MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015315	GCC	2	6	264925	264930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310210
6502	NC_015315	TCT	2	6	264970	264975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310210
6503	NC_015315	AAC	2	6	264978	264983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310210
6504	NC_015315	GGC	2	6	265041	265046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310210
6505	NC_015315	CAT	2	6	265055	265060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310210
6506	NC_015315	CGA	2	6	265079	265084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310210
6507	NC_015315	GCC	2	6	265107	265112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310210
6508	NC_015315	CCT	2	6	265156	265161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310210
6509	NC_015315	GC	3	6	265189	265194	0 %	0 %	50 %	50 %	327310210
6510	NC_015315	CT	3	6	265217	265222	0 %	50 %	0 %	50 %	327310210
6511	NC_015315	CCT	2	6	265249	265254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310210
6512	NC_015315	CTATC	2	10	265261	265270	20 %	40 %	0 %	40 %	327310210
6513	NC_015315	CGA	2	6	265312	265317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310210
6514	NC_015315	CCG	2	6	265362	265367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310210
6515	NC_015315	CGT	3	9	265414	265422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310210
6516	NC_015315	CAC	2	6	265436	265441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310210
6517	NC_015315	CGG	2	6	265447	265452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310210
6518	NC_015315	AGT	2	6	265513	265518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310210
6519	NC_015315	CGA	2	6	265610	265615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310210
6520	NC_015315	CCG	2	6	265641	265646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310210
6521	NC_015315	TAT	2	6	265670	265675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310210
6522	NC_015315	TGT	2	6	265690	265695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310210
6523	NC_015315	GAA	2	6	265706	265711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310210
6524	NC_015315	CTCC	2	8	265742	265749	0 %	25 %	0 %	75 %	327310210
6525	NC_015315	CT	3	6	265765	265770	0 %	50 %	0 %	50 %	327310210
6526	NC_015315	CGGGG	2	10	265856	265865	0 %	0 %	80 %	20 %	327310210
6527	NC_015315	TTG	2	6	265875	265880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310210
6528	NC_015315	CCT	2	6	265909	265914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310210
6529	NC_015315	CG	3	6	265938	265943	0 %	0 %	50 %	50 %	327310210
6530	NC_015315	TCC	2	6	265989	265994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310210
6531	NC_015315	AGG	2	6	266076	266081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310210
6532	NC_015315	C	6	6	266119	266124	0 %	0 %	0 %	100 %	327310210
6533	NC_015315	TCC	2	6	266214	266219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310210
6534	NC_015315	TCT	2	6	266248	266253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310210
6535	NC_015315	AAG	2	6	266256	266261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310210
6536	NC_015315	CGTGC	2	10	266417	266426	0 %	20 %	40 %	40 %	327310210
6537	NC_015315	GC	3	6	266477	266482	0 %	0 %	50 %	50 %	327310210
6538	NC_015315	CGG	2	6	266491	266496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310210
6539	NC_015315	TTA	2	6	266597	266602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_015315	CCT	2	6	266660	266665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6541	NC_015315	CGCGT	2	10	266670	266679	0 %	20 %	40 %	40 %	327310211
6542	NC_015315	TCC	2	6	266682	266687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6543	NC_015315	TCC	2	6	266703	266708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6544	NC_015315	AAC	2	6	266742	266747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310211
6545	NC_015315	CAG	2	6	266768	266773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310211
6546	NC_015315	CGC	2	6	266794	266799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310211
6547	NC_015315	ATG	2	6	266839	266844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310211
6548	NC_015315	TCG	2	6	266871	266876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310211
6549	NC_015315	TTA	2	6	266902	266907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310211
6550	NC_015315	CCG	2	6	266940	266945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310211
6551	NC_015315	GAC	2	6	266982	266987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310211
6552	NC_015315	TCC	2	6	266994	266999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6553	NC_015315	CAA	2	6	267032	267037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310211
6554	NC_015315	TAT	2	6	267080	267085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310211
6555	NC_015315	TCC	2	6	267090	267095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6556	NC_015315	CTC	2	6	267153	267158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310211
6557	NC_015315	GAA	2	6	267182	267187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310211
6558	NC_015315	CAG	2	6	267343	267348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310211
6559	NC_015315	CCT	2	6	267450	267455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310212
6560	NC_015315	CCA	2	6	267491	267496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310212
6561	NC_015315	GGCC	2	8	267524	267531	0 %	0 %	50 %	50 %	327310212
6562	NC_015315	CTT	2	6	267579	267584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310212
6563	NC_015315	TCT	2	6	267635	267640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310212
6564	NC_015315	GTC	2	6	267645	267650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310212
6565	NC_015315	AT	4	8	267686	267693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_015315	TTC	2	6	267758	267763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310213
6567	NC_015315	CGC	2	6	267894	267899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310213
6568	NC_015315	GGC	2	6	267901	267906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310213
6569	NC_015315	CCG	2	6	267939	267944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310213
6570	NC_015315	ACC	2	6	268043	268048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310213
6571	NC_015315	GGCAGA	2	12	268061	268072	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	327310213
6572	NC_015315	CGGC	2	8	268080	268087	0 %	0 %	50 %	50 %	327310213
6573	NC_015315	TCC	2	6	268115	268120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310214
6574	NC_015315	ATT	2	6	268186	268191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6575	NC_015315	ACG	2	6	268216	268221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310214
6576	NC_015315	ACG	2	6	268231	268236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310214
6577	NC_015315	AGT	2	6	268241	268246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310214
6578	NC_015315	GTA	2	6	268272	268277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310214
6579	NC_015315	ACCTCG	2	12	268279	268290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327310214
6580	NC_015315	CCT	2	6	268325	268330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310214
6581	NC_015315	TTTA	2	8	268371	268378	25 %	75 %	0 %	0 %	327310214
6582	NC_015315	AT	5	10	268387	268396	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6583	NC_015315	ATTA	2	8	268407	268414	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6584	NC_015315	TA	3	6	268413	268418	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6585	NC_015315	TA	3	6	268441	268446	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6586	NC_015315	TA	3	6	268494	268499	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6587	NC_015315	TTC	2	6	268507	268512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310214
6588	NC_015315	GAG	2	6	268531	268536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310214
6589	NC_015315	GT	3	6	268582	268587	0 %	50 %	50 %	0 %	327310214
6590	NC_015315	AT	3	6	268650	268655	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6591	NC_015315	ACT	2	6	268663	268668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310214
6592	NC_015315	TTA	2	6	268676	268681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6593	NC_015315	AT	3	6	268727	268732	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6594	NC_015315	AT	3	6	268758	268763	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6595	NC_015315	TAT	3	9	268761	268769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6596	NC_015315	AGT	2	6	268787	268792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310214
6597	NC_015315	CGC	2	6	268832	268837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310214
6598	NC_015315	GGGC	2	8	268842	268849	0 %	0 %	75 %	25 %	327310214
6599	NC_015315	TAGA	2	8	268906	268913	50 %	25 %	25 %	0 %	327310214
6600	NC_015315	GCC	2	6	268936	268941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310214
6601	NC_015315	CAA	2	6	269025	269030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310214
6602	NC_015315	ACG	2	6	269033	269038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310214
6603	NC_015315	ATAC	2	8	269075	269082	50 %	25 %	0 %	25 %	327310214
6604	NC_015315	GTT	2	6	269157	269162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310214
6605	NC_015315	AGG	2	6	269176	269181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310214
6606	NC_015315	CGTAGA	2	12	269198	269209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327310214
6607	NC_015315	CCT	2	6	269315	269320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310214
6608	NC_015315	CGA	2	6	269390	269395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310214
6609	NC_015315	CTC	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310214
6610	NC_015315	ATG	2	6	269425	269430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310214
6611	NC_015315	GACTT	2	10	269505	269514	20 %	40 %	20 %	20 %	327310214
6612	NC_015315	GCG	2	6	269516	269521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310214
6613	NC_015315	GTAC	2	8	269631	269638	25 %	25 %	25 %	25 %	327310214
6614	NC_015315	AG	3	6	269692	269697	50 %	0 %	50 %	0 %	327310214
6615	NC_015315	TAA	2	6	269728	269733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310214
6616	NC_015315	TAT	2	6	269735	269740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6617	NC_015315	AT	3	6	269739	269744	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6618	NC_015315	GTAT	2	8	269745	269752	25 %	50 %	25 %	0 %	327310214
6619	NC_015315	TTATA	2	10	269753	269762	40 %	60 %	0 %	0 %	327310214
6620	NC_015315	AT	3	6	269778	269783	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6621	NC_015315	TAT	2	6	269789	269794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
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6623	NC_015315	CGG	2	6	269907	269912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310214
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6991	NC_015315	CGG	2	6	284634	284639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310235
6992	NC_015315	GCG	2	6	284658	284663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310235
6993	NC_015315	TCA	2	6	284743	284748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6994	NC_015315	CGC	2	6	284779	284784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6995	NC_015315	CG	3	6	284871	284876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6996	NC_015315	CGGC	2	8	284884	284891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6997	NC_015315	CGG	2	6	284893	284898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6998	NC_015315	C	6	6	284908	284913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6999	NC_015315	GCGG	2	8	284938	284945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7000	NC_015315	GCC	2	6	284948	284953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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