458109	458114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310435
11022	NC_015315	CGG	2	6	458168	458173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310435
11023	NC_015315	GCCG	2	8	458241	458248	0 %	0 %	50 %	50 %	327310435
11024	NC_015315	TGA	2	6	458365	458370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310435
11025	NC_015315	AT	3	6	458490	458495	50 %	50 %	0 %	0 %	327310435
11026	NC_015315	CGT	2	6	458504	458509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11027	NC_015315	GCG	2	6	458557	458562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310435
11028	NC_015315	GGA	2	6	458576	458581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310435
11029	NC_015315	GCG	2	6	458605	458610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310435
11030	NC_015315	CGC	2	6	458626	458631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310435
11031	NC_015315	GAG	2	6	458682	458687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310435
11032	NC_015315	CAA	2	6	458696	458701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310435
11033	NC_015315	CTA	2	6	458760	458765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310435
11034	NC_015315	GAG	3	9	458766	458774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310435
11035	NC_015315	GGT	2	6	458828	458833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310435
11036	NC_015315	GAG	2	6	458844	458849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310435
11037	NC_015315	CGA	2	6	458960	458965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11038	NC_015315	GAGG	2	8	458966	458973	25 %	0 %	75 %	0 %	327310435
11039	NC_015315	TAA	2	6	459001	459006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310435
11040	NC_015315	CA	3	6	459013	459018	50 %	0 %	0 %	50 %	327310435
11041	NC_015315	TGG	2	6	459073	459078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310435
11042	NC_015315	GA	4	8	459176	459183	50 %	0 %	50 %	0 %	327310435
11043	NC_015315	GAC	2	6	459219	459224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310435
11044	NC_015315	GAG	2	6	459228	459233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310435
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11047	NC_015315	GTA	2	6	459379	459384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310436
11048	NC_015315	CGA	3	9	459516	459524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310436
11049	NC_015315	TAG	2	6	459578	459583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310436
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11051	NC_015315	CGC	2	6	459627	459632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310436
11052	NC_015315	TAT	2	6	459688	459693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310436
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11054	NC_015315	CGG	2	6	459744	459749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310436
11055	NC_015315	AGCCC	2	10	459762	459771	20 %	0 %	20 %	60 %	327310436
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11057	NC_015315	CGA	2	6	459858	459863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310436
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11060	NC_015315	GC	3	6	459990	459995	0 %	0 %	50 %	50 %	327310436
11061	NC_015315	CCCAG	2	10	460028	460037	20 %	0 %	20 %	60 %	327310436
11062	NC_015315	CCG	2	6	460041	460046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310436
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11064	NC_015315	CGG	2	6	460137	460142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310436
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11085	NC_015315	CGG	2	6	460888	460893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_015315	CG	3	6	460896	460901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_015315	TGT	2	6	460921	460926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310439
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11092	NC_015315	AT	3	6	461009	461014	50 %	50 %	0 %	0 %	327310439
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11100	NC_015315	TAA	3	9	461148	461156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310439
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11104	NC_015315	AT	3	6	461327	461332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_015315	GA	3	6	461384	461389	50 %	0 %	50 %	0 %	327310440
11106	NC_015315	CGAG	2	8	461427	461434	25 %	0 %	50 %	25 %	327310440
11107	NC_015315	GCGG	2	8	461437	461444	0 %	0 %	75 %	25 %	327310440
11108	NC_015315	CGTC	2	8	461445	461452	0 %	25 %	25 %	50 %	327310440
11109	NC_015315	TAG	2	6	461577	461582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310440
11110	NC_015315	TCG	2	6	461676	461681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310440
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11112	NC_015315	GTC	2	6	461708	461713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310440
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11114	NC_015315	CG	3	6	461853	461858	0 %	0 %	50 %	50 %	327310440
11115	NC_015315	GGC	2	6	461876	461881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310440
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11117	NC_015315	CGAT	2	8	462013	462020	25 %	25 %	25 %	25 %	327310441
11118	NC_015315	GCG	2	6	462021	462026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310441
11119	NC_015315	GGCCAG	2	12	462068	462079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	327310441
11120	NC_015315	GGA	2	6	462094	462099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310441
11121	NC_015315	GAC	2	6	462107	462112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310441
11122	NC_015315	GGA	2	6	462142	462147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310441
11123	NC_015315	ACC	2	6	462171	462176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310441
11124	NC_015315	CGA	2	6	462181	462186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310441
11125	NC_015315	CGA	2	6	462205	462210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310441
11126	NC_015315	GCC	2	6	462305	462310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310441
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11128	NC_015315	TCG	3	9	462551	462559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310442
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11130	NC_015315	CCT	2	6	462691	462696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310442
11131	NC_015315	CTC	2	6	462767	462772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310442
11132	NC_015315	CAG	2	6	462869	462874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310443
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11134	NC_015315	CTT	2	6	462923	462928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310443
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11137	NC_015315	CGGT	2	8	463051	463058	0 %	25 %	50 %	25 %	327310443
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11140	NC_015315	CCG	2	6	463156	463161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310443
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11145	NC_015315	CGC	2	6	463301	463306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310443
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11154	NC_015315	CGC	2	6	463634	463639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310443
11155	NC_015315	AG	3	6	463726	463731	50 %	0 %	50 %	0 %	327310443
11156	NC_015315	GGT	2	6	463774	463779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310443
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11158	NC_015315	CAA	2	6	463841	463846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310443
11159	NC_015315	GAC	2	6	463859	463864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310443
11160	NC_015315	TA	3	6	463928	463933	50 %	50 %	0 %	0 %	327310443
11161	NC_015315	ACA	2	6	463944	463949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310443
11162	NC_015315	CGG	2	6	464094	464099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11163	NC_015315	GAA	2	6	464257	464262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310444
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11190	NC_015315	GCA	2	6	465286	465291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310444
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11192	NC_015315	AGG	2	6	465373	465378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11193	NC_015315	GGT	2	6	465419	465424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310445
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11212	NC_015315	TAGC	2	8	466197	466204	25 %	25 %	25 %	25 %	327310445
11213	NC_015315	TCAGC	2	10	466206	466215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11214	NC_015315	TTC	2	6	466244	466249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11215	NC_015315	TAAA	2	8	466270	466277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11216	NC_015315	TAT	2	6	466294	466299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11217	NC_015315	CCG	2	6	466377	466382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11218	NC_015315	GCC	2	6	466404	466409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11219	NC_015315	GCG	2	6	466476	466481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11220	NC_015315	CGGC	2	8	466513	466520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11221	NC_015315	AGG	2	6	466544	466549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_015315	CTC	2	6	466553	466558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11223	NC_015315	AT	3	6	466602	466607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11224	NC_015315	TA	3	6	466612	466617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11225	NC_015315	TGA	2	6	466633	466638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11226	NC_015315	TA	3	6	466649	466654	50 %	50 %	0 %	0 %	327310446
11227	NC_015315	CCG	2	6	466733	466738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310446
11228	NC_015315	G	6	6	466756	466761	0 %	0 %	100 %	0 %	327310446
11229	NC_015315	GGA	2	6	466788	466793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310446
11230	NC_015315	GACA	2	8	466853	466860	50 %	0 %	25 %	25 %	327310446
11231	NC_015315	GCAA	2	8	466903	466910	50 %	0 %	25 %	25 %	327310446
11232	NC_015315	GGTA	2	8	466947	466954	25 %	25 %	50 %	0 %	327310446
11233	NC_015315	AGG	2	6	466958	466963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310446
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11236	NC_015315	TA	3	6	467029	467034	50 %	50 %	0 %	0 %	327310446
11237	NC_015315	GCC	2	6	467035	467040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310446
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11239	NC_015315	GAG	2	6	467119	467124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310446
11240	NC_015315	CGA	2	6	467214	467219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310446
11241	NC_015315	AGG	2	6	467221	467226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310446
11242	NC_015315	CCT	2	6	467232	467237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310446
11243	NC_015315	CCT	2	6	467259	467264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310446
11244	NC_015315	CGT	2	6	467265	467270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310446
11245	NC_015315	GGA	2	6	467271	467276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310446
11246	NC_015315	ACA	2	6	467303	467308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310446
11247	NC_015315	GTG	2	6	467407	467412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310446
11248	NC_015315	TCA	2	6	467426	467431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310446
11249	NC_015315	AAGC	2	8	467449	467456	50 %	0 %	25 %	25 %	327310446
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11257	NC_015315	TACA	2	8	468048	468055	50 %	25 %	0 %	25 %	327310447
11258	NC_015315	CGG	2	6	468085	468090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310447
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11263	NC_015315	TCC	2	6	468283	468288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310447
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11272	NC_015315	TGG	2	6	468616	468621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310447
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11275	NC_015315	TGA	2	6	468712	468717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310447
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11286	NC_015315	CCGAG	2	10	469145	469154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11287	NC_015315	CGG	2	6	469175	469180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11288	NC_015315	GCC	2	6	469199	469204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11336	NC_015315	AT	3	6	471218	471223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11337	NC_015315	CAA	2	6	471256	471261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310450
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11344	NC_015315	AT	4	8	471554	471561	50 %	50 %	0 %	0 %	327310450
11345	NC_015315	GGA	2	6	471576	471581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310450
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11350	NC_015315	CTG	2	6	471701	471706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11351	NC_015315	TCA	2	6	471793	471798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310451
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11353	NC_015315	GGCCT	2	10	471855	471864	0 %	20 %	40 %	40 %	327310451
11354	NC_015315	ACG	2	6	471907	471912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310451
11355	NC_015315	GTC	2	6	472035	472040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310451
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11357	NC_015315	GTG	2	6	472119	472124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310451
11358	NC_015315	C	6	6	472135	472140	0 %	0 %	0 %	100 %	327310451
11359	NC_015315	AG	3	6	472164	472169	50 %	0 %	50 %	0 %	327310451
11360	NC_015315	GGGA	2	8	472255	472262	25 %	0 %	75 %	0 %	327310452
11361	NC_015315	GCC	2	6	472321	472326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310452
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11363	NC_015315	GGA	2	6	472485	472490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310452
11364	NC_015315	GA	3	6	472551	472556	50 %	0 %	50 %	0 %	327310452
11365	NC_015315	GGA	2	6	472565	472570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310452
11366	NC_015315	ACG	2	6	472613	472618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310452
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11370	NC_015315	CGA	2	6	472761	472766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310452
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11393	NC_015315	CTG	2	6	473657	473662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310452
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11395	NC_015315	CGG	2	6	473736	473741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310452
11396	NC_015315	AT	3	6	473748	473753	50 %	50 %	0 %	0 %	327310452
11397	NC_015315	CTAG	2	8	473770	473777	25 %	25 %	25 %	25 %	327310452
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11430	NC_015315	CTC	2	6	475055	475060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
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11433	NC_015315	CCT	2	6	475114	475119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
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11436	NC_015315	CCG	2	6	475194	475199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310453
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11443	NC_015315	CCCT	2	8	475571	475578	0 %	25 %	0 %	75 %	327310453
11444	NC_015315	CTT	2	6	475607	475612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310453
11445	NC_015315	GTA	2	6	475640	475645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310453
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11448	NC_015315	TAG	2	6	475792	475797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310453
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11452	NC_015315	CCCT	2	8	475875	475882	0 %	25 %	0 %	75 %	327310453
11453	NC_015315	CCT	2	6	475942	475947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
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11464	NC_015315	CTC	2	6	476408	476413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
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11469	NC_015315	CT	4	8	476774	476781	0 %	50 %	0 %	50 %	327310453
11470	NC_015315	TCC	3	9	476799	476807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
11471	NC_015315	GCC	2	6	476815	476820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310453
11472	NC_015315	CCT	2	6	476827	476832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310453
11473	NC_015315	GTA	2	6	476851	476856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310453
11474	NC_015315	TA	3	6	476855	476860	50 %	50 %	0 %	0 %	327310453
11475	NC_015315	AGA	2	6	476911	476916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11476	NC_015315	GCC	2	6	476963	476968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11477	NC_015315	AAT	2	6	477039	477044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310454
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11479	NC_015315	TCG	2	6	477190	477195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310454
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11481	NC_015315	CGA	2	6	477209	477214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310454
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11483	NC_015315	GAA	2	6	477263	477268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310454
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11485	NC_015315	GGA	2	6	477292	477297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310454
11486	NC_015315	AAC	2	6	477330	477335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310454
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