MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015315	GC	4	8	415205	415212	0 %	0 %	50 %	50 %	327310387
10002	NC_015315	TA	3	6	415278	415283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_015315	CAA	2	6	415334	415339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310388
10004	NC_015315	TCT	2	6	415420	415425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310388
10005	NC_015315	CTC	3	9	415484	415492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310388
10006	NC_015315	CGGA	2	8	415564	415571	25 %	0 %	50 %	25 %	327310388
10007	NC_015315	CCG	2	6	415621	415626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310388
10008	NC_015315	TGG	2	6	415636	415641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310388
10009	NC_015315	GCG	2	6	415659	415664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310388
10010	NC_015315	CGA	2	6	415678	415683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310388
10011	NC_015315	CGT	3	9	415690	415698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310388
10012	NC_015315	CTT	2	6	415754	415759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310388
10013	NC_015315	CGA	2	6	415795	415800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310388
10014	NC_015315	CGG	2	6	415829	415834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310388
10015	NC_015315	CCTC	2	8	416020	416027	0 %	25 %	0 %	75 %	327310388
10016	NC_015315	GAT	2	6	416064	416069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310388
10017	NC_015315	CCT	2	6	416075	416080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310388
10018	NC_015315	CGT	2	6	416091	416096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310388
10019	NC_015315	ATT	2	6	416139	416144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310388
10020	NC_015315	CCT	2	6	416151	416156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310389
10021	NC_015315	CG	3	6	416190	416195	0 %	0 %	50 %	50 %	327310389
10022	NC_015315	AT	3	6	416309	416314	50 %	50 %	0 %	0 %	327310389
10023	NC_015315	ACG	2	6	416369	416374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310389
10024	NC_015315	CCGA	2	8	416390	416397	25 %	0 %	25 %	50 %	327310389
10025	NC_015315	GA	3	6	416446	416451	50 %	0 %	50 %	0 %	327310389
10026	NC_015315	CGC	2	6	416452	416457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310389
10027	NC_015315	CGA	2	6	416502	416507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310389
10028	NC_015315	CCTC	2	8	416562	416569	0 %	25 %	0 %	75 %	327310389
10029	NC_015315	GCG	2	6	416593	416598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310389
10030	NC_015315	CG	3	6	416706	416711	0 %	0 %	50 %	50 %	327310389
10031	NC_015315	GCA	2	6	416723	416728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310389
10032	NC_015315	TCTGG	2	10	416811	416820	0 %	40 %	40 %	20 %	327310389
10033	NC_015315	TCC	2	6	416823	416828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310389
10034	NC_015315	CCT	2	6	416836	416841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310389
10035	NC_015315	CAG	2	6	416851	416856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310389
10036	NC_015315	CTAT	2	8	416959	416966	25 %	50 %	0 %	25 %	327310390
10037	NC_015315	TAT	2	6	416973	416978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310390
10038	NC_015315	CAA	2	6	416982	416987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310390
10039	NC_015315	CTT	2	6	417090	417095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310390
10040	NC_015315	CG	3	6	417104	417109	0 %	0 %	50 %	50 %	327310390
10041	NC_015315	CT	3	6	417145	417150	0 %	50 %	0 %	50 %	327310390
10042	NC_015315	TCG	2	6	417199	417204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310390
10043	NC_015315	CAC	2	6	417222	417227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310390
10044	NC_015315	GAG	2	6	417252	417257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310390
10045	NC_015315	TCT	2	6	417272	417277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310390
10046	NC_015315	CGC	2	6	417321	417326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310390
10047	NC_015315	TTG	2	6	417442	417447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310390
10048	NC_015315	CCA	2	6	417458	417463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310390
10049	NC_015315	GGA	2	6	417471	417476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310390
10050	NC_015315	CGT	2	6	417491	417496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310390
10051	NC_015315	CCA	2	6	417536	417541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310390
10052	NC_015315	TCA	2	6	417581	417586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310390
10053	NC_015315	TAT	2	6	417647	417652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310391
10054	NC_015315	CGA	2	6	417773	417778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310391
10055	NC_015315	CT	3	6	417823	417828	0 %	50 %	0 %	50 %	327310391
10056	NC_015315	CTC	2	6	417857	417862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310391
10057	NC_015315	CG	3	6	417887	417892	0 %	0 %	50 %	50 %	327310391
10058	NC_015315	GGC	2	6	417924	417929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310391
10059	NC_015315	CCT	2	6	417986	417991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310391
10060	NC_015315	CGG	2	6	418021	418026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310391
10061	NC_015315	TTA	2	6	418048	418053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310391
10062	NC_015315	CTT	2	6	418094	418099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310391
10063	NC_015315	AAAT	2	8	418303	418310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_015315	CTA	2	6	418441	418446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310392
10065	NC_015315	CGTGC	2	10	418447	418456	0 %	20 %	40 %	40 %	327310392
10066	NC_015315	TC	3	6	418473	418478	0 %	50 %	0 %	50 %	327310392
10067	NC_015315	G	7	7	418553	418559	0 %	0 %	100 %	0 %	327310392
10068	NC_015315	ATGT	2	8	418594	418601	25 %	50 %	25 %	0 %	327310392
10069	NC_015315	GTT	2	6	418636	418641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310392
10070	NC_015315	CTT	2	6	418674	418679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310392
10071	NC_015315	CTC	2	6	418704	418709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310393
10072	NC_015315	CTATC	2	10	418760	418769	20 %	40 %	0 %	40 %	327310393
10073	NC_015315	TTC	2	6	418852	418857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310393
10074	NC_015315	CGA	2	6	418868	418873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10075	NC_015315	GTA	2	6	418905	418910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310393
10076	NC_015315	CGC	2	6	418922	418927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310393
10077	NC_015315	GTCT	2	8	418932	418939	0 %	50 %	25 %	25 %	327310393
10078	NC_015315	CTAT	2	8	418960	418967	25 %	50 %	0 %	25 %	327310393
10079	NC_015315	CCA	2	6	418973	418978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310393
10080	NC_015315	TG	3	6	419014	419019	0 %	50 %	50 %	0 %	327310393
10081	NC_015315	TGC	2	6	419023	419028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10082	NC_015315	TCG	2	6	419074	419079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10083	NC_015315	CGAC	2	8	419102	419109	25 %	0 %	25 %	50 %	327310393
10084	NC_015315	CGA	2	6	419120	419125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10085	NC_015315	GTC	2	6	419172	419177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10086	NC_015315	AT	4	8	419182	419189	50 %	50 %	0 %	0 %	327310393
10087	NC_015315	ACG	2	6	419198	419203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310393
10088	NC_015315	AAC	2	6	419212	419217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310393
10089	NC_015315	GCC	2	6	419239	419244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310393
10090	NC_015315	GGA	2	6	419256	419261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310393
10091	NC_015315	CCACT	2	10	419487	419496	20 %	20 %	0 %	60 %	327310394
10092	NC_015315	TCA	2	6	419585	419590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310394
10093	NC_015315	ATG	2	6	419593	419598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310394
10094	NC_015315	ATA	2	6	419687	419692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310394
10095	NC_015315	AT	4	8	419696	419703	50 %	50 %	0 %	0 %	327310394
10096	NC_015315	ATT	2	6	419712	419717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310394
10097	NC_015315	TAA	2	6	419727	419732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310394
10098	NC_015315	GCG	2	6	419768	419773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310394
10099	NC_015315	ACG	2	6	419774	419779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310394
10100	NC_015315	CG	3	6	419804	419809	0 %	0 %	50 %	50 %	327310394
10101	NC_015315	AGG	2	6	419883	419888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310394
10102	NC_015315	AGG	2	6	419944	419949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310395
10103	NC_015315	CG	3	6	419955	419960	0 %	0 %	50 %	50 %	327310395
10104	NC_015315	GAG	2	6	419969	419974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310395
10105	NC_015315	AG	4	8	419991	419998	50 %	0 %	50 %	0 %	327310395
10106	NC_015315	GTA	2	6	420052	420057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310395
10107	NC_015315	AG	3	6	420067	420072	50 %	0 %	50 %	0 %	327310396
10108	NC_015315	AAT	2	6	420211	420216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310396
10109	NC_015315	CGA	2	6	420226	420231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310396
10110	NC_015315	CTG	2	6	420256	420261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310396
10111	NC_015315	GCC	2	6	420320	420325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310396
10112	NC_015315	ACGCC	2	10	420331	420340	20 %	0 %	20 %	60 %	327310396
10113	NC_015315	GGC	2	6	420500	420505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310396
10114	NC_015315	TA	3	6	420527	420532	50 %	50 %	0 %	0 %	327310396
10115	NC_015315	CAA	2	6	420539	420544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310396
10116	NC_015315	CCT	2	6	420604	420609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310396
10117	NC_015315	T	6	6	420669	420674	0 %	100 %	0 %	0 %	327310396
10118	NC_015315	T	7	7	420789	420795	0 %	100 %	0 %	0 %	327310396
10119	NC_015315	A	6	6	420802	420807	100 %	0 %	0 %	0 %	327310396
10120	NC_015315	TAT	2	6	420811	420816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310396
10121	NC_015315	TAT	2	6	420841	420846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310396
10122	NC_015315	TAAA	2	8	420887	420894	75 %	25 %	0 %	0 %	327310396
10123	NC_015315	ATA	2	6	421023	421028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_015315	GGC	2	6	421058	421063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10234	NC_015315	GCC	2	6	425452	425457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10235	NC_015315	TTTCG	2	10	425504	425513	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10236	NC_015315	AT	4	8	425612	425619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_015315	CTT	2	6	425656	425661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10238	NC_015315	GGA	2	6	425671	425676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310402
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10241	NC_015315	CGA	2	6	425904	425909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310402
10242	NC_015315	CTA	2	6	425920	425925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310402
10243	NC_015315	AC	3	6	425935	425940	50 %	0 %	0 %	50 %	327310402
10244	NC_015315	AGA	2	6	426019	426024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310402
10245	NC_015315	AT	3	6	426042	426047	50 %	50 %	0 %	0 %	327310402
10246	NC_015315	GAGG	2	8	426049	426056	25 %	0 %	75 %	0 %	327310402
10247	NC_015315	GGT	2	6	426088	426093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310402
10248	NC_015315	CCT	2	6	426207	426212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310402
10249	NC_015315	TAA	2	6	426291	426296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310402
10250	NC_015315	AGG	2	6	426326	426331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310402
10251	NC_015315	GAG	2	6	426350	426355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310402
10252	NC_015315	GACG	2	8	426379	426386	25 %	0 %	50 %	25 %	327310402
10253	NC_015315	ATCTAC	2	12	426401	426412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310402
10254	NC_015315	GAGC	2	8	426451	426458	25 %	0 %	50 %	25 %	327310402
10255	NC_015315	AG	3	6	426508	426513	50 %	0 %	50 %	0 %	327310402
10256	NC_015315	CTC	2	6	426578	426583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310402
10257	NC_015315	ACG	2	6	426603	426608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310402
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10259	NC_015315	AAG	3	9	426644	426652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310402
10260	NC_015315	TA	3	6	426701	426706	50 %	50 %	0 %	0 %	327310402
10261	NC_015315	TAA	2	6	426724	426729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310402
10262	NC_015315	AAGA	2	8	426754	426761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_015315	TAT	2	6	426765	426770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_015315	TA	5	10	426791	426800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_015315	AATA	2	8	426819	426826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_015315	TA	4	8	426829	426836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_015315	GCG	2	6	426889	426894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310403
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10272	NC_015315	CGA	2	6	427049	427054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310403
10273	NC_015315	GGA	2	6	427067	427072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310403
10274	NC_015315	AGG	3	9	427179	427187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310403
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10285	NC_015315	TA	3	6	427548	427553	50 %	50 %	0 %	0 %	327310403
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10312	NC_015315	TA	4	8	428674	428681	50 %	50 %	0 %	0 %	327310405
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10323	NC_015315	CG	4	8	429107	429114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10324	NC_015315	TAAA	2	8	429137	429144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10325	NC_015315	AACA	2	8	429178	429185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10337	NC_015315	CGC	2	6	429487	429492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10338	NC_015315	CCG	2	6	429500	429505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10339	NC_015315	CGTGGT	2	12	429542	429553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	327310407
10340	NC_015315	GTA	3	9	429561	429569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310407
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10345	NC_015315	CGA	2	6	429785	429790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310407
10346	NC_015315	GATC	2	8	429842	429849	25 %	25 %	25 %	25 %	327310407
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10350	NC_015315	CG	3	6	430066	430071	0 %	0 %	50 %	50 %	327310408
10351	NC_015315	GAG	2	6	430089	430094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310408
10352	NC_015315	GAC	2	6	430173	430178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310408
10353	NC_015315	GGCT	2	8	430257	430264	0 %	25 %	50 %	25 %	327310408
10354	NC_015315	TTC	2	6	430314	430319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310408
10355	NC_015315	CGG	2	6	430339	430344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310408
10356	NC_015315	AGTCCA	2	12	430345	430356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327310408
10357	NC_015315	ATA	2	6	430425	430430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310408
10358	NC_015315	GGC	2	6	430434	430439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310408
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10361	NC_015315	GAGG	2	8	430535	430542	25 %	0 %	75 %	0 %	327310408
10362	NC_015315	GC	3	6	430572	430577	0 %	0 %	50 %	50 %	327310408
10363	NC_015315	GAG	2	6	430578	430583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310408
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10365	NC_015315	GAG	2	6	430779	430784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310408
10366	NC_015315	TA	3	6	430794	430799	50 %	50 %	0 %	0 %	327310408
10367	NC_015315	AGGATA	2	12	430809	430820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	327310408
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10370	NC_015315	GTCG	2	8	430901	430908	0 %	25 %	50 %	25 %	327310408
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10406	NC_015315	A	6	6	432504	432509	100 %	0 %	0 %	0 %	327310411
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10453	NC_015315	TAATA	2	10	433872	433881	60 %	40 %	0 %	0 %	327310411
10454	NC_015315	AGAT	2	8	433886	433893	50 %	25 %	25 %	0 %	327310411
10455	NC_015315	AT	3	6	433892	433897	50 %	50 %	0 %	0 %	327310411
10456	NC_015315	GGA	2	6	433949	433954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310411
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10473	NC_015315	CTG	2	6	434675	434680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310412
10474	NC_015315	GCC	2	6	434727	434732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310412
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10476	NC_015315	C	6	6	434828	434833	0 %	0 %	0 %	100 %	327310412
10477	NC_015315	GGA	2	6	434839	434844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310412
10478	NC_015315	CCG	2	6	434860	434865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310412
10479	NC_015315	GGT	2	6	434899	434904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310412
10480	NC_015315	GTC	2	6	434933	434938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310412
10481	NC_015315	ATA	2	6	434963	434968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310412
10482	NC_015315	ACTGG	2	10	434995	435004	20 %	20 %	40 %	20 %	327310412
10483	NC_015315	TCA	2	6	435073	435078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10484	NC_015315	TA	3	6	435099	435104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10486	NC_015315	GAG	2	6	435220	435225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310413
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10500	NC_015315	A	6	6	435870	435875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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