MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015315	GTG	2	6	222351	222356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310165
5502	NC_015315	CGC	2	6	222391	222396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5503	NC_015315	GC	3	6	222406	222411	0 %	0 %	50 %	50 %	327310165
5504	NC_015315	CCG	2	6	222451	222456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5505	NC_015315	TTG	3	9	222519	222527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310165
5506	NC_015315	CCCT	2	8	222588	222595	0 %	25 %	0 %	75 %	327310165
5507	NC_015315	GCC	2	6	222618	222623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5508	NC_015315	ACA	2	6	222646	222651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310165
5509	NC_015315	TCG	2	6	222658	222663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310165
5510	NC_015315	GCC	2	6	222786	222791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5511	NC_015315	GCC	2	6	222798	222803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5512	NC_015315	GCTCG	2	10	222860	222869	0 %	20 %	40 %	40 %	327310165
5513	NC_015315	GCC	2	6	222870	222875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310165
5514	NC_015315	GAG	2	6	222878	222883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310165
5515	NC_015315	GTC	2	6	222900	222905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310165
5516	NC_015315	GTT	2	6	222941	222946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310165
5517	NC_015315	CTG	2	6	222969	222974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310165
5518	NC_015315	AT	4	8	222993	223000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015315	CGA	2	6	223082	223087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310166
5520	NC_015315	GAG	2	6	223197	223202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5521	NC_015315	GCC	3	9	223205	223213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310166
5522	NC_015315	AT	3	6	223248	223253	50 %	50 %	0 %	0 %	327310166
5523	NC_015315	ACC	2	6	223356	223361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310166
5524	NC_015315	GCG	2	6	223365	223370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310166
5525	NC_015315	TA	3	6	223386	223391	50 %	50 %	0 %	0 %	327310166
5526	NC_015315	GGCC	2	8	223435	223442	0 %	0 %	50 %	50 %	327310166
5527	NC_015315	GA	3	6	223470	223475	50 %	0 %	50 %	0 %	327310166
5528	NC_015315	ACG	2	6	223510	223515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310166
5529	NC_015315	CGGC	2	8	223579	223586	0 %	0 %	50 %	50 %	327310166
5530	NC_015315	GGA	2	6	223613	223618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5531	NC_015315	ACG	2	6	223633	223638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310166
5532	NC_015315	CGA	2	6	223649	223654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310166
5533	NC_015315	GTG	2	6	223665	223670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310166
5534	NC_015315	GCC	2	6	223684	223689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310166
5535	NC_015315	GGC	2	6	223787	223792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310166
5536	NC_015315	TCGGAG	2	12	223825	223836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327310166
5537	NC_015315	CGA	2	6	223844	223849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310166
5538	NC_015315	TGG	2	6	223915	223920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310166
5539	NC_015315	GAG	3	9	223941	223949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5540	NC_015315	GGA	2	6	223958	223963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5541	NC_015315	GCGG	2	8	223972	223979	0 %	0 %	75 %	25 %	327310166
5542	NC_015315	AAG	2	6	223998	224003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310166
5543	NC_015315	AGAT	2	8	224005	224012	50 %	25 %	25 %	0 %	327310166
5544	NC_015315	GTT	2	6	224015	224020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310166
5545	NC_015315	CTC	2	6	224052	224057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310166
5546	NC_015315	AGA	2	6	224107	224112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310166
5547	NC_015315	GC	3	6	224126	224131	0 %	0 %	50 %	50 %	327310166
5548	NC_015315	GAG	3	9	224151	224159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5549	NC_015315	GAA	2	6	224267	224272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310166
5550	NC_015315	GCG	2	6	224288	224293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310166
5551	NC_015315	GAG	2	6	224332	224337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310166
5552	NC_015315	GCC	2	6	224405	224410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310167
5553	NC_015315	AG	3	6	224432	224437	50 %	0 %	50 %	0 %	327310167
5554	NC_015315	CG	3	6	224474	224479	0 %	0 %	50 %	50 %	327310167
5555	NC_015315	GTT	2	6	224509	224514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310167
5556	NC_015315	CGA	2	6	224518	224523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310167
5557	NC_015315	GAG	2	6	224545	224550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310167
5558	NC_015315	GCG	2	6	224643	224648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310167
5559	NC_015315	GCC	2	6	224656	224661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310167
5560	NC_015315	GCG	2	6	224715	224720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310167
5561	NC_015315	CTGGG	2	10	224721	224730	0 %	20 %	60 %	20 %	327310167
5562	NC_015315	GCC	2	6	224737	224742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310167
5563	NC_015315	CAC	2	6	224744	224749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310167
5564	NC_015315	AGG	2	6	224784	224789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310167
5565	NC_015315	GAG	2	6	225068	225073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5566	NC_015315	CCTCG	2	10	225077	225086	0 %	20 %	20 %	60 %	327310168
5567	NC_015315	GAG	2	6	225102	225107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5568	NC_015315	GCG	2	6	225124	225129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310168
5569	NC_015315	GTG	2	6	225216	225221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310168
5570	NC_015315	GGAGCG	2	12	225236	225247	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	327310168
5571	NC_015315	AGG	2	6	225306	225311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5572	NC_015315	GAG	2	6	225338	225343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5573	NC_015315	CGT	2	6	225368	225373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310168
5574	NC_015315	CCT	2	6	225422	225427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310168
5575	NC_015315	CGT	2	6	225458	225463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310168
5576	NC_015315	GAG	2	6	225504	225509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5577	NC_015315	TCC	2	6	225553	225558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310168
5578	NC_015315	CGG	2	6	225562	225567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310168
5579	NC_015315	GTC	2	6	225615	225620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310168
5580	NC_015315	TC	3	6	225653	225658	0 %	50 %	0 %	50 %	327310168
5581	NC_015315	CGC	2	6	225688	225693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310168
5582	NC_015315	ACG	2	6	225712	225717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310168
5583	NC_015315	GTG	2	6	225834	225839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310168
5584	NC_015315	CG	3	6	225877	225882	0 %	0 %	50 %	50 %	327310168
5585	NC_015315	AGG	2	6	225885	225890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5586	NC_015315	GGA	2	6	225892	225897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310168
5587	NC_015315	ACGGCG	2	12	225991	226002	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	327310168
5588	NC_015315	CTCG	2	8	226040	226047	0 %	25 %	25 %	50 %	327310168
5589	NC_015315	GGT	2	6	226049	226054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310168
5590	NC_015315	CAA	2	6	226166	226171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_015315	CGG	2	6	226193	226198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_015315	CG	3	6	226221	226226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_015315	CAAT	2	8	226392	226399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_015315	GGCGC	2	10	226440	226449	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5595	NC_015315	ACG	2	6	226483	226488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015315	TAA	2	6	226519	226524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015315	GCC	2	6	226551	226556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_015315	GAG	2	6	226662	226667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015315	TAGA	2	8	226804	226811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015315	TCC	2	6	226821	226826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_015315	TAA	2	6	226855	226860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015315	GGC	2	6	226894	226899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015315	TCT	2	6	227017	227022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015315	AG	3	6	227028	227033	50 %	0 %	50 %	0 %	327310169
5605	NC_015315	ACC	2	6	227093	227098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310169
5606	NC_015315	CGA	2	6	227103	227108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5607	NC_015315	TCG	2	6	227159	227164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5608	NC_015315	GCC	2	6	227166	227171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310169
5609	NC_015315	CG	3	6	227172	227177	0 %	0 %	50 %	50 %	327310169
5610	NC_015315	CCT	2	6	227247	227252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310169
5611	NC_015315	GTC	2	6	227269	227274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5612	NC_015315	C	6	6	227379	227384	0 %	0 %	0 %	100 %	327310169
5613	NC_015315	TCG	2	6	227406	227411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5614	NC_015315	GTC	2	6	227449	227454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5615	NC_015315	CGT	2	6	227466	227471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5616	NC_015315	GCCCCT	2	12	227473	227484	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	327310169
5617	NC_015315	CT	4	8	227510	227517	0 %	50 %	0 %	50 %	327310169
5618	NC_015315	CTG	2	6	227522	227527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5619	NC_015315	GA	3	6	227539	227544	50 %	0 %	50 %	0 %	327310169
5620	NC_015315	CGA	2	6	227559	227564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310169
5621	NC_015315	GCC	2	6	227630	227635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310169
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5746	NC_015315	AGGAAT	2	12	232935	232946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	327310173
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5748	NC_015315	TGG	2	6	233021	233026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310173
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5750	NC_015315	GCC	2	6	233143	233148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310173
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5829	NC_015315	TC	3	6	235827	235832	0 %	50 %	0 %	50 %	327310175
5830	NC_015315	CACG	2	8	235833	235840	25 %	0 %	25 %	50 %	327310175
5831	NC_015315	GGC	2	6	235845	235850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310175
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5851	NC_015315	TCG	2	6	236534	236539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310176
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5854	NC_015315	CGA	3	9	236601	236609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310176
5855	NC_015315	CAC	2	6	236629	236634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310176
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5858	NC_015315	TCT	2	6	236796	236801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310176
5859	NC_015315	CCG	2	6	236814	236819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310176
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5862	NC_015315	ACGCC	2	10	237003	237012	20 %	0 %	20 %	60 %	327310176
5863	NC_015315	TGGT	2	8	237014	237021	0 %	50 %	50 %	0 %	327310176
5864	NC_015315	C	6	6	237043	237048	0 %	0 %	0 %	100 %	327310176
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5989	NC_015315	TCC	2	6	242620	242625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310182
5990	NC_015315	ACA	2	6	242661	242666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310182
5991	NC_015315	CGG	2	6	242670	242675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310182
5992	NC_015315	GCCA	2	8	242746	242753	25 %	0 %	25 %	50 %	327310182
5993	NC_015315	GGT	2	6	242835	242840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310182
5994	NC_015315	GCCC	2	8	242869	242876	0 %	0 %	25 %	75 %	327310182
5995	NC_015315	TAT	3	9	242887	242895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310182
5996	NC_015315	AT	3	6	243028	243033	50 %	50 %	0 %	0 %	327310182
5997	NC_015315	GTG	2	6	243037	243042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310182
5998	NC_015315	TAT	2	6	243094	243099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310182
5999	NC_015315	TCC	2	6	243111	243116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310182
6000	NC_015315	TCCATG	2	12	243194	243205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327310182

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