MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 46724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015315	AAC	2	6	180925	180930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310109
4502	NC_015315	GTA	2	6	181001	181006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310109
4503	NC_015315	CGC	2	6	181009	181014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310109
4504	NC_015315	AAC	2	6	181053	181058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310109
4505	NC_015315	AGG	2	6	181105	181110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310109
4506	NC_015315	CCA	2	6	181126	181131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310109
4507	NC_015315	CAC	3	9	181205	181213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310109
4508	NC_015315	TA	3	6	181259	181264	50 %	50 %	0 %	0 %	327310109
4509	NC_015315	CGG	2	6	181267	181272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310109
4510	NC_015315	GTC	2	6	181317	181322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310109
4511	NC_015315	CGG	2	6	181388	181393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310109
4512	NC_015315	ACC	2	6	181452	181457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310109
4513	NC_015315	CGC	2	6	181469	181474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310109
4514	NC_015315	GCG	2	6	181555	181560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015315	CCTG	2	8	181591	181598	0 %	25 %	25 %	50 %	327310110
4516	NC_015315	CTCC	2	8	181636	181643	0 %	25 %	0 %	75 %	327310110
4517	NC_015315	GAG	2	6	181754	181759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310110
4518	NC_015315	GAG	2	6	181766	181771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310110
4519	NC_015315	CG	3	6	181778	181783	0 %	0 %	50 %	50 %	327310110
4520	NC_015315	CGA	2	6	181813	181818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310110
4521	NC_015315	GGC	2	6	181859	181864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310110
4522	NC_015315	CGGGG	2	10	181890	181899	0 %	0 %	80 %	20 %	327310110
4523	NC_015315	CGC	2	6	181900	181905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310110
4524	NC_015315	CTCC	2	8	181907	181914	0 %	25 %	0 %	75 %	327310110
4525	NC_015315	CCA	2	6	181963	181968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310110
4526	NC_015315	CGG	2	6	181984	181989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310110
4527	NC_015315	GCC	2	6	182045	182050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310110
4528	NC_015315	CACG	2	8	182072	182079	25 %	0 %	25 %	50 %	327310110
4529	NC_015315	GCC	2	6	182085	182090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310110
4530	NC_015315	AGGG	3	12	182192	182203	25 %	0 %	75 %	0 %	327310110
4531	NC_015315	CTC	2	6	182208	182213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310110
4532	NC_015315	CGG	2	6	182222	182227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310110
4533	NC_015315	GTC	2	6	182329	182334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310111
4534	NC_015315	GAC	2	6	182341	182346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310111
4535	NC_015315	CGC	2	6	182349	182354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310111
4536	NC_015315	CCA	2	6	182368	182373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310111
4537	NC_015315	CCT	2	6	182397	182402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310111
4538	NC_015315	GGC	2	6	182432	182437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310111
4539	NC_015315	CAC	2	6	182461	182466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310111
4540	NC_015315	ACC	3	9	182495	182503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310111
4541	NC_015315	ACG	2	6	182618	182623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310111
4542	NC_015315	CCTC	2	8	182625	182632	0 %	25 %	0 %	75 %	327310111
4543	NC_015315	TCG	2	6	182657	182662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310111
4544	NC_015315	GCC	2	6	182716	182721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310112
4545	NC_015315	CGC	3	9	182843	182851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310112
4546	NC_015315	AAC	2	6	182872	182877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310112
4547	NC_015315	GCC	2	6	182944	182949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310112
4548	NC_015315	AAGC	2	8	182962	182969	50 %	0 %	25 %	25 %	327310112
4549	NC_015315	CTC	2	6	183048	183053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310112
4550	NC_015315	CCGG	2	8	183183	183190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_015315	CG	4	8	183211	183218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_015315	TTAA	2	8	183277	183284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015315	TCGGC	2	10	183309	183318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4554	NC_015315	GGCC	2	8	183328	183335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_015315	TAC	2	6	183350	183355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310113
4556	NC_015315	AAG	2	6	183401	183406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310113
4557	NC_015315	GCC	3	9	183410	183418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310113
4558	NC_015315	ACG	2	6	183472	183477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310113
4559	NC_015315	GGC	2	6	183479	183484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310113
4560	NC_015315	CGC	2	6	183521	183526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310113
4561	NC_015315	CCG	2	6	183535	183540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310113
4562	NC_015315	GGC	3	9	183589	183597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310113
4563	NC_015315	GGC	2	6	183621	183626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310113
4564	NC_015315	CGC	2	6	183629	183634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310113
4565	NC_015315	GGA	2	6	183665	183670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310113
4566	NC_015315	GAG	2	6	183677	183682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310113
4567	NC_015315	CGG	2	6	183689	183694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310113
4568	NC_015315	GAG	2	6	183696	183701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310113
4569	NC_015315	GAG	2	6	183756	183761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310113
4570	NC_015315	CCG	2	6	183802	183807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310113
4571	NC_015315	ATT	2	6	183875	183880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310113
4572	NC_015315	AAC	2	6	183921	183926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310114
4573	NC_015315	AACAG	2	10	183940	183949	60 %	0 %	20 %	20 %	327310114
4574	NC_015315	TGT	2	6	183986	183991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310114
4575	NC_015315	AGCC	2	8	184063	184070	25 %	0 %	25 %	50 %	327310114
4576	NC_015315	CGGC	2	8	184121	184128	0 %	0 %	50 %	50 %	327310114
4577	NC_015315	GGA	2	6	184136	184141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310114
4578	NC_015315	GAA	2	6	184167	184172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310114
4579	NC_015315	GGCA	2	8	184188	184195	25 %	0 %	50 %	25 %	327310114
4580	NC_015315	CAC	2	6	184224	184229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310114
4581	NC_015315	TTG	2	6	184257	184262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310114
4582	NC_015315	AT	4	8	184296	184303	50 %	50 %	0 %	0 %	327310114
4583	NC_015315	TTA	2	6	184310	184315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310114
4584	NC_015315	GGCC	2	8	184340	184347	0 %	0 %	50 %	50 %	327310114
4585	NC_015315	TGC	2	6	184355	184360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310114
4586	NC_015315	ACG	2	6	184387	184392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310114
4587	NC_015315	CGA	2	6	184475	184480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310114
4588	NC_015315	AAG	2	6	184495	184500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310114
4589	NC_015315	CCA	2	6	184577	184582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310114
4590	NC_015315	CCA	2	6	184640	184645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310114
4591	NC_015315	GCC	2	6	184704	184709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310114
4592	NC_015315	AT	4	8	184723	184730	50 %	50 %	0 %	0 %	327310114
4593	NC_015315	CAC	2	6	184731	184736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310114
4594	NC_015315	TTA	2	6	184769	184774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310114
4595	NC_015315	GGCC	2	8	184785	184792	0 %	0 %	50 %	50 %	327310114
4596	NC_015315	CAA	2	6	184811	184816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310114
4597	NC_015315	AAT	2	6	184929	184934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310114
4598	NC_015315	GCCG	2	8	184995	185002	0 %	0 %	50 %	50 %	327310114
4599	NC_015315	GCC	2	6	185103	185108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310114
4600	NC_015315	GGC	2	6	185118	185123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310114
4601	NC_015315	GCC	2	6	185205	185210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310114
4602	NC_015315	CGC	2	6	185271	185276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310114
4603	NC_015315	CAA	2	6	185288	185293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310114
4604	NC_015315	GAA	2	6	185298	185303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310114
4605	NC_015315	CTAT	2	8	185346	185353	25 %	50 %	0 %	25 %	327310115
4606	NC_015315	TA	3	6	185366	185371	50 %	50 %	0 %	0 %	327310115
4607	NC_015315	ACC	2	6	185410	185415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310115
4608	NC_015315	TA	3	6	185455	185460	50 %	50 %	0 %	0 %	327310115
4609	NC_015315	ACT	2	6	185493	185498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310115
4610	NC_015315	TAT	2	6	185516	185521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310115
4611	NC_015315	GCC	2	6	185535	185540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310115
4612	NC_015315	A	7	7	185584	185590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015315	TTA	2	6	185594	185599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015315	ACG	2	6	185680	185685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_015315	CCG	2	6	185689	185694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_015315	GCC	2	6	185710	185715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310116
4617	NC_015315	TGGC	2	8	185731	185738	0 %	25 %	50 %	25 %	327310116
4618	NC_015315	GTG	2	6	185791	185796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310116
4619	NC_015315	GC	3	6	185797	185802	0 %	0 %	50 %	50 %	327310116
4620	NC_015315	AC	3	6	185838	185843	50 %	0 %	0 %	50 %	327310116
4621	NC_015315	CGT	2	6	185847	185852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310116
4622	NC_015315	CCG	2	6	185854	185859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310116
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4624	NC_015315	TCG	2	6	185903	185908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310116
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4741	NC_015315	CG	3	6	191115	191120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4742	NC_015315	ATAA	2	8	191136	191143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_015315	TA	4	8	191165	191172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_015315	AT	4	8	191184	191191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_015315	TAT	2	6	191195	191200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_015315	ATG	2	6	191227	191232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4748	NC_015315	TACA	2	8	191252	191259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4992	NC_015315	AAG	2	6	201244	201249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_015315	AGG	2	6	201343	201348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310132
4994	NC_015315	ACA	2	6	201350	201355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310132
4995	NC_015315	CTC	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310132
4996	NC_015315	GCCGAA	2	12	201381	201392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310132
4997	NC_015315	AGA	2	6	201395	201400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310132
4998	NC_015315	CAA	2	6	201414	201419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310132
4999	NC_015315	GCC	2	6	201511	201516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310133
5000	NC_015315	GAAC	2	8	201586	201593	50 %	0 %	25 %	25 %	327310133

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